MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 18982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013926	ATT	2	6	315607	315612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595990
4002	NC_013926	ATT	2	6	315629	315634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013926	AAT	2	6	315697	315702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595991
4004	NC_013926	ATC	2	6	315749	315754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595991
4005	NC_013926	ATT	2	6	315907	315912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595991
4006	NC_013926	ATG	2	6	315914	315919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595991
4007	NC_013926	CAT	2	6	316027	316032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595991
4008	NC_013926	GTA	2	6	316061	316066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595991
4009	NC_013926	TGC	2	6	316105	316110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595991
4010	NC_013926	CTT	2	6	316124	316129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595991
4011	NC_013926	AGA	2	6	316212	316217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595991
4012	NC_013926	GGC	2	6	316298	316303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289595991
4013	NC_013926	TAT	2	6	316325	316330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595991
4014	NC_013926	TTC	2	6	316528	316533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595991
4015	NC_013926	TAA	2	6	316608	316613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595991
4016	NC_013926	GAG	2	6	316619	316624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595991
4017	NC_013926	TGA	2	6	316638	316643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595991
4018	NC_013926	AAG	2	6	316651	316656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289595991
4019	NC_013926	CCA	2	6	316688	316693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595991
4020	NC_013926	TGT	2	6	316714	316719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595991
4021	NC_013926	CAC	2	6	316755	316760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595991
4022	NC_013926	TAC	2	6	316775	316780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595991
4023	NC_013926	TAT	2	6	316841	316846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595991
4024	NC_013926	TAT	2	6	316857	316862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595991
4025	NC_013926	GTT	2	6	317006	317011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289595991
4026	NC_013926	CCG	2	6	317070	317075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289595991
4027	NC_013926	TAT	2	6	317193	317198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595991
4028	NC_013926	AAT	2	6	317501	317506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289595993
4029	NC_013926	TCT	2	6	317582	317587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595993
4030	NC_013926	ATT	2	6	317748	317753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595993
4031	NC_013926	TAT	2	6	317924	317929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595993
4032	NC_013926	TTA	2	6	318487	318492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595994
4033	NC_013926	ATT	2	6	318634	318639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595994
4034	NC_013926	TTC	2	6	318657	318662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595994
4035	NC_013926	TGA	2	6	318669	318674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289595994
4036	NC_013926	GCT	2	6	318736	318741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289595994
4037	NC_013926	CTT	2	6	318771	318776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595994
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4040	NC_013926	ATT	2	6	319027	319032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595994
4041	NC_013926	TAT	2	6	319076	319081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289595995
4042	NC_013926	CAC	2	6	319094	319099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595995
4043	NC_013926	CAA	2	6	319162	319167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595995
4044	NC_013926	CCT	2	6	319201	319206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595995
4045	NC_013926	CAA	2	6	319390	319395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595995
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4049	NC_013926	CAT	2	6	319789	319794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
4050	NC_013926	CAA	3	9	319824	319832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289595996
4051	NC_013926	ATC	2	6	319939	319944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
4052	NC_013926	GCG	2	6	319952	319957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289595996
4053	NC_013926	ATC	3	9	319972	319980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
4054	NC_013926	CAC	2	6	320029	320034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289595996
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4056	NC_013926	CAG	2	6	320142	320147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289595996
4057	NC_013926	TCA	2	6	320225	320230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
4058	NC_013926	CGC	2	6	320311	320316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289595996
4059	NC_013926	TTC	2	6	320334	320339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595996
4060	NC_013926	GAG	2	6	320519	320524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595996
4061	NC_013926	TAC	2	6	320632	320637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
4062	NC_013926	CTT	2	6	320710	320715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289595996
4063	NC_013926	CCT	2	6	320751	320756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595996
4064	NC_013926	TCC	2	6	320773	320778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289595996
4065	NC_013926	CAT	2	6	320883	320888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289595996
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4099	NC_013926	GGA	2	6	323398	323403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289595998
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4102	NC_013926	TAA	3	9	323795	323803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_013926	ATA	2	6	323826	323831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289596000
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4121	NC_013926	GAT	2	6	325015	325020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289596001
4122	NC_013926	ACC	2	6	325034	325039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289596001
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4129	NC_013926	TCT	2	6	325705	325710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289596002
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4132	NC_013926	CAA	2	6	325765	325770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289596002
4133	NC_013926	GAT	2	6	325857	325862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289596002
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4151	NC_013926	CCA	2	6	326954	326959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289596003
4152	NC_013926	CAT	2	6	327074	327079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289596003
4153	NC_013926	CTT	2	6	327097	327102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289596003
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4160	NC_013926	GGT	2	6	327694	327699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4161	NC_013926	CAT	2	6	327792	327797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289596004
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4361	NC_013926	CTT	2	6	341486	341491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289596014
4362	NC_013926	TCT	2	6	341498	341503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289596014
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4456	NC_013926	CAA	2	6	350149	350154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289596024
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4459	NC_013926	ACA	2	6	350382	350387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4460	NC_013926	AGG	2	6	350512	350517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289596025
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4463	NC_013926	AGC	2	6	350697	350702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289596025
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4471	NC_013926	CCT	2	6	351217	351222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289596026
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4476	NC_013926	TAT	2	6	351467	351472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289596026
4477	NC_013926	TAA	2	6	351507	351512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289596026
4478	NC_013926	CCT	2	6	351560	351565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289596026
4479	NC_013926	TGC	2	6	351580	351585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289596026
4480	NC_013926	GAT	2	6	351622	351627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289596026
4481	NC_013926	GAA	2	6	351872	351877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289596026
4482	NC_013926	GCA	2	6	352003	352008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289596026
4483	NC_013926	AGG	2	6	352058	352063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289596026
4484	NC_013926	CAA	2	6	352131	352136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289596026
4485	NC_013926	TGG	2	6	352146	352151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289596026
4486	NC_013926	AAT	2	6	352153	352158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289596026
4487	NC_013926	GTA	2	6	352258	352263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4488	NC_013926	TGC	2	6	352558	352563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289596027
4489	NC_013926	ATA	2	6	352733	352738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289596027
4490	NC_013926	CTG	2	6	352815	352820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289596027
4491	NC_013926	CCT	2	6	352925	352930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289596027
4492	NC_013926	GAT	2	6	352943	352948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289596027
4493	NC_013926	AGG	2	6	353098	353103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289596027
4494	NC_013926	GTT	2	6	353135	353140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289596027
4495	NC_013926	GAA	2	6	353225	353230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289596027
4496	NC_013926	AGA	2	6	353311	353316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289596027
4497	NC_013926	ATA	2	6	353481	353486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289596027
4498	NC_013926	CAG	2	6	353616	353621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289596027
4499	NC_013926	GCG	2	6	353651	353656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289596027
4500	NC_013926	GAG	2	6	353681	353686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289596027

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