MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	TTCAA	2	10	1653	1662	40 %	40 %	0 %	20 %	257783816
2	NC_013203	TCAAA	2	10	4009	4018	60 %	20 %	0 %	20 %	257783817
3	NC_013203	GAAAC	2	10	5198	5207	60 %	0 %	20 %	20 %	257783819
4	NC_013203	GCAAG	2	10	5544	5553	40 %	0 %	40 %	20 %	257783819
5	NC_013203	GCTTT	2	10	14282	14291	0 %	60 %	20 %	20 %	257783824
6	NC_013203	TTGAT	2	10	19321	19330	20 %	60 %	20 %	0 %	257783827
7	NC_013203	GTTTT	2	10	22750	22759	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013203	TGATT	2	10	23933	23942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013203	TTTGG	2	10	24319	24328	0 %	60 %	40 %	0 %	257783831
10	NC_013203	GTCGA	2	10	26033	26042	20 %	20 %	40 %	20 %	257783832
11	NC_013203	ATCCT	2	10	26183	26192	20 %	40 %	0 %	40 %	257783833
12	NC_013203	GAATG	2	10	28637	28646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013203	ATTTG	2	10	28788	28797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013203	CCAAT	2	10	31107	31116	40 %	20 %	0 %	40 %	257783838
15	NC_013203	AGTTG	2	10	34528	34537	20 %	40 %	40 %	0 %	257783840
16	NC_013203	TAAAA	2	10	36719	36728	80 %	20 %	0 %	0 %	257783841
17	NC_013203	GATCC	2	10	37099	37108	20 %	20 %	20 %	40 %	257783842
18	NC_013203	TTTTG	2	10	37154	37163	0 %	80 %	20 %	0 %	257783842
19	NC_013203	GCTAT	2	10	41270	41279	20 %	40 %	20 %	20 %	257783846
20	NC_013203	TTATT	2	10	48122	48131	20 %	80 %	0 %	0 %	257783853
21	NC_013203	ATTTG	2	10	53438	53447	20 %	60 %	20 %	0 %	257783860
22	NC_013203	AATTT	2	10	54359	54368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013203	GGATA	2	10	56785	56794	40 %	20 %	40 %	0 %	257783863
24	NC_013203	CAATC	2	10	58968	58977	40 %	20 %	0 %	40 %	257783865
25	NC_013203	TGGCA	2	10	62243	62252	20 %	20 %	40 %	20 %	257783868
26	NC_013203	CGGTA	2	10	62960	62969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013203	TCAAA	2	10	70441	70450	60 %	20 %	0 %	20 %	257783872
28	NC_013203	CTGGA	2	10	70811	70820	20 %	20 %	40 %	20 %	257783873
29	NC_013203	TTCTC	2	10	71241	71250	0 %	60 %	0 %	40 %	257783873
30	NC_013203	CTGCG	2	10	71967	71976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013203	GAAGA	2	10	73601	73610	60 %	0 %	40 %	0 %	257783874
32	NC_013203	AGGTG	2	10	73963	73972	20 %	20 %	60 %	0 %	257783874
33	NC_013203	ATGGA	2	10	81107	81116	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013203	GAAGA	2	10	83461	83470	60 %	0 %	40 %	0 %	257783883
35	NC_013203	TACAT	2	10	85765	85774	40 %	40 %	0 %	20 %	257783885
36	NC_013203	TACAA	2	10	86100	86109	60 %	20 %	0 %	20 %	257783885
37	NC_013203	CAATA	2	10	86248	86257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013203	CTTCT	2	10	90119	90128	0 %	60 %	0 %	40 %	257783889
39	NC_013203	AGAGG	2	10	91722	91731	40 %	0 %	60 %	0 %	257783892
40	NC_013203	GAGTG	2	10	93242	93251	20 %	20 %	60 %	0 %	257783893
41	NC_013203	AAATT	2	10	96550	96559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013203	TATTT	2	10	96670	96679	20 %	80 %	0 %	0 %	257783897
43	NC_013203	ATTAC	2	10	97057	97066	40 %	40 %	0 %	20 %	257783898
44	NC_013203	TGAAA	2	10	97854	97863	60 %	20 %	20 %	0 %	257783899
45	NC_013203	AGCTC	2	10	99403	99412	20 %	20 %	20 %	40 %	257783901
46	NC_013203	GCAAA	2	10	102214	102223	60 %	0 %	20 %	20 %	257783903
47	NC_013203	GAAAA	2	10	102663	102672	80 %	0 %	20 %	0 %	257783903
48	NC_013203	GCTCC	2	10	107237	107246	0 %	20 %	20 %	60 %	257783907
49	NC_013203	CAGTA	2	10	108295	108304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013203	GGTAG	2	10	110540	110549	20 %	20 %	60 %	0 %	257783910
