MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 9459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	ATCA	2	8	268	275	50 %	25 %	0 %	25 %	288939765
2	NC_013851	TCGC	2	8	1389	1396	0 %	25 %	25 %	50 %	288939765
3	NC_013851	TGAG	2	8	1933	1940	25 %	25 %	50 %	0 %	288939766
4	NC_013851	GAGC	2	8	2345	2352	25 %	0 %	50 %	25 %	288939766
5	NC_013851	GCGT	2	8	2530	2537	0 %	25 %	50 %	25 %	288939766
6	NC_013851	GATG	2	8	2663	2670	25 %	25 %	50 %	0 %	288939766
7	NC_013851	AAGG	2	8	3209	3216	50 %	0 %	50 %	0 %	288939767
8	NC_013851	CGTG	2	8	3226	3233	0 %	25 %	50 %	25 %	288939767
9	NC_013851	CATC	2	8	3235	3242	25 %	25 %	0 %	50 %	288939767
10	NC_013851	TTCG	2	8	3447	3454	0 %	50 %	25 %	25 %	288939767
11	NC_013851	GGCC	2	8	3691	3698	0 %	0 %	50 %	50 %	288939767
12	NC_013851	CGTG	2	8	4555	4562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013851	CGCT	2	8	5162	5169	0 %	25 %	25 %	50 %	288939769
14	NC_013851	GTTG	2	8	5515	5522	0 %	50 %	50 %	0 %	288939769
15	NC_013851	GCGG	2	8	5793	5800	0 %	0 %	75 %	25 %	288939770
16	NC_013851	ATCC	2	8	6082	6089	25 %	25 %	0 %	50 %	288939770
17	NC_013851	ACGC	2	8	6496	6503	25 %	0 %	25 %	50 %	288939770
18	NC_013851	GGTC	2	8	6660	6667	0 %	25 %	50 %	25 %	288939770
19	NC_013851	GAGC	2	8	7010	7017	25 %	0 %	50 %	25 %	288939771
20	NC_013851	CCGC	2	8	7237	7244	0 %	0 %	25 %	75 %	288939771
21	NC_013851	GCCA	2	8	7288	7295	25 %	0 %	25 %	50 %	288939771
22	NC_013851	GCGG	2	8	8133	8140	0 %	0 %	75 %	25 %	288939771
23	NC_013851	CGCC	2	8	8171	8178	0 %	0 %	25 %	75 %	288939771
24	NC_013851	CGAC	2	8	8435	8442	25 %	0 %	25 %	50 %	288939771
25	NC_013851	CGCC	2	8	8576	8583	0 %	0 %	25 %	75 %	288939771
26	NC_013851	GCGG	2	8	8607	8614	0 %	0 %	75 %	25 %	288939771
27	NC_013851	TCAG	2	8	9142	9149	25 %	25 %	25 %	25 %	288939771
28	NC_013851	CCGC	2	8	9583	9590	0 %	0 %	25 %	75 %	288939772
29	NC_013851	CGAA	2	8	12241	12248	50 %	0 %	25 %	25 %	288939776
30	NC_013851	CTGG	2	8	12753	12760	0 %	25 %	50 %	25 %	288939776
31	NC_013851	GGCG	2	8	12761	12768	0 %	0 %	75 %	25 %	288939776
32	NC_013851	AGCC	2	8	12787	12794	25 %	0 %	25 %	50 %	288939776
33	NC_013851	CGGG	2	8	12839	12846	0 %	0 %	75 %	25 %	288939776
34	NC_013851	GATC	2	8	12854	12861	25 %	25 %	25 %	25 %	288939776
35	NC_013851	GACG	2	8	13224	13231	25 %	0 %	50 %	25 %	288939776
36	NC_013851	CTGC	2	8	13343	13350	0 %	25 %	25 %	50 %	288939777
37	NC_013851	CGAA	2	8	13540	13547	50 %	0 %	25 %	25 %	288939777
38	NC_013851	GCCA	2	8	14175	14182	25 %	0 %	25 %	50 %	288939777
39	NC_013851	CGGC	2	8	14288	14295	0 %	0 %	50 %	50 %	288939777
40	NC_013851	TCGC	2	8	14310	14317	0 %	25 %	25 %	50 %	288939777
41	NC_013851	TCAA	2	8	14491	14498	50 %	25 %	0 %	25 %	288939777
42	NC_013851	GCTC	2	8	14575	14582	0 %	25 %	25 %	50 %	288939778
43	NC_013851	CGGG	2	8	14594	14601	0 %	0 %	75 %	25 %	288939778
44	NC_013851	GTCG	2	8	15139	15146	0 %	25 %	50 %	25 %	288939778
45	NC_013851	CTCA	2	8	15664	15671	25 %	25 %	0 %	50 %	288939779
46	NC_013851	GCCG	2	8	16285	16292	0 %	0 %	50 %	50 %	288939779
47	NC_013851	GCTC	2	8	16878	16885	0 %	25 %	25 %	50 %	288939779
48	NC_013851	CCCG	2	8	17976	17983	0 %	0 %	25 %	75 %	288939779
