MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 2095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	GATGA	2	10	1454664	1454673	40 %	20 %	40 %	0 %	258511384
1002	NC_013205	CGCGG	2	10	1458812	1458821	0 %	0 %	60 %	40 %	258511391
1003	NC_013205	TCGCG	2	10	1459133	1459142	0 %	20 %	40 %	40 %	258511391
1004	NC_013205	GAGCG	2	10	1460005	1460014	20 %	0 %	60 %	20 %	258511392
1005	NC_013205	GTTTG	2	10	1460954	1460963	0 %	60 %	40 %	0 %	258511392
1006	NC_013205	CGTCG	2	10	1461712	1461721	0 %	20 %	40 %	40 %	258511393
1007	NC_013205	CCGCG	2	10	1464743	1464752	0 %	0 %	40 %	60 %	258511395
1008	NC_013205	GACGC	2	10	1465143	1465152	20 %	0 %	40 %	40 %	258511395
1009	NC_013205	GCGCG	2	10	1466449	1466458	0 %	0 %	60 %	40 %	258511396
1010	NC_013205	GCTGC	2	10	1471010	1471019	0 %	20 %	40 %	40 %	258511402
1011	NC_013205	ATGAC	2	10	1475025	1475034	40 %	20 %	20 %	20 %	258511407
1012	NC_013205	GCGCC	2	10	1476661	1476670	0 %	0 %	40 %	60 %	258511408
1013	NC_013205	GCACG	2	10	1479472	1479481	20 %	0 %	40 %	40 %	258511408
1014	NC_013205	AGGTG	2	10	1480670	1480679	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013205	ATCGC	2	10	1480746	1480755	20 %	20 %	20 %	40 %	258511410
1016	NC_013205	GGCGC	2	10	1481731	1481740	0 %	0 %	60 %	40 %	258511411
1017	NC_013205	CCTCG	2	10	1482724	1482733	0 %	20 %	20 %	60 %	258511411
1018	NC_013205	CGAGG	2	10	1483620	1483629	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_013205	GTGGA	2	10	1484998	1485007	20 %	20 %	60 %	0 %	258511413
1020	NC_013205	GATGA	2	10	1486036	1486045	40 %	20 %	40 %	0 %	258511415
1021	NC_013205	GCCGC	2	10	1487692	1487701	0 %	0 %	40 %	60 %	258511415
1022	NC_013205	AATCG	2	10	1488165	1488174	40 %	20 %	20 %	20 %	258511415
1023	NC_013205	TCGCG	2	10	1493001	1493010	0 %	20 %	40 %	40 %	258511422
1024	NC_013205	GGCGA	2	10	1493891	1493900	20 %	0 %	60 %	20 %	258511422
1025	NC_013205	GCCGA	2	10	1493914	1493923	20 %	0 %	40 %	40 %	258511422
1026	NC_013205	CTCGC	2	10	1495677	1495686	0 %	20 %	20 %	60 %	258511423
1027	NC_013205	AGGCG	2	10	1495973	1495982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_013205	CGACG	2	10	1497474	1497483	20 %	0 %	40 %	40 %	258511425
1029	NC_013205	TTTCG	2	10	1499550	1499559	0 %	60 %	20 %	20 %	258511428
1030	NC_013205	CGGCG	2	10	1503267	1503276	0 %	0 %	60 %	40 %	258511431
1031	NC_013205	AGCGC	2	10	1504371	1504380	20 %	0 %	40 %	40 %	258511432
1032	NC_013205	GTGAG	2	10	1505743	1505752	20 %	20 %	60 %	0 %	258511432
1033	NC_013205	CGGTT	2	10	1506259	1506268	0 %	40 %	40 %	20 %	258511433
1034	NC_013205	ATCGA	2	10	1507947	1507956	40 %	20 %	20 %	20 %	258511434
1035	NC_013205	TGGCT	2	10	1508169	1508178	0 %	40 %	40 %	20 %	258511435
1036	NC_013205	TCGCG	2	10	1508413	1508422	0 %	20 %	40 %	40 %	258511435
1037	NC_013205	GCCGC	2	10	1509472	1509481	0 %	0 %	40 %	60 %	258511436
1038	NC_013205	CAGCG	2	10	1511639	1511648	20 %	0 %	40 %	40 %	258511437
1039	NC_013205	TCGTC	2	10	1513262	1513271	0 %	40 %	20 %	40 %	258511439
1040	NC_013205	AAGCG	2	10	1513822	1513831	40 %	0 %	40 %	20 %	258511439
1041	NC_013205	CGGGT	2	10	1514319	1514328	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_013205	GGAGT	2	10	1520972	1520981	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013205	GAGCG	2	10	1522312	1522321	20 %	0 %	60 %	20 %	258511447
1044	NC_013205	TCGGT	2	10	1524445	1524454	0 %	40 %	40 %	20 %	258511450
1045	NC_013205	AGACA	2	10	1526241	1526250	60 %	0 %	20 %	20 %	258511451
1046	NC_013205	CGAAG	2	10	1535721	1535730	40 %	0 %	40 %	20 %	258511460
