MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	GAAAGA	2	12	1146	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
2	NC_014448	GAAAAA	2	12	1382	1393	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372807
3	NC_014448	TTCAAA	2	12	1429	1440	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372807
4	NC_014448	GTTTAA	2	12	1860	1871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372807
5	NC_014448	TCTTTT	2	12	10920	10931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304372814
6	NC_014448	CATTCA	2	12	15393	15404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372817
7	NC_014448	AAATAA	2	12	15681	15692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372817
8	NC_014448	AATTAA	2	12	16140	16151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372817
9	NC_014448	ATTTTT	2	12	18059	18070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014448	CTGGAG	2	12	22609	22620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014448	AAGTGT	2	12	22916	22927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014448	TTTGAA	2	12	24000	24011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372820
13	NC_014448	ATATTT	2	12	25748	25759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014448	AAGATG	2	12	26643	26654	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304372824
15	NC_014448	TGCAAA	2	12	27999	28010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372825
16	NC_014448	TCAAGT	2	12	29609	29620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372826
17	NC_014448	TTTAGA	2	12	33394	33405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372829
18	NC_014448	GAATTT	2	12	35624	35635	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372831
19	NC_014448	ATAAAA	2	12	35811	35822	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372831
20	NC_014448	AATTTA	2	12	37254	37265	50 %	50 %	0 %	0 %	304372832
21	NC_014448	TTTATC	2	12	41123	41134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372836
22	NC_014448	AAAGCA	2	12	45478	45489	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372840
23	NC_014448	ATTTCT	2	12	46346	46357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372840
24	NC_014448	AATTAA	2	12	46591	46602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014448	CTTATT	2	12	48158	48169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014448	ATTAAT	2	12	48270	48281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014448	AATGAA	2	12	49075	49086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014448	AAATTT	2	12	49098	49109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014448	TTTTGA	2	12	50128	50139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014448	GATAGA	2	12	51041	51052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014448	ATTTTT	2	12	53664	53675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372846
32	NC_014448	ATGGTA	2	12	54273	54284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372846
33	NC_014448	AAATTG	2	12	56751	56762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372846
34	NC_014448	AGAAAA	2	12	56824	56835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372846
35	NC_014448	TAAATA	2	12	59861	59872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372849
36	NC_014448	ATTTAA	2	12	62964	62975	50 %	50 %	0 %	0 %	304372852
37	NC_014448	TTTCTA	2	12	66018	66029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304372854
38	NC_014448	TTGCAG	2	12	68789	68800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304372857
39	NC_014448	AGGATT	2	12	68910	68921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372857
40	NC_014448	TATATG	2	12	72336	72347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372858
41	NC_014448	GAAAAA	2	12	73681	73692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372859
42	NC_014448	AAGGTC	2	12	74690	74701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304372859
43	NC_014448	TTTGTT	2	12	78296	78307	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014448	CTTTGT	2	12	78416	78427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304372862
45	NC_014448	TCTAAA	2	12	78583	78594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372862
46	NC_014448	TCAAGT	2	12	78808	78819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372862
47	NC_014448	GAAAAT	2	12	79573	79584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372863
48	NC_014448	TTAAAA	2	12	80177	80188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372864
49	NC_014448	AAAGAA	2	12	81839	81850	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372864
50	NC_014448	AAGCAA	2	12	82520	82531	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372865
51	NC_014448	TGAAAA	2	12	85452	85463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372866
52	NC_014448	TTTTAA	2	12	88012	88023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372868
53	NC_014448	AAAAAC	2	12	91148	91159	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372871
54	NC_014448	TAAAAA	2	12	91593	91604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372871
55	NC_014448	TGAAAA	2	12	92867	92878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372873
56	NC_014448	ACAGAT	2	12	94095	94106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372873
57	NC_014448	TAGGAA	2	12	96416	96427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	304372876
58	NC_014448	ACGGAA	2	12	97370	97381	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	304372876
59	NC_014448	TTTTAT	2	12	97837	97848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372877
