MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 7679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_013205	GCGG	2	8	195578	195585	0 %	0 %	75 %	25 %	258510196
503	NC_013205	TTCC	2	8	195598	195605	0 %	50 %	0 %	50 %	258510196
504	NC_013205	GACG	2	8	196610	196617	25 %	0 %	50 %	25 %	258510196
505	NC_013205	AGCC	2	8	196921	196928	25 %	0 %	25 %	50 %	258510197
506	NC_013205	GATC	2	8	197932	197939	25 %	25 %	25 %	25 %	258510198
507	NC_013205	CGGC	2	8	198094	198101	0 %	0 %	50 %	50 %	258510198
508	NC_013205	CAGA	2	8	198391	198398	50 %	0 %	25 %	25 %	258510199
509	NC_013205	GAAG	2	8	198581	198588	50 %	0 %	50 %	0 %	258510199
510	NC_013205	CGAG	2	8	198897	198904	25 %	0 %	50 %	25 %	258510200
511	NC_013205	GCGG	2	8	199902	199909	0 %	0 %	75 %	25 %	258510200
512	NC_013205	GATC	2	8	200289	200296	25 %	25 %	25 %	25 %	258510200
513	NC_013205	GCAC	2	8	200840	200847	25 %	0 %	25 %	50 %	258510200
514	NC_013205	ACGT	2	8	201076	201083	25 %	25 %	25 %	25 %	258510200
515	NC_013205	ATCG	2	8	201838	201845	25 %	25 %	25 %	25 %	258510200
516	NC_013205	GGCG	2	8	202176	202183	0 %	0 %	75 %	25 %	258510200
517	NC_013205	TCGG	2	8	202342	202349	0 %	25 %	50 %	25 %	258510201
518	NC_013205	GACG	2	8	202372	202379	25 %	0 %	50 %	25 %	258510201
519	NC_013205	TCGC	2	8	202497	202504	0 %	25 %	25 %	50 %	258510201
520	NC_013205	CGGA	2	8	202900	202907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
521	NC_013205	CAGA	2	8	203075	203082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_013205	CGCA	2	8	203094	203101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_013205	TTCG	2	8	203203	203210	0 %	50 %	25 %	25 %	258510202
524	NC_013205	GATC	2	8	203763	203770	25 %	25 %	25 %	25 %	258510203
525	NC_013205	CGGC	2	8	203939	203946	0 %	0 %	50 %	50 %	258510203
526	NC_013205	GATC	2	8	204006	204013	25 %	25 %	25 %	25 %	258510203
527	NC_013205	ACGC	2	8	204139	204146	25 %	0 %	25 %	50 %	258510203
528	NC_013205	ATGA	2	8	204577	204584	50 %	25 %	25 %	0 %	258510203
529	NC_013205	GCTG	2	8	206033	206040	0 %	25 %	50 %	25 %	258510207
530	NC_013205	CGCA	2	8	207328	207335	25 %	0 %	25 %	50 %	258510209
531	NC_013205	TTCA	2	8	207957	207964	25 %	50 %	0 %	25 %	258510211
532	NC_013205	TGTA	2	8	208061	208068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013205	CGCC	2	8	208230	208237	0 %	0 %	25 %	75 %	258510212
534	NC_013205	CGCA	2	8	208430	208437	25 %	0 %	25 %	50 %	258510212
535	NC_013205	CTGC	2	8	208732	208739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_013205	GAGG	2	8	209053	209060	25 %	0 %	75 %	0 %	258510213
537	NC_013205	GACG	2	8	211017	211024	25 %	0 %	50 %	25 %	258510213
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540	NC_013205	GTGG	2	8	212090	212097	0 %	25 %	75 %	0 %	258510215
541	NC_013205	CCCG	2	8	212699	212706	0 %	0 %	25 %	75 %	258510215
542	NC_013205	CACG	2	8	213109	213116	25 %	0 %	25 %	50 %	258510216
543	NC_013205	CGAG	2	8	213373	213380	25 %	0 %	50 %	25 %	258510216
544	NC_013205	ACGA	2	8	213662	213669	50 %	0 %	25 %	25 %	258510216
545	NC_013205	CGTC	2	8	213694	213701	0 %	25 %	25 %	50 %	258510216
546	NC_013205	CCGC	2	8	214197	214204	0 %	0 %	25 %	75 %	258510216
547	NC_013205	TGCC	2	8	214230	214237	0 %	25 %	25 %	50 %	258510216
548	NC_013205	CGTG	2	8	214352	214359	0 %	25 %	50 %	25 %	258510216
549	NC_013205	GGCG	2	8	215113	215120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
550	NC_013205	TCTT	2	8	215121	215128	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_013205	TTCA	2	8	215307	215314	25 %	50 %	0 %	25 %	258510218
552	NC_013205	GCCC	2	8	215782	215789	0 %	0 %	25 %	75 %	258510218
553	NC_013205	GGCG	2	8	215822	215829	0 %	0 %	75 %	25 %	258510218
554	NC_013205	ATCG	2	8	216372	216379	25 %	25 %	25 %	25 %	258510218
555	NC_013205	CGGA	2	8	217214	217221	25 %	0 %	50 %	25 %	258510219
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557	NC_013205	GACG	2	8	217694	217701	25 %	0 %	50 %	25 %	258510219
558	NC_013205	GGAT	2	8	218365	218372	25 %	25 %	50 %	0 %	258510220
