MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 3637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014002	AT	3	6	69	74	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014002	TA	3	6	140	145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014002	AT	3	6	1452	1457	50 %	50 %	0 %	0 %	294494692
4	NC_014002	AT	3	6	2444	2449	50 %	50 %	0 %	0 %	294494693
5	NC_014002	TC	3	6	3350	3355	0 %	50 %	0 %	50 %	294494693
6	NC_014002	TA	3	6	3622	3627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014002	CT	3	6	6055	6060	0 %	50 %	0 %	50 %	294494696
8	NC_014002	AC	3	6	6297	6302	50 %	0 %	0 %	50 %	294494696
9	NC_014002	TA	3	6	6515	6520	50 %	50 %	0 %	0 %	294494696
10	NC_014002	CA	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	294494698
11	NC_014002	TG	3	6	9365	9370	0 %	50 %	50 %	0 %	294494699
12	NC_014002	TG	3	6	11122	11127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014002	AT	3	6	11154	11159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014002	CT	3	6	11611	11616	0 %	50 %	0 %	50 %	294494701
15	NC_014002	CT	3	6	11813	11818	0 %	50 %	0 %	50 %	294494701
16	NC_014002	CA	3	6	12402	12407	50 %	0 %	0 %	50 %	294494702
17	NC_014002	GA	3	6	13240	13245	50 %	0 %	50 %	0 %	294494703
18	NC_014002	CT	3	6	13404	13409	0 %	50 %	0 %	50 %	294494703
19	NC_014002	GC	3	6	13929	13934	0 %	0 %	50 %	50 %	294494703
20	NC_014002	GT	3	6	14302	14307	0 %	50 %	50 %	0 %	294494704
21	NC_014002	AG	4	8	16009	16016	50 %	0 %	50 %	0 %	294494706
22	NC_014002	TC	3	6	17140	17145	0 %	50 %	0 %	50 %	294494707
23	NC_014002	TC	3	6	17587	17592	0 %	50 %	0 %	50 %	294494707
24	NC_014002	AG	3	6	17753	17758	50 %	0 %	50 %	0 %	294494708
25	NC_014002	CT	3	6	17830	17835	0 %	50 %	0 %	50 %	294494708
26	NC_014002	TA	3	6	18331	18336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014002	TA	3	6	18357	18362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014002	AT	3	6	18989	18994	50 %	50 %	0 %	0 %	294494709
29	NC_014002	AG	3	6	19494	19499	50 %	0 %	50 %	0 %	294494709
30	NC_014002	AT	3	6	19660	19665	50 %	50 %	0 %	0 %	294494709
31	NC_014002	TA	3	6	19723	19728	50 %	50 %	0 %	0 %	294494709
32	NC_014002	TC	3	6	19819	19824	0 %	50 %	0 %	50 %	294494709
33	NC_014002	GA	3	6	19974	19979	50 %	0 %	50 %	0 %	294494710
34	NC_014002	AT	3	6	20015	20020	50 %	50 %	0 %	0 %	294494710
35	NC_014002	TG	3	6	20246	20251	0 %	50 %	50 %	0 %	294494710
36	NC_014002	AT	3	6	21607	21612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014002	AT	4	8	21904	21911	50 %	50 %	0 %	0 %	294494712
38	NC_014002	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	294494713
39	NC_014002	TA	3	6	23663	23668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014002	AT	3	6	23756	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014002	AT	3	6	23918	23923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014002	TA	3	6	23940	23945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014002	AT	3	6	24206	24211	50 %	50 %	0 %	0 %	294494714
44	NC_014002	TG	3	6	24768	24773	0 %	50 %	50 %	0 %	294494714
45	NC_014002	TA	4	8	26099	26106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014002	TA	3	6	26453	26458	50 %	50 %	0 %	0 %	294494716
47	NC_014002	CT	5	10	27016	27025	0 %	50 %	0 %	50 %	294494716
48	NC_014002	AT	3	6	27107	27112	50 %	50 %	0 %	0 %	294494716
49	NC_014002	AT	3	6	28493	28498	50 %	50 %	0 %	0 %	294494718
