MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 1027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013851	CCGC	2	8	1645546	1645553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_013851	TCGA	2	8	1647161	1647168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_013851	TCGC	2	8	1650253	1650260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_013851	CTGA	2	8	1661032	1661039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_013851	GATC	2	8	1661067	1661074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_013851	TCGC	2	8	1661351	1661358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
507	NC_013851	TGGT	2	8	1661643	1661650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013851	GAGC	2	8	1671129	1671136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_013851	TCCC	2	8	1672559	1672566	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
510	NC_013851	TTGA	2	8	1677528	1677535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013851	GCCG	2	8	1679065	1679072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_013851	GGCC	2	8	1679104	1679111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_013851	TACA	2	8	1687797	1687804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_013851	AGCG	2	8	1691312	1691319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_013851	GCAA	2	8	1694936	1694943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_013851	TAGC	2	8	1694950	1694957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
517	NC_013851	GCTC	2	8	1695040	1695047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
518	NC_013851	CCGG	2	8	1696985	1696992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_013851	CGCC	2	8	1697027	1697034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
520	NC_013851	TTGG	2	8	1710431	1710438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013851	AATT	2	8	1715652	1715659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013851	TCAA	2	8	1715779	1715786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
523	NC_013851	GGCA	2	8	1728186	1728193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_013851	CGGG	2	8	1731289	1731296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
525	NC_013851	GGAC	2	8	1731302	1731309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_013851	GCTC	2	8	1735278	1735285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
527	NC_013851	CGAT	2	8	1735612	1735619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_013851	GGGA	2	8	1736848	1736855	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013851	TGCG	2	8	1740727	1740734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013851	GGGC	2	8	1740855	1740862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
531	NC_013851	TGGG	2	8	1745252	1745259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013851	TGCC	2	8	1749905	1749912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_013851	GTTC	2	8	1752155	1752162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_013851	GGTC	2	8	1758224	1758231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_013851	TCAT	2	8	1761033	1761040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_013851	ACAG	2	8	1763146	1763153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_013851	CCGG	2	8	1775215	1775222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_013851	TCGA	2	8	1778454	1778461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_013851	GGCG	2	8	1781594	1781601	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
540	NC_013851	GTCC	2	8	1781782	1781789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_013851	CAAC	2	8	1790653	1790660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_013851	GGCT	2	8	1795286	1795293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
543	NC_013851	AGCG	2	8	1804036	1804043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_013851	GCGG	2	8	1810042	1810049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
545	NC_013851	GGCA	2	8	1818047	1818054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
546	NC_013851	GATC	2	8	1821904	1821911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_013851	ACGC	2	8	1823025	1823032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013851	CGGG	2	8	1834530	1834537	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
549	NC_013851	GCTC	2	8	1835966	1835973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_013851	CGGA	2	8	1840985	1840992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
551	NC_013851	GGGC	2	8	1842505	1842512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
552	NC_013851	GATT	2	8	1842623	1842630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013851	AGCC	2	8	1853952	1853959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013851	GTTG	2	8	1859909	1859916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013851	ATCC	2	8	1867749	1867756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_013851	CAGA	2	8	1868955	1868962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_013851	TATT	2	8	1877407	1877414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013851	GGGC	2	8	1879754	1879761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
559	NC_013851	GTCG	2	8	1892259	1892266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_013851	CAAC	2	8	1894557	1894564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_013851	ACGC	2	8	1903856	1903863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_013851	GGGA	2	8	1904168	1904175	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013851	GGTG	2	8	1904542	1904549	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013851	GTCG	2	8	1905092	1905099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_013851	ATCG	2	8	1905835	1905842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_013851	ATCG	2	8	1905851	1905858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_013851	TTCC	2	8	1905899	1905906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_013851	ACGG	2	8	1908041	1908048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
569	NC_013851	ATCG	2	8	1908455	1908462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_013851	GCCG	2	8	1917485	1917492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_013851	CCGG	2	8	1918524	1918531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_013851	CGGT	2	8	1918588	1918595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_013851	CGCC	2	8	1918943	1918950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
574	NC_013851	ATCC	2	8	1919019	1919026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_013851	GGGT	2	8	1919294	1919301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013851	TCGA	2	8	1923223	1923230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_013851	AGGC	2	8	1924611	1924618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_013851	CAGC	2	8	1926568	1926575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_013851	CGGT	2	8	1928430	1928437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