1047	NC_013205	GCCTC	2	10	1536070	1536079	0 %	20 %	20 %	60 %	258511461
1048	NC_013205	ATCGC	2	10	1536303	1536312	20 %	20 %	20 %	40 %	258511461
1049	NC_013205	TGGAC	2	10	1536360	1536369	20 %	20 %	40 %	20 %	258511461
1050	NC_013205	GCGCC	2	10	1536546	1536555	0 %	0 %	40 %	60 %	258511461
1051	NC_013205	CTCGT	2	10	1538404	1538413	0 %	40 %	20 %	40 %	258511462
1052	NC_013205	GCGGG	2	10	1541093	1541102	0 %	0 %	80 %	20 %	258511466
1053	NC_013205	CCCCG	2	10	1541503	1541512	0 %	0 %	20 %	80 %	258511466
1054	NC_013205	AGGCG	2	10	1542022	1542031	20 %	0 %	60 %	20 %	258511466
1055	NC_013205	GCGAG	2	10	1542945	1542954	20 %	0 %	60 %	20 %	258511466
1056	NC_013205	CGCCA	2	10	1543735	1543744	20 %	0 %	20 %	60 %	258511467
1057	NC_013205	CCGAG	2	10	1547419	1547428	20 %	0 %	40 %	40 %	258511470
1058	NC_013205	GGAAG	2	10	1549614	1549623	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013205	TCCAA	2	10	1551631	1551640	40 %	20 %	0 %	40 %	258511475
1060	NC_013205	TCAAC	2	10	1555584	1555593	40 %	20 %	0 %	40 %	258511478
1061	NC_013205	CGTGG	2	10	1557604	1557613	0 %	20 %	60 %	20 %	258511481
1062	NC_013205	AATGA	2	10	1558212	1558221	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013205	GCTTG	2	10	1558361	1558370	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_013205	GTTCG	2	10	1559076	1559085	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_013205	CCGAT	2	10	1559263	1559272	20 %	20 %	20 %	40 %	258511482
1066	NC_013205	CGTGA	2	10	1561846	1561855	20 %	20 %	40 %	20 %	258511484
1067	NC_013205	GATTC	2	10	1564605	1564614	20 %	40 %	20 %	20 %	258511486
1068	NC_013205	CGTGG	2	10	1564742	1564751	0 %	20 %	60 %	20 %	258511487
1069	NC_013205	CGCTT	2	10	1565426	1565435	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_013205	CGCGC	2	10	1565945	1565954	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1071	NC_013205	GGAAG	2	10	1571888	1571897	40 %	0 %	60 %	0 %	258511490
1072	NC_013205	TCAAT	2	10	1573643	1573652	40 %	40 %	0 %	20 %	258511492
1073	NC_013205	ACGAT	2	10	1574319	1574328	40 %	20 %	20 %	20 %	258511492
1074	NC_013205	CTGCA	2	10	1575095	1575104	20 %	20 %	20 %	40 %	258511493
1075	NC_013205	CAGCG	2	10	1578153	1578162	20 %	0 %	40 %	40 %	258511497
1076	NC_013205	CCTGA	2	10	1578717	1578726	20 %	20 %	20 %	40 %	258511497
1077	NC_013205	TTTGC	2	10	1580029	1580038	0 %	60 %	20 %	20 %	258511498
1078	NC_013205	CACGT	2	10	1581512	1581521	20 %	20 %	20 %	40 %	258511500
1079	NC_013205	AGAAA	2	10	1582499	1582508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013205	GGGTG	2	10	1582925	1582934	0 %	20 %	80 %	0 %	258511501
1081	NC_013205	TAGGA	2	10	1583042	1583051	40 %	20 %	40 %	0 %	258511501
1082	NC_013205	CGCGG	2	10	1583706	1583715	0 %	0 %	60 %	40 %	258511502
1083	NC_013205	GTTGT	2	10	1585014	1585023	0 %	60 %	40 %	0 %	258511503
1084	NC_013205	TTGGA	2	10	1586218	1586227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013205	ATGGT	2	10	1592909	1592918	20 %	40 %	40 %	0 %	258511507
1086	NC_013205	TGCGA	2	10	1594270	1594279	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_013205	GGAAG	2	10	1595920	1595929	40 %	0 %	60 %	0 %	258511510
1088	NC_013205	AGAGA	2	10	1597528	1597537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013205	CTGGT	2	10	1600044	1600053	0 %	40 %	40 %	20 %	258511512
1090	NC_013205	GCGCG	2	10	1601569	1601578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1091	NC_013205	TTATA	2	10	1603172	1603181	40 %	60 %	0 %	0 %	258511515
1092	NC_013205	ATAGA	2	10	1604197	1604206	60 %	20 %	20 %	0 %	258511516
