MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014448	TTTTAA	2	12	688411	688422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014448	AACTTC	2	12	689169	689180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373345
503	NC_014448	GTGGAT	2	12	690179	690190	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	304373346
504	NC_014448	ATCAAA	2	12	690200	690211	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373346
505	NC_014448	TTTTCT	2	12	690405	690416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304373346
506	NC_014448	CGATTT	2	12	690679	690690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304373346
507	NC_014448	TACCTG	2	12	691102	691113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304373346
508	NC_014448	TAAAGA	2	12	692659	692670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373347
509	NC_014448	ATTTGT	2	12	692862	692873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373347
510	NC_014448	TAAGAT	2	12	693513	693524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304373348
511	NC_014448	GTTTTT	2	12	694662	694673	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373350
512	NC_014448	TTATAA	2	12	700189	700200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014448	TTTGAT	2	12	703655	703666	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373355
514	NC_014448	GAAAAA	2	12	704270	704281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304373356
515	NC_014448	TATTTT	2	12	707400	707411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014448	TGATAA	2	12	708263	708274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304373359
517	NC_014448	AAGAAA	2	12	710135	710146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014448	TGCTTA	2	12	711185	711196	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_014448	ATGCAG	2	12	713188	713199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
520	NC_014448	AAAATA	2	12	713256	713267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014448	TAAAAA	2	12	713281	713292	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014448	TAAAAT	2	12	713359	713370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014448	GATTTT	2	12	713886	713897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373363
524	NC_014448	AAATGA	2	12	714267	714278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373364
525	NC_014448	ATATCT	2	12	715438	715449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_014448	TAAAAC	2	12	717013	717024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373365
527	NC_014448	GCATTT	2	12	718057	718068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304373366
528	NC_014448	ATTGTG	2	12	719260	719271	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	304373367
529	NC_014448	CAAAAA	2	12	721109	721120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
530	NC_014448	AAAGAA	2	12	722044	722055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	304373369
531	NC_014448	ATGAAA	2	12	722693	722704	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373369
532	NC_014448	TTTTAA	2	12	725122	725133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373372
533	NC_014448	GTTTGG	2	12	726908	726919	0 %	50 %	50 %	0 %	304373373
534	NC_014448	ATTCAT	2	12	729670	729681	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373374
535	NC_014448	TACTTG	2	12	730334	730345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304373374
536	NC_014448	ATTTTT	2	12	732026	732037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373374
537	NC_014448	TTTTTA	2	12	732616	732627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373374
538	NC_014448	TTAGGT	2	12	735965	735976	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	304373378
539	NC_014448	TGAATT	2	12	736069	736080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304373378
540	NC_014448	TGATCC	2	12	736138	736149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304373378
541	NC_014448	AACTTC	2	12	738076	738087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373380
542	NC_014448	TTAACT	2	12	738143	738154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373380
543	NC_014448	TGTTTT	2	12	738988	738999	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373380
544	NC_014448	AAAATC	2	12	741849	741860	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373382
545	NC_014448	TTAAAT	2	12	747118	747129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014448	ATAAAA	2	12	747230	747241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014448	TGTTTT	2	12	749615	749626	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373390
548	NC_014448	CTTTTG	2	12	749638	749649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373390
549	NC_014448	ATTTAA	2	12	753470	753481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014448	TAATAG	2	12	753902	753913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304373393
551	NC_014448	AACATT	2	12	758581	758592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_014448	AATTCT	2	12	758873	758884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373397
553	NC_014448	TTTTCA	2	12	758924	758935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304373397
554	NC_014448	TTTTCT	2	12	760143	760154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
555	NC_014448	ATAAGA	2	12	760199	760210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014448	AAAATG	2	12	760696	760707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373399
557	NC_014448	ATTACA	2	12	764364	764375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_014448	TAAAAT	2	12	766177	766188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373403
