MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013385	CCCCT	2	10	2091378	2091387	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1502	NC_013385	CTCCC	2	10	2091833	2091842	0 %	20 %	0 %	80 %	260893930
1503	NC_013385	CCAGA	2	10	2092284	2092293	40 %	0 %	20 %	40 %	260893931
1504	NC_013385	GCCCG	2	10	2093119	2093128	0 %	0 %	40 %	60 %	260893934
1505	NC_013385	AAAAG	2	10	2094066	2094075	80 %	0 %	20 %	0 %	260893935
1506	NC_013385	CCTTT	2	10	2094378	2094387	0 %	60 %	0 %	40 %	260893936
1507	NC_013385	CCATC	2	10	2094567	2094576	20 %	20 %	0 %	60 %	260893936
1508	NC_013385	GCCGG	2	10	2095351	2095360	0 %	0 %	60 %	40 %	260893936
1509	NC_013385	GCCAG	2	10	2095787	2095796	20 %	0 %	40 %	40 %	260893937
1510	NC_013385	GAAGG	2	10	2096057	2096066	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013385	CAAGA	2	10	2098748	2098757	60 %	0 %	20 %	20 %	260893941
1512	NC_013385	GCCGG	2	10	2101426	2101435	0 %	0 %	60 %	40 %	260893944
1513	NC_013385	CGCTT	2	10	2103868	2103877	0 %	40 %	20 %	40 %	260893947
1514	NC_013385	CAAGC	2	10	2104120	2104129	40 %	0 %	20 %	40 %	260893947
1515	NC_013385	GCTCC	2	10	2104331	2104340	0 %	20 %	20 %	60 %	260893947
1516	NC_013385	TCCGG	2	10	2107142	2107151	0 %	20 %	40 %	40 %	260893951
1517	NC_013385	GCGCC	2	10	2107274	2107283	0 %	0 %	40 %	60 %	260893951
1518	NC_013385	GGAAG	2	10	2108218	2108227	40 %	0 %	60 %	0 %	260893951
1519	NC_013385	CCAGG	2	10	2111443	2111452	20 %	0 %	40 %	40 %	260893956
1520	NC_013385	GCGCT	2	10	2112555	2112564	0 %	20 %	40 %	40 %	260893958
1521	NC_013385	TCGAG	2	10	2114823	2114832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1522	NC_013385	CCCCG	2	10	2116352	2116361	0 %	0 %	20 %	80 %	260893962
1523	NC_013385	CGTTG	2	10	2118613	2118622	0 %	40 %	40 %	20 %	260893964
1524	NC_013385	CCGCC	2	10	2119618	2119627	0 %	0 %	20 %	80 %	260893964
1525	NC_013385	CTGCT	2	10	2119823	2119832	0 %	40 %	20 %	40 %	260893964
1526	NC_013385	CACCG	2	10	2120041	2120050	20 %	0 %	20 %	60 %	260893965
1527	NC_013385	TCTGC	2	10	2120160	2120169	0 %	40 %	20 %	40 %	260893965
1528	NC_013385	ACCAC	2	10	2120926	2120935	40 %	0 %	0 %	60 %	260893967
1529	NC_013385	CTGCT	2	10	2122061	2122070	0 %	40 %	20 %	40 %	260893970
1530	NC_013385	CCCAG	2	10	2125317	2125326	20 %	0 %	20 %	60 %	260893975
1531	NC_013385	AGCCC	2	10	2126197	2126206	20 %	0 %	20 %	60 %	260893976
1532	NC_013385	ACCTC	2	10	2126538	2126547	20 %	20 %	0 %	60 %	260893977

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.