MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013740	GTCCA	2	10	1331285	1331294	20 %	20 %	20 %	40 %	284048540
1002	NC_013740	GGCAC	2	10	1333317	1333326	20 %	0 %	40 %	40 %	284048542
1003	NC_013740	GGTCC	2	10	1336060	1336069	0 %	20 %	40 %	40 %	284048544
1004	NC_013740	CCCCG	2	10	1337241	1337250	0 %	0 %	20 %	80 %	284048546
1005	NC_013740	TTCCC	2	10	1337351	1337360	0 %	40 %	0 %	60 %	284048546
1006	NC_013740	CCCGG	2	10	1338717	1338726	0 %	0 %	40 %	60 %	284048548
1007	NC_013740	CAGAT	2	10	1339132	1339141	40 %	20 %	20 %	20 %	284048548
1008	NC_013740	TGCCG	2	10	1339206	1339215	0 %	20 %	40 %	40 %	284048548
1009	NC_013740	GGCTG	2	10	1340689	1340698	0 %	20 %	60 %	20 %	284048549
1010	NC_013740	CCGGG	2	10	1341233	1341242	0 %	0 %	60 %	40 %	284048549
1011	NC_013740	GCTCC	2	10	1343971	1343980	0 %	20 %	20 %	60 %	284048550
1012	NC_013740	ATGGA	2	10	1345313	1345322	40 %	20 %	40 %	0 %	284048551
1013	NC_013740	TGGGC	2	10	1346477	1346486	0 %	20 %	60 %	20 %	284048551
1014	NC_013740	GGTCA	2	10	1349474	1349483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_013740	AGGAA	2	10	1351281	1351290	60 %	0 %	40 %	0 %	284048554
1016	NC_013740	TGACC	2	10	1352031	1352040	20 %	20 %	20 %	40 %	284048557
1017	NC_013740	CAGGA	2	10	1352831	1352840	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_013740	CGGGC	2	10	1353192	1353201	0 %	0 %	60 %	40 %	284048559
1019	NC_013740	GCCCG	2	10	1357913	1357922	0 %	0 %	40 %	60 %	284048565
1020	NC_013740	TACTT	2	10	1360727	1360736	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_013740	CTTTG	2	10	1360933	1360942	0 %	60 %	20 %	20 %	284048568
1022	NC_013740	ACAGG	2	10	1365221	1365230	40 %	0 %	40 %	20 %	284048572
1023	NC_013740	CCGCC	2	10	1368452	1368461	0 %	0 %	20 %	80 %	284048575
1024	NC_013740	GGGCT	2	10	1370954	1370963	0 %	20 %	60 %	20 %	284048577
1025	NC_013740	TCCCG	2	10	1370974	1370983	0 %	20 %	20 %	60 %	284048577
1026	NC_013740	CCCTG	2	10	1374874	1374883	0 %	20 %	20 %	60 %	284048582
1027	NC_013740	TTTCC	2	10	1375912	1375921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_013740	CCCCG	2	10	1378388	1378397	0 %	0 %	20 %	80 %	284048586
1029	NC_013740	CCGTC	2	10	1379572	1379581	0 %	20 %	20 %	60 %	284048587
1030	NC_013740	TCCCG	2	10	1380828	1380837	0 %	20 %	20 %	60 %	284048587
1031	NC_013740	CCTTC	2	10	1382278	1382287	0 %	40 %	0 %	60 %	284048588
1032	NC_013740	AGTTC	2	10	1385998	1386007	20 %	40 %	20 %	20 %	284048592
1033	NC_013740	CCCTG	2	10	1390880	1390889	0 %	20 %	20 %	60 %	284048597
1034	NC_013740	CGTCC	2	10	1392811	1392820	0 %	20 %	20 %	60 %	284048597
1035	NC_013740	CAGGA	2	10	1393634	1393643	40 %	0 %	40 %	20 %	284048598
1036	NC_013740	AGGAA	2	10	1394285	1394294	60 %	0 %	40 %	0 %	284048598
1037	NC_013740	GTTCC	2	10	1395760	1395769	0 %	40 %	20 %	40 %	284048600
1038	NC_013740	GGCAT	2	10	1396745	1396754	20 %	20 %	40 %	20 %	284048600
1039	NC_013740	TGCTT	2	10	1396837	1396846	0 %	60 %	20 %	20 %	284048600
1040	NC_013740	TCCTG	2	10	1397239	1397248	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_013740	GAAAC	2	10	1397564	1397573	60 %	0 %	20 %	20 %	284048601
1042	NC_013740	GGAAA	2	10	1398557	1398566	60 %	0 %	40 %	0 %	284048602
1043	NC_013740	TCCGG	2	10	1399966	1399975	0 %	20 %	40 %	40 %	284048604
1044	NC_013740	GGTCC	2	10	1400198	1400207	0 %	20 %	40 %	40 %	284048604
1045	NC_013740	ACTAT	2	10	1402038	1402047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_013740	TCCTT	2	10	1402466	1402475	0 %	60 %	0 %	40 %	284048606
1047	NC_013740	CCTGG	2	10	1402620	1402629	0 %	20 %	40 %	40 %	284048606
1048	NC_013740	CGTTC	2	10	1407477	1407486	0 %	40 %	20 %	40 %	284048610
1049	NC_013740	AAAGG	2	10	1408510	1408519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013740	CGTAT	2	10	1411651	1411660	20 %	40 %	20 %	20 %	284048614
1051	NC_013740	CGGCA	2	10	1412359	1412368	20 %	0 %	40 %	40 %	284048615
1052	NC_013740	CCGGC	2	10	1416059	1416068	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1053	NC_013740	CCATG	2	10	1423544	1423553	20 %	20 %	20 %	40 %	284048622
1054	NC_013740	TTCTA	2	10	1424718	1424727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_013740	TTTTA	2	10	1425544	1425553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013740	TTCCG	2	10	1426460	1426469	0 %	40 %	20 %	40 %	284048626
1057	NC_013740	TCCCC	2	10	1428096	1428105	0 %	20 %	0 %	80 %	284048630
1058	NC_013740	TTTTC	2	10	1428111	1428120	0 %	80 %	0 %	20 %	284048630
1059	NC_013740	AACGG	2	10	1430180	1430189	40 %	0 %	40 %	20 %	284048632
