MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	CCGGA	2	10	712388	712397	20 %	0 %	40 %	40 %	260892589
502	NC_013385	GGCCC	2	10	713937	713946	0 %	0 %	40 %	60 %	260892590
503	NC_013385	CCTGC	2	10	714247	714256	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
504	NC_013385	GGAGG	2	10	716744	716753	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013385	ACCTT	2	10	717155	717164	20 %	40 %	0 %	40 %	260892595
506	NC_013385	TTCCA	2	10	717783	717792	20 %	40 %	0 %	40 %	260892596
507	NC_013385	TCCTT	2	10	718528	718537	0 %	60 %	0 %	40 %	260892597
508	NC_013385	TCCTA	2	10	718672	718681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
509	NC_013385	CCGTT	2	10	719569	719578	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
510	NC_013385	GGAGG	2	10	720570	720579	20 %	0 %	80 %	0 %	260892599
511	NC_013385	TTCCT	2	10	720807	720816	0 %	60 %	0 %	40 %	260892600
512	NC_013385	TCCCG	2	10	723721	723730	0 %	20 %	20 %	60 %	260892603
513	NC_013385	TCGTT	2	10	727005	727014	0 %	60 %	20 %	20 %	260892609
514	NC_013385	GCGCC	2	10	729005	729014	0 %	0 %	40 %	60 %	260892611
515	NC_013385	AAGGG	2	10	729481	729490	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013385	AGCTG	2	10	730392	730401	20 %	20 %	40 %	20 %	260892612
517	NC_013385	GGGAA	2	10	732209	732218	40 %	0 %	60 %	0 %	260892618
518	NC_013385	GCTTT	2	10	733238	733247	0 %	60 %	20 %	20 %	260892619
519	NC_013385	GTTCT	2	10	733259	733268	0 %	60 %	20 %	20 %	260892619
520	NC_013385	GCCCG	2	10	736403	736412	0 %	0 %	40 %	60 %	260892621
521	NC_013385	GGTGG	2	10	737780	737789	0 %	20 %	80 %	0 %	260892623
522	NC_013385	GGACA	2	10	738720	738729	40 %	0 %	40 %	20 %	260892624
523	NC_013385	GAGAA	2	10	739406	739415	60 %	0 %	40 %	0 %	260892624
524	NC_013385	CGGCG	2	10	741341	741350	0 %	0 %	60 %	40 %	260892628
525	NC_013385	CGGTG	2	10	742977	742986	0 %	20 %	60 %	20 %	260892630
526	NC_013385	GGGAG	2	10	746795	746804	20 %	0 %	80 %	0 %	260892632
527	NC_013385	GGACG	2	10	748706	748715	20 %	0 %	60 %	20 %	260892636
528	NC_013385	AGGGA	2	10	749433	749442	40 %	0 %	60 %	0 %	260892636
529	NC_013385	TCCCG	2	10	751183	751192	0 %	20 %	20 %	60 %	260892639
530	NC_013385	CGGCC	2	10	751524	751533	0 %	0 %	40 %	60 %	260892639
531	NC_013385	CGGCG	2	10	751948	751957	0 %	0 %	60 %	40 %	260892639
532	NC_013385	AGAGA	2	10	754480	754489	60 %	0 %	40 %	0 %	260892642
533	NC_013385	CTGCC	2	10	754650	754659	0 %	20 %	20 %	60 %	260892642
534	NC_013385	GGCAA	2	10	756807	756816	40 %	0 %	40 %	20 %	260892644
535	NC_013385	CGGGC	2	10	757385	757394	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
536	NC_013385	GCTCC	2	10	758740	758749	0 %	20 %	20 %	60 %	260892645
537	NC_013385	CATCC	2	10	760410	760419	20 %	20 %	0 %	60 %	260892647
538	NC_013385	CTTTT	2	10	765390	765399	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_013385	AGCTC	2	10	765650	765659	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
540	NC_013385	CCGGC	2	10	768281	768290	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
541	NC_013385	CTTTT	2	10	768305	768314	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
542	NC_013385	AGGGC	2	10	771532	771541	20 %	0 %	60 %	20 %	260892657
543	NC_013385	GAGGT	2	10	772596	772605	20 %	20 %	60 %	0 %	260892659
