MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	TCGT	2	8	52	59	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013205	TCGT	2	8	481	488	0 %	50 %	25 %	25 %	258510021
3	NC_013205	ACGA	2	8	682	689	50 %	0 %	25 %	25 %	258510021
4	NC_013205	CGCC	2	8	871	878	0 %	0 %	25 %	75 %	258510021
5	NC_013205	TTCG	2	8	908	915	0 %	50 %	25 %	25 %	258510021
6	NC_013205	CCAA	2	8	1040	1047	50 %	0 %	0 %	50 %	258510021
7	NC_013205	GAAG	2	8	1113	1120	50 %	0 %	50 %	0 %	258510021
8	NC_013205	TCCT	2	8	1621	1628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013205	GCCC	2	8	1928	1935	0 %	0 %	25 %	75 %	258510022
10	NC_013205	ATCG	2	8	2514	2521	25 %	25 %	25 %	25 %	258510022
11	NC_013205	GCTG	2	8	3523	3530	0 %	25 %	50 %	25 %	258510024
12	NC_013205	GCGG	2	8	4883	4890	0 %	0 %	75 %	25 %	258510025
13	NC_013205	GCAC	2	8	5083	5090	25 %	0 %	25 %	50 %	258510025
14	NC_013205	GATG	2	8	6041	6048	25 %	25 %	50 %	0 %	258510025
15	NC_013205	GCAT	2	8	6196	6203	25 %	25 %	25 %	25 %	258510026
16	NC_013205	AGGC	2	8	6368	6375	25 %	0 %	50 %	25 %	258510026
17	NC_013205	CACC	2	8	7731	7738	25 %	0 %	0 %	75 %	258510026
18	NC_013205	CGGC	2	8	7932	7939	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
19	NC_013205	GACG	2	8	8175	8182	25 %	0 %	50 %	25 %	258510026
20	NC_013205	GATG	2	8	8316	8323	25 %	25 %	50 %	0 %	258510026
21	NC_013205	TGGA	2	8	8681	8688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013205	CGGC	2	8	8940	8947	0 %	0 %	50 %	50 %	258510028
23	NC_013205	GCGG	2	8	9606	9613	0 %	0 %	75 %	25 %	258510028
24	NC_013205	GCTC	2	8	9902	9909	0 %	25 %	25 %	50 %	258510029
25	NC_013205	GCGG	2	8	10016	10023	0 %	0 %	75 %	25 %	258510029
26	NC_013205	GTCG	2	8	10364	10371	0 %	25 %	50 %	25 %	258510030
27	NC_013205	TGAC	2	8	11521	11528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013205	AGCC	2	8	12232	12239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013205	GCGA	2	8	12672	12679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013205	AGCC	2	8	12769	12776	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013205	GGCC	2	8	12808	12815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013205	GCGA	2	8	13095	13102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013205	GCGA	2	8	13452	13459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013205	ACCG	2	8	15148	15155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013205	GAAG	2	8	15270	15277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013205	GCGA	2	8	15428	15435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013205	GAGC	2	8	15540	15547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013205	AGCC	2	8	15557	15564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013205	GGGA	2	8	15641	15648	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013205	AGGT	2	8	15661	15668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013205	CAGC	2	8	15836	15843	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013205	ATCT	2	8	16461	16468	25 %	50 %	0 %	25 %	258510031
43	NC_013205	TTCG	2	8	16960	16967	0 %	50 %	25 %	25 %	258510031
44	NC_013205	GGCG	2	8	17099	17106	0 %	0 %	75 %	25 %	258510031
45	NC_013205	CGGC	2	8	17224	17231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510031
46	NC_013205	GCAG	2	8	17305	17312	25 %	0 %	50 %	25 %	258510031
47	NC_013205	GGTT	2	8	17697	17704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013205	GCCG	2	8	18056	18063	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
