MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 13607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014448	TTA	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
2	NC_014448	ACT	2	6	61	66	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372806
3	NC_014448	TTC	2	6	129	134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372806
4	NC_014448	AAC	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
5	NC_014448	TAA	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
6	NC_014448	TTC	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372806
7	NC_014448	GAA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
8	NC_014448	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
9	NC_014448	TAT	2	6	494	499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
10	NC_014448	TGA	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372806
11	NC_014448	TAA	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
12	NC_014448	CAA	2	6	533	538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
13	NC_014448	ATC	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372806
14	NC_014448	GGT	2	6	625	630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372806
15	NC_014448	GAA	2	6	634	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
16	NC_014448	TTA	2	6	644	649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
17	NC_014448	AGA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
18	NC_014448	ATA	2	6	940	945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372806
19	NC_014448	GAA	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
20	NC_014448	ATT	2	6	959	964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
21	NC_014448	AGA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372806
22	NC_014448	ATT	2	6	1114	1119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372806
23	NC_014448	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372806
24	NC_014448	CTT	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014448	GTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014448	TAT	3	9	1304	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014448	AGG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304372807
28	NC_014448	ATT	3	9	1462	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
29	NC_014448	AAG	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
30	NC_014448	TTA	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
31	NC_014448	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
32	NC_014448	TAA	2	6	1752	1757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
33	NC_014448	ATT	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
34	NC_014448	TAT	2	6	1848	1853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
35	NC_014448	AGA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
36	NC_014448	AGA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
37	NC_014448	TGA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
38	NC_014448	ACA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
39	NC_014448	GAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372807
40	NC_014448	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372807
41	NC_014448	CAA	2	6	2196	2201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
42	NC_014448	TTC	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372807
43	NC_014448	AGA	2	6	2248	2253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372807
44	NC_014448	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
45	NC_014448	TAA	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372807
46	NC_014448	AAC	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372807
47	NC_014448	AAT	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372808
48	NC_014448	AGA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372808
49	NC_014448	TAG	3	9	2757	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
50	NC_014448	TGG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372809
51	NC_014448	TAA	2	6	2904	2909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372809
52	NC_014448	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372809
53	NC_014448	CAG	2	6	3000	3005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372809
54	NC_014448	AGA	2	6	3094	3099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
55	NC_014448	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372809
56	NC_014448	ACA	2	6	3191	3196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372809
57	NC_014448	GAA	2	6	3230	3235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
58	NC_014448	TTC	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372809
59	NC_014448	GAA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
60	NC_014448	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372809
61	NC_014448	AAG	2	6	3790	3795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
62	NC_014448	GAA	2	6	3860	3865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
63	NC_014448	GCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372809
64	NC_014448	TAG	2	6	3882	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
65	NC_014448	AGA	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372809
66	NC_014448	TGA	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
67	NC_014448	ATG	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
68	NC_014448	TGA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372809
69	NC_014448	CTG	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304372809
70	NC_014448	ATT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
71	NC_014448	TAA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372810
72	NC_014448	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372810
73	NC_014448	AGA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
74	NC_014448	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
75	NC_014448	TAG	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372810
76	NC_014448	ATT	2	6	4690	4695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
77	NC_014448	AAG	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372810
78	NC_014448	ATT	2	6	4753	4758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
79	NC_014448	TAA	2	6	4865	4870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372810
80	NC_014448	ATT	2	6	4974	4979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372810
81	NC_014448	TAT	2	6	5087	5092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372811
82	NC_014448	TCA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372811
83	NC_014448	TTC	2	6	5205	5210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372811
84	NC_014448	GAA	3	9	5262	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372811
85	NC_014448	GAA	2	6	5274	5279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372811
86	NC_014448	CAT	2	6	5303	5308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372811
87	NC_014448	CAG	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372811
88	NC_014448	ATC	3	9	5389	5397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304372811
89	NC_014448	TGT	2	6	5399	5404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372811
90	NC_014448	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372811
91	NC_014448	TTC	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372811
92	NC_014448	GCT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304372811
93	NC_014448	TGA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372811
94	NC_014448	TGA	2	6	5501	5506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372811
95	NC_014448	ACA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372811
96	NC_014448	AGA	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372811
97	NC_014448	ACA	2	6	5812	5817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372811
98	NC_014448	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372811
99	NC_014448	TTA	2	6	5884	5889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372811
100	NC_014448	AGC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372811
101	NC_014448	AAG	2	6	5980	5985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372811
102	NC_014448	TAA	2	6	6027	6032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372811
103	NC_014448	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372812
104	NC_014448	CAA	2	6	6055	6060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372812
105	NC_014448	TAA	2	6	6156	6161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304372812
106	NC_014448	TTC	2	6	6203	6208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372812
107	NC_014448	AGA	2	6	6246	6251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372812
108	NC_014448	GTT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304372812
109	NC_014448	GAT	3	9	6361	6369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372812
110	NC_014448	TTC	2	6	6396	6401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304372812
111	NC_014448	AGC	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304372812
112	NC_014448	ATT	2	6	6751	6756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372812
113	NC_014448	AAG	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372812
114	NC_014448	AGT	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372812
115	NC_014448	GTG	2	6	6875	6880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304372812
116	NC_014448	TAT	2	6	6903	6908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372812
117	NC_014448	AGT	2	6	6933	6938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372812
118	NC_014448	TTA	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014448	TAA	2	6	7164	7169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014448	CTT	2	6	7173	7178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014448	TCT	2	6	7230	7235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014448	ATT	2	6	7241	7246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014448	AGT	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014448	CAA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014448	AGA	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014448	AAC	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014448	CTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014448	TAG	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014448	TAT	2	6	7744	7749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304372813
130	NC_014448	ACA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304372813
131	NC_014448	GTA	2	6	7844	7849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304372813
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133	NC_014448	AAG	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372813
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259	NC_014448	GAA	2	6	15343	15348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304372817
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388	NC_014448	ATA	2	6	24229	24234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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