MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 1144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	AATGT	2	10	441	450	40 %	40 %	20 %	0 %	294494691
2	NC_014002	TCTTT	2	10	2163	2172	0 %	80 %	0 %	20 %	294494693
3	NC_014002	GGTAT	2	10	2580	2589	20 %	40 %	40 %	0 %	294494693
4	NC_014002	TTTCA	2	10	2840	2849	20 %	60 %	0 %	20 %	294494693
5	NC_014002	CAGGA	2	10	3010	3019	40 %	0 %	40 %	20 %	294494693
6	NC_014002	ATGCC	2	10	4435	4444	20 %	20 %	20 %	40 %	294494694
7	NC_014002	AAGGG	2	10	4756	4765	40 %	0 %	60 %	0 %	294494695
8	NC_014002	AGGAT	2	10	8222	8231	40 %	20 %	40 %	0 %	294494698
9	NC_014002	AATGG	2	10	8274	8283	40 %	20 %	40 %	0 %	294494698
10	NC_014002	TCCGG	2	10	8341	8350	0 %	20 %	40 %	40 %	294494698
11	NC_014002	GGGAT	2	10	8658	8667	20 %	20 %	60 %	0 %	294494698
12	NC_014002	TTTGG	2	10	11023	11032	0 %	60 %	40 %	0 %	294494700
13	NC_014002	AGGAA	2	10	13542	13551	60 %	0 %	40 %	0 %	294494703
14	NC_014002	CTTCA	2	10	18880	18889	20 %	40 %	0 %	40 %	294494709
15	NC_014002	ATGAG	2	10	23074	23083	40 %	20 %	40 %	0 %	294494713
16	NC_014002	CGTTT	2	10	23091	23100	0 %	60 %	20 %	20 %	294494713
17	NC_014002	AGTGT	2	10	25365	25374	20 %	40 %	40 %	0 %	294494714
18	NC_014002	AGAGG	2	10	25564	25573	40 %	0 %	60 %	0 %	294494715
19	NC_014002	CTGCT	2	10	26362	26371	0 %	40 %	20 %	40 %	294494716
20	NC_014002	CCGTC	2	10	29102	29111	0 %	20 %	20 %	60 %	294494719
21	NC_014002	AAAGT	2	10	33017	33026	60 %	20 %	20 %	0 %	294494723
22	NC_014002	ATTCC	2	10	33343	33352	20 %	40 %	0 %	40 %	294494723
23	NC_014002	AAGGG	2	10	33648	33657	40 %	0 %	60 %	0 %	294494724
24	NC_014002	TGGAT	2	10	35157	35166	20 %	40 %	40 %	0 %	294494725
25	NC_014002	GGAAC	2	10	36878	36887	40 %	0 %	40 %	20 %	294494726
26	NC_014002	GGAAT	2	10	37115	37124	40 %	20 %	40 %	0 %	294494726
27	NC_014002	AAATT	2	10	39293	39302	60 %	40 %	0 %	0 %	294494726
28	NC_014002	GTAGA	2	10	42260	42269	40 %	20 %	40 %	0 %	294494728
29	NC_014002	CAATT	2	10	42666	42675	40 %	40 %	0 %	20 %	294494729
30	NC_014002	GTTTG	2	10	44644	44653	0 %	60 %	40 %	0 %	294494731
31	NC_014002	TCAAT	2	10	49307	49316	40 %	40 %	0 %	20 %	294494734
32	NC_014002	TAAAA	2	10	51964	51973	80 %	20 %	0 %	0 %	294494737
33	NC_014002	AACTG	2	10	58446	58455	40 %	20 %	20 %	20 %	294494742
34	NC_014002	CCTGT	2	10	59326	59335	0 %	40 %	20 %	40 %	294494742
35	NC_014002	CGGAT	2	10	60144	60153	20 %	20 %	40 %	20 %	294494743
36	NC_014002	GCAGA	2	10	60326	60335	40 %	0 %	40 %	20 %	294494743
37	NC_014002	ACCGA	2	10	60650	60659	40 %	0 %	20 %	40 %	294494743
38	NC_014002	AAAGT	2	10	63049	63058	60 %	20 %	20 %	0 %	294494745
39	NC_014002	CAGAG	2	10	63098	63107	40 %	0 %	40 %	20 %	294494745
40	NC_014002	TATTC	2	10	64029	64038	20 %	60 %	0 %	20 %	294494746
41	NC_014002	ATTTT	2	10	64266	64275	20 %	80 %	0 %	0 %	294494747
42	NC_014002	AAAAT	2	10	66961	66970	80 %	20 %	0 %	0 %	294494752
43	NC_014002	GGAAA	2	10	67518	67527	60 %	0 %	40 %	0 %	294494752
44	NC_014002	TGCTG	2	10	68258	68267	0 %	40 %	40 %	20 %	294494753