49	NC_013205	CGCC	2	8	18382	18389	0 %	0 %	25 %	75 %	258510032
50	NC_013205	CGAG	2	8	19500	19507	25 %	0 %	50 %	25 %	258510034
51	NC_013205	AGCG	2	8	19748	19755	25 %	0 %	50 %	25 %	258510034
52	NC_013205	CGAT	2	8	21038	21045	25 %	25 %	25 %	25 %	258510035
53	NC_013205	GCGT	2	8	21085	21092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013205	GCCG	2	8	21509	21516	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
55	NC_013205	GCCC	2	8	21772	21779	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
56	NC_013205	GGCG	2	8	22127	22134	0 %	0 %	75 %	25 %	258510036
57	NC_013205	CCGC	2	8	22408	22415	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
58	NC_013205	CAGC	2	8	22481	22488	25 %	0 %	25 %	50 %	258510036
59	NC_013205	GCTG	2	8	22636	22643	0 %	25 %	50 %	25 %	258510036
60	NC_013205	CGCC	2	8	22748	22755	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
61	NC_013205	ATGT	2	8	22996	23003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013205	AACG	2	8	23629	23636	50 %	0 %	25 %	25 %	258510037
63	NC_013205	AGGA	2	8	23755	23762	50 %	0 %	50 %	0 %	258510037
64	NC_013205	ACTT	2	8	23879	23886	25 %	50 %	0 %	25 %	258510037
65	NC_013205	GTTA	2	8	24033	24040	25 %	50 %	25 %	0 %	258510037
66	NC_013205	CCAT	2	8	24339	24346	25 %	25 %	0 %	50 %	258510037
67	NC_013205	TGCT	2	8	24756	24763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013205	TCCA	2	8	24780	24787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013205	TTTC	2	8	24958	24965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013205	GACG	2	8	25343	25350	25 %	0 %	50 %	25 %	258510038
71	NC_013205	TGGA	2	8	26484	26491	25 %	25 %	50 %	0 %	258510039
72	NC_013205	TGAG	2	8	27847	27854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013205	ACTC	2	8	27856	27863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013205	GCGG	2	8	28104	28111	0 %	0 %	75 %	25 %	258510040
75	NC_013205	ACTG	2	8	28125	28132	25 %	25 %	25 %	25 %	258510040
76	NC_013205	GACG	2	8	28215	28222	25 %	0 %	50 %	25 %	258510040
77	NC_013205	TGTA	2	8	28949	28956	25 %	50 %	25 %	0 %	258510040
78	NC_013205	TCGC	2	8	29188	29195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013205	CGTC	2	8	29413	29420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013205	TGGA	2	8	29455	29462	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013205	GACC	2	8	29549	29556	25 %	0 %	25 %	50 %	258510041
82	NC_013205	CGAG	2	8	29623	29630	25 %	0 %	50 %	25 %	258510041
83	NC_013205	GTCA	2	8	30023	30030	25 %	25 %	25 %	25 %	258510041
84	NC_013205	CTTC	2	8	30339	30346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013205	TGGT	2	8	30632	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013205	GTAA	2	8	30716	30723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013205	ACGA	2	8	30820	30827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013205	ATGG	2	8	31344	31351	25 %	25 %	50 %	0 %	258510042
89	NC_013205	CGGT	2	8	32282	32289	0 %	25 %	50 %	25 %	258510043
90	NC_013205	GGAC	2	8	32351	32358	25 %	0 %	50 %	25 %	258510043
91	NC_013205	ACCA	2	8	32568	32575	50 %	0 %	0 %	50 %	258510043
92	NC_013205	GGCG	2	8	32870	32877	0 %	0 %	75 %	25 %	258510043
93	NC_013205	GAGC	2	8	33982	33989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013205	GGCG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
95	NC_013205	GGCG	2	8	34622	34629	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
