MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 9459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_013851	GCTG	2	8	574105	574112	0 %	25 %	50 %	25 %	288940246
1503	NC_013851	GATG	2	8	574895	574902	25 %	25 %	50 %	0 %	288940247
1504	NC_013851	CCGT	2	8	575759	575766	0 %	25 %	25 %	50 %	288940248
1505	NC_013851	ATGG	2	8	575818	575825	25 %	25 %	50 %	0 %	288940248
1506	NC_013851	TCGC	2	8	576254	576261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_013851	GGTG	2	8	578177	578184	0 %	25 %	75 %	0 %	288940250
1508	NC_013851	CGCC	2	8	579672	579679	0 %	0 %	25 %	75 %	288940251
1509	NC_013851	TCCT	2	8	579825	579832	0 %	50 %	0 %	50 %	288940251
1510	NC_013851	TGCG	2	8	579865	579872	0 %	25 %	50 %	25 %	288940251
1511	NC_013851	GAAC	2	8	581173	581180	50 %	0 %	25 %	25 %	288940251
1512	NC_013851	CGTG	2	8	581789	581796	0 %	25 %	50 %	25 %	288940253
1513	NC_013851	CGAT	2	8	581857	581864	25 %	25 %	25 %	25 %	288940253
1514	NC_013851	CCGA	2	8	582375	582382	25 %	0 %	25 %	50 %	288940253
1515	NC_013851	GATT	2	8	582466	582473	25 %	50 %	25 %	0 %	288940253
1516	NC_013851	ATTC	2	8	582476	582483	25 %	50 %	0 %	25 %	288940253
1517	NC_013851	GACC	2	8	582709	582716	25 %	0 %	25 %	50 %	288940254
1518	NC_013851	TCGT	2	8	582908	582915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_013851	CGAG	2	8	583311	583318	25 %	0 %	50 %	25 %	288940255
1520	NC_013851	CCGC	2	8	583357	583364	0 %	0 %	25 %	75 %	288940255
1521	NC_013851	CGCC	2	8	583920	583927	0 %	0 %	25 %	75 %	288940255
1522	NC_013851	AAGG	2	8	584474	584481	50 %	0 %	50 %	0 %	288940255
1523	NC_013851	ATCC	2	8	584744	584751	25 %	25 %	0 %	50 %	288940255
1524	NC_013851	AAGG	2	8	585065	585072	50 %	0 %	50 %	0 %	288940255
1525	NC_013851	GTTT	2	8	585240	585247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013851	ACGA	2	8	585536	585543	50 %	0 %	25 %	25 %	288940256
1527	NC_013851	GGCC	2	8	586786	586793	0 %	0 %	50 %	50 %	288940257
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1529	NC_013851	CGGC	2	8	587031	587038	0 %	0 %	50 %	50 %	288940257
1530	NC_013851	CGCT	2	8	588073	588080	0 %	25 %	25 %	50 %	288940258
1531	NC_013851	GGTG	2	8	588111	588118	0 %	25 %	75 %	0 %	288940258
1532	NC_013851	CGGC	2	8	588394	588401	0 %	0 %	50 %	50 %	288940259
1533	NC_013851	GGGC	2	8	588943	588950	0 %	0 %	75 %	25 %	288940260
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1537	NC_013851	AAGG	2	8	590213	590220	50 %	0 %	50 %	0 %	288940260
1538	NC_013851	CAGC	2	8	590251	590258	25 %	0 %	25 %	50 %	288940260
1539	NC_013851	CCGA	2	8	590261	590268	25 %	0 %	25 %	50 %	288940260
1540	NC_013851	TCTG	2	8	590307	590314	0 %	50 %	25 %	25 %	288940260
1541	NC_013851	TGGA	2	8	590513	590520	25 %	25 %	50 %	0 %	288940260
1542	NC_013851	GGAT	2	8	591015	591022	25 %	25 %	50 %	0 %	288940261
1543	NC_013851	GTGC	2	8	591112	591119	0 %	25 %	50 %	25 %	288940262
1544	NC_013851	CAGT	2	8	591120	591127	25 %	25 %	25 %	25 %	288940262
1545	NC_013851	TGCG	2	8	591136	591143	0 %	25 %	50 %	25 %	288940262
1546	NC_013851	TCCA	2	8	591289	591296	25 %	25 %	0 %	50 %	288940262
1547	NC_013851	CGCC	2	8	591411	591418	0 %	0 %	25 %	75 %	288940262
1548	NC_013851	CGCT	2	8	591623	591630	0 %	25 %	25 %	50 %	288940262
1549	NC_013851	AGCG	2	8	591956	591963	25 %	0 %	50 %	25 %	288940263
1550	NC_013851	CAGC	2	8	592085	592092	25 %	0 %	25 %	50 %	288940263
1551	NC_013851	CGGT	2	8	592113	592120	0 %	25 %	50 %	25 %	288940263
1552	NC_013851	GGCT	2	8	593225	593232	0 %	25 %	50 %	25 %	288940264
1553	NC_013851	CAGA	2	8	593255	593262	50 %	0 %	25 %	25 %	288940264
1554	NC_013851	GCCG	2	8	593474	593481	0 %	0 %	50 %	50 %	288940265
1555	NC_013851	ACGC	2	8	593510	593517	25 %	0 %	25 %	50 %	288940265
1556	NC_013851	ACCG	2	8	593822	593829	25 %	0 %	25 %	50 %	288940265
1557	NC_013851	GCCG	2	8	594167	594174	0 %	0 %	50 %	50 %	288940266
1558	NC_013851	CGGC	2	8	594335	594342	0 %	0 %	50 %	50 %	288940266
1559	NC_013851	CCGG	2	8	594469	594476	0 %	0 %	50 %	50 %	288940266