1093	NC_013205	GTTTG	2	10	1607816	1607825	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_013205	CCGCT	2	10	1611117	1611126	0 %	20 %	20 %	60 %	258511520
1095	NC_013205	TTGGA	2	10	1612814	1612823	20 %	40 %	40 %	0 %	258511521
1096	NC_013205	CCACG	2	10	1617799	1617808	20 %	0 %	20 %	60 %	258511523
1097	NC_013205	GAATC	2	10	1617936	1617945	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_013205	GGAAG	2	10	1618412	1618421	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_013205	GAATT	2	10	1619403	1619412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013205	GGCGC	2	10	1620059	1620068	0 %	0 %	60 %	40 %	258511524
1101	NC_013205	GCAGG	2	10	1622433	1622442	20 %	0 %	60 %	20 %	258511525
1102	NC_013205	GGATT	2	10	1622759	1622768	20 %	40 %	40 %	0 %	258511526
1103	NC_013205	GGCGC	2	10	1627200	1627209	0 %	0 %	60 %	40 %	258511530
1104	NC_013205	CGATG	2	10	1627643	1627652	20 %	20 %	40 %	20 %	258511530
1105	NC_013205	GTGGC	2	10	1632655	1632664	0 %	20 %	60 %	20 %	258511534
1106	NC_013205	GGCGC	2	10	1633077	1633086	0 %	0 %	60 %	40 %	258511535
1107	NC_013205	AGCGA	2	10	1633593	1633602	40 %	0 %	40 %	20 %	258511537
1108	NC_013205	GCAAG	2	10	1633729	1633738	40 %	0 %	40 %	20 %	258511537
1109	NC_013205	GCGCG	2	10	1633966	1633975	0 %	0 %	60 %	40 %	258511537
1110	NC_013205	CTTCA	2	10	1637649	1637658	20 %	40 %	0 %	40 %	258511540
1111	NC_013205	CGAAG	2	10	1637660	1637669	40 %	0 %	40 %	20 %	258511540
1112	NC_013205	GTCCG	2	10	1639324	1639333	0 %	20 %	40 %	40 %	258511542
1113	NC_013205	CGAGG	2	10	1640609	1640618	20 %	0 %	60 %	20 %	258511543
1114	NC_013205	GAGAC	2	10	1641337	1641346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_013205	TTCGA	2	10	1641660	1641669	20 %	40 %	20 %	20 %	258511544
1116	NC_013205	GGTCG	2	10	1643366	1643375	0 %	20 %	60 %	20 %	258511545
1117	NC_013205	ACGTC	2	10	1645060	1645069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1118	NC_013205	AATCG	2	10	1648082	1648091	40 %	20 %	20 %	20 %	258511550
1119	NC_013205	CCACG	2	10	1648801	1648810	20 %	0 %	20 %	60 %	258511550
1120	NC_013205	ACGTG	2	10	1649079	1649088	20 %	20 %	40 %	20 %	258511550
1121	NC_013205	GCGCG	2	10	1650949	1650958	0 %	0 %	60 %	40 %	258511552
1122	NC_013205	GGCCC	2	10	1651300	1651309	0 %	0 %	40 %	60 %	258511552
1123	NC_013205	GCGCA	2	10	1654095	1654104	20 %	0 %	40 %	40 %	258511557
1124	NC_013205	ACCTG	2	10	1654766	1654775	20 %	20 %	20 %	40 %	258511558
1125	NC_013205	CGCGC	2	10	1657825	1657834	0 %	0 %	40 %	60 %	258511560
1126	NC_013205	GGACG	2	10	1658041	1658050	20 %	0 %	60 %	20 %	258511560
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1129	NC_013205	ACCGC	2	10	1662775	1662784	20 %	0 %	20 %	60 %	258511563
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1131	NC_013205	TCGCC	2	10	1663844	1663853	0 %	20 %	20 %	60 %	258511564
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1135	NC_013205	ATGTG	2	10	1665873	1665882	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013205	GAAGC	2	10	1666043	1666052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1169	NC_013205	GGCTT	2	10	1710814	1710823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1397	NC_013205	TCCGC	2	10	2029141	2029150	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1398	NC_013205	TGCCG	2	10	2029176	2029185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1455	NC_013205	GCTTG	2	10	2108676	2108685	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1499	NC_013205	ATCGT	2	10	2158304	2158313	20 %	40 %	20 %	20 %	258512066
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