MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013385	ACAAAA	2	12	1782529	1782540	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1002	NC_013385	TCCACG	2	12	1786542	1786553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893631
1003	NC_013385	TCCACC	2	12	1787424	1787435	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893632
1004	NC_013385	GAAAAA	2	12	1794689	1794700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260893639
1005	NC_013385	CAGCAC	2	12	1795444	1795455	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893640
1006	NC_013385	AAATAA	2	12	1799990	1800001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013385	TTGAAG	2	12	1800210	1800221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013385	CCCCTG	2	12	1802824	1802835	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013385	TCACGC	2	12	1804255	1804266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893647
1010	NC_013385	CAGGAA	2	12	1806528	1806539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893650
1011	NC_013385	CGACAG	2	12	1808638	1808649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893654
1012	NC_013385	CCAGGG	2	12	1814694	1814705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893660
1013	NC_013385	CGCCGG	2	12	1816640	1816651	0 %	0 %	50 %	50 %	260893662
1014	NC_013385	AGGCAA	2	12	1816876	1816887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893662
1015	NC_013385	GAAGCA	2	12	1818304	1818315	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893663
1016	NC_013385	TTGAGC	2	12	1819294	1819305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893663
1017	NC_013385	CAGGCG	2	12	1819644	1819655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893663
1018	NC_013385	CACCCG	2	12	1820583	1820594	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893663
1019	NC_013385	TCCTTT	2	12	1823460	1823471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893665
1020	NC_013385	CCAGCA	2	12	1829814	1829825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893671
1021	NC_013385	CACCCG	2	12	1833190	1833201	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893673
1022	NC_013385	GGCGAA	2	12	1836353	1836364	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893676
1023	NC_013385	CTGGCG	2	12	1837535	1837546	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893677
1024	NC_013385	GTTCCT	2	12	1838387	1838398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260893677
1025	NC_013385	GGGGCT	2	12	1839593	1839604	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_013385	CCCGGC	2	12	1845466	1845477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893683
1027	NC_013385	CTCCAC	2	12	1846428	1846439	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893684
1028	NC_013385	AGCACC	2	12	1847848	1847859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893686
1029	NC_013385	AGGCCC	2	12	1850122	1850133	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893687
1030	NC_013385	TCCCCA	2	12	1850243	1850254	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893687
1031	NC_013385	GGCCAG	2	12	1850688	1850699	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893687
1032	NC_013385	GCCCGG	2	12	1858442	1858453	0 %	0 %	50 %	50 %	260893693
1033	NC_013385	GGTGCA	2	12	1858949	1858960	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893694
1034	NC_013385	CCAGCA	2	12	1863462	1863473	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893699
1035	NC_013385	AGAAGG	2	12	1864273	1864284	50 %	0 %	50 %	0 %	260893699
1036	NC_013385	AGGTCG	2	12	1865869	1865880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893701
1037	NC_013385	ACCGCC	2	12	1866752	1866763	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893702
1038	NC_013385	AAAGCC	2	12	1868131	1868142	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260893704
1039	NC_013385	TCCAGG	2	12	1871149	1871160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893706
1040	NC_013385	CCCTAT	2	12	1876024	1876035	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260893711
1041	NC_013385	AAAAAC	2	12	1877537	1877548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1042	NC_013385	GTCCTC	2	12	1879603	1879614	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893714
1043	NC_013385	CACCGC	2	12	1881379	1881390	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893717
1044	NC_013385	GGGGAC	2	12	1881817	1881828	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260893717
1045	NC_013385	CACCCG	2	12	1882447	1882458	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893717
1046	NC_013385	ACCAGT	2	12	1888633	1888644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013385	GATCCC	2	12	1888842	1888853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893720
1048	NC_013385	TATTGA	2	12	1889536	1889547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013385	GCGCAC	2	12	1889814	1889825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893721
1050	NC_013385	ACCTTG	2	12	1889941	1889952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893721
1051	NC_013385	GGGGCC	2	12	1901658	1901669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893732
1052	NC_013385	CAACTC	2	12	1909829	1909840	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260893739
1053	NC_013385	TCCTGT	2	12	1912425	1912436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260893740
1054	NC_013385	TAACCG	2	12	1914030	1914041	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893741
1055	NC_013385	GGGAGG	2	12	1915969	1915980	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260893743
1056	NC_013385	CTCAAT	2	12	1921794	1921805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013385	CGCCGG	2	12	1925843	1925854	0 %	0 %	50 %	50 %	260893751
1058	NC_013385	CTCGAC	2	12	1925877	1925888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893751
1059	NC_013385	GTAACC	2	12	1927930	1927941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893753
1060	NC_013385	GCCAGG	2	12	1931285	1931296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893757
1061	NC_013385	GGCCTC	2	12	1934548	1934559	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893759
1062	NC_013385	AGGCCC	2	12	1934624	1934635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893759
