MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 37324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	AGG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013740	TGG	2	6	50	55	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047387
3	NC_013740	GAA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
4	NC_013740	GTG	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047387
5	NC_013740	GGC	3	9	231	239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047387
6	NC_013740	CAA	2	6	252	257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047387
7	NC_013740	CTT	2	6	279	284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047387
8	NC_013740	TGA	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
9	NC_013740	GAA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
10	NC_013740	TGC	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047387
11	NC_013740	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
12	NC_013740	TCC	2	6	494	499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047387
13	NC_013740	GAA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
14	NC_013740	CAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047387
15	NC_013740	ATC	3	9	568	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047387
16	NC_013740	CCG	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047387
17	NC_013740	GAT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
18	NC_013740	CCG	2	6	650	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047387
19	NC_013740	TCC	2	6	692	697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047387
20	NC_013740	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
21	NC_013740	CTG	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047387
22	NC_013740	CAG	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
23	NC_013740	CAG	3	9	919	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047387
24	NC_013740	CGG	2	6	982	987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047387
25	NC_013740	GAT	2	6	1002	1007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047387
26	NC_013740	GAA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
27	NC_013740	CAT	2	6	1089	1094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047387
28	NC_013740	AGG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047387
29	NC_013740	GAA	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047387
30	NC_013740	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013740	CTC	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013740	CCG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013740	CTT	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013740	TTC	2	6	1871	1876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013740	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
36	NC_013740	AGC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
37	NC_013740	TGC	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
38	NC_013740	CAG	2	6	2198	2203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
39	NC_013740	ACC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047388
40	NC_013740	CTG	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
41	NC_013740	GCC	2	6	2327	2332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047388
42	NC_013740	CAG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
43	NC_013740	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047388
44	NC_013740	CAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047388
45	NC_013740	CCG	2	6	2397	2402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047388
46	NC_013740	CGG	2	6	2412	2417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047388
47	NC_013740	TGA	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047388
48	NC_013740	GCG	2	6	2474	2479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047388
49	NC_013740	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
50	NC_013740	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047388
51	NC_013740	CCG	2	6	2636	2641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013740	ATG	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
53	NC_013740	GAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
54	NC_013740	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047389
55	NC_013740	CAT	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
56	NC_013740	GAA	2	6	2943	2948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
57	NC_013740	TGG	2	6	2995	3000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
58	NC_013740	CGG	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047389
59	NC_013740	TGA	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
60	NC_013740	TGC	2	6	3421	3426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047389
61	NC_013740	CGA	2	6	3431	3436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047389
62	NC_013740	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
63	NC_013740	TTC	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047389
64	NC_013740	ATC	3	9	3519	3527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
65	NC_013740	GCC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047389
66	NC_013740	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
67	NC_013740	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047389
68	NC_013740	TCC	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047389
69	NC_013740	CCA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047389
70	NC_013740	TGG	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
71	NC_013740	GGA	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047389
72	NC_013740	TCC	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047389
73	NC_013740	TGG	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047389
74	NC_013740	GAA	2	6	4130	4135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047389
75	NC_013740	ATG	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047389
76	NC_013740	TTG	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013740	CTA	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013740	AGG	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013740	ATG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047390
80	NC_013740	GAG	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047390
81	NC_013740	CTG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047390
82	NC_013740	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047390
83	NC_013740	GAA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047390
84	NC_013740	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047390
85	NC_013740	CCA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047390
86	NC_013740	GCA	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047390
87	NC_013740	GGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047390
88	NC_013740	TAT	2	6	5094	5099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047390
89	NC_013740	TCC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047390
90	NC_013740	ACA	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047390
91	NC_013740	ATC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047390
92	NC_013740	TTC	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047390
93	NC_013740	GCT	2	6	5534	5539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
94	NC_013740	CTG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
95	NC_013740	CGG	2	6	5647	5652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
96	NC_013740	GAG	2	6	5682	5687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
97	NC_013740	GGA	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
98	NC_013740	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
99	NC_013740	GCT	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
100	NC_013740	GAA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
101	NC_013740	CTG	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
102	NC_013740	GAT	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047391
103	NC_013740	CGG	2	6	5913	5918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
104	NC_013740	TAT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047391
105	NC_013740	CTG	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
106	NC_013740	CAG	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047391
107	NC_013740	GAA	2	6	6042	6047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
108	NC_013740	GCT	2	6	6053	6058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047391
109	NC_013740	GGC	2	6	6086	6091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
110	NC_013740	ACC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047391
111	NC_013740	TCC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047391
112	NC_013740	GGC	2	6	6137	6142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
113	NC_013740	GAA	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
114	NC_013740	GAC	2	6	6339	6344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047391
115	NC_013740	GAA	2	6	6459	6464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047391
116	NC_013740	GAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047391
117	NC_013740	CGG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047391
118	NC_013740	TCA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047391
119	NC_013740	GCC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047391
120	NC_013740	GGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047391
121	NC_013740	TGA	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047392
122	NC_013740	GCA	2	6	6700	6705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047392
123	NC_013740	GGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
124	NC_013740	ATG	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047392
125	NC_013740	CTG	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047392
126	NC_013740	GGA	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
127	NC_013740	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047392
128	NC_013740	ATC	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047392
129	NC_013740	AGG	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
130	NC_013740	GGA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047392
131	NC_013740	CGG	2	6	7070	7075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047392
132	NC_013740	CAG	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047392
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136	NC_013740	TTA	2	6	7351	7356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047392
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153	NC_013740	GAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047394
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232	NC_013740	CAT	2	6	13391	13396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047397
233	NC_013740	ATC	3	9	13416	13424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047397
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235	NC_013740	GGA	2	6	13634	13639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_013740	CGG	2	6	13801	13806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
237	NC_013740	AGG	2	6	13821	13826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
238	NC_013740	TGG	2	6	13904	13909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047398
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241	NC_013740	TCC	2	6	14027	14032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047398
242	NC_013740	CTG	2	6	14071	14076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047398
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245	NC_013740	ATG	2	6	14194	14199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047398
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257	NC_013740	TTC	2	6	14731	14736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047399
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