51	NC_013203	TTCAA	2	10	111781	111790	40 %	40 %	0 %	20 %	257783912
52	NC_013203	AACTC	2	10	114470	114479	40 %	20 %	0 %	40 %	257783912
53	NC_013203	CTGAG	2	10	116210	116219	20 %	20 %	40 %	20 %	257783912
54	NC_013203	CTTAT	2	10	117081	117090	20 %	60 %	0 %	20 %	257783913
55	NC_013203	GTACA	2	10	120686	120695	40 %	20 %	20 %	20 %	257783916
56	NC_013203	CGCAG	2	10	122071	122080	20 %	0 %	40 %	40 %	257783918
57	NC_013203	GCGAT	2	10	124773	124782	20 %	20 %	40 %	20 %	257783920
58	NC_013203	AGATG	2	10	125534	125543	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013203	CAGAT	2	10	127911	127920	40 %	20 %	20 %	20 %	257783923
60	NC_013203	TGCTT	2	10	129870	129879	0 %	60 %	20 %	20 %	257783925
61	NC_013203	GAGTC	2	10	131158	131167	20 %	20 %	40 %	20 %	257783925
62	NC_013203	TCCTC	2	10	138106	138115	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013203	TTTGA	2	10	140351	140360	20 %	60 %	20 %	0 %	257783934
64	NC_013203	GTCAC	2	10	143755	143764	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013203	ATTTT	2	10	144610	144619	20 %	80 %	0 %	0 %	257783937
66	NC_013203	AACTG	2	10	145204	145213	40 %	20 %	20 %	20 %	257783938
67	NC_013203	CAGAT	2	10	145410	145419	40 %	20 %	20 %	20 %	257783938
68	NC_013203	ATTTA	2	10	145990	145999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013203	TCTGA	2	10	147800	147809	20 %	40 %	20 %	20 %	257783939
70	NC_013203	CAGAT	2	10	148580	148589	40 %	20 %	20 %	20 %	257783940
71	NC_013203	TTGCT	2	10	149649	149658	0 %	60 %	20 %	20 %	257783941
72	NC_013203	AACAA	2	10	150470	150479	80 %	0 %	0 %	20 %	257783942
73	NC_013203	ATAGA	2	10	151482	151491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013203	GCATT	2	10	152309	152318	20 %	40 %	20 %	20 %	257783943
75	NC_013203	GCAAG	2	10	156197	156206	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013203	ATTGG	2	10	157477	157486	20 %	40 %	40 %	0 %	257783948
77	NC_013203	TGTTT	2	10	161701	161710	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013203	ACGGT	2	10	166813	166822	20 %	20 %	40 %	20 %	257783956
79	NC_013203	AGTCC	2	10	167125	167134	20 %	20 %	20 %	40 %	257783956
80	NC_013203	TGCGC	2	10	167861	167870	0 %	20 %	40 %	40 %	257783957
81	NC_013203	GACCA	2	10	172153	172162	40 %	0 %	20 %	40 %	257783959
82	NC_013203	CGTTA	2	10	173365	173374	20 %	40 %	20 %	20 %	257783959
83	NC_013203	CTGGT	2	10	173963	173972	0 %	40 %	40 %	20 %	257783959
84	NC_013203	GTTGA	2	10	181299	181308	20 %	40 %	40 %	0 %	257783967
85	NC_013203	GAGCA	2	10	184951	184960	40 %	0 %	40 %	20 %	257783970
86	NC_013203	AGCGT	2	10	187182	187191	20 %	20 %	40 %	20 %	257783971
87	NC_013203	CAAAA	2	10	188217	188226	80 %	0 %	0 %	20 %	257783972
88	NC_013203	ACTTG	2	10	188230	188239	20 %	40 %	20 %	20 %	257783972
89	NC_013203	TTCCG	2	10	189622	189631	0 %	40 %	20 %	40 %	257783973
90	NC_013203	TGGTA	2	10	196633	196642	20 %	40 %	40 %	0 %	257783980
91	NC_013203	AAAAG	2	10	202490	202499	80 %	0 %	20 %	0 %	257783986
92	NC_013203	ACTTT	2	10	206946	206955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013203	ACGTT	2	10	207396	207405	20 %	40 %	20 %	20 %	257783988
94	NC_013203	AGGAG	2	10	217025	217034	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013203	ATTCC	2	10	224497	224506	20 %	40 %	0 %	40 %	257783999
96	NC_013203	ACAAT	2	10	225418	225427	60 %	20 %	0 %	20 %	257784000