544	NC_013385	ACCGC	2	10	773569	773578	20 %	0 %	20 %	60 %	260892661
545	NC_013385	GGCGC	2	10	773864	773873	0 %	0 %	60 %	40 %	260892661
546	NC_013385	GCCGT	2	10	774605	774614	0 %	20 %	40 %	40 %	260892662
547	NC_013385	GGGGC	2	10	774781	774790	0 %	0 %	80 %	20 %	260892663
548	NC_013385	CCGCC	2	10	775877	775886	0 %	0 %	20 %	80 %	260892664
549	NC_013385	CGGGG	2	10	779105	779114	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
550	NC_013385	CGCGG	2	10	779540	779549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
551	NC_013385	GAAGG	2	10	780711	780720	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013385	CCTGG	2	10	784265	784274	0 %	20 %	40 %	40 %	260892672
553	NC_013385	CTGGC	2	10	785683	785692	0 %	20 %	40 %	40 %	260892674
554	NC_013385	GGGGA	2	10	786772	786781	20 %	0 %	80 %	0 %	260892675
555	NC_013385	GGCCG	2	10	787450	787459	0 %	0 %	60 %	40 %	260892675
556	NC_013385	GAGAG	2	10	787522	787531	40 %	0 %	60 %	0 %	260892675
557	NC_013385	GGACG	2	10	788787	788796	20 %	0 %	60 %	20 %	260892676
558	NC_013385	CGCGC	2	10	789163	789172	0 %	0 %	40 %	60 %	260892677
559	NC_013385	CTCGT	2	10	790094	790103	0 %	40 %	20 %	40 %	260892678
560	NC_013385	GGAGG	2	10	791991	792000	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013385	CGGCG	2	10	793603	793612	0 %	0 %	60 %	40 %	260892683
562	NC_013385	GGCCC	2	10	794231	794240	0 %	0 %	40 %	60 %	260892683
563	NC_013385	GCCCC	2	10	795581	795590	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
564	NC_013385	CTTTT	2	10	797389	797398	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
565	NC_013385	GGGGA	2	10	798813	798822	20 %	0 %	80 %	0 %	260892687
566	NC_013385	CGGGC	2	10	799538	799547	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
567	NC_013385	GCCGA	2	10	800964	800973	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
568	NC_013385	CCCGG	2	10	803355	803364	0 %	0 %	40 %	60 %	260892690
569	NC_013385	CCGGG	2	10	803660	803669	0 %	0 %	60 %	40 %	260892690
570	NC_013385	CTTTC	2	10	804298	804307	0 %	60 %	0 %	40 %	260892691
571	NC_013385	GTGGA	2	10	806723	806732	20 %	20 %	60 %	0 %	260892694
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574	NC_013385	CCGGG	2	10	813389	813398	0 %	0 %	60 %	40 %	260892700
575	NC_013385	CGGCA	2	10	815526	815535	20 %	0 %	40 %	40 %	260892700
576	NC_013385	CCGGG	2	10	816232	816241	0 %	0 %	60 %	40 %	260892701
577	NC_013385	CCAGA	2	10	816940	816949	40 %	0 %	20 %	40 %	260892701
578	NC_013385	CCCCG	2	10	818136	818145	0 %	0 %	20 %	80 %	260892703
579	NC_013385	CCTTT	2	10	820599	820608	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
580	NC_013385	GCGTC	2	10	821726	821735	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
581	NC_013385	GTGGA	2	10	822000	822009	20 %	20 %	60 %	0 %	260892705
582	NC_013385	TGAAG	2	10	824849	824858	40 %	20 %	40 %	0 %	260892709
583	NC_013385	CGAAG	2	10	825005	825014	40 %	0 %	40 %	20 %	260892709
584	NC_013385	GGAGG	2	10	826063	826072	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013385	ACCGC	2	10	827862	827871	20 %	0 %	20 %	60 %	260892713
586	NC_013385	CCTGA	2	10	829137	829146	20 %	20 %	20 %	40 %	260892714
587	NC_013385	CTGGT	2	10	831169	831178	0 %	40 %	40 %	20 %	260892716
588	NC_013385	TCCCG	2	10	832134	832143	0 %	20 %	20 %	60 %	260892716
