MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	TTCCC	2	10	722	731	0 %	40 %	0 %	60 %	284047387
2	NC_013740	TCCCT	2	10	1659	1668	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_013740	CTATA	2	10	1761	1770	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013740	GAACA	2	10	2102	2111	60 %	0 %	20 %	20 %	284047388
5	NC_013740	ACCAC	2	10	4033	4042	40 %	0 %	0 %	60 %	284047389
6	NC_013740	GGACC	2	10	4767	4776	20 %	0 %	40 %	40 %	284047390
7	NC_013740	CCGGC	2	10	5443	5452	0 %	0 %	40 %	60 %	284047390
8	NC_013740	ACATA	2	10	5579	5588	60 %	20 %	0 %	20 %	284047391
9	NC_013740	GTGCT	2	10	9997	10006	0 %	40 %	40 %	20 %	284047395
10	NC_013740	AATGA	2	10	10629	10638	60 %	20 %	20 %	0 %	284047396
11	NC_013740	TGCCC	2	10	10865	10874	0 %	20 %	20 %	60 %	284047396
12	NC_013740	AGATG	2	10	11120	11129	40 %	20 %	40 %	0 %	284047397
13	NC_013740	AGAAA	2	10	13878	13887	80 %	0 %	20 %	0 %	284047398
14	NC_013740	TCCAG	2	10	14385	14394	20 %	20 %	20 %	40 %	284047399
15	NC_013740	AAAAT	2	10	15303	15312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013740	GGCCA	2	10	16742	16751	20 %	0 %	40 %	40 %	284047400
17	NC_013740	CCTTT	2	10	17175	17184	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013740	CCATA	2	10	17221	17230	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013740	GATCA	2	10	17606	17615	40 %	20 %	20 %	20 %	284047401
20	NC_013740	AAAGA	2	10	18569	18578	80 %	0 %	20 %	0 %	284047401
21	NC_013740	TACGG	2	10	22566	22575	20 %	20 %	40 %	20 %	284047406
22	NC_013740	CTATA	2	10	24388	24397	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013740	TCGTG	2	10	25758	25767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013740	ACAAA	2	10	26357	26366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013740	TGATG	2	10	26375	26384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013740	GGGAA	2	10	26759	26768	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013740	GGGCT	2	10	29151	29160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013740	GGGCG	2	10	29975	29984	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013740	CCGAT	2	10	30507	30516	20 %	20 %	20 %	40 %	284047411
30	NC_013740	TTCTT	2	10	31272	31281	0 %	80 %	0 %	20 %	284047412
31	NC_013740	AAGGA	2	10	32487	32496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013740	GCTTC	2	10	33486	33495	0 %	40 %	20 %	40 %	284047414
33	NC_013740	TGCCC	2	10	34851	34860	0 %	20 %	20 %	60 %	284047415
34	NC_013740	ACGGG	2	10	35741	35750	20 %	0 %	60 %	20 %	284047415
35	NC_013740	CCTTC	2	10	37988	37997	0 %	40 %	0 %	60 %	284047418
36	NC_013740	GGTCC	2	10	38087	38096	0 %	20 %	40 %	40 %	284047418
37	NC_013740	ACGGA	2	10	40809	40818	40 %	0 %	40 %	20 %	284047420
38	NC_013740	TGAAC	2	10	41164	41173	40 %	20 %	20 %	20 %	284047420
39	NC_013740	CGAAG	2	10	43450	43459	40 %	0 %	40 %	20 %	284047420
40	NC_013740	CAGAT	2	10	43746	43755	40 %	20 %	20 %	20 %	284047420
41	NC_013740	CATAC	2	10	45973	45982	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013740	CTTCG	2	10	48919	48928	0 %	40 %	20 %	40 %	284047424
43	NC_013740	CGGGG	2	10	51546	51555	0 %	0 %	80 %	20 %	284047427
44	NC_013740	CTATA	2	10	57423	57432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013740	TCGTG	2	10	58793	58802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013740	ACAAA	2	10	59392	59401	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013740	TGATG	2	10	59410	59419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013740	GGGAA	2	10	59794	59803	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013740	GGGCT	2	10	62187	62196	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013740	GGGCG	2	10	63011	63020	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013740	TTTTA	2	10	64638	64647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013740	CAATT	2	10	64692	64701	40 %	40 %	0 %	20 %	284047433
53	NC_013740	GAAAA	2	10	66261	66270	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013740	CCGTC	2	10	67190	67199	0 %	20 %	20 %	60 %	284047434
55	NC_013740	TGGAC	2	10	68273	68282	20 %	20 %	40 %	20 %	284047435