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1063	NC_013740	GGCCC	2	10	1440174	1440183	0 %	0 %	40 %	60 %	284048642
1064	NC_013740	TTTCC	2	10	1441425	1441434	0 %	60 %	0 %	40 %	284048643
1065	NC_013740	GGATG	2	10	1443707	1443716	20 %	20 %	60 %	0 %	284048645
1066	NC_013740	AGACA	2	10	1444860	1444869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_013740	AGGCC	2	10	1447276	1447285	20 %	0 %	40 %	40 %	284048650
1068	NC_013740	GCCGG	2	10	1447532	1447541	0 %	0 %	60 %	40 %	284048650
1069	NC_013740	ATTTC	2	10	1448967	1448976	20 %	60 %	0 %	20 %	284048652
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1071	NC_013740	CCGGG	2	10	1452961	1452970	0 %	0 %	60 %	40 %	284048654
1072	NC_013740	TGGAA	2	10	1456733	1456742	40 %	20 %	40 %	0 %	284048657
1073	NC_013740	GGCCT	2	10	1459523	1459532	0 %	20 %	40 %	40 %	284048658
1074	NC_013740	TTTCC	2	10	1462397	1462406	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_013740	GTCCA	2	10	1463088	1463097	20 %	20 %	20 %	40 %	284048660
1076	NC_013740	CTGTT	2	10	1463477	1463486	0 %	60 %	20 %	20 %	284048660
1077	NC_013740	AAAGG	2	10	1464226	1464235	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013740	AGGCC	2	10	1464860	1464869	20 %	0 %	40 %	40 %	284048662
1079	NC_013740	AAAAG	2	10	1465410	1465419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013740	CGTCA	2	10	1467659	1467668	20 %	20 %	20 %	40 %	284048664
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1083	NC_013740	GCAAT	2	10	1471355	1471364	40 %	20 %	20 %	20 %	284048667
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1087	NC_013740	CGGTC	2	10	1472676	1472685	0 %	20 %	40 %	40 %	284048669
1088	NC_013740	CTTCC	2	10	1475606	1475615	0 %	40 %	0 %	60 %	284048670
1089	NC_013740	GGACC	2	10	1477535	1477544	20 %	0 %	40 %	40 %	284048670
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1092	NC_013740	GCCAT	2	10	1482970	1482979	20 %	20 %	20 %	40 %	284048674
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1094	NC_013740	CCGGT	2	10	1487841	1487850	0 %	20 %	40 %	40 %	284048678
1095	NC_013740	CCGGG	2	10	1488645	1488654	0 %	0 %	60 %	40 %	284048678
1096	NC_013740	CCTTC	2	10	1489333	1489342	0 %	40 %	0 %	60 %	284048679
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1098	NC_013740	CAGGG	2	10	1490788	1490797	20 %	0 %	60 %	20 %	284048681
1099	NC_013740	TCCTT	2	10	1491926	1491935	0 %	60 %	0 %	40 %	284048682
1100	NC_013740	CATGG	2	10	1492563	1492572	20 %	20 %	40 %	20 %	284048683
1101	NC_013740	TATAC	2	10	1494451	1494460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_013740	GCCGG	2	10	1495077	1495086	0 %	0 %	60 %	40 %	284048685
1103	NC_013740	CCGGA	2	10	1495233	1495242	20 %	0 %	40 %	40 %	284048685
1104	NC_013740	GGGCA	2	10	1496192	1496201	20 %	0 %	60 %	20 %	284048686
1105	NC_013740	CGTCA	2	10	1496828	1496837	20 %	20 %	20 %	40 %	284048686
1106	NC_013740	TCTCC	2	10	1498272	1498281	0 %	40 %	0 %	60 %	284048688
1107	NC_013740	CACGG	2	10	1499190	1499199	20 %	0 %	40 %	40 %	284048689
1108	NC_013740	TCACG	2	10	1501241	1501250	20 %	20 %	20 %	40 %	284048691
1109	NC_013740	GTACG	2	10	1507607	1507616	20 %	20 %	40 %	20 %	284048697
1110	NC_013740	TATAT	2	10	1510064	1510073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013740	CTTTT	2	10	1510147	1510156	0 %	80 %	0 %	20 %	284048699
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1114	NC_013740	TCCAT	2	10	1518147	1518156	20 %	40 %	0 %	40 %	284048706
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1118	NC_013740	GTTCC	2	10	1521265	1521274	0 %	40 %	20 %	40 %	284048707
1119	NC_013740	TGCTC	2	10	1521886	1521895	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1120	NC_013740	AGCAC	2	10	1522812	1522821	40 %	0 %	20 %	40 %	284048708
1121	NC_013740	GCCAG	2	10	1523547	1523556	20 %	0 %	40 %	40 %	284048708
1122	NC_013740	GTCCC	2	10	1524429	1524438	0 %	20 %	20 %	60 %	284048709
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1124	NC_013740	TCCGT	2	10	1525235	1525244	0 %	40 %	20 %	40 %	284048710
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1246	NC_013740	CAGCC	2	10	1712461	1712470	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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1248	NC_013740	TTCCC	2	10	1714855	1714864	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1249	NC_013740	TTTGT	2	10	1715257	1715266	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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