1560	NC_013851	GATC	2	8	594836	594843	25 %	25 %	25 %	25 %	288940267
1561	NC_013851	GAAC	2	8	595397	595404	50 %	0 %	25 %	25 %	288940268
1562	NC_013851	GCGA	2	8	595552	595559	25 %	0 %	50 %	25 %	288940268
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1565	NC_013851	CCGT	2	8	596647	596654	0 %	25 %	25 %	50 %	288940268
1566	NC_013851	GTCG	2	8	596655	596662	0 %	25 %	50 %	25 %	288940268
1567	NC_013851	GCCG	2	8	596859	596866	0 %	0 %	50 %	50 %	288940269
1568	NC_013851	GGTC	2	8	596935	596942	0 %	25 %	50 %	25 %	288940269
1569	NC_013851	GGAT	2	8	597385	597392	25 %	25 %	50 %	0 %	288940269
1570	NC_013851	GGCC	2	8	597567	597574	0 %	0 %	50 %	50 %	288940269
1571	NC_013851	CCGG	2	8	597697	597704	0 %	0 %	50 %	50 %	288940269
1572	NC_013851	TGGC	2	8	597773	597780	0 %	25 %	50 %	25 %	288940270
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1578	NC_013851	TGCG	2	8	599946	599953	0 %	25 %	50 %	25 %	288940272
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1580	NC_013851	GTCG	2	8	601056	601063	0 %	25 %	50 %	25 %	288940273
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1584	NC_013851	TGCG	2	8	601971	601978	0 %	25 %	50 %	25 %	288940274
1585	NC_013851	GTCC	2	8	602387	602394	0 %	25 %	25 %	50 %	288940274
1586	NC_013851	TCGG	2	8	602634	602641	0 %	25 %	50 %	25 %	288940274
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1592	NC_013851	CGGC	2	8	606480	606487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_013851	GGCT	2	8	606822	606829	0 %	25 %	50 %	25 %	288940278
1594	NC_013851	AGGA	2	8	607403	607410	50 %	0 %	50 %	0 %	288940278
1595	NC_013851	ACCC	2	8	607429	607436	25 %	0 %	0 %	75 %	288940278
1596	NC_013851	CGCC	2	8	607757	607764	0 %	0 %	25 %	75 %	288940278
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1599	NC_013851	GGCG	2	8	609273	609280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_013851	CGGC	2	8	609890	609897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_013851	ACCT	2	8	610312	610319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_013851	CGGC	2	8	610670	610677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_013851	AAGG	2	8	613629	613636	50 %	0 %	50 %	0 %	288940279
1604	NC_013851	CGCC	2	8	613868	613875	0 %	0 %	25 %	75 %	288940279
1605	NC_013851	ATTG	2	8	614957	614964	25 %	50 %	25 %	0 %	288940280
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1608	NC_013851	ACTT	2	8	617773	617780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_013851	GCAT	2	8	617968	617975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_013851	GACA	2	8	618475	618482	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_013851	AATG	2	8	619219	619226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013851	AGAA	2	8	619294	619301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013851	GGCG	2	8	619824	619831	0 %	0 %	75 %	25 %	288940284
1614	NC_013851	CCTT	2	8	620063	620070	0 %	50 %	0 %	50 %	288940284
1615	NC_013851	TGTC	2	8	621123	621130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_013851	GATG	2	8	621628	621635	25 %	25 %	50 %	0 %	288940285
1617	NC_013851	TGAT	2	8	622265	622272	25 %	50 %	25 %	0 %	288940286
1618	NC_013851	CGGC	2	8	622317	622324	0 %	0 %	50 %	50 %	288940286
1619	NC_013851	GCAC	2	8	624569	624576	25 %	0 %	25 %	50 %	288940286
1620	NC_013851	GGCG	2	8	624743	624750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_013851	GTCG	2	8	625251	625258	0 %	25 %	50 %	25 %	288940287
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1625	NC_013851	GATC	2	8	626935	626942	25 %	25 %	25 %	25 %	288940288
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1627	NC_013851	GCCC	2	8	628440	628447	0 %	0 %	25 %	75 %	288940288
1628	NC_013851	GATC	2	8	628534	628541	25 %	25 %	25 %	25 %	288940288
1629	NC_013851	GATC	2	8	628603	628610	25 %	25 %	25 %	25 %	288940288
1630	NC_013851	CAGC	2	8	629432	629439	25 %	0 %	25 %	50 %	288940288
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