1063	NC_013385	GCATAC	2	12	1938067	1938078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013385	TTGAAG	2	12	1938143	1938154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013385	CCTTCT	2	12	1938668	1938679	0 %	50 %	0 %	50 %	260893766
1066	NC_013385	ACCGCT	2	12	1941956	1941967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893770
1067	NC_013385	TCCTCG	2	12	1945005	1945016	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893773
1068	NC_013385	CGAAGC	2	12	1947371	1947382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893776
1069	NC_013385	GGCCAG	2	12	1948376	1948387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893776
1070	NC_013385	TTACCT	2	12	1948486	1948497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260893776
1071	NC_013385	CCAGGT	2	12	1950038	1950049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893777
1072	NC_013385	GCGTAA	2	12	1950302	1950313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893778
1073	NC_013385	AAGCCT	2	12	1950526	1950537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893778
1074	NC_013385	AGGGCC	2	12	1952519	1952530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893779
1075	NC_013385	CTCCAC	2	12	1952898	1952909	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893780
1076	NC_013385	CACCAG	2	12	1955624	1955635	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893781
1077	NC_013385	CCCGTC	2	12	1956143	1956154	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893781
1078	NC_013385	CTTCCC	2	12	1956909	1956920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893783
1079	NC_013385	TTACCT	2	12	1957226	1957237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_013385	AGAAGG	2	12	1959397	1959408	50 %	0 %	50 %	0 %	260893786
1081	NC_013385	CTTCAA	2	12	1959922	1959933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013385	CTGCTC	2	12	1960740	1960751	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893787
1083	NC_013385	AGAAGG	2	12	1963825	1963836	50 %	0 %	50 %	0 %	260893790
1084	NC_013385	CTTCAA	2	12	1964350	1964361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013385	GCCAGG	2	12	1970728	1970739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893798
1086	NC_013385	CCACCG	2	12	1971389	1971400	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893798
1087	NC_013385	TCCCCG	2	12	1974623	1974634	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893801
1088	NC_013385	GCCCCA	2	12	1975775	1975786	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893802
1089	NC_013385	TCCGCC	2	12	1977305	1977316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893804
1090	NC_013385	AGGAGC	2	12	1977759	1977770	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893805
1091	NC_013385	GCTTCA	2	12	1979857	1979868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893807
1092	NC_013385	GCTACC	2	12	1980127	1980138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893807
1093	NC_013385	CGGGCA	2	12	1980200	1980211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893807
1094	NC_013385	GTGCGC	2	12	1982434	1982445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893808
1095	NC_013385	CTCGAG	2	12	1982488	1982499	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893808
1096	NC_013385	CACCCC	2	12	1985010	1985021	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	260893812
1097	NC_013385	CCACCG	2	12	1986127	1986138	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893813
1098	NC_013385	CTCGAT	2	12	1986467	1986478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893813
1099	NC_013385	GCCCCA	2	12	1989205	1989216	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893816
1100	NC_013385	TCCGCC	2	12	1990584	1990595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893817
1101	NC_013385	TCCCTC	2	12	1995351	1995362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013385	GGCGAA	2	12	1997369	1997380	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893824
1103	NC_013385	GCGGTG	2	12	1999904	1999915	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260893827
1104	NC_013385	TGCGGA	2	12	2002545	2002556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893831
1105	NC_013385	TCCAGC	2	12	2002898	2002909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893831
1106	NC_013385	CCACCG	2	12	2002938	2002949	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893831
1107	NC_013385	TGGCCG	2	12	2004890	2004901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893834
1108	NC_013385	GCCCAG	2	12	2005069	2005080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893834
1109	NC_013385	CGAAGG	2	12	2006512	2006523	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893836
1110	NC_013385	CGAAGG	2	12	2009939	2009950	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893840
1111	NC_013385	GCAGGA	2	12	2010932	2010943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893840
1112	NC_013385	AGGTAG	2	12	2016129	2016140	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260893846
1113	NC_013385	GGGCCT	2	12	2016781	2016792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893847
1114	NC_013385	ACCAGA	2	12	2017461	2017472	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260893847
1115	NC_013385	GGAAAG	2	12	2017604	2017615	50 %	0 %	50 %	0 %	260893847
1116	NC_013385	CCTCCC	2	12	2017866	2017877	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	260893847
1117	NC_013385	TATCTC	2	12	2019684	2019695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260893848
1118	NC_013385	AGGAAG	2	12	2021543	2021554	50 %	0 %	50 %	0 %	260893851
1119	NC_013385	CCAGCG	2	12	2025581	2025592	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893857
1120	NC_013385	CACGAT	2	12	2032584	2032595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893864
1121	NC_013385	CGCCTT	2	12	2033074	2033085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893866
1122	NC_013385	GGGGGA	2	12	2033713	2033724	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260893867
1123	NC_013385	CCAGCA	2	12	2033795	2033806	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893867
1124	NC_013385	GGAGTA	2	12	2034052	2034063	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260893868