97	NC_013203	AGTAA	2	10	226151	226160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013203	GCTTT	2	10	231527	231536	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013203	TTACC	2	10	236012	236021	20 %	40 %	0 %	40 %	257784004
100	NC_013203	TGATG	2	10	237450	237459	20 %	40 %	40 %	0 %	257784005
101	NC_013203	TGGTC	2	10	238938	238947	0 %	40 %	40 %	20 %	257784006
102	NC_013203	TGCGT	2	10	240200	240209	0 %	40 %	40 %	20 %	257784007
103	NC_013203	GGATT	2	10	240915	240924	20 %	40 %	40 %	0 %	257784008
104	NC_013203	TCGCG	2	10	242198	242207	0 %	20 %	40 %	40 %	257784009
105	NC_013203	CAGAT	2	10	242780	242789	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013203	CGTCT	2	10	242811	242820	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013203	GACAA	2	10	243893	243902	60 %	0 %	20 %	20 %	257784010
108	NC_013203	CAAGT	2	10	244296	244305	40 %	20 %	20 %	20 %	257784011
109	NC_013203	CGCAG	2	10	248008	248017	20 %	0 %	40 %	40 %	257784014
110	NC_013203	TTTTA	2	10	251916	251925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013203	TCTCC	2	10	256112	256121	0 %	40 %	0 %	60 %	257784023
112	NC_013203	TGATT	2	10	257432	257441	20 %	60 %	20 %	0 %	257784024
113	NC_013203	AAAGT	2	10	258985	258994	60 %	20 %	20 %	0 %	257784025
114	NC_013203	TTTTA	2	10	260764	260773	20 %	80 %	0 %	0 %	257784027
115	NC_013203	TTGCG	2	10	261728	261737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013203	TAATT	2	10	263326	263335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013203	AAAGC	2	10	263663	263672	60 %	0 %	20 %	20 %	257784033
118	NC_013203	ACGTT	2	10	265694	265703	20 %	40 %	20 %	20 %	257784035
119	NC_013203	TCAGC	2	10	266464	266473	20 %	20 %	20 %	40 %	257784036
120	NC_013203	TTACT	2	10	266516	266525	20 %	60 %	0 %	20 %	257784036
121	NC_013203	GGTGC	2	10	268956	268965	0 %	20 %	60 %	20 %	257784038
122	NC_013203	GTCTT	2	10	268981	268990	0 %	60 %	20 %	20 %	257784038
123	NC_013203	CTGCA	2	10	269651	269660	20 %	20 %	20 %	40 %	257784039
124	NC_013203	CCAAC	2	10	269835	269844	40 %	0 %	0 %	60 %	257784039
125	NC_013203	ATGGG	2	10	270642	270651	20 %	20 %	60 %	0 %	257784040
126	NC_013203	TGTTT	2	10	270972	270981	0 %	80 %	20 %	0 %	257784040
127	NC_013203	ATTCC	2	10	275263	275272	20 %	40 %	0 %	40 %	257784043
128	NC_013203	GGATG	2	10	279002	279011	20 %	20 %	60 %	0 %	257784044
129	NC_013203	ATACT	2	10	279361	279370	40 %	40 %	0 %	20 %	257784044
130	NC_013203	CGTGG	2	10	279884	279893	0 %	20 %	60 %	20 %	257784044
131	NC_013203	CGCTG	2	10	283083	283092	0 %	20 %	40 %	40 %	257784046
132	NC_013203	AACTC	2	10	283908	283917	40 %	20 %	0 %	40 %	257784047
133	NC_013203	TGGAC	2	10	286896	286905	20 %	20 %	40 %	20 %	257784050
134	NC_013203	TGACG	2	10	287860	287869	20 %	20 %	40 %	20 %	257784050
135	NC_013203	CGTGT	2	10	290952	290961	0 %	40 %	40 %	20 %	257784055
136	NC_013203	CTGAA	2	10	291670	291679	40 %	20 %	20 %	20 %	257784055
137	NC_013203	TTGTG	2	10	294035	294044	0 %	60 %	40 %	0 %	257784057
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250	NC_013203	GATTA	2	10	482335	482344	40 %	40 %	20 %	0 %	257784222
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263	NC_013203	TTCTT	2	10	498747	498756	0 %	80 %	0 %	20 %	257784236
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266	NC_013203	TACTT	2	10	503588	503597	20 %	60 %	0 %	20 %	257784240
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500	NC_013203	GCTTA	2	10	991465	991474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

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