MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 1144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014002	AATAA	2	10	901363	901372	80 %	20 %	0 %	0 %	294495555
502	NC_014002	TAAAA	2	10	902111	902120	80 %	20 %	0 %	0 %	294495557
503	NC_014002	GGATT	2	10	902499	902508	20 %	40 %	40 %	0 %	294495557
504	NC_014002	AAAAT	2	10	904318	904327	80 %	20 %	0 %	0 %	294495558
505	NC_014002	GCTCA	2	10	905253	905262	20 %	20 %	20 %	40 %	294495560
506	NC_014002	ATATC	2	10	905432	905441	40 %	40 %	0 %	20 %	294495560
507	NC_014002	GGTAT	2	10	910451	910460	20 %	40 %	40 %	0 %	294495566
508	NC_014002	GGGAA	2	10	913254	913263	40 %	0 %	60 %	0 %	294495567
509	NC_014002	GTATG	2	10	916087	916096	20 %	40 %	40 %	0 %	294495570
510	NC_014002	CGAGA	2	10	916262	916271	40 %	0 %	40 %	20 %	294495570
511	NC_014002	TCGGT	2	10	921271	921280	0 %	40 %	40 %	20 %	294495576
512	NC_014002	GTTTC	2	10	921298	921307	0 %	60 %	20 %	20 %	294495576
513	NC_014002	CCTGA	2	10	921570	921579	20 %	20 %	20 %	40 %	294495576
514	NC_014002	GGATT	2	10	924078	924087	20 %	40 %	40 %	0 %	294495577
515	NC_014002	TTGTA	2	10	924589	924598	20 %	60 %	20 %	0 %	294495578
516	NC_014002	CTGTG	2	10	924893	924902	0 %	40 %	40 %	20 %	294495578
517	NC_014002	CTTTT	2	10	927411	927420	0 %	80 %	0 %	20 %	294495581
518	NC_014002	ATGGA	2	10	928024	928033	40 %	20 %	40 %	0 %	294495581
519	NC_014002	AATAC	2	10	928217	928226	60 %	20 %	0 %	20 %	294495581
520	NC_014002	GCAGG	2	10	939242	939251	20 %	0 %	60 %	20 %	294495593
521	NC_014002	AGTAT	2	10	941741	941750	40 %	40 %	20 %	0 %	294495596
522	NC_014002	CTGAA	2	10	942387	942396	40 %	20 %	20 %	20 %	294495596
523	NC_014002	GATTT	2	10	943574	943583	20 %	60 %	20 %	0 %	294495596
524	NC_014002	CGTTT	2	10	948211	948220	0 %	60 %	20 %	20 %	294495601
525	NC_014002	CTTCT	2	10	949293	949302	0 %	60 %	0 %	40 %	294495601
526	NC_014002	AATTC	2	10	951522	951531	40 %	40 %	0 %	20 %	294495602
527	NC_014002	ATCTC	2	10	951600	951609	20 %	40 %	0 %	40 %	294495602
528	NC_014002	TGGTA	2	10	953257	953266	20 %	40 %	40 %	0 %	294495604
529	NC_014002	TTCAT	2	10	954045	954054	20 %	60 %	0 %	20 %	294495605
530	NC_014002	ATAAA	2	10	955155	955164	80 %	20 %	0 %	0 %	294495606
531	NC_014002	AAGAC	2	10	958216	958225	60 %	0 %	20 %	20 %	294495609
532	NC_014002	CAAAA	3	15	958709	958723	80 %	0 %	0 %	20 %	294495609
533	NC_014002	AAGGG	2	10	958864	958873	40 %	0 %	60 %	0 %	294495610
534	NC_014002	AGAAA	2	10	959036	959045	80 %	0 %	20 %	0 %	294495611
535	NC_014002	CTTCG	2	10	959635	959644	0 %	40 %	20 %	40 %	294495611
536	NC_014002	CAGCA	2	10	960978	960987	40 %	0 %	20 %	40 %	294495613
537	NC_014002	CCATA	2	10	963997	964006	40 %	20 %	0 %	40 %	294495616
538	NC_014002	GGATA	2	10	965269	965278	40 %	20 %	40 %	0 %	294495618
539	NC_014002	AGCGC	2	10	966253	966262	20 %	0 %	40 %	40 %	294495619
540	NC_014002	TCAAT	2	10	966956	966965	40 %	40 %	0 %	20 %	294495620
541	NC_014002	GGCTT	2	10	967226	967235	0 %	40 %	40 %	20 %	294495620
