MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 18982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013926	AGT	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
2	NC_013926	AGA	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
3	NC_013926	TCC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595679
4	NC_013926	AGA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
5	NC_013926	TGA	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
6	NC_013926	GTT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595679
7	NC_013926	TGA	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
8	NC_013926	GAT	2	6	545	550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595679
9	NC_013926	CTT	3	9	563	571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595679
10	NC_013926	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
11	NC_013926	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595679
12	NC_013926	GAG	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595679
13	NC_013926	ACA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595679
14	NC_013926	TAC	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595679
15	NC_013926	AAG	2	6	1096	1101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
16	NC_013926	GAA	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595679
17	NC_013926	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
18	NC_013926	AAT	2	6	1225	1230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595679
19	NC_013926	CCT	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595680
20	NC_013926	TCT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
21	NC_013926	TAA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595680
22	NC_013926	CAA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
23	NC_013926	ATT	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
24	NC_013926	AAG	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595680
25	NC_013926	TAT	2	6	1793	1798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
26	NC_013926	TTC	2	6	1864	1869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
27	NC_013926	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
28	NC_013926	TGC	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595680
29	NC_013926	AGG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595680
30	NC_013926	TAT	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
31	NC_013926	AAC	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595680
32	NC_013926	TTA	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595680
33	NC_013926	TTC	2	6	2108	2113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595680
34	NC_013926	GGA	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595681
35	NC_013926	GTT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595681
36	NC_013926	GAT	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595681
37	NC_013926	AAG	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595681
38	NC_013926	AAT	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595681
39	NC_013926	TGA	2	6	2449	2454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595681
40	NC_013926	GAG	2	6	2507	2512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595681
41	NC_013926	CAT	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
42	NC_013926	TGA	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595682
43	NC_013926	TAC	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
44	NC_013926	AAT	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595682
45	NC_013926	TGG	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289595682
46	NC_013926	TGC	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595682
47	NC_013926	AAT	2	6	3072	3077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595682
48	NC_013926	AAG	3	9	3104	3112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595682
49	NC_013926	CAT	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595682
50	NC_013926	CCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595682
51	NC_013926	GTG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013926	GAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595683
53	NC_013926	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595683
54	NC_013926	TGT	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595683
55	NC_013926	ATG	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595683
56	NC_013926	AAT	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595684
57	NC_013926	GAG	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595684
58	NC_013926	CAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595684
59	NC_013926	TAT	2	6	4837	4842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
60	NC_013926	GTT	2	6	4843	4848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595684
61	NC_013926	GAT	3	9	4990	4998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595684
62	NC_013926	ACT	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595684
63	NC_013926	AGA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
64	NC_013926	TTG	2	6	5219	5224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595684
65	NC_013926	AGA	2	6	5352	5357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
66	NC_013926	CCA	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595684
67	NC_013926	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
68	NC_013926	AGG	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595684
69	NC_013926	TAA	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595684
70	NC_013926	GAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
71	NC_013926	ATG	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595684
72	NC_013926	AGA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
73	NC_013926	ATT	2	6	5981	5986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595684
74	NC_013926	AGA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595684
75	NC_013926	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595685
76	NC_013926	CTC	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595685
77	NC_013926	AGA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595685
78	NC_013926	ATG	2	6	6411	6416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595685
79	NC_013926	ATT	2	6	6420	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595685
80	NC_013926	AAT	2	6	6428	6433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595685
81	NC_013926	ATC	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595685
82	NC_013926	CAA	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595685
83	NC_013926	GAA	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595685
84	NC_013926	AGG	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595685
85	NC_013926	AAC	2	6	6731	6736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595685
86	NC_013926	AGG	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595685
87	NC_013926	AGA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595685
88	NC_013926	ATT	2	6	6839	6844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595685
89	NC_013926	GTT	2	6	6891	6896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595685
90	NC_013926	ATA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595685
91	NC_013926	AAT	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595685
92	NC_013926	GCA	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595685
93	NC_013926	AAT	2	6	6959	6964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595685
94	NC_013926	AGG	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595685
95	NC_013926	AAT	2	6	7105	7110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595686
96	NC_013926	AGA	2	6	7230	7235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595686
97	NC_013926	CTT	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595686
98	NC_013926	AAT	3	9	7459	7467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595686
99	NC_013926	GCT	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595686
100	NC_013926	TAT	2	6	7621	7626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595686
101	NC_013926	AAC	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595686
102	NC_013926	AAT	2	6	7750	7755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595686
103	NC_013926	AAT	2	6	7804	7809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595686
104	NC_013926	TTC	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595686
105	NC_013926	CAA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595687
106	NC_013926	ATG	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
107	NC_013926	TAA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595687
108	NC_013926	GCA	2	6	8038	8043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595687
109	NC_013926	TGA	2	6	8138	8143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
110	NC_013926	ACC	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595687
111	NC_013926	GAT	2	6	8190	8195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
112	NC_013926	ATG	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
113	NC_013926	ATA	2	6	8307	8312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595687
114	NC_013926	GAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595687
115	NC_013926	CTC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595687
116	NC_013926	AAG	2	6	8675	8680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595687
117	NC_013926	ATG	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
118	NC_013926	ACC	3	9	8817	8825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595687
119	NC_013926	TTC	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595687
120	NC_013926	TCC	2	6	8849	8854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595687
121	NC_013926	AGA	2	6	8876	8881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595687
122	NC_013926	TGA	2	6	9122	9127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
123	NC_013926	ATA	2	6	9300	9305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595687
124	NC_013926	AAT	2	6	9309	9314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595687
125	NC_013926	GAT	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595687
126	NC_013926	AGA	2	6	9524	9529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595687
127	NC_013926	AGA	2	6	9545	9550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595687
128	NC_013926	TAT	2	6	9553	9558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595687
129	NC_013926	TCC	2	6	9578	9583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595688
130	NC_013926	TTC	2	6	9584	9589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595688
131	NC_013926	CTT	2	6	9601	9606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595688
132	NC_013926	CTT	2	6	9672	9677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595688
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260	NC_013926	GAG	2	6	20685	20690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595692
261	NC_013926	TCC	2	6	20732	20737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595692
262	NC_013926	CTC	2	6	20776	20781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595692
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264	NC_013926	CTC	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595692
265	NC_013926	TTG	2	6	20834	20839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595692
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273	NC_013926	GAT	2	6	21393	21398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013926	TAA	2	6	21400	21405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_013926	TAT	2	6	22036	22041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595695
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285	NC_013926	TCC	3	9	22229	22237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595695
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294	NC_013926	CAA	2	6	22995	23000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595696
295	NC_013926	AAG	2	6	23009	23014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595696
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381	NC_013926	AAT	2	6	29903	29908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595698
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383	NC_013926	AAC	2	6	29971	29976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595698
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499	NC_013926	ACA	2	6	39246	39251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_013926	AGG	2	6	39259	39264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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