45	NC_014002	TGGGT	2	10	73888	73897	0 %	40 %	60 %	0 %	294494759
46	NC_014002	ATCCC	2	10	73985	73994	20 %	20 %	0 %	60 %	294494759
47	NC_014002	GATCA	2	10	76012	76021	40 %	20 %	20 %	20 %	294494761
48	NC_014002	TGAAT	2	10	78104	78113	40 %	40 %	20 %	0 %	294494762
49	NC_014002	CTCTT	2	10	78878	78887	0 %	60 %	0 %	40 %	294494762
50	NC_014002	TACCA	2	10	82404	82413	40 %	20 %	0 %	40 %	294494767
51	NC_014002	TTCTG	2	10	84425	84434	0 %	60 %	20 %	20 %	294494767
52	NC_014002	TATAT	2	10	90372	90381	40 %	60 %	0 %	0 %	294494772
53	NC_014002	TTCAA	2	10	91386	91395	40 %	40 %	0 %	20 %	294494773
54	NC_014002	TGGGG	2	10	92220	92229	0 %	20 %	80 %	0 %	294494774
55	NC_014002	AAAAG	2	10	93641	93650	80 %	0 %	20 %	0 %	294494776
56	NC_014002	AATTT	2	10	93680	93689	40 %	60 %	0 %	0 %	294494776
57	NC_014002	TAAAT	2	10	95620	95629	60 %	40 %	0 %	0 %	294494777
58	NC_014002	ATAAA	2	10	97142	97151	80 %	20 %	0 %	0 %	294494779
59	NC_014002	ATTTT	2	10	97272	97281	20 %	80 %	0 %	0 %	294494779
60	NC_014002	ACTTC	2	10	98787	98796	20 %	40 %	0 %	40 %	294494781
61	NC_014002	ACGAT	2	10	100797	100806	40 %	20 %	20 %	20 %	294494782
62	NC_014002	TTTAT	2	10	101302	101311	20 %	80 %	0 %	0 %	294494783
63	NC_014002	AGTAA	2	10	101850	101859	60 %	20 %	20 %	0 %	294494783
64	NC_014002	TTGAT	2	10	105727	105736	20 %	60 %	20 %	0 %	294494787
65	NC_014002	TGATC	2	10	108534	108543	20 %	40 %	20 %	20 %	294494790
66	NC_014002	CTTCC	2	10	111466	111475	0 %	40 %	0 %	60 %	294494793
67	NC_014002	TTTGT	2	10	117167	117176	0 %	80 %	20 %	0 %	294494793
68	NC_014002	TCCTC	2	10	123822	123831	0 %	40 %	0 %	60 %	294494795
69	NC_014002	TTGTA	2	10	124443	124452	20 %	60 %	20 %	0 %	294494795
70	NC_014002	GTTCA	2	10	126028	126037	20 %	40 %	20 %	20 %	294494795
71	NC_014002	CTGTG	2	10	126325	126334	0 %	40 %	40 %	20 %	294494795
72	NC_014002	ATTAC	2	10	126425	126434	40 %	40 %	0 %	20 %	294494795
73	NC_014002	CAATG	2	10	127009	127018	40 %	20 %	20 %	20 %	294494795
74	NC_014002	GAAAT	2	10	130891	130900	60 %	20 %	20 %	0 %	294494796
75	NC_014002	ACAAT	2	10	131434	131443	60 %	20 %	0 %	20 %	294494796
76	NC_014002	CAATT	2	10	131642	131651	40 %	40 %	0 %	20 %	294494796
77	NC_014002	AACAA	2	10	132409	132418	80 %	0 %	0 %	20 %	294494796
78	NC_014002	ATTTT	2	10	132834	132843	20 %	80 %	0 %	0 %	294494797
79	NC_014002	TTCAA	2	10	135577	135586	40 %	40 %	0 %	20 %	294494797
80	NC_014002	ATTGC	2	10	136774	136783	20 %	40 %	20 %	20 %	294494798
81	NC_014002	CCAAT	2	10	136898	136907	40 %	20 %	0 %	40 %	294494798
82	NC_014002	CAAGT	2	10	137724	137733	40 %	20 %	20 %	20 %	294494798
83	NC_014002	ATTCC	2	10	144154	144163	20 %	40 %	0 %	40 %	294494802
84	NC_014002	CCAGA	2	10	145196	145205	40 %	0 %	20 %	40 %	294494803
85	NC_014002	AAGTG	2	10	146089	146098	40 %	20 %	40 %	0 %	294494805
86	NC_014002	CTGTT	2	10	148715	148724	0 %	60 %	20 %	20 %	294494807
87	NC_014002	ATATC	2	10	148866	148875	40 %	40 %	0 %	20 %	294494807
88	NC_014002	AATAC	2	10	154705	154714	60 %	20 %	0 %	20 %	294494811
