MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	GAGCGT	2	12	844685	844696	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892722
502	NC_013385	GGAAGG	2	12	846790	846801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892725
503	NC_013385	GGCTAC	2	12	850012	850023	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013385	CGTAGA	2	12	855757	855768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260892734
505	NC_013385	CGCAGG	2	12	857937	857948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892736
506	NC_013385	CGAAGG	2	12	860946	860957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892740
507	NC_013385	AGCGCC	2	12	861003	861014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892740
508	NC_013385	GCGGTG	2	12	861671	861682	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892740
509	NC_013385	GTGGGA	2	12	866951	866962	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260892747
510	NC_013385	CTTCGT	2	12	867311	867322	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260892747
511	NC_013385	GGCGCG	2	12	868183	868194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892748
512	NC_013385	GGTGGC	2	12	869867	869878	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892749
513	NC_013385	CTTGCC	2	12	869879	869890	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892749
514	NC_013385	AGCAGG	2	12	870832	870843	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892749
515	NC_013385	ACCTTA	2	12	871542	871553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892749
516	NC_013385	GGGAAG	2	12	872306	872317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892750
517	NC_013385	GGGAGA	2	12	872912	872923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892751
518	NC_013385	AGGGCT	2	12	873268	873279	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892751
519	NC_013385	TGCACC	2	12	874619	874630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892752
520	NC_013385	GTGGCC	2	12	875333	875344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892753
521	NC_013385	CGAGGT	2	12	876920	876931	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892755
522	NC_013385	CTTTTT	2	12	877887	877898	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260892757
523	NC_013385	GGGAAG	2	12	878120	878131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892757
524	NC_013385	GTTTTT	2	12	882007	882018	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	260892760
525	NC_013385	AAAGTT	2	12	882886	882897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260892761
526	NC_013385	AAAGTT	2	12	882901	882912	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260892761
527	NC_013385	GACAGG	2	12	884915	884926	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892762
528	NC_013385	CCTCCC	2	12	885048	885059	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	260892762
529	NC_013385	GGCCGC	2	12	886539	886550	0 %	0 %	50 %	50 %	260892763
530	NC_013385	CCCGCC	2	12	886569	886580	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	260892763
531	NC_013385	AAGGAA	2	12	887169	887180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892763
532	NC_013385	CAGGCT	2	12	888433	888444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892765
533	NC_013385	CGCGGA	2	12	888998	889009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892766
534	NC_013385	ACGGGG	2	12	891399	891410	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892768
535	NC_013385	CTGCCG	2	12	891581	891592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260892768
536	NC_013385	GGGGAC	2	12	893438	893449	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
537	NC_013385	CGCGCC	2	12	893887	893898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_013385	TTGGCC	2	12	896784	896795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892773
539	NC_013385	CTGGTG	2	12	897207	897218	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892773
540	NC_013385	TGGAGC	2	12	901963	901974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892778
541	NC_013385	GGCCAG	2	12	903945	903956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892782
542	NC_013385	AACGCC	2	12	904861	904872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260892783
543	NC_013385	ACCTGC	2	12	904982	904993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892783
544	NC_013385	CCTGAC	2	12	906399	906410	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892783
545	NC_013385	ATACGC	2	12	909947	909958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013385	CGATTA	2	12	910197	910208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260892787
547	NC_013385	CCGGCG	2	12	911708	911719	0 %	0 %	50 %	50 %	260892787
548	NC_013385	TCTTTA	2	12	912922	912933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	260892789
549	NC_013385	AGTAGA	2	12	921581	921592	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013385	CCTGGC	2	12	928785	928796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
551	NC_013385	CGCCGT	2	12	929461	929472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
552	NC_013385	GAAAAA	2	12	931788	931799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260892802
553	NC_013385	GAAGAT	2	12	933923	933934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260892803
554	NC_013385	GGTGGA	2	12	942020	942031	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260892810
555	NC_013385	TGGCGG	2	12	942127	942138	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892810
556	NC_013385	CTGGCG	2	12	943275	943286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892812
557	NC_013385	GGGGGA	2	12	945671	945682	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260892814
558	NC_013385	ACCTGG	2	12	945712	945723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892815
559	NC_013385	GTGGCG	2	12	949928	949939	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892820
560	NC_013385	CGGTGG	2	12	950970	950981	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892820
561	NC_013385	GGGGAC	2	12	951224	951235	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892821
562	NC_013385	CAGGAC	2	12	957670	957681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892830
563	NC_013385	GGAGCG	2	12	959101	959112	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892831
564	NC_013385	CAGGAA	2	12	960338	960349	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260892835
565	NC_013385	CGCCAG	2	12	961191	961202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892835
566	NC_013385	GAGGTT	2	12	961497	961508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892835
567	NC_013385	CCTTCT	2	12	962996	963007	0 %	50 %	0 %	50 %	260892838
568	NC_013385	CACGGC	2	12	963934	963945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892839
569	NC_013385	TCCTGC	2	12	965210	965221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892840
570	NC_013385	CTGGCG	2	12	966911	966922	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892842
571	NC_013385	GTTCCT	2	12	967763	967774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260892842
572	NC_013385	GGAGGG	2	12	972727	972738	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260892848
573	NC_013385	TGCTGG	2	12	974600	974611	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892850
574	NC_013385	CTCCTT	2	12	977772	977783	0 %	50 %	0 %	50 %	260892853
575	NC_013385	CCTGCT	2	12	980948	980959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892856
576	NC_013385	TACGGC	2	12	981662	981673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892857
