MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 33391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_013740	CAG	2	6	269651	269656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047606
4003	NC_013740	CTG	2	6	269744	269749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047606
4004	NC_013740	TGG	2	6	269847	269852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047606
4005	NC_013740	TGC	2	6	269976	269981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047606
4006	NC_013740	GGT	2	6	270151	270156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047606
4007	NC_013740	CTG	3	9	270197	270205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047606
4008	NC_013740	GTT	2	6	270484	270489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047607
4009	NC_013740	GGT	2	6	270498	270503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047607
4010	NC_013740	CTG	3	9	270505	270513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047607
4011	NC_013740	GGT	2	6	270543	270548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047607
4012	NC_013740	GCG	2	6	270603	270608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047607
4013	NC_013740	AGC	2	6	270729	270734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047607
4014	NC_013740	TGG	2	6	270938	270943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047607
4015	NC_013740	GAT	2	6	270948	270953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047607
4016	NC_013740	GCT	3	9	271062	271070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047608
4017	NC_013740	CGG	2	6	271121	271126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047608
4018	NC_013740	GTG	2	6	271255	271260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047608
4019	NC_013740	GGA	2	6	271293	271298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047608
4020	NC_013740	AAC	2	6	271348	271353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047608
4021	NC_013740	CTG	3	9	271360	271368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047608
4022	NC_013740	TTC	3	9	271723	271731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047608
4023	NC_013740	GCG	2	6	271736	271741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047608
4024	NC_013740	GGA	2	6	271759	271764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047608
4025	NC_013740	CGG	3	9	271773	271781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047608
4026	NC_013740	CGG	2	6	271788	271793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047608
4027	NC_013740	CAG	2	6	271818	271823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047608
4028	NC_013740	GTC	2	6	272279	272284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047609
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4030	NC_013740	GCA	2	6	272321	272326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047609
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4032	NC_013740	TCT	3	9	272487	272495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047609
4033	NC_013740	GGC	2	6	272579	272584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047609
4034	NC_013740	GAT	3	9	272600	272608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047609
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4050	NC_013740	TGA	2	6	274138	274143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047610
4051	NC_013740	TGG	2	6	274162	274167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047610
4052	NC_013740	CAT	2	6	274234	274239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047610
4053	NC_013740	GCA	2	6	274287	274292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047610
4054	NC_013740	CAA	2	6	274375	274380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047610
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4059	NC_013740	TGG	2	6	275055	275060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047611
4060	NC_013740	GGC	2	6	275096	275101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047611
4061	NC_013740	GGC	2	6	275246	275251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047611
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4068	NC_013740	TCC	2	6	275610	275615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047611
4069	NC_013740	TGG	2	6	275619	275624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047611
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4087	NC_013740	CAT	2	6	276634	276639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047612
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4102	NC_013740	GCT	2	6	277481	277486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047613
4103	NC_013740	AGA	2	6	277490	277495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047613
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4106	NC_013740	GCT	3	9	277574	277582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047613
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4119	NC_013740	TGC	2	6	278834	278839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
4120	NC_013740	CGG	2	6	278865	278870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047614
4121	NC_013740	CGG	2	6	278874	278879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047614
4122	NC_013740	TAC	2	6	278887	278892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047614
4123	NC_013740	GGC	2	6	278919	278924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047614
4124	NC_013740	GAT	2	6	279097	279102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047614
4125	NC_013740	TGG	2	6	279143	279148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047614
4126	NC_013740	CTG	2	6	279181	279186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
4127	NC_013740	TCC	2	6	279352	279357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047614
4128	NC_013740	TGA	2	6	279380	279385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047614
4129	NC_013740	TGG	2	6	279422	279427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047614
4130	NC_013740	CCA	4	12	279536	279547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047614
4131	NC_013740	ACT	2	6	279557	279562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047614
4132	NC_013740	CTG	2	6	279601	279606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
4133	NC_013740	CCA	2	6	279608	279613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047614
4134	NC_013740	CAA	2	6	279669	279674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047614
4135	NC_013740	CTG	2	6	279760	279765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047614
4136	NC_013740	TGG	2	6	279818	279823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047614
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4138	NC_013740	CCA	2	6	280038	280043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047615
4139	NC_013740	TGA	2	6	280044	280049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047615
4140	NC_013740	CGA	2	6	280123	280128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047615
4141	NC_013740	CGG	2	6	280151	280156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047615
4142	NC_013740	CTG	2	6	280184	280189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047615
4143	NC_013740	CGG	2	6	280200	280205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047615
4144	NC_013740	TCA	2	6	280371	280376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047615
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4146	NC_013740	CGA	2	6	280399	280404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047615
4147	NC_013740	ATC	2	6	280442	280447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047615
4148	NC_013740	AGG	2	6	280470	280475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047615
4149	NC_013740	GGC	2	6	280513	280518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047615
4150	NC_013740	GAG	2	6	280575	280580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047615
4151	NC_013740	GGT	2	6	280585	280590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047615
4152	NC_013740	CAA	2	6	280634	280639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047616
4153	NC_013740	CAT	3	9	280667	280675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047616
4154	NC_013740	GCA	2	6	280756	280761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047616
4155	NC_013740	CTG	2	6	280764	280769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047616
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4159	NC_013740	ATC	2	6	281388	281393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047616
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4161	NC_013740	CTG	3	9	281427	281435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047616
4162	NC_013740	CTG	2	6	281457	281462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047616
4163	NC_013740	CAT	2	6	281477	281482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047616
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4172	NC_013740	GCG	2	6	281763	281768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047616
4173	NC_013740	CTG	2	6	281769	281774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047616
4174	NC_013740	TCC	2	6	281852	281857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047617
4175	NC_013740	CTG	2	6	281914	281919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047617
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4200	NC_013740	GCT	2	6	283670	283675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047619
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4224	NC_013740	CAA	2	6	284978	284983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047620
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4233	NC_013740	TCT	3	9	285457	285465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047621
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4235	NC_013740	TCT	2	6	285505	285510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047621
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4237	NC_013740	TGG	2	6	285530	285535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047621
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4474	NC_013740	CGA	2	6	303496	303501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
4475	NC_013740	AGC	3	9	303597	303605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047630
4476	NC_013740	GCC	2	6	303713	303718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047630
4477	NC_013740	ACC	2	6	303731	303736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047630
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4482	NC_013740	CCG	2	6	304036	304041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047631
4483	NC_013740	CCA	2	6	304201	304206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047631
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