MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyorhinis HUB-1 chromosome

Total Repeats: 13607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014448	CAT	2	6	307911	307916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373037
5002	NC_014448	TTG	2	6	308050	308055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373037
5003	NC_014448	ATC	2	6	308062	308067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373037
5004	NC_014448	TAA	2	6	308144	308149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373037
5005	NC_014448	AAT	2	6	308156	308161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373037
5006	NC_014448	ATT	2	6	308240	308245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373037
5007	NC_014448	CAA	2	6	308353	308358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373037
5008	NC_014448	TAG	2	6	308639	308644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373038
5009	NC_014448	ATC	2	6	308681	308686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373038
5010	NC_014448	ATT	2	6	308806	308811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373038
5011	NC_014448	ATT	2	6	308842	308847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373038
5012	NC_014448	ATC	2	6	308895	308900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373038
5013	NC_014448	TTG	2	6	308909	308914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373038
5014	NC_014448	TTA	2	6	308941	308946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373038
5015	NC_014448	TTA	2	6	309091	309096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373038
5016	NC_014448	TGA	2	6	309105	309110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373038
5017	NC_014448	GCA	2	6	309163	309168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304373038
5018	NC_014448	AGG	2	6	309191	309196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304373038
5019	NC_014448	TAA	2	6	309308	309313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373039
5020	NC_014448	CAA	2	6	309393	309398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373039
5021	NC_014448	TCA	2	6	309476	309481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373039
5022	NC_014448	GAA	2	6	309507	309512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373039
5023	NC_014448	ATT	2	6	309643	309648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373039
5024	NC_014448	TCT	2	6	309678	309683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373039
5025	NC_014448	ATT	2	6	309714	309719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373039
5026	NC_014448	TAA	2	6	309856	309861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365897171
5027	NC_014448	TCT	2	6	309863	309868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365897171
5028	NC_014448	ACA	2	6	309917	309922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365897171
5029	NC_014448	AGA	2	6	309928	309933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365897171
5030	NC_014448	ATT	2	6	310070	310075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373040
5031	NC_014448	ATG	2	6	310182	310187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373041
5032	NC_014448	CAA	2	6	310213	310218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373041
5033	NC_014448	AGA	2	6	310229	310234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373041
5034	NC_014448	TTA	2	6	310405	310410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373041
5035	NC_014448	TTC	2	6	310478	310483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373041
5036	NC_014448	GAA	2	6	310536	310541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373041
5037	NC_014448	TTG	2	6	310558	310563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373041
5038	NC_014448	ATT	2	6	310581	310586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373041
5039	NC_014448	GTT	2	6	310611	310616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373041
5040	NC_014448	ATT	2	6	310620	310625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373041
5041	NC_014448	CTT	2	6	310681	310686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373041
5042	NC_014448	CTG	2	6	310687	310692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	304373041
5043	NC_014448	GAA	2	6	310711	310716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373041
5044	NC_014448	TAA	3	9	310779	310787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373041
5045	NC_014448	ATG	2	6	310842	310847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014448	AAT	2	6	310856	310861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014448	TCT	2	6	310925	310930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373042
5048	NC_014448	CAA	3	9	310964	310972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373042
5049	NC_014448	TAA	2	6	310987	310992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373042
5050	NC_014448	TAA	2	6	311029	311034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373042
5051	NC_014448	AAC	2	6	311055	311060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373042
5052	NC_014448	ATT	2	6	311078	311083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373042
5053	NC_014448	GTA	2	6	311093	311098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373042
5054	NC_014448	ATT	2	6	311127	311132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373042
5055	NC_014448	GAA	2	6	311150	311155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373042
5056	NC_014448	AAT	2	6	311186	311191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373042
5057	NC_014448	GAA	2	6	311258	311263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373042
5058	NC_014448	ATT	2	6	311407	311412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014448	ACT	2	6	311474	311479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_014448	AGA	2	6	311674	311679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014448	TGG	2	6	311737	311742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014448	TGC	2	6	311834	311839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_014448	CAA	2	6	311848	311853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_014448	ATA	2	6	311911	311916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014448	ATT	2	6	311998	312003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014448	AAT	2	6	312079	312084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014448	GTT	2	6	312112	312117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014448	TAG	2	6	312283	312288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014448	TTC	2	6	312470	312475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_014448	TAA	2	6	312503	312508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014448	ACA	2	6	312529	312534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_014448	ATC	2	6	312566	312571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_014448	TAT	2	6	312680	312685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014448	TAA	3	9	312686	312694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014448	TTC	2	6	312767	312772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_014448	ATA	2	6	312812	312817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014448	ATT	2	6	312818	312823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014448	AAT	2	6	312886	312891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014448	TAA	2	6	312893	312898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_014448	TAA	2	6	312988	312993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014448	TAT	2	6	313023	313028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014448	CAA	2	6	313032	313037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_014448	ATT	2	6	313093	313098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373043
5084	NC_014448	ATT	2	6	313140	313145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373043
5085	NC_014448	AAG	2	6	313174	313179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373043
5086	NC_014448	ATT	2	6	313221	313226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373043
5087	NC_014448	TTA	2	6	313270	313275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373043
5088	NC_014448	GAA	2	6	313329	313334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373043
5089	NC_014448	TAA	2	6	313340	313345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373043
5090	NC_014448	TAA	3	9	313361	313369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373043
5091	NC_014448	GTT	2	6	313380	313385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373043
5092	NC_014448	AAT	2	6	313430	313435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373043
5093	NC_014448	TCT	2	6	313682	313687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	304373043
5094	NC_014448	TAA	3	9	313844	313852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373043
5095	NC_014448	CTA	2	6	314038	314043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373043
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5097	NC_014448	ATT	2	6	314356	314361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373044
5098	NC_014448	AAC	3	9	314442	314450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	304373044
5099	NC_014448	GAT	2	6	314637	314642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373044
5100	NC_014448	TTG	2	6	314659	314664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373044
5101	NC_014448	TAG	2	6	314734	314739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373044
5102	NC_014448	GAA	2	6	314770	314775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	304373044
5103	NC_014448	ACT	2	6	314911	314916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373044
5104	NC_014448	TGT	2	6	314930	314935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373044
5105	NC_014448	GAT	2	6	314991	314996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373044
5106	NC_014448	GAA	2	6	315049	315054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_014448	GTT	2	6	315067	315072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014448	TAG	2	6	315160	315165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014448	CAT	2	6	315286	315291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373045
5110	NC_014448	TGA	2	6	315321	315326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373045
5111	NC_014448	CAG	2	6	315443	315448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	304373045
5112	NC_014448	GTT	2	6	315454	315459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373045
5113	NC_014448	GGA	2	6	315478	315483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	304373045
5114	NC_014448	GGT	2	6	315514	315519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304373045
5115	NC_014448	AGT	2	6	315540	315545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	304373045
5116	NC_014448	TGG	2	6	315618	315623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304373045
5117	NC_014448	TAC	2	6	315678	315683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	304373045
5118	NC_014448	TAT	2	6	315708	315713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373045
5119	NC_014448	ATT	2	6	315739	315744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	304373045
5120	NC_014448	AAT	2	6	315811	315816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373045
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5122	NC_014448	AAT	2	6	315846	315851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	304373045
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5240	NC_014448	TGT	2	6	322557	322562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	304373048
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