MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 3637

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014002	TA	3	6	1927757	1927762	50 %	50 %	0 %	0 %	294496603
3502	NC_014002	AT	4	8	1927995	1928002	50 %	50 %	0 %	0 %	294496603
3503	NC_014002	GA	3	6	1928011	1928016	50 %	0 %	50 %	0 %	294496603
3504	NC_014002	GA	3	6	1928972	1928977	50 %	0 %	50 %	0 %	294496604
3505	NC_014002	AT	3	6	1929168	1929173	50 %	50 %	0 %	0 %	294496604
3506	NC_014002	AT	3	6	1930586	1930591	50 %	50 %	0 %	0 %	294496605
3507	NC_014002	TA	4	8	1931124	1931131	50 %	50 %	0 %	0 %	294496606
3508	NC_014002	TG	3	6	1931370	1931375	0 %	50 %	50 %	0 %	294496606
3509	NC_014002	TA	4	8	1933218	1933225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014002	CA	3	6	1933259	1933264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_014002	AG	3	6	1934153	1934158	50 %	0 %	50 %	0 %	294496608
3512	NC_014002	AG	3	6	1934193	1934198	50 %	0 %	50 %	0 %	294496608
3513	NC_014002	CT	3	6	1935802	1935807	0 %	50 %	0 %	50 %	294496610
3514	NC_014002	GT	3	6	1938019	1938024	0 %	50 %	50 %	0 %	294496612
3515	NC_014002	AG	3	6	1938729	1938734	50 %	0 %	50 %	0 %	294496612
3516	NC_014002	TA	3	6	1939200	1939205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014002	AC	4	8	1940101	1940108	50 %	0 %	0 %	50 %	294496614
3518	NC_014002	TG	3	6	1941127	1941132	0 %	50 %	50 %	0 %	294496615
3519	NC_014002	GA	3	6	1941342	1941347	50 %	0 %	50 %	0 %	294496615
3520	NC_014002	GA	3	6	1941386	1941391	50 %	0 %	50 %	0 %	294496615
3521	NC_014002	AT	3	6	1941861	1941866	50 %	50 %	0 %	0 %	294496617
3522	NC_014002	TA	3	6	1942164	1942169	50 %	50 %	0 %	0 %	294496617
3523	NC_014002	CT	3	6	1942393	1942398	0 %	50 %	0 %	50 %	294496617
3524	NC_014002	CA	3	6	1943514	1943519	50 %	0 %	0 %	50 %	294496619
3525	NC_014002	AT	4	8	1945170	1945177	50 %	50 %	0 %	0 %	294496620
3526	NC_014002	AC	3	6	1945362	1945367	50 %	0 %	0 %	50 %	294496620
3527	NC_014002	AG	3	6	1945415	1945420	50 %	0 %	50 %	0 %	294496620
3528	NC_014002	AG	3	6	1945520	1945525	50 %	0 %	50 %	0 %	294496620
3529	NC_014002	AT	3	6	1945718	1945723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014002	GA	3	6	1945805	1945810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014002	TA	4	8	1947338	1947345	50 %	50 %	0 %	0 %	294496623
3532	NC_014002	GA	3	6	1949372	1949377	50 %	0 %	50 %	0 %	294496626
3533	NC_014002	AT	3	6	1950027	1950032	50 %	50 %	0 %	0 %	294496627
3534	NC_014002	TA	3	6	1950712	1950717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_014002	TG	3	6	1951249	1951254	0 %	50 %	50 %	0 %	294496628
3536	NC_014002	AT	3	6	1951455	1951460	50 %	50 %	0 %	0 %	294496628
3537	NC_014002	AG	3	6	1951672	1951677	50 %	0 %	50 %	0 %	294496629
3538	NC_014002	TG	3	6	1951769	1951774	0 %	50 %	50 %	0 %	294496629
3539	NC_014002	TG	3	6	1951976	1951981	0 %	50 %	50 %	0 %	294496629
3540	NC_014002	CA	3	6	1952088	1952093	50 %	0 %	0 %	50 %	294496629
3541	NC_014002	GT	3	6	1952569	1952574	0 %	50 %	50 %	0 %	294496630
3542	NC_014002	GA	3	6	1952602	1952607	50 %	0 %	50 %	0 %	294496630
3543	NC_014002	CA	3	6	1952806	1952811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_014002	AT	3	6	1952891	1952896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014002	AT	4	8	1952987	1952994	50 %	50 %	0 %	0 %	294496631
