MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 1027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013851	CGTG	2	8	4555	4562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013851	TGGT	2	8	23050	23057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013851	ACCG	2	8	23230	23237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013851	ACGA	2	8	29888	29895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013851	TCAG	2	8	34085	34092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013851	GTCT	2	8	40271	40278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013851	GGCG	2	8	40363	40370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013851	GTCC	2	8	40909	40916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013851	TTGC	2	8	40981	40988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013851	GATC	2	8	40991	40998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013851	CAAC	2	8	45987	45994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013851	CGGC	2	8	49037	49044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013851	GCCG	2	8	49946	49953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013851	CGGG	2	8	49976	49983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013851	ATGA	2	8	55368	55375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013851	CTCC	2	8	61304	61311	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013851	CCTC	2	8	63713	63720	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_013851	GTCT	2	8	65688	65695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013851	TCTG	2	8	69923	69930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013851	GGAT	2	8	73470	73477	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013851	TGCC	2	8	73539	73546	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013851	ATCG	2	8	75376	75383	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013851	GACG	2	8	82469	82476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013851	GATC	2	8	90053	90060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013851	TTTG	2	8	92892	92899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013851	AGCA	2	8	94134	94141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013851	GGCC	2	8	95946	95953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013851	GGCT	2	8	99748	99755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013851	GATC	2	8	103197	103204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013851	ATGG	2	8	103948	103955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013851	GCCG	2	8	104205	104212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013851	TCGG	2	8	107332	107339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013851	CGCT	2	8	109716	109723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013851	GAAA	2	8	112875	112882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013851	GTTG	2	8	113849	113856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013851	CCAG	2	8	114112	114119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013851	GCCT	2	8	114210	114217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013851	TTTG	2	8	114359	114366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013851	CGAC	2	8	114942	114949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013851	ACTT	2	8	115089	115096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013851	CGTC	2	8	115466	115473	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013851	AAAG	2	8	115589	115596	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013851	GCTG	2	8	115730	115737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013851	GTTG	2	8	115954	115961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013851	TGAT	2	8	116049	116056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013851	ACGG	2	8	117233	117240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013851	TCAC	2	8	117437	117444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013851	CCAG	2	8	121981	121988	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013851	ATGA	2	8	130533	130540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013851	GGAT	2	8	142068	142075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013851	CCAG	2	8	144079	144086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013851	TCGA	2	8	146110	146117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013851	GGTC	2	8	146156	146163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013851	GACC	2	8	149087	149094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013851	CGCC	2	8	149103	149110	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_013851	GACG	2	8	154301	154308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013851	GGAT	2	8	159646	159653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013851	TGGA	2	8	161709	161716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013851	CAGT	2	8	163809	163816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013851	TGAT	2	8	168118	168125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013851	ATCA	2	8	173833	173840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013851	TTCG	2	8	178689	178696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013851	GTGG	2	8	181849	181856	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013851	AGGC	2	8	181877	181884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013851	CGGG	2	8	181930	181937	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013851	CGAC	2	8	184384	184391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013851	CAAA	2	8	185950	185957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013851	GGTC	2	8	195561	195568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013851	TCGA	2	8	195661	195668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013851	CGGG	2	8	212385	212392	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013851	GATC	2	8	216380	216387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013851	CATC	2	8	217339	217346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013851	GGCG	2	8	221274	221281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013851	CATC	2	8	228021	228028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013851	GCAA	2	8	235642	235649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013851	ATCC	2	8	238609	238616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013851	CGGT	2	8	238638	238645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013851	TTTC	2	8	238765	238772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013851	CGGG	2	8	238948	238955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013851	CTGT	2	8	239677	239684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013851	GGGC	2	8	243261	243268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013851	GTAT	2	8	243371	243378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013851	GGAT	2	8	244309	244316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013851	CTTG	2	8	244809	244816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013851	AGTA	2	8	246036	246043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013851	TAAA	2	8	246307	246314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013851	TTTA	2	8	246688	246695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013851	GGTT	2	8	246867	246874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013851	CGCT	2	8	248808	248815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013851	CAGG	2	8	254880	254887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013851	TGAT	2	8	255577	255584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013851	CAAT	2	8	281422	281429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013851	CCTG	2	8	281514	281521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013851	CTTC	2	8	296420	296427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013851	AACG	2	8	306923	306930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013851	GGCG	2	8	311884	311891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013851	AGCC	2	8	316434	316441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013851	ACCC	2	8	319970	319977	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_013851	TGCG	2	8	319992	319999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013851	GAAT	2	8	320475	320482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013851	CTGC	2	8	323919	323926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013851	TCCG	2	8	325488	325495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013851	CGTC	2	8	325510	325517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013851	GGAA	2	8	336140	336147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013851	ATTC	2	8	338601	338608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013851	TCGA	2	8	357093	357100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013851	CAGA	2	8	359418	359425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013851	GGAC	2	8	369113	369120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013851	CTCA	2	8	384928	384935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013851	TCAT	2	8	387315	387322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013851	TCGG	2	8	391842	391849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013851	GGAT	2	8	393879	393886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013851	GGCT	2	8	400032	400039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013851	TGAG	2	8	402918	402925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013851	TGGA	2	8	404276	404283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013851	CCGC	2	8	405133	405140	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_013851	GCGA	2	8	408876	408883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013851	TGGC	2	8	410222	410229	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013851	CGGG	2	8	412742	412749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013851	ACGC	2	8	413793	413800	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013851	CTGG	2	8	414779	414786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013851	GCCG	2	8	418192	418199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013851	GCTT	2	8	419042	419049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013851	GCCT	2	8	426610	426617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013851	TTGT	2	8	428650	428657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013851	CAGC	2	8	428738	428745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013851	CCAC	2	8	437262	437269	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_013851	CAGT	2	8	438064	438071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013851	TCGA	2	8	445812	445819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013851	GCCA	2	8	445865	445872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013851	TAAA	2	8	447954	447961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013851	CCCT	2	8	451096	451103	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_013851	GTTG	2	8	464515	464522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013851	TGAG	2	8	464544	464551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013851	TCTT	2	8	469889	469896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013851	CCTA	2	8	478507	478514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013851	GTTC	2	8	478895	478902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013851	CGAT	2	8	479904	479911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013851	GCCA	2	8	481711	481718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013851	CGCT	2	8	481817	481824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013851	GAGC	2	8	481843	481850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013851	CGGC	2	8	481902	481909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013851	ATCT	2	8	481976	481983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013851	GTCC	2	8	495846	495853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013851	TCCC	2	8	498756	498763	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_013851	ATCG	2	8	506657	506664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013851	GATC	2	8	506690	506697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013851	AGTG	2	8	508925	508932	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013851	GGCC	2	8	508939	508946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013851	ACCC	2	8	508971	508978	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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481	NC_013851	GGTT	2	8	1592465	1592472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_013851	CGGC	2	8	1596157	1596164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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486	NC_013851	ATCC	2	8	1605382	1605389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
487	NC_013851	CGAG	2	8	1610963	1610970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_013851	TCGA	2	8	1622518	1622525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_013851	GCCC	2	8	1622675	1622682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
494	NC_013851	CGGA	2	8	1623119	1623126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_013851	TCGA	2	8	1633774	1633781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_013851	CGTT	2	8	1634052	1634059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_013851	CGCC	2	8	1639023	1639030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_013851	GCAG	2	8	1640170	1640177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_013851	GACG	2	8	1640748	1640755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_013851	CCCG	2	8	1643347	1643354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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