MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 37324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013740	TGC	2	6	211108	211113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3502	NC_013740	CTT	2	6	211156	211161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3503	NC_013740	CTG	2	6	211292	211297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3504	NC_013740	CAG	2	6	211388	211393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3505	NC_013740	CAG	2	6	211442	211447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3506	NC_013740	CGG	2	6	211471	211476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
3507	NC_013740	CCA	2	6	211477	211482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
3508	NC_013740	CAT	2	6	211502	211507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047563
3509	NC_013740	TGG	2	6	211533	211538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
3510	NC_013740	CGG	2	6	211597	211602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
3511	NC_013740	TAA	2	6	211635	211640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047563
3512	NC_013740	GGT	2	6	211715	211720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
3513	NC_013740	ACC	2	6	211743	211748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
3514	NC_013740	GCA	2	6	211752	211757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3515	NC_013740	CTT	2	6	211771	211776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3516	NC_013740	CAG	2	6	211781	211786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3517	NC_013740	GCA	2	6	211861	211866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3518	NC_013740	TAT	2	6	211949	211954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013740	ATT	2	6	212029	212034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013740	CAG	2	6	212130	212135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013740	TAC	2	6	212159	212164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013740	GGT	2	6	212228	212233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013740	GAA	2	6	212290	212295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
3524	NC_013740	GGC	2	6	212389	212394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
3525	NC_013740	TGG	2	6	212445	212450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047564
3526	NC_013740	GGC	2	6	212479	212484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
3527	NC_013740	TAT	2	6	212521	212526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047564
3528	NC_013740	GAA	2	6	212527	212532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
3529	NC_013740	ACC	2	6	212836	212841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
3530	NC_013740	GCG	2	6	212872	212877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3531	NC_013740	ACC	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
3532	NC_013740	CCT	2	6	213024	213029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047565
3533	NC_013740	TGG	2	6	213074	213079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3534	NC_013740	CTG	2	6	213118	213123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3535	NC_013740	TGC	2	6	213149	213154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3536	NC_013740	GGC	2	6	213171	213176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3537	NC_013740	GGA	2	6	213207	213212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
3538	NC_013740	AGG	2	6	213239	213244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
3539	NC_013740	CAG	2	6	213271	213276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3540	NC_013740	TAC	2	6	213286	213291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3541	NC_013740	GCC	2	6	213304	213309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047565
3542	NC_013740	CGG	2	6	213327	213332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3543	NC_013740	GGT	2	6	213402	213407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3544	NC_013740	CCT	2	6	213466	213471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047565
3545	NC_013740	TGG	2	6	213494	213499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3546	NC_013740	ATG	2	6	213598	213603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047565
3547	NC_013740	GAA	2	6	213657	213662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047565
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3550	NC_013740	CGG	2	6	213747	213752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3551	NC_013740	CTG	2	6	213778	213783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3552	NC_013740	TGG	2	6	213848	213853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3553	NC_013740	TGG	2	6	213860	213865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3554	NC_013740	TGC	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3555	NC_013740	TCA	2	6	213932	213937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3556	NC_013740	CTT	2	6	213948	213953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
3557	NC_013740	CAT	2	6	214011	214016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3558	NC_013740	AAG	2	6	214039	214044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047565
3559	NC_013740	ACA	2	6	214085	214090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047565
3560	NC_013740	TCA	2	6	214169	214174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3561	NC_013740	GGC	2	6	214221	214226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3562	NC_013740	CAT	3	9	214260	214268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3563	NC_013740	CAG	2	6	214293	214298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3564	NC_013740	TTC	2	6	214318	214323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
3565	NC_013740	CGG	2	6	214341	214346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3566	NC_013740	GGA	2	6	214403	214408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013740	GCA	2	6	214452	214457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3568	NC_013740	GCT	2	6	214604	214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
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3571	NC_013740	CGG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047566
3572	NC_013740	CTG	2	6	214725	214730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3573	NC_013740	GAA	2	6	214791	214796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047566
3574	NC_013740	CAT	2	6	214808	214813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
3575	NC_013740	TGG	2	6	214825	214830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047566
3576	NC_013740	CTG	2	6	214851	214856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3577	NC_013740	TCA	2	6	214864	214869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
3578	NC_013740	CGT	2	6	214905	214910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
3579	NC_013740	AGA	3	9	214938	214946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047567