3546	NC_014002	AT	3	6	1953115	1953120	50 %	50 %	0 %	0 %	294496631
3547	NC_014002	AT	3	6	1954232	1954237	50 %	50 %	0 %	0 %	294496632
3548	NC_014002	GT	3	6	1954626	1954631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014002	GT	3	6	1955885	1955890	0 %	50 %	50 %	0 %	294496633
3550	NC_014002	AT	3	6	1956093	1956098	50 %	50 %	0 %	0 %	294496633
3551	NC_014002	TC	3	6	1956911	1956916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3552	NC_014002	AT	3	6	1957338	1957343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014002	TA	3	6	1959609	1959614	50 %	50 %	0 %	0 %	294496634
3554	NC_014002	GA	3	6	1960835	1960840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014002	AT	3	6	1962037	1962042	50 %	50 %	0 %	0 %	294496638
3556	NC_014002	AT	4	8	1962380	1962387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014002	TA	4	8	1962455	1962462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014002	AG	3	6	1962558	1962563	50 %	0 %	50 %	0 %	294496639
3559	NC_014002	CT	4	8	1963549	1963556	0 %	50 %	0 %	50 %	294496639
3560	NC_014002	AC	3	6	1964032	1964037	50 %	0 %	0 %	50 %	294496640
3561	NC_014002	TG	3	6	1964552	1964557	0 %	50 %	50 %	0 %	294496640
3562	NC_014002	AC	3	6	1964605	1964610	50 %	0 %	0 %	50 %	294496640
3563	NC_014002	TC	4	8	1965280	1965287	0 %	50 %	0 %	50 %	294496641
3564	NC_014002	GA	3	6	1966221	1966226	50 %	0 %	50 %	0 %	294496641
3565	NC_014002	GT	3	6	1966415	1966420	0 %	50 %	50 %	0 %	294496641
3566	NC_014002	AC	3	6	1967955	1967960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_014002	GC	3	6	1968923	1968928	0 %	0 %	50 %	50 %	294496642
3568	NC_014002	GA	3	6	1969000	1969005	50 %	0 %	50 %	0 %	294496642
3569	NC_014002	GC	3	6	1969652	1969657	0 %	0 %	50 %	50 %	294496642
3570	NC_014002	CA	3	6	1969803	1969808	50 %	0 %	0 %	50 %	294496642
3571	NC_014002	GC	3	6	1969900	1969905	0 %	0 %	50 %	50 %	294496642
3572	NC_014002	GC	3	6	1969982	1969987	0 %	0 %	50 %	50 %	294496642
3573	NC_014002	CA	3	6	1970515	1970520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_014002	AT	3	6	1970736	1970741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014002	AT	3	6	1970857	1970862	50 %	50 %	0 %	0 %	294496643
3576	NC_014002	AT	3	6	1971039	1971044	50 %	50 %	0 %	0 %	294496643
3577	NC_014002	TC	3	6	1971404	1971409	0 %	50 %	0 %	50 %	294496643
3578	NC_014002	TA	3	6	1971693	1971698	50 %	50 %	0 %	0 %	294496643
3579	NC_014002	TC	3	6	1971984	1971989	0 %	50 %	0 %	50 %	294496643
3580	NC_014002	TC	3	6	1972093	1972098	0 %	50 %	0 %	50 %	294496643
3581	NC_014002	AT	3	6	1972619	1972624	50 %	50 %	0 %	0 %	294496643
3582	NC_014002	AT	3	6	1972642	1972647	50 %	50 %	0 %	0 %	294496643
3583	NC_014002	AC	3	6	1972963	1972968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_014002	CT	3	6	1974565	1974570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_014002	TG	3	6	1975250	1975255	0 %	50 %	50 %	0 %	294496646
3586	NC_014002	AT	3	6	1975799	1975804	50 %	50 %	0 %	0 %	294496647
3587	NC_014002	AT	3	6	1976501	1976506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014002	CA	3	6	1978465	1978470	50 %	0 %	0 %	50 %	294496650
3589	NC_014002	CT	3	6	1979280	1979285	0 %	50 %	0 %	50 %	294496651
3590	NC_014002	AT	3	6	1979694	1979699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014002	TC	3	6	1980055	1980060	0 %	50 %	0 %	50 %	294496652
