MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013203	CAGCC	2	10	993421	993430	20 %	0 %	20 %	60 %	257784691
502	NC_013203	TAAAT	2	10	994537	994546	60 %	40 %	0 %	0 %	257784692
503	NC_013203	CTGGT	2	10	996851	996860	0 %	40 %	40 %	20 %	257784694
504	NC_013203	AAAGT	2	10	998335	998344	60 %	20 %	20 %	0 %	257784695
505	NC_013203	AGTCC	2	10	1005840	1005849	20 %	20 %	20 %	40 %	257784701
506	NC_013203	CTCTT	2	10	1006899	1006908	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
507	NC_013203	CTCAA	2	10	1008140	1008149	40 %	20 %	0 %	40 %	257784702
508	NC_013203	ATGCC	2	10	1009126	1009135	20 %	20 %	20 %	40 %	257784703
509	NC_013203	AACTC	2	10	1009155	1009164	40 %	20 %	0 %	40 %	257784703
510	NC_013203	GGCTT	2	10	1017619	1017628	0 %	40 %	40 %	20 %	257784711
511	NC_013203	TCGTC	2	10	1018481	1018490	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_013203	AAGCT	2	10	1018694	1018703	40 %	20 %	20 %	20 %	257784712
513	NC_013203	CAAAA	2	10	1018895	1018904	80 %	0 %	0 %	20 %	257784712
514	NC_013203	GCACT	2	10	1019015	1019024	20 %	20 %	20 %	40 %	257784712
515	NC_013203	CAACA	2	10	1019196	1019205	60 %	0 %	0 %	40 %	257784712
516	NC_013203	TGCCA	2	10	1020024	1020033	20 %	20 %	20 %	40 %	257784714
517	NC_013203	AAATA	2	10	1020160	1020169	80 %	20 %	0 %	0 %	257784714
518	NC_013203	CCTAC	2	10	1023827	1023836	20 %	20 %	0 %	60 %	257784717
519	NC_013203	CATCT	2	10	1023940	1023949	20 %	40 %	0 %	40 %	257784717
520	NC_013203	AGTAA	2	10	1024614	1024623	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013203	GCTCA	2	10	1026617	1026626	20 %	20 %	20 %	40 %	257784719
522	NC_013203	TTCCA	2	10	1028592	1028601	20 %	40 %	0 %	40 %	257784720
523	NC_013203	ACCAA	2	10	1033038	1033047	60 %	0 %	0 %	40 %	257784722
524	NC_013203	ACCTC	2	10	1046004	1046013	20 %	20 %	0 %	60 %	257784736
525	NC_013203	TCATC	2	10	1050184	1050193	20 %	40 %	0 %	40 %	257784738
526	NC_013203	TCCAC	2	10	1053724	1053733	20 %	20 %	0 %	60 %	257784741
527	NC_013203	AGCAG	2	10	1053740	1053749	40 %	0 %	40 %	20 %	257784741
528	NC_013203	AGAAT	2	10	1054925	1054934	60 %	20 %	20 %	0 %	257784742
529	NC_013203	GTAAG	2	10	1057555	1057564	40 %	20 %	40 %	0 %	257784744
530	NC_013203	AGGCA	2	10	1060668	1060677	40 %	0 %	40 %	20 %	257784746
531	NC_013203	TCTGT	2	10	1062611	1062620	0 %	60 %	20 %	20 %	257784748
532	NC_013203	TTCAA	2	10	1063046	1063055	40 %	40 %	0 %	20 %	257784748
533	NC_013203	AGAAA	2	10	1063556	1063565	80 %	0 %	20 %	0 %	257784748
534	NC_013203	CTTCT	2	10	1066064	1066073	0 %	60 %	0 %	40 %	257784749
535	NC_013203	ATGAG	2	10	1066136	1066145	40 %	20 %	40 %	0 %	257784749
536	NC_013203	AGCAG	2	10	1070805	1070814	40 %	0 %	40 %	20 %	257784754
537	NC_013203	CCTGG	2	10	1075853	1075862	0 %	20 %	40 %	40 %	257784758
538	NC_013203	ACAAA	2	10	1076739	1076748	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_013203	TCTTT	2	10	1084754	1084763	0 %	80 %	0 %	20 %	257784764
540	NC_013203	AAAAG	2	10	1085764	1085773	80 %	0 %	20 %	0 %	257784764
541	NC_013203	TTGTT	2	10	1088106	1088115	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013203	AGTGC	2	10	1091523	1091532	20 %	20 %	40 %	20 %	257784769
543	NC_013203	AATGG	2	10	1091943	1091952	40 %	20 %	40 %	0 %	257784769
544	NC_013203	CAGGC	2	10	1093260	1093269	20 %	0 %	40 %	40 %	257784771
545	NC_013203	TTTCC	2	10	1093397	1093406	0 %	60 %	0 %	40 %	257784771
546	NC_013203	ATTAT	2	10	1094143	1094152	40 %	60 %	0 %	0 %	257784772