56	NC_013740	GAGCA	2	10	68290	68299	40 %	0 %	40 %	20 %	284047435
57	NC_013740	GGGGC	2	10	70728	70737	0 %	0 %	80 %	20 %	284047438
58	NC_013740	GATGT	2	10	75616	75625	20 %	40 %	40 %	0 %	284047443
59	NC_013740	ATCGG	2	10	77082	77091	20 %	20 %	40 %	20 %	284047444
60	NC_013740	GGGTG	2	10	77833	77842	0 %	20 %	80 %	0 %	284047445
61	NC_013740	GGAAA	2	10	79352	79361	60 %	0 %	40 %	0 %	284047447
62	NC_013740	CTGGG	2	10	80396	80405	0 %	20 %	60 %	20 %	284047448
63	NC_013740	CCAAC	2	10	81014	81023	40 %	0 %	0 %	60 %	284047449
64	NC_013740	TCCGG	2	10	83335	83344	0 %	20 %	40 %	40 %	284047450
65	NC_013740	TGGGC	2	10	83551	83560	0 %	20 %	60 %	20 %	284047450
66	NC_013740	GTTCC	2	10	85412	85421	0 %	40 %	20 %	40 %	284047452
67	NC_013740	GCCCG	2	10	85864	85873	0 %	0 %	40 %	60 %	284047452
68	NC_013740	ACGGA	2	10	87041	87050	40 %	0 %	40 %	20 %	284047453
69	NC_013740	AGTAA	2	10	87268	87277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013740	GGAAC	3	15	87539	87553	40 %	0 %	40 %	20 %	284047454
71	NC_013740	GCCGG	3	15	89509	89523	0 %	0 %	60 %	40 %	284047455
72	NC_013740	AGAAA	2	10	94396	94405	80 %	0 %	20 %	0 %	284047460
73	NC_013740	CAGCG	2	10	94706	94715	20 %	0 %	40 %	40 %	284047460
74	NC_013740	TGAAC	2	10	96925	96934	40 %	20 %	20 %	20 %	284047463
75	NC_013740	CGGAA	2	10	98487	98496	40 %	0 %	40 %	20 %	284047463
76	NC_013740	AGTGA	2	10	103138	103147	40 %	20 %	40 %	0 %	284047467
77	NC_013740	GAAAT	2	10	103222	103231	60 %	20 %	20 %	0 %	284047467
78	NC_013740	ACCCC	2	10	103277	103286	20 %	0 %	0 %	80 %	284047467
79	NC_013740	GCCCG	2	10	105844	105853	0 %	0 %	40 %	60 %	284047469
80	NC_013740	AAGGT	2	10	107320	107329	40 %	20 %	40 %	0 %	284047471
81	NC_013740	TATGA	2	10	107441	107450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013740	AGGAA	2	10	107688	107697	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013740	ATTGT	2	10	107714	107723	20 %	60 %	20 %	0 %	284047472
84	NC_013740	GAACA	2	10	108344	108353	60 %	0 %	20 %	20 %	284047472
85	NC_013740	AAAGA	2	10	108947	108956	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013740	CAAAC	2	10	108958	108967	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013740	CCGGG	2	10	109953	109962	0 %	0 %	60 %	40 %	284047474
88	NC_013740	CCGGA	2	10	111106	111115	20 %	0 %	40 %	40 %	284047475
89	NC_013740	GGGCG	2	10	111399	111408	0 %	0 %	80 %	20 %	284047475
90	NC_013740	ATGAA	2	10	111733	111742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013740	CCTTC	2	10	112918	112927	0 %	40 %	0 %	60 %	284047477
92	NC_013740	CGGTG	2	10	113381	113390	0 %	20 %	60 %	20 %	284047478
93	NC_013740	CGGTG	2	10	113732	113741	0 %	20 %	60 %	20 %	284047479
94	NC_013740	TTTCC	2	10	114295	114304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013740	CTTCC	2	10	114489	114498	0 %	40 %	0 %	60 %	284047480
96	NC_013740	ATCTG	2	10	115573	115582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013740	TGGGG	2	10	116202	116211	0 %	20 %	80 %	0 %	284047481
98	NC_013740	CCATC	2	10	116796	116805	20 %	20 %	0 %	60 %	284047481
99	NC_013740	GGTCC	2	10	116862	116871	0 %	20 %	40 %	40 %	284047481
100	NC_013740	CTCTT	2	10	117940	117949	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013740	ACGCC	2	10	118843	118852	20 %	0 %	20 %	60 %	284047482
102	NC_013740	GTTTT	2	10	119420	119429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013740	TCCGG	2	10	124250	124259	0 %	20 %	40 %	40 %	284047488
104	NC_013740	GCCAG	2	10	126859	126868	20 %	0 %	40 %	40 %	284047490
105	NC_013740	AGGAC	2	10	127085	127094	40 %	0 %	40 %	20 %	284047491
106	NC_013740	GGAAC	2	10	127248	127257	40 %	0 %	40 %	20 %	284047491
107	NC_013740	CCAGG	2	10	130657	130666	20 %	0 %	40 %	40 %	284047496
108	NC_013740	GGGCA	2	10	132173	132182	20 %	0 %	60 %	20 %	284047498
109	NC_013740	ACGGC	2	10	132607	132616	20 %	0 %	40 %	40 %	284047498
110	NC_013740	GAACA	2	10	135830	135839	60 %	0 %	20 %	20 %	284047501
111	NC_013740	GCCCT	2	10	135911	135920	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
112	NC_013740	GCTCC	2	10	136074	136083	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
