MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 25891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013416	CAA	2	6	410135	410140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867157
5002	NC_013416	TCA	2	6	410182	410187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867157
5003	NC_013416	ATT	2	6	410294	410299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867157
5004	NC_013416	AAT	2	6	410370	410375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867157
5005	NC_013416	GTT	2	6	410409	410414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867158
5006	NC_013416	ACC	2	6	410464	410469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867158
5007	NC_013416	TGC	2	6	410576	410581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867158
5008	NC_013416	CAA	2	6	410638	410643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867158
5009	NC_013416	GCG	2	6	410656	410661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867158
5010	NC_013416	CGA	2	6	410804	410809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867159
5011	NC_013416	CAC	2	6	410898	410903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867159
5012	NC_013416	GCA	2	6	410917	410922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867159
5013	NC_013416	ATT	2	6	410951	410956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867159
5014	NC_013416	AAC	2	6	411039	411044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867159
5015	NC_013416	TAT	2	6	411071	411076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867159
5016	NC_013416	GAA	2	6	411152	411157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867159
5017	NC_013416	TGA	2	6	411213	411218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867159
5018	NC_013416	TGT	2	6	411246	411251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867159
5019	NC_013416	CGA	2	6	411274	411279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867159
5020	NC_013416	TTG	2	6	411290	411295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867159
5021	NC_013416	AAT	2	6	411629	411634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867159
5022	NC_013416	ATC	2	6	411641	411646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867159
5023	NC_013416	CGC	2	6	411786	411791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867159
5024	NC_013416	CAC	2	6	412080	412085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867159
5025	NC_013416	AAT	2	6	412191	412196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867159
5026	NC_013416	GAA	2	6	412526	412531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867160
5027	NC_013416	AGA	2	6	412594	412599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867160
5028	NC_013416	TAT	2	6	412603	412608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867160
5029	NC_013416	CGG	3	9	412648	412656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867160
5030	NC_013416	TGA	2	6	412870	412875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867160
5031	NC_013416	TGT	2	6	412961	412966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867161
5032	NC_013416	ATT	2	6	413019	413024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867161
5033	NC_013416	CAA	2	6	413058	413063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867161
5034	NC_013416	TAT	2	6	413156	413161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867161
5035	NC_013416	GCG	2	6	413264	413269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867161
5036	NC_013416	GCG	3	9	413296	413304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867161
5037	NC_013416	ACC	2	6	413341	413346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867161
5038	NC_013416	TTC	2	6	413364	413369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867161
5039	NC_013416	GGC	2	6	413374	413379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867161
5040	NC_013416	ACC	2	6	413393	413398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867161
5041	NC_013416	AGC	2	6	413558	413563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867161
5042	NC_013416	GCT	2	6	413618	413623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867161
5043	NC_013416	ATG	2	6	413773	413778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867161
5044	NC_013416	GCG	2	6	413779	413784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867161
5045	NC_013416	TGA	2	6	413909	413914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867161
5046	NC_013416	GCC	2	6	414088	414093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867162
5047	NC_013416	CTA	2	6	414147	414152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867162
5048	NC_013416	TAC	3	9	414351	414359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867162
5049	NC_013416	GAA	3	9	414516	414524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867162
5050	NC_013416	CGC	2	6	414536	414541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867162
5051	NC_013416	CAA	2	6	414579	414584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867162
5052	NC_013416	CCA	2	6	414695	414700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867162
5053	NC_013416	AAC	2	6	414736	414741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867162
5054	NC_013416	ATC	3	9	415023	415031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867163
5055	NC_013416	CGG	2	6	415052	415057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867163
5056	NC_013416	TGT	2	6	415093	415098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867163
5057	NC_013416	CCG	2	6	415138	415143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867163
5058	NC_013416	GGT	2	6	415197	415202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867163
5059	NC_013416	GGC	2	6	415307	415312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867163
5060	NC_013416	TGG	2	6	415385	415390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867163
5061	NC_013416	AAT	2	6	415464	415469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867163
5062	NC_013416	ATA	2	6	415489	415494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867163
5063	NC_013416	TAT	2	6	415657	415662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867164
5064	NC_013416	CAT	3	9	416024	416032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867164
5065	NC_013416	TGG	2	6	416064	416069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867164
5066	NC_013416	ATG	2	6	416102	416107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867164
5067	NC_013416	GGT	2	6	416119	416124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867164
5068	NC_013416	CAA	2	6	416159	416164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867164
5069	NC_013416	GTG	3	9	416264	416272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867164
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5071	NC_013416	TGA	2	6	416527	416532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867164
5072	NC_013416	GTG	2	6	416540	416545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867164
5073	NC_013416	TAT	3	9	416606	416614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867164
5074	NC_013416	ATT	2	6	416696	416701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867164
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5080	NC_013416	GTG	2	6	417287	417292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867164
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5083	NC_013416	AAC	2	6	417521	417526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867164
5084	NC_013416	TCA	2	6	418015	418020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867164
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5086	NC_013416	CGG	2	6	418153	418158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867164
5087	NC_013416	CCG	2	6	418350	418355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867164
5088	NC_013416	GCG	3	9	418389	418397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867164
5089	NC_013416	GCA	2	6	418605	418610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867165
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5091	NC_013416	TTG	2	6	418639	418644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867165
5092	NC_013416	TGT	2	6	418673	418678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867165
5093	NC_013416	TGT	2	6	418745	418750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867165
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5099	NC_013416	CTG	2	6	419525	419530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867167
5100	NC_013416	ATT	2	6	419577	419582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867167
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5102	NC_013416	CGC	2	6	419631	419636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867167
5103	NC_013416	ACC	2	6	419645	419650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867167
5104	NC_013416	CAA	2	6	419663	419668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867167
5105	NC_013416	CAG	2	6	419675	419680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867167
5106	NC_013416	CGT	2	6	419820	419825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867168
5107	NC_013416	CGC	2	6	419927	419932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867168
5108	NC_013416	TCG	2	6	419943	419948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867168
5109	NC_013416	TAA	2	6	419956	419961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867168
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5119	NC_013416	TGG	2	6	420492	420497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867168
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5477	NC_013416	ATT	2	6	449269	449274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867200
5478	NC_013416	GAC	2	6	449419	449424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867200
5479	NC_013416	TCA	2	6	449441	449446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867200
5480	NC_013416	TTG	2	6	449491	449496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867200
5481	NC_013416	CAC	2	6	449505	449510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867200
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5499	NC_013416	CGT	2	6	451113	451118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867202
5500	NC_013416	ATG	2	6	451239	451244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867202

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