559	NC_013205	TGCA	2	8	218971	218978	25 %	25 %	25 %	25 %	258510220
560	NC_013205	GACA	2	8	219357	219364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_013205	TGAA	2	8	219610	219617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013205	GGTG	2	8	219672	219679	0 %	25 %	75 %	0 %	258510221
563	NC_013205	GCGG	2	8	219808	219815	0 %	0 %	75 %	25 %	258510221
564	NC_013205	GATC	2	8	220699	220706	25 %	25 %	25 %	25 %	258510221
565	NC_013205	CGGG	2	8	221130	221137	0 %	0 %	75 %	25 %	258510222
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567	NC_013205	GGCG	2	8	221310	221317	0 %	0 %	75 %	25 %	258510222
568	NC_013205	GCCT	2	8	222219	222226	0 %	25 %	25 %	50 %	258510223
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570	NC_013205	CGAG	2	8	223042	223049	25 %	0 %	50 %	25 %	258510225
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577	NC_013205	GCGA	2	8	227811	227818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
578	NC_013205	AGCC	2	8	227908	227915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_013205	GGCC	2	8	227947	227954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_013205	GCGA	2	8	228234	228241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_013205	GCGA	2	8	228591	228598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013205	ACCG	2	8	230287	230294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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587	NC_013205	GGGA	2	8	230780	230787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_013205	ACAA	2	8	231340	231347	75 %	0 %	0 %	25 %	258510229
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599	NC_013205	TCGC	2	8	235573	235580	0 %	25 %	25 %	50 %	258510233
600	NC_013205	GTCC	2	8	235679	235686	0 %	25 %	25 %	50 %	258510233
601	NC_013205	ATTC	2	8	235811	235818	25 %	50 %	0 %	25 %	258510233
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603	NC_013205	GGGC	2	8	236685	236692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
604	NC_013205	GATC	2	8	237826	237833	25 %	25 %	25 %	25 %	258510235
605	NC_013205	TTGA	2	8	237902	237909	25 %	50 %	25 %	0 %	258510235
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607	NC_013205	GATC	2	8	238583	238590	25 %	25 %	25 %	25 %	258510236
608	NC_013205	CGAA	2	8	238631	238638	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_013205	CCGG	2	8	238953	238960	0 %	0 %	50 %	50 %	258510237
610	NC_013205	AGGC	2	8	239209	239216	25 %	0 %	50 %	25 %	258510237
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612	NC_013205	TTTG	2	8	239704	239711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013205	CTGG	2	8	240294	240301	0 %	25 %	50 %	25 %	258510238
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615	NC_013205	TTGA	2	8	241213	241220	25 %	50 %	25 %	0 %	258510238
616	NC_013205	CGAA	2	8	241253	241260	50 %	0 %	25 %	25 %	258510239
617	NC_013205	GCTG	3	12	241387	241398	0 %	25 %	50 %	25 %	258510239
618	NC_013205	GGGC	2	8	241428	241435	0 %	0 %	75 %	25 %	258510239
619	NC_013205	TGAA	2	8	243271	243278	50 %	25 %	25 %	0 %	258510239
620	NC_013205	GCGT	2	8	243696	243703	0 %	25 %	50 %	25 %	258510240
621	NC_013205	GGCG	2	8	243709	243716	0 %	0 %	75 %	25 %	258510241
622	NC_013205	TGCG	3	12	244148	244159	0 %	25 %	50 %	25 %	258510241
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626	NC_013205	GCGG	2	8	246366	246373	0 %	0 %	75 %	25 %	258510243
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629	NC_013205	CAAC	2	8	247155	247162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_013205	CGAT	2	8	247267	247274	25 %	25 %	25 %	25 %	258510244
631	NC_013205	GACG	2	8	248057	248064	25 %	0 %	50 %	25 %	258510245
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633	NC_013205	GACG	2	8	249591	249598	25 %	0 %	50 %	25 %	258510246
634	NC_013205	GCCT	2	8	250221	250228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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