113	NC_013740	CCAGC	2	10	141285	141294	20 %	0 %	20 %	60 %	284047504
114	NC_013740	AAGGA	2	10	141557	141566	60 %	0 %	40 %	0 %	284047504
115	NC_013740	AAAGA	2	10	143296	143305	80 %	0 %	20 %	0 %	284047507
116	NC_013740	CCGTC	2	10	145192	145201	0 %	20 %	20 %	60 %	284047510
117	NC_013740	GGCCC	2	10	145680	145689	0 %	0 %	40 %	60 %	284047510
118	NC_013740	GTTCC	2	10	145971	145980	0 %	40 %	20 %	40 %	284047510
119	NC_013740	CCCTG	2	10	148111	148120	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_013740	TCCAG	2	10	148180	148189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013740	TGACC	2	10	149134	149143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013740	GAACG	2	10	151129	151138	40 %	0 %	40 %	20 %	284047514
123	NC_013740	TTCCA	2	10	151540	151549	20 %	40 %	0 %	40 %	284047514
124	NC_013740	GAAAA	2	10	152365	152374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013740	TGGAA	2	10	152617	152626	40 %	20 %	40 %	0 %	284047515
126	NC_013740	GTACG	2	10	153107	153116	20 %	20 %	40 %	20 %	284047515
127	NC_013740	TGCCC	2	10	153346	153355	0 %	20 %	20 %	60 %	284047515
128	NC_013740	CCGGG	2	10	155389	155398	0 %	0 %	60 %	40 %	284047516
129	NC_013740	GAACA	2	10	157350	157359	60 %	0 %	20 %	20 %	284047518
130	NC_013740	CACGG	2	10	159698	159707	20 %	0 %	40 %	40 %	284047520
131	NC_013740	CCCGG	2	10	159755	159764	0 %	0 %	40 %	60 %	284047520
132	NC_013740	GAAAT	2	10	159774	159783	60 %	20 %	20 %	0 %	284047520
133	NC_013740	TCCGG	2	10	160195	160204	0 %	20 %	40 %	40 %	284047520
134	NC_013740	GCCAG	2	10	161285	161294	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
135	NC_013740	CCGGA	2	10	161390	161399	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
136	NC_013740	GGACG	2	10	161475	161484	20 %	0 %	60 %	20 %	284047522
137	NC_013740	CCTGG	2	10	162657	162666	0 %	20 %	40 %	40 %	284047523
138	NC_013740	CCGGA	2	10	162933	162942	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
139	NC_013740	CGGTA	2	10	163104	163113	20 %	20 %	40 %	20 %	284047523
140	NC_013740	GGACC	2	10	163269	163278	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
141	NC_013740	TATGA	2	10	163727	163736	40 %	40 %	20 %	0 %	284047524
142	NC_013740	TCCGG	2	10	164101	164110	0 %	20 %	40 %	40 %	284047524
143	NC_013740	CGGGG	2	10	166056	166065	0 %	0 %	80 %	20 %	284047526
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152	NC_013740	TCGGA	2	10	174943	174952	20 %	20 %	40 %	20 %	284047535
153	NC_013740	GGACC	2	10	175031	175040	20 %	0 %	40 %	40 %	284047535
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157	NC_013740	TGGAA	2	10	178435	178444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_013740	GGACC	2	10	213378	213387	20 %	0 %	40 %	40 %	284047565
181	NC_013740	CCTGG	2	10	213990	213999	0 %	20 %	40 %	40 %	284047565
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198	NC_013740	ATAAA	2	10	252132	252141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_013740	CCATC	2	10	252618	252627	20 %	20 %	0 %	60 %	284047590
200	NC_013740	CTTTT	2	10	255183	255192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
201	NC_013740	GAAAT	2	10	256729	256738	60 %	20 %	20 %	0 %	284047593
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243	NC_013740	CATTT	2	10	315867	315876	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_013740	AGCGG	2	10	316691	316700	20 %	0 %	60 %	20 %	284047646
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259	NC_013740	CCCGG	2	10	333838	333847	0 %	0 %	40 %	60 %	284047663
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261	NC_013740	GACCT	2	10	335322	335331	20 %	20 %	20 %	40 %	284047665
262	NC_013740	TGAAG	2	10	336483	336492	40 %	20 %	40 %	0 %	284047666
263	NC_013740	CCAGG	2	10	336702	336711	20 %	0 %	40 %	40 %	284047666
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265	NC_013740	GGACC	2	10	341296	341305	20 %	0 %	40 %	40 %	284047670
266	NC_013740	CCCGG	2	10	342695	342704	0 %	0 %	40 %	60 %	284047672
267	NC_013740	CCGGC	2	10	343861	343870	0 %	0 %	40 %	60 %	284047674
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