1125	NC_013385	GGCTGA	2	12	2035700	2035711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893870
1126	NC_013385	CGCAGG	2	12	2036667	2036678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893871
1127	NC_013385	GGGCGA	2	12	2037241	2037252	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260893872
1128	NC_013385	CCACTA	2	12	2037373	2037384	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260893872
1129	NC_013385	TGACGT	2	12	2037466	2037477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893872
1130	NC_013385	CGGCTT	2	12	2038477	2038488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893873
1131	NC_013385	GGCGCA	2	12	2038793	2038804	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893874
1132	NC_013385	GAAGTC	2	12	2040399	2040410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893875
1133	NC_013385	TCGGCC	2	12	2041383	2041394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893876
1134	NC_013385	ACGTTG	2	12	2041649	2041660	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893877
1135	NC_013385	GCCCTG	2	12	2043175	2043186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893879
1136	NC_013385	ACCTCA	2	12	2043512	2043523	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260893879
1137	NC_013385	TCCGGT	2	12	2044245	2044256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893880
1138	NC_013385	CTCCGT	2	12	2044887	2044898	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_013385	AGCTCA	2	12	2045770	2045781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893882
1140	NC_013385	CTCGGG	2	12	2049173	2049184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893886
1141	NC_013385	GGAGTA	2	12	2052324	2052335	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260893888
1142	NC_013385	TGCCCG	2	12	2054599	2054610	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893890
1143	NC_013385	TCCGCC	2	12	2056551	2056562	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893891
1144	NC_013385	ACCTCC	3	18	2057576	2057593	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893892
1145	NC_013385	GAGGGT	2	12	2057833	2057844	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260893892
1146	NC_013385	AGGAAA	2	12	2058426	2058437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893892
1147	NC_013385	CCGGCC	2	12	2058476	2058487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893892
1148	NC_013385	CCCCCT	2	12	2062364	2062375	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1149	NC_013385	ATCTCG	2	12	2062782	2062793	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893900
1150	NC_013385	CGCCAC	2	12	2064892	2064903	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893902
1151	NC_013385	GTAGGC	2	12	2066003	2066014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893903
1152	NC_013385	GGCCCT	2	12	2070506	2070517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893906
1153	NC_013385	TTGTGG	2	12	2071374	2071385	0 %	50 %	50 %	0 %	260893907
1154	NC_013385	ATCCCG	2	12	2071431	2071442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893907
1155	NC_013385	CTTTTT	2	12	2074247	2074258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260893910
1156	NC_013385	CAACTT	2	12	2077709	2077720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893912
1157	NC_013385	TTGAAG	2	12	2079487	2079498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_013385	CCTTCT	2	12	2080012	2080023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1159	NC_013385	GCGGTA	2	12	2083341	2083352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893919
1160	NC_013385	TGAACT	3	18	2087262	2087279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260893924
1161	NC_013385	GTCCAC	2	12	2088338	2088349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893925
1162	NC_013385	CTCCAG	2	12	2089527	2089538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893926
1163	NC_013385	AGCAAA	2	12	2091429	2091440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260893929
1164	NC_013385	ACCCAA	2	12	2092548	2092559	50 %	0 %	0 %	50 %	260893932
1165	NC_013385	CCCGCT	2	12	2093443	2093454	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893934
1166	NC_013385	TTTTTC	2	12	2094682	2094693	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260893936
1167	NC_013385	AGCTCG	2	12	2094815	2094826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893936
1168	NC_013385	TTGAGC	2	12	2095619	2095630	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893936
1169	NC_013385	AAGAGG	2	12	2098462	2098473	50 %	0 %	50 %	0 %	260893941
1170	NC_013385	CGCCAC	2	12	2104065	2104076	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893947
1171	NC_013385	GTCCTT	2	12	2105562	2105573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260893949
1172	NC_013385	GGAGCA	2	12	2107216	2107227	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260893951
1173	NC_013385	GCCATG	2	12	2110667	2110678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893955
1174	NC_013385	GGTCGG	2	12	2111280	2111291	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260893956
1175	NC_013385	CGCAGG	2	12	2113398	2113409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893960
1176	NC_013385	GCGTGC	2	12	2117622	2117633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893963
1177	NC_013385	GAAGTC	2	12	2118536	2118547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893964
1178	NC_013385	CCGCGC	2	12	2118959	2118970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893964
1179	NC_013385	CGGTAG	2	12	2119338	2119349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893964
1180	NC_013385	CTGCCT	2	12	2120142	2120153	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893965
1181	NC_013385	CCCGCA	2	12	2121565	2121576	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893969
1182	NC_013385	GGCCAG	2	12	2126852	2126863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893977
1183	NC_013385	AGCCTT	2	12	2127634	2127645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893978
1184	NC_013385	ACCTCC	2	12	2127734	2127745	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893978
1185	NC_013385	CGTAAG	2	12	2128626	2128637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893980

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