MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 33391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013740	AGG	2	6	206961	206966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047559
3002	NC_013740	TTC	2	6	206980	206985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047559
3003	NC_013740	AGG	2	6	207104	207109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047559
3004	NC_013740	TCT	2	6	207125	207130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047559
3005	NC_013740	CTG	2	6	207382	207387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047560
3006	NC_013740	GGC	2	6	207414	207419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047560
3007	NC_013740	AGA	2	6	207557	207562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047560
3008	NC_013740	GGC	3	9	207595	207603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047560
3009	NC_013740	TCA	2	6	207605	207610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047560
3010	NC_013740	TGG	2	6	207668	207673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047560
3011	NC_013740	CAC	2	6	207843	207848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047560
3012	NC_013740	CCG	2	6	207989	207994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047560
3013	NC_013740	CGG	2	6	208035	208040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047560
3014	NC_013740	TGC	2	6	208124	208129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047560
3015	NC_013740	CGG	2	6	208142	208147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047560
3016	NC_013740	GGT	2	6	208152	208157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047560
3017	NC_013740	TGT	2	6	208178	208183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047560
3018	NC_013740	CGG	2	6	208211	208216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047560
3019	NC_013740	AGC	2	6	208236	208241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047560
3020	NC_013740	TTC	2	6	208294	208299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047560
3021	NC_013740	GGA	2	6	208333	208338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047561
3022	NC_013740	GCT	2	6	208627	208632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047561
3023	NC_013740	GAC	2	6	208655	208660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047561
3024	NC_013740	GGT	2	6	208723	208728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047561
3025	NC_013740	GAA	2	6	208763	208768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047561
3026	NC_013740	AGG	2	6	208929	208934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047561
3027	NC_013740	GCC	2	6	209030	209035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047561
3028	NC_013740	CAA	2	6	209059	209064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047561
3029	NC_013740	GAA	2	6	209314	209319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047562
3030	NC_013740	CGG	2	6	209416	209421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047562
3031	NC_013740	TGC	2	6	209502	209507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047562
3032	NC_013740	TCA	2	6	209675	209680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047562
3033	NC_013740	CTG	3	9	209692	209700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047562
3034	NC_013740	ATC	2	6	209818	209823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047562
3035	NC_013740	TTC	2	6	209874	209879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047562
3036	NC_013740	CTT	2	6	209912	209917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047562
3037	NC_013740	ATG	2	6	209936	209941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047562
3038	NC_013740	GAT	2	6	209956	209961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047562
3039	NC_013740	GCC	2	6	209995	210000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047562
3040	NC_013740	TCC	2	6	210074	210079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047562
3041	NC_013740	CCA	2	6	210134	210139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047562
3042	NC_013740	TCC	2	6	210154	210159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047562
3043	NC_013740	GGC	2	6	210183	210188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047562
3044	NC_013740	GTG	2	6	210220	210225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047562
3045	NC_013740	CCA	2	6	210269	210274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047562
3046	NC_013740	AAG	2	6	210314	210319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047562
3047	NC_013740	CAG	2	6	210417	210422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047562
3048	NC_013740	GGC	2	6	210447	210452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047562
3049	NC_013740	TCA	2	6	210476	210481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047562
3050	NC_013740	GAA	2	6	210525	210530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047562
3051	NC_013740	CCA	2	6	210757	210762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
3052	NC_013740	TTC	3	9	210809	210817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3053	NC_013740	AGG	2	6	210894	210899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047563
3054	NC_013740	CAG	2	6	210992	210997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3055	NC_013740	CTT	2	6	211009	211014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3056	NC_013740	ACT	2	6	211038	211043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047563
3057	NC_013740	TGC	2	6	211108	211113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3058	NC_013740	CTT	2	6	211156	211161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3059	NC_013740	CTG	2	6	211292	211297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3060	NC_013740	CAG	2	6	211388	211393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3061	NC_013740	CAG	2	6	211442	211447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3062	NC_013740	CGG	2	6	211471	211476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
3063	NC_013740	CCA	2	6	211477	211482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
3064	NC_013740	CAT	2	6	211502	211507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047563
3065	NC_013740	TGG	2	6	211533	211538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
3066	NC_013740	CGG	2	6	211597	211602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047563
3067	NC_013740	TAA	2	6	211635	211640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284047563
3068	NC_013740	GGT	2	6	211715	211720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047563
3069	NC_013740	ACC	2	6	211743	211748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047563
3070	NC_013740	GCA	2	6	211752	211757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3071	NC_013740	CTT	2	6	211771	211776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047563
3072	NC_013740	CAG	2	6	211781	211786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3073	NC_013740	GCA	2	6	211861	211866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047563
3074	NC_013740	GAA	2	6	212290	212295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
3075	NC_013740	GGC	2	6	212389	212394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
3076	NC_013740	TGG	2	6	212445	212450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047564
