MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 25891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013416	AGA	2	6	256747	256752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866986
3002	NC_013416	GTC	2	6	256811	256816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866986
3003	NC_013416	CAT	2	6	257718	257723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866987
3004	NC_013416	GTA	2	6	257805	257810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866987
3005	NC_013416	AAG	2	6	257860	257865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866987
3006	NC_013416	GCC	2	6	257871	257876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866987
3007	NC_013416	GCC	2	6	257967	257972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866987
3008	NC_013416	GGC	2	6	258102	258107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866987
3009	NC_013416	CGG	2	6	258170	258175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866987
3010	NC_013416	ATT	2	6	258252	258257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866987
3011	NC_013416	TTA	2	6	258284	258289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866987
3012	NC_013416	GGC	2	6	258474	258479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
3013	NC_013416	TGA	2	6	258487	258492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866988
3014	NC_013416	CAA	2	6	258531	258536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866988
3015	NC_013416	CGC	2	6	258575	258580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866988
3016	NC_013416	TTC	2	6	258609	258614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866988
3017	NC_013416	TTG	2	6	258680	258685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866988
3018	NC_013416	GCG	2	6	258742	258747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
3019	NC_013416	ATT	2	6	258751	258756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866988
3020	NC_013416	CAC	2	6	258815	258820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866988
3021	NC_013416	CAA	2	6	258966	258971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866988
3022	NC_013416	CTG	2	6	259002	259007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866988
3023	NC_013416	CGG	2	6	259027	259032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866988
3024	NC_013416	GGT	2	6	259336	259341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866989
3025	NC_013416	GAT	2	6	259343	259348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866989
3026	NC_013416	TTG	2	6	259451	259456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866989
3027	NC_013416	GCA	2	6	259502	259507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866989
3028	NC_013416	TGA	2	6	259579	259584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866989
3029	NC_013416	AGC	2	6	259687	259692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866989
3030	NC_013416	ATT	2	6	259715	259720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866989
3031	NC_013416	CGC	2	6	259726	259731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866989
3032	NC_013416	CGG	2	6	259770	259775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
3033	NC_013416	ATT	2	6	259784	259789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866989
3034	NC_013416	ATT	2	6	259892	259897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866989
3035	NC_013416	CGG	2	6	259903	259908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
3036	NC_013416	AAT	2	6	259919	259924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866989
3037	NC_013416	GCG	2	6	260098	260103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
3038	NC_013416	GTT	2	6	260113	260118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866989
3039	NC_013416	CGC	2	6	260125	260130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866989
3040	NC_013416	GGC	2	6	260170	260175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866989
3041	NC_013416	ATT	2	6	260448	260453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866990
3042	NC_013416	TCG	2	6	260460	260465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866990
3043	NC_013416	GTG	2	6	260504	260509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866990
3044	NC_013416	TCG	2	6	260516	260521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866990
3045	NC_013416	CGT	2	6	260529	260534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866990
3046	NC_013416	TGG	2	6	260541	260546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866990
3047	NC_013416	CGA	2	6	260589	260594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866990
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3049	NC_013416	CGT	2	6	260655	260660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866990
3050	NC_013416	GGC	2	6	260845	260850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866990
3051	NC_013416	CGC	2	6	261027	261032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866990
3052	NC_013416	AAT	2	6	261077	261082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866990
3053	NC_013416	TTG	2	6	261097	261102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
3054	NC_013416	ATT	2	6	261136	261141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866990
3055	NC_013416	CCG	2	6	261177	261182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866990
3056	NC_013416	GTA	2	6	261229	261234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866990
3057	NC_013416	GTT	3	9	261247	261255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
3058	NC_013416	GGC	2	6	261460	261465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866990
3059	NC_013416	GCC	2	6	261551	261556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866990
3060	NC_013416	GTT	2	6	261582	261587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
3061	NC_013416	GTT	2	6	261627	261632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
3062	NC_013416	CGC	2	6	261642	261647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866990
3063	NC_013416	GTT	2	6	261684	261689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866990
3064	NC_013416	CGG	2	6	261780	261785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866990
3065	NC_013416	TAC	2	6	261793	261798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866990
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3067	NC_013416	AAC	2	6	261984	261989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866991
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3069	NC_013416	CAC	2	6	262144	262149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866991
3070	NC_013416	CGC	2	6	262212	262217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866991
3071	NC_013416	GTG	2	6	262286	262291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866991
3072	NC_013416	CGG	2	6	262321	262326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866991
3073	NC_013416	TCA	2	6	262354	262359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866991
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3085	NC_013416	ACG	2	6	262878	262883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866991
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3087	NC_013416	GTC	2	6	263128	263133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866992
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3089	NC_013416	GGC	2	6	263220	263225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866992
3090	NC_013416	TGG	3	9	263333	263341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866992
3091	NC_013416	CGC	3	9	263400	263408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866992
3092	NC_013416	TGG	2	6	263456	263461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866992
3093	NC_013416	CGC	2	6	263466	263471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866992
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3101	NC_013416	ATG	2	6	263857	263862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866992
3102	NC_013416	TGG	2	6	263936	263941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866992
3103	NC_013416	AAT	2	6	264114	264119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866993
3104	NC_013416	CAT	2	6	264147	264152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866993
3105	NC_013416	CAC	2	6	264166	264171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866993
3106	NC_013416	TAT	2	6	264267	264272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866993
3107	NC_013416	ATA	2	6	264298	264303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866993
3108	NC_013416	TGC	2	6	264304	264309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866993
3109	NC_013416	ATT	2	6	264418	264423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866993
3110	NC_013416	TAT	2	6	264433	264438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866993
3111	NC_013416	AAT	2	6	264461	264466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866993
3112	NC_013416	ATT	2	6	265180	265185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866994
3113	NC_013416	TAA	2	6	265216	265221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866994
3114	NC_013416	TGA	2	6	265260	265265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866994
3115	NC_013416	ACA	2	6	265327	265332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866994
3116	NC_013416	AAT	2	6	265355	265360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866994
3117	NC_013416	CGC	2	6	265927	265932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866995
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3119	NC_013416	GCA	2	6	266035	266040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866995
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3358	NC_013416	ATT	2	6	284008	284013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867015
3359	NC_013416	ATT	2	6	284073	284078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867015
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3477	NC_013416	TGC	2	6	295126	295131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867030
3478	NC_013416	GTG	2	6	295209	295214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867030
3479	NC_013416	TTA	2	6	295280	295285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867030
3480	NC_013416	CGT	2	6	295286	295291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867030
3481	NC_013416	CCG	2	6	295292	295297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867030
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