559	NC_014448	ATTTTA	2	12	766194	766205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373403
560	NC_014448	ATTTTT	2	12	766952	766963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373404
561	NC_014448	ATTTTT	2	12	768388	768399	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373406
562	NC_014448	ACTAAT	2	12	769019	769030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373407
563	NC_014448	TTTACA	2	12	771527	771538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373408
564	NC_014448	AAAGCA	2	12	772433	772444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304373408
565	NC_014448	GCTTCA	2	12	773006	773017	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304373409
566	NC_014448	ATCTAA	2	12	773847	773858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373410
567	NC_014448	CAAAAA	2	12	774512	774523	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
568	NC_014448	TTCCTA	2	12	776194	776205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	304373411
569	NC_014448	ATTCAA	2	12	777101	777112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373412
570	NC_014448	TTTTCT	2	12	777554	777565	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	304373413
571	NC_014448	ACTAAA	2	12	777780	777791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	304373413
572	NC_014448	TCTTTG	2	12	778373	778384	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373414
573	NC_014448	TGTTTT	2	12	778564	778575	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373414
574	NC_014448	ATCTTT	2	12	778640	778651	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	304373414
575	NC_014448	CTTTTG	2	12	782817	782828	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373417
576	NC_014448	AATTGG	2	12	783703	783714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373418
577	NC_014448	TTATCA	2	12	785908	785919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373418
578	NC_014448	TCATAA	2	12	786504	786515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_014448	TTCCTC	2	12	786934	786945	0 %	50 %	0 %	50 %	304373419
580	NC_014448	TTGCAT	2	12	787842	787853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	304373420
581	NC_014448	TAAAAT	2	12	790006	790017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373422
582	NC_014448	GAAACT	2	12	791644	791655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	304373423
583	NC_014448	AAGCTG	2	12	793549	793560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304373424
584	NC_014448	TAAAAT	2	12	795198	795209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373426
585	NC_014448	TGAAAT	2	12	795315	795326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	304373426
586	NC_014448	GTTCCA	2	12	796340	796351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	304373427
587	NC_014448	ATTTTT	2	12	796432	796443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373427
588	NC_014448	TTCTAA	2	12	797291	797302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373428
589	NC_014448	CTTAAT	2	12	797949	797960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373429
590	NC_014448	TAAAAA	2	12	800278	800289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304373431
591	NC_014448	TAAAAT	2	12	801976	801987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373432
592	NC_014448	TCAATA	2	12	803623	803634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373433
593	NC_014448	CTTTGT	2	12	806490	806501	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	304373434
594	NC_014448	TTAACT	2	12	807607	807618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	304373435
595	NC_014448	ATTTGA	2	12	812698	812709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304373438
596	NC_014448	TTTTGG	2	12	813351	813362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373439
597	NC_014448	AAGAAT	2	12	814397	814408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373439
598	NC_014448	TTCAGG	2	12	815247	815258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304373439
599	NC_014448	TTCAGG	2	12	815283	815294	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	304373439
600	NC_014448	ACAAAG	2	12	823066	823077	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304373446
601	NC_014448	TCAATA	2	12	823090	823101	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	304373446
602	NC_014448	AGACAA	2	12	823121	823132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	304373446
603	NC_014448	TTTGAA	2	12	824243	824254	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	304373446
604	NC_014448	TGGTGT	2	12	824638	824649	0 %	50 %	50 %	0 %	304373446
605	NC_014448	AATATT	2	12	827832	827843	50 %	50 %	0 %	0 %	304373449
606	NC_014448	AAACAA	2	12	828861	828872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_014448	ATGTAG	2	12	828878	828889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014448	ACAGGT	2	12	830203	830214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	304373452
609	NC_014448	TGTTAT	2	12	834533	834544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	304373456
610	NC_014448	GTTTTT	2	12	834959	834970	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	304373456
611	NC_014448	GTAAAA	2	12	835740	835751	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	304373457
612	NC_014448	ATTTTT	2	12	836252	836263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	304373457
613	NC_014448	TAAAAA	2	12	838304	838315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	304373458
614	NC_014448	TATAAT	2	12	839385	839396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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