49	NC_013851	GTCA	2	8	18289	18296	25 %	25 %	25 %	25 %	288939779
50	NC_013851	TCGG	2	8	18388	18395	0 %	25 %	50 %	25 %	288939779
51	NC_013851	TCAA	2	8	18452	18459	50 %	25 %	0 %	25 %	288939779
52	NC_013851	GTCG	2	8	18976	18983	0 %	25 %	50 %	25 %	288939780
53	NC_013851	CTGG	2	8	19039	19046	0 %	25 %	50 %	25 %	288939780
54	NC_013851	GGCC	2	8	19168	19175	0 %	0 %	50 %	50 %	288939781
55	NC_013851	CGTG	2	8	19321	19328	0 %	25 %	50 %	25 %	288939781
56	NC_013851	GTCG	2	8	19544	19551	0 %	25 %	50 %	25 %	288939782
57	NC_013851	GGCC	2	8	19656	19663	0 %	0 %	50 %	50 %	288939782
58	NC_013851	GGCT	2	8	19975	19982	0 %	25 %	50 %	25 %	288939782
59	NC_013851	CCGA	2	8	20137	20144	25 %	0 %	25 %	50 %	288939782
60	NC_013851	GATG	2	8	20901	20908	25 %	25 %	50 %	0 %	288939783
61	NC_013851	GTGC	2	8	21040	21047	0 %	25 %	50 %	25 %	288939783
62	NC_013851	CATC	2	8	21603	21610	25 %	25 %	0 %	50 %	288939783
63	NC_013851	ACTG	2	8	21866	21873	25 %	25 %	25 %	25 %	288939784
64	NC_013851	TGGT	2	8	23050	23057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013851	ACCG	2	8	23230	23237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013851	GCAG	2	8	23351	23358	25 %	0 %	50 %	25 %	288939786
67	NC_013851	CCGA	2	8	24311	24318	25 %	0 %	25 %	50 %	288939788
68	NC_013851	CCGG	3	12	24397	24408	0 %	0 %	50 %	50 %	288939788
69	NC_013851	CATC	2	8	24952	24959	25 %	25 %	0 %	50 %	288939789
70	NC_013851	GGTC	2	8	25090	25097	0 %	25 %	50 %	25 %	288939789
71	NC_013851	CCGG	2	8	25587	25594	0 %	0 %	50 %	50 %	288939790
72	NC_013851	GTCG	2	8	25836	25843	0 %	25 %	50 %	25 %	288939790
73	NC_013851	CGAC	2	8	25999	26006	25 %	0 %	25 %	50 %	288939790
74	NC_013851	CGCC	2	8	26194	26201	0 %	0 %	25 %	75 %	288939790
75	NC_013851	GAGC	2	8	26593	26600	25 %	0 %	50 %	25 %	288939790
76	NC_013851	GGAC	2	8	26812	26819	25 %	0 %	50 %	25 %	288939791
77	NC_013851	TCGC	2	8	26840	26847	0 %	25 %	25 %	50 %	288939791
78	NC_013851	CTGA	2	8	27002	27009	25 %	25 %	25 %	25 %	288939791
79	NC_013851	CTGG	2	8	27310	27317	0 %	25 %	50 %	25 %	288939791
80	NC_013851	CCAT	2	8	27471	27478	25 %	25 %	0 %	50 %	288939791
81	NC_013851	CGCC	2	8	28493	28500	0 %	0 %	25 %	75 %	288939792
82	NC_013851	CATC	2	8	28971	28978	25 %	25 %	0 %	50 %	288939793
83	NC_013851	CCGG	2	8	29321	29328	0 %	0 %	50 %	50 %	288939794
84	NC_013851	CTGG	2	8	29504	29511	0 %	25 %	50 %	25 %	288939794
85	NC_013851	GATC	2	8	29663	29670	25 %	25 %	25 %	25 %	288939794
86	NC_013851	ACGA	2	8	29888	29895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013851	TCGA	2	8	30039	30046	25 %	25 %	25 %	25 %	288939795
88	NC_013851	GCGG	2	8	30526	30533	0 %	0 %	75 %	25 %	288939795
89	NC_013851	CGGC	2	8	31177	31184	0 %	0 %	50 %	50 %	288939795
90	NC_013851	CGGG	2	8	31423	31430	0 %	0 %	75 %	25 %	288939795
91	NC_013851	CCTG	2	8	31472	31479	0 %	25 %	25 %	50 %	288939795
92	NC_013851	GTTC	2	8	31983	31990	0 %	50 %	25 %	25 %	288939795
93	NC_013851	CCAT	2	8	32026	32033	25 %	25 %	0 %	50 %	288939795
94	NC_013851	GCTG	2	8	33778	33785	0 %	25 %	50 %	25 %	288939795
95	NC_013851	TCAG	2	8	34085	34092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013851	GCTG	2	8	34762	34769	0 %	25 %	50 %	25 %	288939796