589	NC_013385	GGGAG	2	10	832445	832454	20 %	0 %	80 %	0 %	260892716
590	NC_013385	GGGAG	2	10	832885	832894	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013385	CCCGA	2	10	833543	833552	20 %	0 %	20 %	60 %	260892718
592	NC_013385	ATGTG	2	10	833689	833698	20 %	40 %	40 %	0 %	260892718
593	NC_013385	GGTCT	2	10	834569	834578	0 %	40 %	40 %	20 %	260892718
594	NC_013385	AAAAG	2	10	835366	835375	80 %	0 %	20 %	0 %	260892718
595	NC_013385	GGGAG	2	10	836092	836101	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013385	AAGGG	2	10	836547	836556	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013385	TTACC	2	10	838859	838868	20 %	40 %	0 %	40 %	260892720
598	NC_013385	CCAGT	2	10	839323	839332	20 %	20 %	20 %	40 %	260892720
599	NC_013385	CGGAA	2	10	840271	840280	40 %	0 %	40 %	20 %	260892720
600	NC_013385	TCCCG	2	10	842333	842342	0 %	20 %	20 %	60 %	260892721
601	NC_013385	GGCTG	2	10	842561	842570	0 %	20 %	60 %	20 %	260892721
602	NC_013385	CTTTT	2	10	844995	845004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
603	NC_013385	CTTTT	2	10	845633	845642	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
604	NC_013385	AAGGG	2	10	851113	851122	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013385	AGGAG	2	10	852639	852648	40 %	0 %	60 %	0 %	260892729
606	NC_013385	CCACC	2	10	853001	853010	20 %	0 %	0 %	80 %	260892730
607	NC_013385	CAGGG	2	10	853265	853274	20 %	0 %	60 %	20 %	260892731
608	NC_013385	GGAAG	2	10	856326	856335	40 %	0 %	60 %	0 %	260892735
609	NC_013385	ACGCG	2	10	857154	857163	20 %	0 %	40 %	40 %	260892735
610	NC_013385	GAAAG	2	10	858419	858428	60 %	0 %	40 %	0 %	260892737
611	NC_013385	CCGGA	2	10	858659	858668	20 %	0 %	40 %	40 %	260892738
612	NC_013385	CCGGG	2	10	859640	859649	0 %	0 %	60 %	40 %	260892738
613	NC_013385	CTGGC	2	10	867021	867030	0 %	20 %	40 %	40 %	260892747
614	NC_013385	GGAGC	2	10	867077	867086	20 %	0 %	60 %	20 %	260892747
615	NC_013385	CGGCG	2	10	867181	867190	0 %	0 %	60 %	40 %	260892747
616	NC_013385	AAGCC	2	10	871942	871951	40 %	0 %	20 %	40 %	260892749
617	NC_013385	CCCAC	2	10	873924	873933	20 %	0 %	0 %	80 %	260892752
618	NC_013385	CCTTT	2	10	875036	875045	0 %	60 %	0 %	40 %	260892753
619	NC_013385	AGGAG	2	10	877497	877506	40 %	0 %	60 %	0 %	260892756
620	NC_013385	CTTTG	2	10	877856	877865	0 %	60 %	20 %	20 %	260892757
621	NC_013385	TTTTC	2	10	877903	877912	0 %	80 %	0 %	20 %	260892757
622	NC_013385	GGGGA	2	10	884546	884555	20 %	0 %	80 %	0 %	260892762
623	NC_013385	CCGGT	2	10	885074	885083	0 %	20 %	40 %	40 %	260892762
624	NC_013385	CGGCG	2	10	885647	885656	0 %	0 %	60 %	40 %	260892763
625	NC_013385	TGGAA	2	10	886049	886058	40 %	20 %	40 %	0 %	260892763
626	NC_013385	CGGGC	2	10	886112	886121	0 %	0 %	60 %	40 %	260892763
627	NC_013385	GGCGG	2	10	886341	886350	0 %	0 %	80 %	20 %	260892763
628	NC_013385	GGGGA	2	10	887701	887710	20 %	0 %	80 %	0 %	260892765
629	NC_013385	GGAAC	2	10	887722	887731	40 %	0 %	40 %	20 %	260892765
630	NC_013385	GTGGC	2	10	887846	887855	0 %	20 %	60 %	20 %	260892765
631	NC_013385	CCCGC	2	10	890538	890547	0 %	0 %	20 %	80 %	260892767
632	NC_013385	GGGCT	2	10	890887	890896	0 %	20 %	60 %	20 %	260892768
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