MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 2095

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 45Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013205	CGATT	2	10	2878103	2878112	20 %	40 %	20 %	20 %	258512777
2002	NC_013205	GCGCC	2	10	2878292	2878301	0 %	0 %	40 %	60 %	258512778
2003	NC_013205	TCCGC	2	10	2880903	2880912	0 %	20 %	20 %	60 %	258512780
2004	NC_013205	CGGCG	2	10	2885027	2885036	0 %	0 %	60 %	40 %	258512784
2005	NC_013205	TCCGC	2	10	2885535	2885544	0 %	20 %	20 %	60 %	258512784
2006	NC_013205	GCGCC	2	10	2886743	2886752	0 %	0 %	40 %	60 %	258512785
2007	NC_013205	GCCAA	2	10	2886804	2886813	40 %	0 %	20 %	40 %	258512785
2008	NC_013205	CGATG	2	10	2887076	2887085	20 %	20 %	40 %	20 %	258512785
2009	NC_013205	CGGGT	2	10	2887381	2887390	0 %	20 %	60 %	20 %	258512786
2010	NC_013205	TCAAC	2	10	2887734	2887743	40 %	20 %	0 %	40 %	258512786
2011	NC_013205	CGCGG	2	10	2889368	2889377	0 %	0 %	60 %	40 %	258512788
2012	NC_013205	CTATG	2	10	2889979	2889988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2013	NC_013205	CCCCG	2	10	2890055	2890064	0 %	0 %	20 %	80 %	258512789
2014	NC_013205	TCTCC	2	10	2892218	2892227	0 %	40 %	0 %	60 %	258512791
2015	NC_013205	GCGCG	2	10	2893681	2893690	0 %	0 %	60 %	40 %	258512793
2016	NC_013205	CCGGC	2	10	2894154	2894163	0 %	0 %	40 %	60 %	258512793
2017	NC_013205	TTCTG	2	10	2894657	2894666	0 %	60 %	20 %	20 %	258512793
2018	NC_013205	TATGC	2	10	2896954	2896963	20 %	40 %	20 %	20 %	258512796
2019	NC_013205	CCGTC	2	10	2899837	2899846	0 %	20 %	20 %	60 %	258512799
2020	NC_013205	TTCGA	2	10	2904763	2904772	20 %	40 %	20 %	20 %	258512804
2021	NC_013205	CGGAT	2	10	2907476	2907485	20 %	20 %	40 %	20 %	258512807
2022	NC_013205	GGGCG	2	10	2908117	2908126	0 %	0 %	80 %	20 %	258512807
2023	NC_013205	ACGCT	2	10	2909046	2909055	20 %	20 %	20 %	40 %	258512808
2024	NC_013205	TCTTA	2	10	2909402	2909411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2025	NC_013205	GGCGA	2	10	2909792	2909801	20 %	0 %	60 %	20 %	258512810
2026	NC_013205	CTCTC	2	10	2910370	2910379	0 %	40 %	0 %	60 %	258512811
2027	NC_013205	CTCAC	2	10	2911054	2911063	20 %	20 %	0 %	60 %	258512811
2028	NC_013205	GCCCC	2	10	2911328	2911337	0 %	0 %	20 %	80 %	258512811
2029	NC_013205	TCGCG	2	10	2912270	2912279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2030	NC_013205	TCGCC	2	10	2912315	2912324	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2031	NC_013205	TGGGA	2	10	2912617	2912626	20 %	20 %	60 %	0 %	258512813
2032	NC_013205	ATTGA	2	10	2913388	2913397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_013205	CCCAG	2	10	2913709	2913718	20 %	0 %	20 %	60 %	258512814
2034	NC_013205	GCGGT	2	10	2916899	2916908	0 %	20 %	60 %	20 %	258512817
2035	NC_013205	TTCCC	2	10	2916946	2916955	0 %	40 %	0 %	60 %	258512817
2036	NC_013205	AGCGC	2	10	2917096	2917105	20 %	0 %	40 %	40 %	258512817
2037	NC_013205	AACCG	2	10	2917403	2917412	40 %	0 %	20 %	40 %	258512817
2038	NC_013205	CACTG	2	10	2917659	2917668	20 %	20 %	20 %	40 %	258512817
2039	NC_013205	CGCGC	2	10	2917809	2917818	0 %	0 %	40 %	60 %	258512817
2040	NC_013205	ACCGC	2	10	2918116	2918125	20 %	0 %	20 %	60 %	258512818
2041	NC_013205	ACTTC	2	10	2918751	2918760	20 %	40 %	0 %	40 %	258512819
2042	NC_013205	CAACA	2	10	2928777	2928786	60 %	0 %	0 %	40 %	258512828
2043	NC_013205	AAGGA	2	10	2933040	2933049	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_013205	CCACC	2	10	2935987	2935996	20 %	0 %	0 %	80 %	258512833
2045	NC_013205	CAACC	2	10	2936838	2936847	40 %	0 %	0 %	60 %	258512833
2046	NC_013205	TTCCC	2	10	2938523	2938532	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2047	NC_013205	TCAAC	2	10	2938625	2938634	40 %	20 %	0 %	40 %	258512834