89	NC_014002	AACAC	2	10	156497	156506	60 %	0 %	0 %	40 %	294494814
90	NC_014002	GGGCG	2	10	159111	159120	0 %	0 %	80 %	20 %	294494817
91	NC_014002	TTTCA	2	10	159959	159968	20 %	60 %	0 %	20 %	294494818
92	NC_014002	ATGAT	2	10	162491	162500	40 %	40 %	20 %	0 %	294494821
93	NC_014002	TCCCA	2	10	165778	165787	20 %	20 %	0 %	60 %	294494823
94	NC_014002	GCCCA	2	10	166365	166374	20 %	0 %	20 %	60 %	294494824
95	NC_014002	CTGAA	2	10	167098	167107	40 %	20 %	20 %	20 %	294494826
96	NC_014002	CGTGC	2	10	171521	171530	0 %	20 %	40 %	40 %	294494829
97	NC_014002	TTCTG	2	10	172338	172347	0 %	60 %	20 %	20 %	294494830
98	NC_014002	TGAAT	2	10	175932	175941	40 %	40 %	20 %	0 %	294494833
99	NC_014002	CGGAA	2	10	180760	180769	40 %	0 %	40 %	20 %	294494838
100	NC_014002	CAATA	2	10	181152	181161	60 %	20 %	0 %	20 %	294494839
101	NC_014002	AAATG	2	10	181335	181344	60 %	20 %	20 %	0 %	294494839
102	NC_014002	CCTGA	2	10	182312	182321	20 %	20 %	20 %	40 %	294494840
103	NC_014002	CATCT	2	10	184075	184084	20 %	40 %	0 %	40 %	294494842
104	NC_014002	CTGAT	2	10	186034	186043	20 %	40 %	20 %	20 %	294494844
105	NC_014002	ATCTA	2	10	188775	188784	40 %	40 %	0 %	20 %	294494846
106	NC_014002	TCTTT	2	10	189062	189071	0 %	80 %	0 %	20 %	294494846
107	NC_014002	TACTT	2	10	190269	190278	20 %	60 %	0 %	20 %	294494848
108	NC_014002	CAGTC	2	10	190720	190729	20 %	20 %	20 %	40 %	294494848
109	NC_014002	TTATA	2	10	194098	194107	40 %	60 %	0 %	0 %	294494851
110	NC_014002	GTTTT	2	10	198613	198622	0 %	80 %	20 %	0 %	294494856
111	NC_014002	CTGGA	2	10	198926	198935	20 %	20 %	40 %	20 %	294494856
112	NC_014002	CCATT	2	10	200226	200235	20 %	40 %	0 %	40 %	294494856
113	NC_014002	AGTGA	2	10	201307	201316	40 %	20 %	40 %	0 %	294494857
114	NC_014002	CCCAG	2	10	202344	202353	20 %	0 %	20 %	60 %	294494859
115	NC_014002	TGGGG	2	10	204759	204768	0 %	20 %	80 %	0 %	294494861
116	NC_014002	TCCAC	2	10	205011	205020	20 %	20 %	0 %	60 %	294494862
117	NC_014002	TTTCT	2	10	205980	205989	0 %	80 %	0 %	20 %	294494863
118	NC_014002	AGGTA	2	10	206182	206191	40 %	20 %	40 %	0 %	294494863
119	NC_014002	ATGAA	2	10	210003	210012	60 %	20 %	20 %	0 %	294494868
120	NC_014002	GAGCA	2	10	211225	211234	40 %	0 %	40 %	20 %	294494870
121	NC_014002	GTCCT	2	10	212838	212847	0 %	40 %	20 %	40 %	294494872
122	NC_014002	CAGGG	2	10	216865	216874	20 %	0 %	60 %	20 %	294494875
123	NC_014002	TCTGA	2	10	219439	219448	20 %	40 %	20 %	20 %	294494878
124	NC_014002	GATCT	2	10	224836	224845	20 %	40 %	20 %	20 %	294494882
125	NC_014002	GTCAT	2	10	225878	225887	20 %	40 %	20 %	20 %	294494883
126	NC_014002	TTTGG	2	10	230180	230189	0 %	60 %	40 %	0 %	294494887
127	NC_014002	TTGAA	2	10	231367	231376	40 %	40 %	20 %	0 %	294494888
128	NC_014002	TTCCA	2	10	238428	238437	20 %	40 %	0 %	40 %	294494895
129	NC_014002	TGAGA	2	10	238478	238487	40 %	20 %	40 %	0 %	294494895
130	NC_014002	CTCCA	2	10	240860	240869	20 %	20 %	0 %	60 %	294494898
131	NC_014002	ACAAT	2	10	241331	241340	60 %	20 %	0 %	20 %	294494898