97	NC_013851	CCGG	2	8	35097	35104	0 %	0 %	50 %	50 %	288939796
98	NC_013851	GCTC	2	8	35452	35459	0 %	25 %	25 %	50 %	288939796
99	NC_013851	CGTG	2	8	35783	35790	0 %	25 %	50 %	25 %	288939797
100	NC_013851	GCCG	2	8	35952	35959	0 %	0 %	50 %	50 %	288939797
101	NC_013851	CGCC	2	8	36080	36087	0 %	0 %	25 %	75 %	288939797
102	NC_013851	CGGC	2	8	36179	36186	0 %	0 %	50 %	50 %	288939797
103	NC_013851	GCCA	2	8	36271	36278	25 %	0 %	25 %	50 %	288939797
104	NC_013851	CCGC	2	8	36927	36934	0 %	0 %	25 %	75 %	288939797
105	NC_013851	CGCC	2	8	37082	37089	0 %	0 %	25 %	75 %	288939797
106	NC_013851	TCGA	2	8	37186	37193	25 %	25 %	25 %	25 %	288939797
107	NC_013851	TCCG	2	8	37425	37432	0 %	25 %	25 %	50 %	288939797
108	NC_013851	TCGC	2	8	37582	37589	0 %	25 %	25 %	50 %	288939797
109	NC_013851	CTGA	2	8	38511	38518	25 %	25 %	25 %	25 %	288939797
110	NC_013851	GCCA	2	8	38884	38891	25 %	0 %	25 %	50 %	288939797
111	NC_013851	GATC	2	8	38963	38970	25 %	25 %	25 %	25 %	288939797
112	NC_013851	GTCC	2	8	39158	39165	0 %	25 %	25 %	50 %	288939797
113	NC_013851	TGCG	2	8	39890	39897	0 %	25 %	50 %	25 %	288939797
114	NC_013851	ACCG	2	8	39945	39952	25 %	0 %	25 %	50 %	288939797
115	NC_013851	GTCT	2	8	40271	40278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013851	GGCG	2	8	40363	40370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013851	TGCC	2	8	40615	40622	0 %	25 %	25 %	50 %	288939798
118	NC_013851	ATCG	2	8	40685	40692	25 %	25 %	25 %	25 %	288939798
119	NC_013851	GTCC	2	8	40909	40916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013851	TTGC	2	8	40981	40988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013851	GATC	2	8	40991	40998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013851	GCGA	2	8	41195	41202	25 %	0 %	50 %	25 %	288939799
123	NC_013851	GCTG	2	8	41964	41971	0 %	25 %	50 %	25 %	288939799
124	NC_013851	ACCG	2	8	42520	42527	25 %	0 %	25 %	50 %	288939800
125	NC_013851	GATC	2	8	42870	42877	25 %	25 %	25 %	25 %	288939801
126	NC_013851	CGCC	3	12	43657	43668	0 %	0 %	25 %	75 %	288939802
127	NC_013851	CAGT	2	8	43686	43693	25 %	25 %	25 %	25 %	288939802
128	NC_013851	GACC	2	8	44440	44447	25 %	0 %	25 %	50 %	288939802
129	NC_013851	CAGA	2	8	44699	44706	50 %	0 %	25 %	25 %	288939803
130	NC_013851	GCTG	2	8	44806	44813	0 %	25 %	50 %	25 %	288939803
131	NC_013851	CTTG	2	8	44975	44982	0 %	50 %	25 %	25 %	288939803
132	NC_013851	TCGC	2	8	45715	45722	0 %	25 %	25 %	50 %	288939804
133	NC_013851	CAAC	2	8	45987	45994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013851	CGAC	2	8	46611	46618	25 %	0 %	25 %	50 %	288939806
135	NC_013851	GCGT	2	8	47163	47170	0 %	25 %	50 %	25 %	288939807
136	NC_013851	ATCC	2	8	47407	47414	25 %	25 %	0 %	50 %	288939808
137	NC_013851	GTCG	2	8	47816	47823	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
138	NC_013851	CGGT	2	8	47869	47876	0 %	25 %	50 %	25 %	288939808
139	NC_013851	GACC	2	8	48464	48471	25 %	0 %	25 %	50 %	288939808
140	NC_013851	TCCG	2	8	48487	48494	0 %	25 %	25 %	50 %	288939808
141	NC_013851	CCGC	2	8	48826	48833	0 %	0 %	25 %	75 %	288939808
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