96	NC_013205	TGTC	2	8	34822	34829	0 %	50 %	25 %	25 %	258510045
97	NC_013205	GCCC	2	8	34970	34977	0 %	0 %	25 %	75 %	258510045
98	NC_013205	CCGT	2	8	36137	36144	0 %	25 %	25 %	50 %	258510046
99	NC_013205	GGCG	2	8	36147	36154	0 %	0 %	75 %	25 %	258510046
100	NC_013205	CGCC	2	8	36441	36448	0 %	0 %	25 %	75 %	258510046
101	NC_013205	TGCG	2	8	36719	36726	0 %	25 %	50 %	25 %	258510046
102	NC_013205	CGTG	2	8	36767	36774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013205	AGGC	2	8	37638	37645	25 %	0 %	50 %	25 %	258510047
104	NC_013205	GGGC	2	8	37960	37967	0 %	0 %	75 %	25 %	258510047
105	NC_013205	CGGG	2	8	38403	38410	0 %	0 %	75 %	25 %	258510047
106	NC_013205	CACT	2	8	38544	38551	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013205	GCGG	2	8	38959	38966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013205	GACC	2	8	39049	39056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013205	GTAT	2	8	39391	39398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013205	GCCA	2	8	40353	40360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013205	CCCA	2	8	40368	40375	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_013205	CTAC	2	8	41364	41371	25 %	25 %	0 %	50 %	258510048
113	NC_013205	GATG	2	8	41591	41598	25 %	25 %	50 %	0 %	258510048
114	NC_013205	AGCG	2	8	42282	42289	25 %	0 %	50 %	25 %	258510049
115	NC_013205	GCCC	2	8	43613	43620	0 %	0 %	25 %	75 %	258510050
116	NC_013205	AACG	2	8	43692	43699	50 %	0 %	25 %	25 %	258510050
117	NC_013205	TGCC	2	8	43721	43728	0 %	25 %	25 %	50 %	258510050
118	NC_013205	CAGC	2	8	43776	43783	25 %	0 %	25 %	50 %	258510050
119	NC_013205	ACCC	2	8	43806	43813	25 %	0 %	0 %	75 %	258510050
120	NC_013205	CGGG	2	8	44431	44438	0 %	0 %	75 %	25 %	258510051
121	NC_013205	CCCG	2	8	44653	44660	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
122	NC_013205	GCCC	2	8	45283	45290	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
123	NC_013205	CGTC	2	8	45751	45758	0 %	25 %	25 %	50 %	258510052
124	NC_013205	AAAC	2	8	47081	47088	75 %	0 %	0 %	25 %	258510053
125	NC_013205	GGCG	2	8	47344	47351	0 %	0 %	75 %	25 %	258510053
126	NC_013205	GCCT	2	8	47528	47535	0 %	25 %	25 %	50 %	258510053
127	NC_013205	GGGC	2	8	47756	47763	0 %	0 %	75 %	25 %	258510054
128	NC_013205	TCCT	2	8	48152	48159	0 %	50 %	0 %	50 %	258510054
129	NC_013205	TCGC	2	8	48188	48195	0 %	25 %	25 %	50 %	258510054
130	NC_013205	AGGA	2	8	48650	48657	50 %	0 %	50 %	0 %	258510055
131	NC_013205	CCGC	2	8	48935	48942	0 %	0 %	25 %	75 %	258510056
132	NC_013205	GAGG	2	8	49039	49046	25 %	0 %	75 %	0 %	258510056
133	NC_013205	ATGC	2	8	49531	49538	25 %	25 %	25 %	25 %	258510057
134	NC_013205	CGGC	2	8	50207	50214	0 %	0 %	50 %	50 %	258510058
135	NC_013205	CGCC	2	8	50843	50850	0 %	0 %	25 %	75 %	258510058
136	NC_013205	GCCG	2	8	50907	50914	0 %	0 %	50 %	50 %	258510058
137	NC_013205	CGGC	2	8	50971	50978	0 %	0 %	50 %	50 %	258510059
138	NC_013205	TCGC	2	8	51111	51118	0 %	25 %	25 %	50 %	258510059
139	NC_013205	CAAG	2	8	51535	51542	50 %	0 %	25 %	25 %	258510059
140	NC_013205	CAGC	2	8	52220	52227	25 %	0 %	25 %	50 %	258510059
141	NC_013205	GCCG	2	8	52556	52563	0 %	0 %	50 %	50 %	258510059
142	NC_013205	GACG	2	8	52717	52724	25 %	0 %	50 %	25 %	258510060
143	NC_013205	CCGG	2	8	52739	52746	0 %	0 %	50 %	50 %	258510060
144	NC_013205	CAGG	2	8	53124	53131	25 %	0 %	50 %	25 %	258510060
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