3077	NC_013740	GGC	2	6	212479	212484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047564
3078	NC_013740	TAT	2	6	212521	212526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284047564
3079	NC_013740	GAA	2	6	212527	212532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047564
3080	NC_013740	ACC	2	6	212836	212841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
3081	NC_013740	GCG	2	6	212872	212877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3082	NC_013740	ACC	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
3083	NC_013740	CCT	2	6	213024	213029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047565
3084	NC_013740	TGG	2	6	213074	213079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3085	NC_013740	CTG	2	6	213118	213123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3086	NC_013740	TGC	2	6	213149	213154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3087	NC_013740	GGC	2	6	213171	213176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3088	NC_013740	GGA	2	6	213207	213212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
3089	NC_013740	AGG	2	6	213239	213244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047565
3090	NC_013740	CAG	2	6	213271	213276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3091	NC_013740	TAC	2	6	213286	213291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3092	NC_013740	GCC	2	6	213304	213309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047565
3093	NC_013740	CGG	2	6	213327	213332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3094	NC_013740	GGT	2	6	213402	213407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3095	NC_013740	CCT	2	6	213466	213471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047565
3096	NC_013740	TGG	2	6	213494	213499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3097	NC_013740	ATG	2	6	213598	213603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047565
3098	NC_013740	GAA	2	6	213657	213662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047565
3099	NC_013740	TTC	2	6	213706	213711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
3100	NC_013740	CCA	2	6	213722	213727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047565
3101	NC_013740	CGG	2	6	213747	213752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3102	NC_013740	CTG	2	6	213778	213783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3103	NC_013740	TGG	2	6	213848	213853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3104	NC_013740	TGG	2	6	213860	213865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047565
3105	NC_013740	TGC	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3106	NC_013740	TCA	2	6	213932	213937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3107	NC_013740	CTT	2	6	213948	213953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
3108	NC_013740	CAT	2	6	214011	214016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3109	NC_013740	AAG	2	6	214039	214044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047565
3110	NC_013740	ACA	2	6	214085	214090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047565
3111	NC_013740	TCA	2	6	214169	214174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3112	NC_013740	GGC	2	6	214221	214226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3113	NC_013740	CAT	3	9	214260	214268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047565
3114	NC_013740	CAG	2	6	214293	214298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047565
3115	NC_013740	TTC	2	6	214318	214323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047565
3116	NC_013740	CGG	2	6	214341	214346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047565
3117	NC_013740	GCA	2	6	214452	214457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3118	NC_013740	GCT	2	6	214604	214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3119	NC_013740	TCA	3	9	214618	214626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
3120	NC_013740	ACC	2	6	214668	214673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047566
3121	NC_013740	CGG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047566
3122	NC_013740	CTG	2	6	214725	214730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3123	NC_013740	GAA	2	6	214791	214796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047566
3124	NC_013740	CAT	2	6	214808	214813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
3125	NC_013740	TGG	2	6	214825	214830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047566
3126	NC_013740	CTG	2	6	214851	214856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047566
3127	NC_013740	TCA	2	6	214864	214869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047566
3128	NC_013740	CGT	2	6	214905	214910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
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3130	NC_013740	AGC	2	6	214974	214979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047567
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3132	NC_013740	TGG	2	6	215267	215272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047567
3133	NC_013740	CTG	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047567
3134	NC_013740	GGA	2	6	215469	215474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047567
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3139	NC_013740	CTG	2	6	215789	215794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3140	NC_013740	CTG	2	6	215822	215827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
3141	NC_013740	GCT	2	6	215836	215841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047568
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3149	NC_013740	TCC	2	6	216366	216371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047568
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3230	NC_013740	TGG	2	6	221290	221295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047573
3231	NC_013740	CTG	3	9	221313	221321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
3232	NC_013740	CTG	2	6	221325	221330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
3233	NC_013740	CTG	2	6	221334	221339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047573
3234	NC_013740	CGG	2	6	221437	221442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047573
3235	NC_013740	TGA	2	6	221470	221475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047573
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3237	NC_013740	GAC	2	6	221574	221579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047573
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3355	NC_013740	GCA	2	6	230413	230418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047584
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3470	NC_013740	CGA	2	6	236924	236929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047585
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3472	NC_013740	AGA	2	6	237043	237048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047585
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3474	NC_013740	ACC	2	6	237069	237074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047585
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3476	NC_013740	CGG	2	6	237136	237141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
3477	NC_013740	CGG	2	6	237217	237222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047585
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