50	NC_014002	AT	3	6	29462	29467	50 %	50 %	0 %	0 %	294494719
51	NC_014002	CT	3	6	30283	30288	0 %	50 %	0 %	50 %	294494720
52	NC_014002	CA	3	6	30821	30826	50 %	0 %	0 %	50 %	294494721
53	NC_014002	TA	4	8	31134	31141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014002	TC	3	6	31977	31982	0 %	50 %	0 %	50 %	294494722
55	NC_014002	AT	3	6	35678	35683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014002	AC	3	6	35891	35896	50 %	0 %	0 %	50 %	294494726
57	NC_014002	AG	3	6	36047	36052	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
58	NC_014002	TA	3	6	37130	37135	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
59	NC_014002	TC	3	6	37985	37990	0 %	50 %	0 %	50 %	294494726
60	NC_014002	GA	3	6	38090	38095	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
61	NC_014002	CT	3	6	38334	38339	0 %	50 %	0 %	50 %	294494726
62	NC_014002	TC	3	6	38638	38643	0 %	50 %	0 %	50 %	294494726
63	NC_014002	CT	3	6	38681	38686	0 %	50 %	0 %	50 %	294494726
64	NC_014002	AG	3	6	38831	38836	50 %	0 %	50 %	0 %	294494726
65	NC_014002	CT	3	6	39414	39419	0 %	50 %	0 %	50 %	294494726
66	NC_014002	TA	3	6	40338	40343	50 %	50 %	0 %	0 %	294494726
67	NC_014002	TA	3	6	42172	42177	50 %	50 %	0 %	0 %	294494728
68	NC_014002	GA	3	6	42268	42273	50 %	0 %	50 %	0 %	294494728
69	NC_014002	TA	3	6	42449	42454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014002	CA	3	6	42983	42988	50 %	0 %	0 %	50 %	294494729
71	NC_014002	TG	3	6	44359	44364	0 %	50 %	50 %	0 %	294494730
72	NC_014002	AC	3	6	44849	44854	50 %	0 %	0 %	50 %	294494731
73	NC_014002	AC	3	6	45871	45876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014002	AG	3	6	47029	47034	50 %	0 %	50 %	0 %	294494732
75	NC_014002	AT	3	6	47940	47945	50 %	50 %	0 %	0 %	294494733
76	NC_014002	AG	3	6	47970	47975	50 %	0 %	50 %	0 %	294494733
77	NC_014002	AC	3	6	48230	48235	50 %	0 %	0 %	50 %	294494733
78	NC_014002	TC	3	6	48914	48919	0 %	50 %	0 %	50 %	294494734
79	NC_014002	AT	3	6	49164	49169	50 %	50 %	0 %	0 %	294494734
80	NC_014002	AT	3	6	49315	49320	50 %	50 %	0 %	0 %	294494734
81	NC_014002	TA	3	6	49961	49966	50 %	50 %	0 %	0 %	294494735
82	NC_014002	CA	3	6	50872	50877	50 %	0 %	0 %	50 %	294494736
83	NC_014002	CT	3	6	51421	51426	0 %	50 %	0 %	50 %	294494737
84	NC_014002	TA	3	6	52755	52760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014002	AT	3	6	53492	53497	50 %	50 %	0 %	0 %	294494739
86	NC_014002	TA	3	6	54817	54822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014002	TA	3	6	54824	54829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014002	AT	3	6	54837	54842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014002	AT	3	6	54867	54872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014002	GA	3	6	55123	55128	50 %	0 %	50 %	0 %	294494740
91	NC_014002	TG	3	6	56062	56067	0 %	50 %	50 %	0 %	294494740
92	NC_014002	GA	3	6	56947	56952	50 %	0 %	50 %	0 %	294494741
93	NC_014002	TG	3	6	57617	57622	0 %	50 %	50 %	0 %	294494742
94	NC_014002	CA	3	6	57834	57839	50 %	0 %	0 %	50 %	294494742
95	NC_014002	CT	3	6	58838	58843	0 %	50 %	0 %	50 %	294494742
96	NC_014002	AT	3	6	62016	62021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014002	AT	3	6	62025	62030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014002	AT	3	6	62449	62454	50 %	50 %	0 %	0 %	294494745
99	NC_014002	TG	3	6	62533	62538	0 %	50 %	50 %	0 %	294494745