547	NC_013203	ATCAA	2	10	1095640	1095649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
548	NC_013203	AAGGT	2	10	1101828	1101837	40 %	20 %	40 %	0 %	257784777
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550	NC_013203	TTGCC	2	10	1103872	1103881	0 %	40 %	20 %	40 %	257784779
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552	NC_013203	TTGAA	2	10	1110908	1110917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013203	GAAAA	2	10	1116693	1116702	80 %	0 %	20 %	0 %	257784792
554	NC_013203	GTAGT	2	10	1117923	1117932	20 %	40 %	40 %	0 %	257784794
555	NC_013203	CCAAA	2	10	1120138	1120147	60 %	0 %	0 %	40 %	257784794
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557	NC_013203	TCTTT	2	10	1131404	1131413	0 %	80 %	0 %	20 %	257784805
558	NC_013203	ATCCA	2	10	1138487	1138496	40 %	20 %	0 %	40 %	257784811
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562	NC_013203	AATAA	2	10	1153887	1153896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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564	NC_013203	TCAGA	2	10	1154964	1154973	40 %	20 %	20 %	20 %	257784823
565	NC_013203	TTCCC	2	10	1156991	1157000	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
566	NC_013203	AACTA	2	10	1157141	1157150	60 %	20 %	0 %	20 %	257784825
567	NC_013203	AAAGA	2	10	1157426	1157435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_013203	TTTTA	2	10	1160431	1160440	20 %	80 %	0 %	0 %	257784828
570	NC_013203	CAATC	2	10	1162701	1162710	40 %	20 %	0 %	40 %	257784830
571	NC_013203	CAATC	2	10	1162725	1162734	40 %	20 %	0 %	40 %	257784830
572	NC_013203	GCAAT	2	10	1163067	1163076	40 %	20 %	20 %	20 %	257784830
573	NC_013203	AAGAA	2	10	1163720	1163729	80 %	0 %	20 %	0 %	257784832
574	NC_013203	ATCAA	2	10	1165747	1165756	60 %	20 %	0 %	20 %	257784836
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606	NC_013203	TGAGC	2	10	1232159	1232168	20 %	20 %	40 %	20 %	257784890
607	NC_013203	TGCTC	2	10	1233315	1233324	0 %	40 %	20 %	40 %	257784892
608	NC_013203	GTCTG	2	10	1233484	1233493	0 %	40 %	40 %	20 %	257784892
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611	NC_013203	CCGTT	2	10	1237444	1237453	0 %	40 %	20 %	40 %	257784895
612	NC_013203	CAAAT	2	10	1238502	1238511	60 %	20 %	0 %	20 %	257784895
613	NC_013203	TTCTG	2	10	1241458	1241467	0 %	60 %	20 %	20 %	257784899
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615	NC_013203	CATGC	2	10	1242089	1242098	20 %	20 %	20 %	40 %	257784900
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619	NC_013203	GATTT	2	10	1247651	1247660	20 %	60 %	20 %	0 %	257784906
620	NC_013203	GCATT	2	10	1252744	1252753	20 %	40 %	20 %	20 %	257784908
621	NC_013203	ACCAC	2	10	1253350	1253359	40 %	0 %	0 %	60 %	257784909
622	NC_013203	AAAGA	2	10	1253763	1253772	80 %	0 %	20 %	0 %	257784909
623	NC_013203	AAATA	2	10	1260040	1260049	80 %	20 %	0 %	0 %	257784914
624	NC_013203	TATCT	2	10	1260984	1260993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
625	NC_013203	ATCTG	2	10	1261973	1261982	20 %	40 %	20 %	20 %	257784915
626	NC_013203	GAGCT	2	10	1264647	1264656	20 %	20 %	40 %	20 %	257784916
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628	NC_013203	TACGT	2	10	1270676	1270685	20 %	40 %	20 %	20 %	257784923
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753	NC_013203	GAGTT	2	10	1515002	1515011	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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