580	NC_013851	CGGC	2	8	1929877	1929884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_013851	GCCG	2	8	1942012	1942019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_013851	GATC	2	8	1945685	1945692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_013851	TGGC	2	8	1946388	1946395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_013851	ATTT	2	8	1946447	1946454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013851	CAGC	2	8	1949786	1949793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_013851	AGCG	2	8	1949817	1949824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_013851	CATC	2	8	1952965	1952972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_013851	GCGG	2	8	1953722	1953729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
589	NC_013851	CGGA	2	8	1953960	1953967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
590	NC_013851	GTCC	2	8	1957132	1957139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
591	NC_013851	CGGT	2	8	1957244	1957251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_013851	TCGA	2	8	1963465	1963472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_013851	CGCC	2	8	1963749	1963756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
594	NC_013851	GCTG	2	8	1964068	1964075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_013851	CCTG	2	8	1964792	1964799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
596	NC_013851	CGGG	2	8	1964922	1964929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
597	NC_013851	ACGC	2	8	1965056	1965063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_013851	CGGA	2	8	1967266	1967273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_013851	CTTG	2	8	1967441	1967448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_013851	TGCC	2	8	1973931	1973938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
601	NC_013851	GGCG	2	8	1975770	1975777	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
602	NC_013851	CGGC	2	8	1975888	1975895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013851	GCGT	2	8	1975899	1975906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_013851	GGCG	2	8	1987357	1987364	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
605	NC_013851	CGAT	2	8	1992653	1992660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_013851	CATC	2	8	1998196	1998203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_013851	GGAA	2	8	1998994	1999001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013851	GGTT	2	8	1999223	1999230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013851	CGCT	2	8	1999764	1999771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_013851	GGAA	3	12	2011506	2011517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013851	GATC	2	8	2015867	2015874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_013851	GTGA	2	8	2022059	2022066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013851	CCGT	2	8	2022263	2022270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_013851	ATCA	2	8	2023446	2023453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_013851	CAAC	2	8	2023541	2023548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_013851	CCAG	2	8	2023764	2023771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
617	NC_013851	CTTT	2	8	2023906	2023913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_013851	GTCT	2	8	2024049	2024056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_013851	AGTG	2	8	2024272	2024279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013851	AAGT	2	8	2024406	2024413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013851	TCGG	3	12	2024550	2024561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
622	NC_013851	TCGC	2	8	2024733	2024740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_013851	ACAA	2	8	2025134	2025141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_013851	AGGC	2	8	2025284	2025291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_013851	CTGG	2	8	2025382	2025389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013851	CAAC	2	8	2025645	2025652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_013851	TTTC	2	8	2026618	2026625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_013851	GCCG	2	8	2028942	2028949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_013851	TTGC	2	8	2035429	2035436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_013851	TCGA	2	8	2054032	2054039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_013851	TTGG	2	8	2054054	2054061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013851	TCGA	2	8	2054338	2054345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_013851	ATAC	2	8	2054393	2054400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_013851	AAAT	2	8	2054631	2054638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013851	TCCA	2	8	2056255	2056262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_013851	GAAC	2	8	2085078	2085085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_013851	TTGG	2	8	2091613	2091620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013851	CATC	2	8	2111869	2111876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_013851	TCTA	2	8	2114454	2114461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
640	NC_013851	TCGA	2	8	2122947	2122954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
641	NC_013851	ACGC	2	8	2122995	2123002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
642	NC_013851	TCGA	2	8	2124662	2124669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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644	NC_013851	CTCG	2	8	2133503	2133510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
645	NC_013851	GACC	2	8	2134675	2134682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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657	NC_013851	CCGG	2	8	2185676	2185683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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661	NC_013851	ACTG	2	8	2199017	2199024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
662	NC_013851	CGGC	2	8	2199026	2199033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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677	NC_013851	TCGA	2	8	2281440	2281447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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686	NC_013851	TCGA	2	8	2316981	2316988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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763	NC_013851	TCGT	2	8	2610726	2610733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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922	NC_013851	TGGA	2	8	3126318	3126325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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