3592	NC_014002	AT	3	6	1981802	1981807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014002	CA	3	6	1982792	1982797	50 %	0 %	0 %	50 %	294496653
3594	NC_014002	AG	3	6	1982815	1982820	50 %	0 %	50 %	0 %	294496653
3595	NC_014002	AT	3	6	1983833	1983838	50 %	50 %	0 %	0 %	294496654
3596	NC_014002	TC	3	6	1984628	1984633	0 %	50 %	0 %	50 %	294496654
3597	NC_014002	GT	3	6	1985212	1985217	0 %	50 %	50 %	0 %	294496654
3598	NC_014002	GA	3	6	1985543	1985548	50 %	0 %	50 %	0 %	294496654
3599	NC_014002	CA	3	6	1987186	1987191	50 %	0 %	0 %	50 %	294496656
3600	NC_014002	AC	3	6	1987605	1987610	50 %	0 %	0 %	50 %	294496656
3601	NC_014002	AT	3	6	1987625	1987630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014002	AT	3	6	1987709	1987714	50 %	50 %	0 %	0 %	294496657
3603	NC_014002	AT	3	6	1987821	1987826	50 %	50 %	0 %	0 %	294496657
3604	NC_014002	AT	3	6	1989807	1989812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014002	AT	3	6	1990223	1990228	50 %	50 %	0 %	0 %	294496660
3606	NC_014002	TA	3	6	1990452	1990457	50 %	50 %	0 %	0 %	294496660
3607	NC_014002	AT	3	6	1990824	1990829	50 %	50 %	0 %	0 %	294496660
3608	NC_014002	CT	3	6	1991251	1991256	0 %	50 %	0 %	50 %	294496661
3609	NC_014002	TA	3	6	1991488	1991493	50 %	50 %	0 %	0 %	294496661
3610	NC_014002	AT	3	6	1992379	1992384	50 %	50 %	0 %	0 %	294496662
3611	NC_014002	CT	3	6	1992491	1992496	0 %	50 %	0 %	50 %	294496662
3612	NC_014002	CA	3	6	1992665	1992670	50 %	0 %	0 %	50 %	294496663
3613	NC_014002	GA	3	6	1993080	1993085	50 %	0 %	50 %	0 %	294496663
3614	NC_014002	TA	3	6	1993195	1993200	50 %	50 %	0 %	0 %	294496663
3615	NC_014002	AT	3	6	1993674	1993679	50 %	50 %	0 %	0 %	294496663
3616	NC_014002	AT	3	6	1993742	1993747	50 %	50 %	0 %	0 %	294496663
3617	NC_014002	TC	3	6	1996035	1996040	0 %	50 %	0 %	50 %	294496664
3618	NC_014002	TA	3	6	1998050	1998055	50 %	50 %	0 %	0 %	294496666
3619	NC_014002	CA	3	6	1998227	1998232	50 %	0 %	0 %	50 %	294496666
3620	NC_014002	GA	3	6	1998424	1998429	50 %	0 %	50 %	0 %	294496666
3621	NC_014002	TC	3	6	1999796	1999801	0 %	50 %	0 %	50 %	294496667
3622	NC_014002	CA	3	6	2001699	2001704	50 %	0 %	0 %	50 %	294496669
3623	NC_014002	AT	3	6	2001968	2001973	50 %	50 %	0 %	0 %	294496669
3624	NC_014002	AT	3	6	2002592	2002597	50 %	50 %	0 %	0 %	294496670
3625	NC_014002	CT	3	6	2002779	2002784	0 %	50 %	0 %	50 %	294496670
3626	NC_014002	CA	3	6	2003069	2003074	50 %	0 %	0 %	50 %	294496670
3627	NC_014002	TA	3	6	2004547	2004552	50 %	50 %	0 %	0 %	294496671
3628	NC_014002	GT	3	6	2005503	2005508	0 %	50 %	50 %	0 %	294496672
3629	NC_014002	AT	3	6	2007302	2007307	50 %	50 %	0 %	0 %	294496674
3630	NC_014002	AG	3	6	2008086	2008091	50 %	0 %	50 %	0 %	294496674
3631	NC_014002	GA	3	6	2008698	2008703	50 %	0 %	50 %	0 %	294496675
3632	NC_014002	AT	3	6	2009191	2009196	50 %	50 %	0 %	0 %	294496675
3633	NC_014002	TA	3	6	2010042	2010047	50 %	50 %	0 %	0 %	294496676
3634	NC_014002	AT	3	6	2010765	2010770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_014002	TA	3	6	2012195	2012200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_014002	CT	3	6	2012208	2012213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3637	NC_014002	TC	4	8	2012293	2012300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.