60	NC_014448	CAAAAT	2	12	98404	98415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372877
61	NC_014448	TTAAAT	2	12	98423	98434	50 %	50 %	0 %	0 %	304372877
62	NC_014448	ATTCAA	2	12	98709	98720	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372877
63	NC_014448	CAAAAA	2	12	99293	99304	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372877
64	NC_014448	TAAAGA	2	12	105513	105524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372884
65	NC_014448	CAAAAA	2	12	107367	107378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372887
66	NC_014448	CCAAAT	2	12	108018	108029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304372887
67	NC_014448	TCAAAA	2	12	108543	108554	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014448	TAAAAT	2	12	108966	108977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014448	TACAAA	2	12	109444	109455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014448	TTGGAG	2	12	110048	110059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014448	TAAAAG	2	12	112819	112830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372890
72	NC_014448	AGACAA	2	12	113404	113415	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372891
73	NC_014448	ATTCAA	2	12	114696	114707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372891
74	NC_014448	TTAATA	2	12	115170	115181	50 %	50 %	0 %	0 %	304372893
75	NC_014448	TTGTTA	2	12	116317	116328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304372894
76	NC_014448	ATTGAC	2	12	116889	116900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304372894
77	NC_014448	ATTACA	2	12	118427	118438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372897
78	NC_014448	ATCTAA	2	12	120051	120062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304372899
79	NC_014448	AAGGAA	2	12	121413	121424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372901
80	NC_014448	CTCTTT	2	12	122632	122643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372902
81	NC_014448	AAAGAA	2	12	123903	123914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372903
82	NC_014448	TTTTGA	2	12	129014	129025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304372910
83	NC_014448	TTTTGT	2	12	129528	129539	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372911
84	NC_014448	AAGAAA	2	12	131142	131153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372912
85	NC_014448	ATAATT	2	12	131397	131408	50 %	50 %	0 %	0 %	304372912
86	NC_014448	TTCATA	2	12	133890	133901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304372914
87	NC_014448	TTAAAA	2	12	134469	134480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372915
88	NC_014448	CTTCAT	2	12	136812	136823	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	304372915
89	NC_014448	TAAAAA	2	12	137906	137917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304372917
90	NC_014448	TAAAAA	2	12	138875	138886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014448	AGAATT	2	12	141130	141141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372920
92	NC_014448	AAATAG	2	12	142770	142781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372922
93	NC_014448	CAAAAT	2	12	143380	143391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372922
94	NC_014448	ATAAAG	2	12	143821	143832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372923
95	NC_014448	GTTTTT	2	12	149217	149228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372929
96	NC_014448	ATTGAA	2	12	153901	153912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304372932
97	NC_014448	AAAAGA	2	12	154734	154745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372932
98	NC_014448	TTTTGT	2	12	154749	154760	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304372932
99	NC_014448	GTTACT	2	12	156739	156750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304372933
100	NC_014448	TGAAAA	2	12	163208	163219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372937
101	NC_014448	AACTAA	2	12	166513	166524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372938
102	NC_014448	GAAAAA	2	12	167880	167891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372940
103	NC_014448	ATAGCA	2	12	169227	169238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372941
104	NC_014448	TTGCAT	2	12	169892	169903	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014448	AAATTC	2	12	172401	172412	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014448	GAAGGA	2	12	172916	172927	50 %	0 %	50 %	0 %	304372944
107	NC_014448	TCCAAA	2	12	173137	173148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304372944
108	NC_014448	ATTTTT	2	12	178340	178351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372947
109	NC_014448	TGAAAA	2	12	179439	179450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372947
110	NC_014448	TTTATT	2	12	181731	181742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304372950
111	NC_014448	GTTTGA	2	12	182096	182107	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	304372950
112	NC_014448	AACAAT	2	12	184198	184209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304372951
113	NC_014448	ACAAAA	2	12	188515	188526	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	304372953
114	NC_014448	AAGAAA	2	12	190198	190209	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304372953
115	NC_014448	ACACAA	2	12	192807	192818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372953
116	NC_014448	AGTTGA	2	12	192974	192985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372953
117	NC_014448	CAAGAA	2	12	193563	193574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304372953