2048	NC_013205	GCAGC	2	10	2941889	2941898	20 %	0 %	40 %	40 %	258512838
2049	NC_013205	CGCGA	2	10	2943234	2943243	20 %	0 %	40 %	40 %	258512839
2050	NC_013205	CTCGC	2	10	2943739	2943748	0 %	20 %	20 %	60 %	258512839
2051	NC_013205	GGCCG	2	10	2944037	2944046	0 %	0 %	60 %	40 %	258512840
2052	NC_013205	TCGCG	2	10	2946909	2946918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2053	NC_013205	CGCGG	2	10	2947768	2947777	0 %	0 %	60 %	40 %	258512843
2054	NC_013205	ATCCG	2	10	2953685	2953694	20 %	20 %	20 %	40 %	258512847
2055	NC_013205	CGCGC	2	10	2956026	2956035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2056	NC_013205	GCGAC	2	10	2956246	2956255	20 %	0 %	40 %	40 %	258512849
2057	NC_013205	GCGAA	2	10	2957308	2957317	40 %	0 %	40 %	20 %	258512850
2058	NC_013205	GCGGG	2	10	2958638	2958647	0 %	0 %	80 %	20 %	258512850
2059	NC_013205	TGAGG	2	10	2963098	2963107	20 %	20 %	60 %	0 %	258512854
2060	NC_013205	GCGCC	2	10	2967015	2967024	0 %	0 %	40 %	60 %	258512857
2061	NC_013205	CGCGC	2	10	2967955	2967964	0 %	0 %	40 %	60 %	258512858
2062	NC_013205	CAGCC	2	10	2970006	2970015	20 %	0 %	20 %	60 %	258512859
2063	NC_013205	TTTGA	2	10	2972353	2972362	20 %	60 %	20 %	0 %	258512861
2064	NC_013205	CGAGA	2	10	2977599	2977608	40 %	0 %	40 %	20 %	258512865
2065	NC_013205	ACTCC	2	10	2978428	2978437	20 %	20 %	0 %	60 %	258512866
2066	NC_013205	GGCGA	2	10	2979789	2979798	20 %	0 %	60 %	20 %	258512866
2067	NC_013205	GCGCC	2	10	2980830	2980839	0 %	0 %	40 %	60 %	258512867
2068	NC_013205	TTCAC	2	10	2981253	2981262	20 %	40 %	0 %	40 %	258512868
2069	NC_013205	CAGCG	2	10	2981470	2981479	20 %	0 %	40 %	40 %	258512868
2070	NC_013205	CGTGC	2	10	2981899	2981908	0 %	20 %	40 %	40 %	258512868
2071	NC_013205	TGGAA	2	10	2984777	2984786	40 %	20 %	40 %	0 %	258512871
2072	NC_013205	GCGTC	2	10	2986672	2986681	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2073	NC_013205	GTTCC	2	10	2986971	2986980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2074	NC_013205	TCCCA	2	10	2987463	2987472	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2075	NC_013205	CCCAT	2	10	2987632	2987641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2076	NC_013205	CGGCG	2	10	2990013	2990022	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2077	NC_013205	CCTCG	2	10	2991066	2991075	0 %	20 %	20 %	60 %	258512875
2078	NC_013205	GCGCG	2	10	2994109	2994118	0 %	0 %	60 %	40 %	258512878
2079	NC_013205	CGGCT	2	10	2994130	2994139	0 %	20 %	40 %	40 %	258512878
2080	NC_013205	CGGCG	2	10	2994906	2994915	0 %	0 %	60 %	40 %	258512879
2081	NC_013205	GTTCC	2	10	2998379	2998388	0 %	40 %	20 %	40 %	258512882
2082	NC_013205	GCCGT	2	10	3000963	3000972	0 %	20 %	40 %	40 %	258512887
2083	NC_013205	CCTTC	2	10	3001654	3001663	0 %	40 %	0 %	60 %	258512889
2084	NC_013205	GGCCT	2	10	3003761	3003770	0 %	20 %	40 %	40 %	258512891
2085	NC_013205	TTCGA	2	10	3006265	3006274	20 %	40 %	20 %	20 %	258512894
2086	NC_013205	TCCAG	2	10	3006491	3006500	20 %	20 %	20 %	40 %	258512894
2087	NC_013205	TTTCA	2	10	3007843	3007852	20 %	60 %	0 %	20 %	258512896
2088	NC_013205	CGAGC	2	10	3011893	3011902	20 %	0 %	40 %	40 %	258512901
2089	NC_013205	GCACA	2	10	3012175	3012184	40 %	0 %	20 %	40 %	258512901
2090	NC_013205	CGTTC	2	10	3013235	3013244	0 %	40 %	20 %	40 %	258512902
2091	NC_013205	TGGAG	2	10	3013375	3013384	20 %	20 %	60 %	0 %	258512902
2092	NC_013205	GTCCC	2	10	3013537	3013546	0 %	20 %	20 %	60 %	258512902
2093	NC_013205	CGGGA	2	10	3013682	3013691	20 %	0 %	60 %	20 %	258512902
2094	NC_013205	CTCGC	2	10	3015703	3015712	0 %	20 %	20 %	60 %	258512903
2095	NC_013205	CGCTC	2	10	3016773	3016782	0 %	20 %	20 %	60 %	258512905

< Previous 1 2 3 45Next >