577	NC_013385	CCTTTA	2	12	986250	986261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260892860
578	NC_013385	CTTTAC	2	12	986946	986957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260892861
579	NC_013385	CCTCAT	2	12	990076	990087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260892863
580	NC_013385	CAAAGC	2	12	991315	991326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260892864
581	NC_013385	CGAAGA	2	12	992380	992391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
582	NC_013385	ACTCGG	2	12	1000995	1001006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892870
583	NC_013385	AGGTGC	2	12	1002488	1002499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892872
584	NC_013385	GGAGAG	2	12	1002892	1002903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892873
585	NC_013385	CGGGTG	2	12	1003013	1003024	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892873
586	NC_013385	TGGGAA	2	12	1004840	1004851	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260892875
587	NC_013385	AGGCGG	2	12	1004888	1004899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892875
588	NC_013385	TAAAAG	2	12	1007017	1007028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260892879
589	NC_013385	GTCCAG	2	12	1008621	1008632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892880
590	NC_013385	GGCCTG	2	12	1009534	1009545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013385	GCGGGC	2	12	1010475	1010486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892881
592	NC_013385	AGGAAA	2	12	1020176	1020187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892890
593	NC_013385	GTGGCA	2	12	1023164	1023175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892892
594	NC_013385	CGGCGA	2	12	1023427	1023438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892892
595	NC_013385	GCCTCT	2	12	1023768	1023779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892892
596	NC_013385	GGAAAG	2	12	1027076	1027087	50 %	0 %	50 %	0 %	260892896
597	NC_013385	GCTGGT	2	12	1027304	1027315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892897
598	NC_013385	AGTGGT	2	12	1028515	1028526	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892898
599	NC_013385	ACATAG	2	12	1029350	1029361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260892899
600	NC_013385	GAGGGA	2	12	1031491	1031502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892901
601	NC_013385	GTTAAA	2	12	1031952	1031963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260892903
602	NC_013385	AGGTGG	2	12	1036027	1036038	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260892906
603	NC_013385	GGCCTG	2	12	1036844	1036855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892908
604	NC_013385	GGTTGC	2	12	1038463	1038474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892910
605	NC_013385	TTGGCC	2	12	1038693	1038704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892910
606	NC_013385	GCTGGT	2	12	1041072	1041083	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
607	NC_013385	AGAAGG	2	12	1042183	1042194	50 %	0 %	50 %	0 %	260892911
608	NC_013385	CTTCAA	2	12	1042708	1042719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013385	TACCGT	2	12	1047189	1047200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892914
610	NC_013385	GGCAAG	2	12	1047777	1047788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892915
611	NC_013385	GGTTTT	2	12	1049543	1049554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260892916
612	NC_013385	TGAAAG	2	12	1052996	1053007	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013385	TAGTGG	2	12	1055868	1055879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892926
614	NC_013385	TCGATT	2	12	1056315	1056326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	260892926
615	NC_013385	GCGAAG	2	12	1062466	1062477	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892933
616	NC_013385	CCTGGC	2	12	1064346	1064357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
617	NC_013385	CGTTTT	2	12	1065371	1065382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260892935
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620	NC_013385	AGAAGG	2	12	1069416	1069427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013385	CTTCAA	2	12	1069941	1069952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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720	NC_013385	CACGGT	2	12	1237506	1237517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893089
721	NC_013385	GTAAAA	2	12	1238457	1238468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260893089
722	NC_013385	CTCCCA	2	12	1238796	1238807	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893090
723	NC_013385	CGTAAG	2	12	1239288	1239299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893090
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725	NC_013385	TTGAAG	2	12	1249282	1249293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
726	NC_013385	CCTTCT	2	12	1249807	1249818	0 %	50 %	0 %	50 %	260893102
727	NC_013385	CAAAGG	2	12	1250650	1250661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
728	NC_013385	AAGGAG	2	12	1251479	1251490	50 %	0 %	50 %	0 %	260893104
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730	NC_013385	TGGAGC	2	12	1255438	1255449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893107
731	NC_013385	CTATGG	2	12	1257637	1257648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893109
732	NC_013385	GCAGCC	2	12	1258547	1258558	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893111
733	NC_013385	TTGGCC	2	12	1259181	1259192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893111
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844	NC_013385	GCCCTC	2	12	1460623	1460634	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893304
845	NC_013385	TTGAAG	2	12	1462040	1462051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
846	NC_013385	CCTTCT	2	12	1462565	1462576	0 %	50 %	0 %	50 %	260893306
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851	NC_013385	CCCCTG	2	12	1472116	1472127	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893316
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854	NC_013385	GGCTTC	2	12	1478770	1478781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893324
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888	NC_013385	TCTCCT	2	12	1555231	1555242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
889	NC_013385	CTGCCC	2	12	1555612	1555623	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893412
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944	NC_013385	ACCTCC	2	12	1645840	1645851	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
945	NC_013385	CACCTC	2	12	1647428	1647439	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893505
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947	NC_013385	CGCAGG	2	12	1648949	1648960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893507
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949	NC_013385	GGGCCT	2	12	1649883	1649894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893508
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951	NC_013385	GGGTAG	2	12	1657808	1657819	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260893516
952	NC_013385	CCGCCA	2	12	1659606	1659617	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893518
953	NC_013385	GGCGCA	2	12	1662171	1662182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893519
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