132	NC_014002	TCATT	2	10	243252	243261	20 %	60 %	0 %	20 %	294494901
133	NC_014002	CAATG	2	10	243759	243768	40 %	20 %	20 %	20 %	294494901
134	NC_014002	CGATT	2	10	245444	245453	20 %	40 %	20 %	20 %	294494902
135	NC_014002	GTAAT	2	10	246085	246094	40 %	40 %	20 %	0 %	294494902
136	NC_014002	ATCCC	2	10	247336	247345	20 %	20 %	0 %	60 %	294494905
137	NC_014002	GGATG	2	10	251102	251111	20 %	20 %	60 %	0 %	294494908
138	NC_014002	TGTAC	2	10	251940	251949	20 %	40 %	20 %	20 %	294494908
139	NC_014002	AGTGA	2	10	256503	256512	40 %	20 %	40 %	0 %	294494913
140	NC_014002	AGATC	2	10	257181	257190	40 %	20 %	20 %	20 %	294494914
141	NC_014002	CAACC	2	10	257367	257376	40 %	0 %	0 %	60 %	294494914
142	NC_014002	CAAAT	2	10	260162	260171	60 %	20 %	0 %	20 %	294494917
143	NC_014002	ATTTT	2	10	261243	261252	20 %	80 %	0 %	0 %	294494918
144	NC_014002	TACTG	2	10	262272	262281	20 %	40 %	20 %	20 %	294494919
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146	NC_014002	ATATT	2	10	267552	267561	40 %	60 %	0 %	0 %	294494925
147	NC_014002	GCACT	2	10	269809	269818	20 %	20 %	20 %	40 %	294494928
148	NC_014002	GCATG	2	10	269879	269888	20 %	20 %	40 %	20 %	294494928
149	NC_014002	AGGTC	2	10	275561	275570	20 %	20 %	40 %	20 %	294494935
150	NC_014002	CCTTG	2	10	275681	275690	0 %	40 %	20 %	40 %	294494935
151	NC_014002	ATGTT	2	10	277049	277058	20 %	60 %	20 %	0 %	294494935
152	NC_014002	ATTTT	2	10	277938	277947	20 %	80 %	0 %	0 %	294494937
153	NC_014002	AATAT	2	10	279284	279293	60 %	40 %	0 %	0 %	294494938
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156	NC_014002	TGTCC	2	10	281131	281140	0 %	40 %	20 %	40 %	294494940
157	NC_014002	ATTGG	2	10	281227	281236	20 %	40 %	40 %	0 %	294494940
158	NC_014002	TTCCC	2	10	281536	281545	0 %	40 %	0 %	60 %	294494940
159	NC_014002	CCTTT	2	10	284291	284300	0 %	60 %	0 %	40 %	294494944
160	NC_014002	TGATC	2	10	284865	284874	20 %	40 %	20 %	20 %	294494946
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168	NC_014002	AAAAG	2	10	291336	291345	80 %	0 %	20 %	0 %	294494952
169	NC_014002	GGCAG	2	10	295306	295315	20 %	0 %	60 %	20 %	294494958
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176	NC_014002	TTTCC	2	10	304646	304655	0 %	60 %	0 %	40 %	294494967
177	NC_014002	ATTCC	2	10	305079	305088	20 %	40 %	0 %	40 %	294494968
178	NC_014002	TCCCA	2	10	306540	306549	20 %	20 %	0 %	60 %	294494969
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213	NC_014002	CAACC	2	10	359544	359553	40 %	0 %	0 %	60 %	294495025
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252	NC_014002	CGGTG	2	10	424155	424164	0 %	20 %	60 %	20 %	294495089
253	NC_014002	GATCT	2	10	424944	424953	20 %	40 %	20 %	20 %	294495090
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257	NC_014002	TGCGG	2	10	437053	437062	0 %	20 %	60 %	20 %	294495100
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261	NC_014002	CGATT	2	10	462560	462569	20 %	40 %	20 %	20 %	294495124
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