3580	NC_013740	AGC	2	6	214974	214979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047567
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3582	NC_013740	TGG	2	6	215267	215272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047567
3583	NC_013740	CTG	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
3584	NC_013740	GGA	2	6	215469	215474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047567
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3586	NC_013740	GGC	2	6	215626	215631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047568
3587	NC_013740	GCT	3	9	215638	215646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3588	NC_013740	ATC	2	6	215711	215716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047568
3589	NC_013740	CTG	2	6	215789	215794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3590	NC_013740	CTG	2	6	215822	215827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3591	NC_013740	GCT	2	6	215836	215841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3592	NC_013740	TCC	2	6	215862	215867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047568
3593	NC_013740	CCT	2	6	215893	215898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047568
3594	NC_013740	GCC	2	6	215935	215940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047568
3595	NC_013740	CTG	2	6	216014	216019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3596	NC_013740	TGG	2	6	216180	216185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047568
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3598	NC_013740	CCG	2	6	216337	216342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047568
3599	NC_013740	TCC	2	6	216366	216371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047568
3600	NC_013740	GAT	2	6	216454	216459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047568
3601	NC_013740	GGC	2	6	216476	216481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047568
3602	NC_013740	GCA	2	6	216533	216538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013740	TGA	2	6	216584	216589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047569
3604	NC_013740	GAA	2	6	216625	216630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047569
3605	NC_013740	CCG	2	6	216701	216706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047569
3606	NC_013740	CCG	2	6	216773	216778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047569
3607	NC_013740	TGA	2	6	217002	217007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047570
3608	NC_013740	GAA	2	6	217030	217035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047570
3609	NC_013740	CGG	2	6	217263	217268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047570
3610	NC_013740	CGG	2	6	217298	217303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047570
3611	NC_013740	CCA	2	6	217370	217375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047570
3612	NC_013740	TGC	2	6	217433	217438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047570
3613	NC_013740	GAA	2	6	217489	217494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047570
3614	NC_013740	GCC	2	6	217555	217560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047570
3615	NC_013740	CAT	2	6	217629	217634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047570
3616	NC_013740	TGA	2	6	217727	217732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047570
3617	NC_013740	GCC	2	6	217774	217779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047570
3618	NC_013740	CAT	2	6	217848	217853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047570
3619	NC_013740	TCC	2	6	217897	217902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047570
3620	NC_013740	GAA	2	6	217909	217914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047570
3621	NC_013740	GAA	2	6	217924	217929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047570
3622	NC_013740	TCC	2	6	217948	217953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047570
3623	NC_013740	TAC	2	6	217966	217971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047570
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3627	NC_013740	TGG	2	6	218240	218245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047570
3628	NC_013740	TCC	2	6	218261	218266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047570
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3630	NC_013740	TGG	2	6	218300	218305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047570
3631	NC_013740	ATC	2	6	218446	218451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047570
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3634	NC_013740	TGG	2	6	218691	218696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047571
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3639	NC_013740	CGG	2	6	218994	218999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047571
3640	NC_013740	CGA	2	6	219160	219165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047571
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3643	NC_013740	CTT	2	6	219217	219222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047571
3644	NC_013740	TCA	2	6	219270	219275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047571
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3646	NC_013740	CGG	2	6	219333	219338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047571
3647	NC_013740	TCA	3	9	219375	219383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047571
3648	NC_013740	AAG	2	6	219521	219526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047571
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3652	NC_013740	TGC	2	6	219672	219677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047571
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3654	NC_013740	CCA	2	6	219798	219803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047571
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3656	NC_013740	TAC	2	6	219998	220003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047571
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3663	NC_013740	CTG	2	6	220277	220282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047572
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3670	NC_013740	CGG	2	6	220529	220534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047572
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3672	NC_013740	TGA	2	6	220635	220640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047572
3673	NC_013740	AAG	2	6	220673	220678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3674	NC_013740	TGA	2	6	220764	220769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3686	NC_013740	CTG	2	6	221334	221339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
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3706	NC_013740	GCT	2	6	222253	222258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047574
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