542	NC_014002	TCCCA	2	10	967811	967820	20 %	20 %	0 %	60 %	294495620
543	NC_014002	TATTT	2	10	971305	971314	20 %	80 %	0 %	0 %	294495625
544	NC_014002	ATTGT	2	10	971584	971593	20 %	60 %	20 %	0 %	294495626
545	NC_014002	TCCCA	2	10	973574	973583	20 %	20 %	0 %	60 %	294495627
546	NC_014002	TGCAG	2	10	973868	973877	20 %	20 %	40 %	20 %	294495627
547	NC_014002	TAATG	2	10	975369	975378	40 %	40 %	20 %	0 %	294495628
548	NC_014002	TTTCC	2	10	979501	979510	0 %	60 %	0 %	40 %	294495631
549	NC_014002	AGACA	2	10	981030	981039	60 %	0 %	20 %	20 %	294495632
550	NC_014002	CATCC	2	10	982168	982177	20 %	20 %	0 %	60 %	294495632
551	NC_014002	TGTAC	2	10	987037	987046	20 %	40 %	20 %	20 %	294495635
552	NC_014002	CCAAT	2	10	990799	990808	40 %	20 %	0 %	40 %	294495638
553	NC_014002	CATGT	2	10	997628	997637	20 %	40 %	20 %	20 %	294495643
554	NC_014002	TTCAG	2	10	998587	998596	20 %	40 %	20 %	20 %	294495644
555	NC_014002	GAAAA	2	10	999993	1000002	80 %	0 %	20 %	0 %	294495646
556	NC_014002	AAAAG	2	10	1001303	1001312	80 %	0 %	20 %	0 %	294495646
557	NC_014002	CGTAT	2	10	1004511	1004520	20 %	40 %	20 %	20 %	294495648
558	NC_014002	ACACC	2	10	1006166	1006175	40 %	0 %	0 %	60 %	294495650
559	NC_014002	AATAC	2	10	1006478	1006487	60 %	20 %	0 %	20 %	294495650
560	NC_014002	AAAAC	2	10	1008257	1008266	80 %	0 %	0 %	20 %	294495651
561	NC_014002	TCCAT	2	10	1008698	1008707	20 %	40 %	0 %	40 %	294495652
562	NC_014002	ACCAA	2	10	1009075	1009084	60 %	0 %	0 %	40 %	294495652
563	NC_014002	GAAAA	2	10	1011021	1011030	80 %	0 %	20 %	0 %	294495653
564	NC_014002	CTGTA	2	10	1011589	1011598	20 %	40 %	20 %	20 %	294495655
565	NC_014002	TATCC	2	10	1011774	1011783	20 %	40 %	0 %	40 %	294495655
566	NC_014002	AAATT	2	10	1011900	1011909	60 %	40 %	0 %	0 %	294495655
567	NC_014002	AATGA	2	10	1013265	1013274	60 %	20 %	20 %	0 %	294495657
568	NC_014002	TCAAT	2	10	1016749	1016758	40 %	40 %	0 %	20 %	294495663
569	NC_014002	CATTT	2	10	1019217	1019226	20 %	60 %	0 %	20 %	294495664
570	NC_014002	AGAGA	2	10	1025015	1025024	60 %	0 %	40 %	0 %	294495669
571	NC_014002	CCGAT	2	10	1026007	1026016	20 %	20 %	20 %	40 %	294495669
572	NC_014002	AGAAA	2	10	1026142	1026151	80 %	0 %	20 %	0 %	294495669
573	NC_014002	ATTGA	2	10	1029092	1029101	40 %	40 %	20 %	0 %	294495672
574	NC_014002	TGCAA	2	10	1029115	1029124	40 %	20 %	20 %	20 %	294495672
575	NC_014002	CAAAA	2	10	1029244	1029253	80 %	0 %	0 %	20 %	294495672
576	NC_014002	CCTGT	2	10	1032427	1032436	0 %	40 %	20 %	40 %	294495676
577	NC_014002	CTGCA	2	10	1032503	1032512	20 %	20 %	20 %	40 %	294495676
578	NC_014002	CCTTT	2	10	1033800	1033809	0 %	60 %	0 %	40 %	294495676
579	NC_014002	CAATC	2	10	1035662	1035671	40 %	20 %	0 %	40 %	294495678
580	NC_014002	CATGG	2	10	1037194	1037203	20 %	20 %	40 %	20 %	294495679
581	NC_014002	AAAGG	2	10	1038569	1038578	60 %	0 %	40 %	0 %	294495681
582	NC_014002	ATTTC	2	10	1038772	1038781	20 %	60 %	0 %	20 %	294495681