100	NC_014002	TC	3	6	63440	63445	0 %	50 %	0 %	50 %	294494745
101	NC_014002	TA	3	6	63701	63706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014002	AT	3	6	64327	64332	50 %	50 %	0 %	0 %	294494747
103	NC_014002	TC	3	6	65121	65126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014002	TG	3	6	65785	65790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014002	AT	3	6	65818	65823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014002	AT	3	6	66097	66102	50 %	50 %	0 %	0 %	294494750
107	NC_014002	AT	4	8	66565	66572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014002	TA	3	6	66699	66704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014002	AT	3	6	66846	66851	50 %	50 %	0 %	0 %	294494752
110	NC_014002	TG	4	8	67823	67830	0 %	50 %	50 %	0 %	294494752
111	NC_014002	AG	3	6	68099	68104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014002	AT	3	6	68463	68468	50 %	50 %	0 %	0 %	294494753
113	NC_014002	GT	3	6	69171	69176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014002	TA	4	8	69220	69227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014002	TA	3	6	69689	69694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014002	AT	3	6	69823	69828	50 %	50 %	0 %	0 %	294494755
117	NC_014002	AG	3	6	69898	69903	50 %	0 %	50 %	0 %	294494755
118	NC_014002	TC	3	6	70819	70824	0 %	50 %	0 %	50 %	294494756
119	NC_014002	AG	3	6	72143	72148	50 %	0 %	50 %	0 %	294494757
120	NC_014002	TC	3	6	72290	72295	0 %	50 %	0 %	50 %	294494757
121	NC_014002	AT	3	6	72307	72312	50 %	50 %	0 %	0 %	294494757
122	NC_014002	AT	3	6	72892	72897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014002	AT	3	6	73210	73215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014002	AT	3	6	74695	74700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014002	AT	3	6	74705	74710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014002	CA	3	6	74924	74929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014002	AT	3	6	75266	75271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014002	GA	4	8	75401	75408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014002	TA	3	6	76656	76661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014002	TA	4	8	77825	77832	50 %	50 %	0 %	0 %	294494762
131	NC_014002	CT	3	6	78143	78148	0 %	50 %	0 %	50 %	294494762
132	NC_014002	GT	3	6	79969	79974	0 %	50 %	50 %	0 %	294494764
133	NC_014002	TG	3	6	80314	80319	0 %	50 %	50 %	0 %	294494765
134	NC_014002	GA	3	6	80389	80394	50 %	0 %	50 %	0 %	294494765
135	NC_014002	AT	3	6	81948	81953	50 %	50 %	0 %	0 %	294494767
136	NC_014002	AT	3	6	82017	82022	50 %	50 %	0 %	0 %	294494767
137	NC_014002	AT	3	6	82083	82088	50 %	50 %	0 %	0 %	294494767
138	NC_014002	AC	3	6	82550	82555	50 %	0 %	0 %	50 %	294494767
139	NC_014002	CT	3	6	82654	82659	0 %	50 %	0 %	50 %	294494767
140	NC_014002	AG	3	6	82834	82839	50 %	0 %	50 %	0 %	294494767
141	NC_014002	AT	3	6	82869	82874	50 %	50 %	0 %	0 %	294494767
142	NC_014002	AT	3	6	84022	84027	50 %	50 %	0 %	0 %	294494767
143	NC_014002	AT	3	6	84600	84605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014002	TA	3	6	85812	85817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014002	AG	3	6	85932	85937	50 %	0 %	50 %	0 %	294494769
146	NC_014002	CT	3	6	86659	86664	0 %	50 %	0 %	50 %	294494769
147	NC_014002	AG	3	6	86837	86842	50 %	0 %	50 %	0 %	294494769
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