118	NC_014448	ATTGAT	2	12	193614	193625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304372953
119	NC_014448	CAAACA	2	12	193785	193796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372953
120	NC_014448	AAATGA	2	12	194054	194065	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372953
121	NC_014448	TTACTA	2	12	194287	194298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304372953
122	NC_014448	AAAAGT	2	12	194729	194740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304372953
123	NC_014448	CAAATG	2	12	195847	195858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304372953
124	NC_014448	TAAAAT	2	12	196021	196032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372953
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229	NC_014448	TGAAGT	2	12	355988	355999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373073
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231	NC_014448	GAAAAA	2	12	357760	357771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304373074
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234	NC_014448	CCAAAT	2	12	360167	360178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	304373075
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237	NC_014448	TAACAC	2	12	367484	367495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_014448	TTTTTA	2	12	368218	368229	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373082
239	NC_014448	ATTTTC	2	12	370158	370169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304373083
240	NC_014448	CTTCAC	2	12	370535	370546	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	304373083
241	NC_014448	TTTCTT	2	12	371550	371561	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304373085
242	NC_014448	GAATCA	2	12	372395	372406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304373087
243	NC_014448	ATTGCA	2	12	372695	372706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304373087
244	NC_014448	TCAAAA	2	12	375977	375988	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373089
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247	NC_014448	AAATTT	2	12	378989	379000	50 %	50 %	0 %	0 %	304373090
248	NC_014448	AAAATC	2	12	380768	380779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373091
249	NC_014448	GCTGCA	2	12	380964	380975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	304373091
250	NC_014448	CTAAAG	2	12	382260	382271	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304373093
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252	NC_014448	TGGTTG	2	12	384990	385001	0 %	50 %	50 %	0 %	304373094
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258	NC_014448	TTTTGC	2	12	390900	390911	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373099
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289	NC_014448	ATATAA	2	12	429310	429321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_014448	TAGAAT	2	12	478870	478881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
332	NC_014448	TTAAAT	2	12	479936	479947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_014448	TTTTTA	2	12	482169	482180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373164
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335	NC_014448	TTCTTT	2	12	489606	489617	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304373171
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346	NC_014448	GTTTTT	2	12	505825	505836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373197
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355	NC_014448	CAATAA	2	12	513815	513826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373204
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357	NC_014448	TGTTTT	2	12	516798	516809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
358	NC_014448	ATTTTA	2	12	517003	517014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
359	NC_014448	TAAAAA	2	12	519787	519798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
360	NC_014448	TTTAAA	2	12	525249	525260	50 %	50 %	0 %	0 %	304373215
361	NC_014448	TCTAAT	2	12	526180	526191	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373216
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381	NC_014448	AAGAAA	2	12	549993	550004	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304373231
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387	NC_014448	AAAATT	2	12	555248	555259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_014448	CTAAAT	2	12	555808	555819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
389	NC_014448	ACTTGT	2	12	555939	555950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304373236
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464	NC_014448	TCTTTT	2	12	647139	647150	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304373317
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472	NC_014448	TTCTAA	2	12	654115	654126	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373323
473	NC_014448	GCTTTT	2	12	654203	654214	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373323
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475	NC_014448	TTTAAT	2	12	654922	654933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373323
476	NC_014448	CTAATG	2	12	655137	655148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	304373323
477	NC_014448	TTTCTG	2	12	656875	656886	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373324
478	NC_014448	TCTTGT	2	12	658044	658055	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373324
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