583	NC_014002	CCCTG	2	10	1039724	1039733	0 %	20 %	20 %	60 %	294495682
584	NC_014002	CATTT	2	10	1040845	1040854	20 %	60 %	0 %	20 %	294495683
585	NC_014002	TTTTA	2	10	1040937	1040946	20 %	80 %	0 %	0 %	294495683
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589	NC_014002	TGATC	2	10	1050936	1050945	20 %	40 %	20 %	20 %	294495689
590	NC_014002	GTTTT	2	10	1051928	1051937	0 %	80 %	20 %	0 %	294495690
591	NC_014002	CTGTG	2	10	1053050	1053059	0 %	40 %	40 %	20 %	294495692
592	NC_014002	GTACC	2	10	1054284	1054293	20 %	20 %	20 %	40 %	294495694
593	NC_014002	TCCAA	2	10	1054436	1054445	40 %	20 %	0 %	40 %	294495694
594	NC_014002	TCCCT	2	10	1057482	1057491	0 %	40 %	0 %	60 %	294495697
595	NC_014002	CAGAC	2	10	1058136	1058145	40 %	0 %	20 %	40 %	294495698
596	NC_014002	CTCTT	2	10	1059252	1059261	0 %	60 %	0 %	40 %	294495699
597	NC_014002	CTTCC	2	10	1060710	1060719	0 %	40 %	0 %	60 %	294495702
598	NC_014002	CCTCT	2	10	1061358	1061367	0 %	40 %	0 %	60 %	294495702
599	NC_014002	TTTCC	2	10	1061695	1061704	0 %	60 %	0 %	40 %	294495703
600	NC_014002	CGGGT	2	10	1061918	1061927	0 %	20 %	60 %	20 %	294495703
601	NC_014002	CACCT	2	10	1064042	1064051	20 %	20 %	0 %	60 %	294495706
602	NC_014002	GAAAA	2	10	1070660	1070669	80 %	0 %	20 %	0 %	294495710
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604	NC_014002	TGGAA	2	10	1071843	1071852	40 %	20 %	40 %	0 %	294495711
605	NC_014002	TTTTG	2	10	1072912	1072921	0 %	80 %	20 %	0 %	294495712
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607	NC_014002	CTTTT	2	10	1077290	1077299	0 %	80 %	0 %	20 %	294495715
608	NC_014002	ATCCA	2	10	1077332	1077341	40 %	20 %	0 %	40 %	294495715
609	NC_014002	ATACA	2	10	1079328	1079337	60 %	20 %	0 %	20 %	294495716
610	NC_014002	AACAG	2	10	1083501	1083510	60 %	0 %	20 %	20 %	294495718
611	NC_014002	AAGGA	2	10	1083695	1083704	60 %	0 %	40 %	0 %	294495718
612	NC_014002	TCGAA	2	10	1085001	1085010	40 %	20 %	20 %	20 %	294495719
613	NC_014002	GCAAA	2	10	1087499	1087508	60 %	0 %	20 %	20 %	294495721
614	NC_014002	ACAGA	2	10	1091036	1091045	60 %	0 %	20 %	20 %	294495725
615	NC_014002	TTCAT	2	10	1096919	1096928	20 %	60 %	0 %	20 %	294495729
616	NC_014002	TACCT	2	10	1097056	1097065	20 %	40 %	0 %	40 %	294495729
617	NC_014002	CAGTT	2	10	1097509	1097518	20 %	40 %	20 %	20 %	294495730
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619	NC_014002	GAAAG	2	10	1098086	1098095	60 %	0 %	40 %	0 %	294495732
620	NC_014002	GAAAT	2	10	1098115	1098124	60 %	20 %	20 %	0 %	294495732
621	NC_014002	CAAAA	2	10	1101675	1101684	80 %	0 %	0 %	20 %	294495735
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623	NC_014002	ATTTT	2	10	1102275	1102284	20 %	80 %	0 %	0 %	294495736
624	NC_014002	GAAAT	2	10	1104068	1104077	60 %	20 %	20 %	0 %	294495737
625	NC_014002	CAATT	2	10	1104583	1104592	40 %	40 %	0 %	20 %	294495737
626	NC_014002	AAATA	2	10	1104888	1104897	80 %	20 %	0 %	0 %	294495737
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