MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013156	GCATCT	2	12	699	710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256809975
2	NC_013156	CATCTA	2	12	4307	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809978
3	NC_013156	TGTGAT	2	12	7391	7402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256809980
4	NC_013156	AAAATG	2	12	9522	9533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256809982
5	NC_013156	ATATTT	2	12	10561	10572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809982
6	NC_013156	CTCTAA	2	12	12296	12307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809986
7	NC_013156	TTTGTT	2	12	14541	14552	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256809989
8	NC_013156	TTTAAA	2	12	14722	14733	50 %	50 %	0 %	0 %	256809989
9	NC_013156	ATTAAA	2	12	15734	15745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809990
10	NC_013156	CTTCAA	2	12	16924	16935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809991
11	NC_013156	AACTAA	2	12	17089	17100	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256809992
12	NC_013156	TATCTA	2	12	17601	17612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256809992
13	NC_013156	GCAGAT	2	12	22078	22089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256809998
14	NC_013156	GAAAAT	2	12	28036	28047	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256810002
15	NC_013156	AAAAGA	2	12	28659	28670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810002
16	NC_013156	GAGGAT	2	12	32798	32809	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256810007
17	NC_013156	TCATTT	2	12	35927	35938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810011
18	NC_013156	GATTTA	2	12	37095	37106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810012
19	NC_013156	GCTTCA	2	12	39897	39908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256810013
20	NC_013156	CCTAAA	2	12	43798	43809	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256810016
21	NC_013156	AACTTC	2	12	49491	49502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810022
22	NC_013156	TTAAGT	2	12	50180	50191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810022
23	NC_013156	TCTTTA	2	12	50612	50623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810022
24	NC_013156	ATACAA	2	12	50966	50977	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256810022
25	NC_013156	AAGGAA	2	12	53871	53882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810024
26	NC_013156	AAAGAA	2	12	54212	54223	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810024
27	NC_013156	TTAAAT	2	12	56936	56947	50 %	50 %	0 %	0 %	256810027
28	NC_013156	CTTAAA	2	12	58085	58096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256810029
29	NC_013156	TTTTAA	2	12	61407	61418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810034
30	NC_013156	CTAAAT	2	12	63090	63101	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256810036
31	NC_013156	GGGATA	2	12	66521	66532	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256810039
32	NC_013156	CTTTTA	2	12	70294	70305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810045
33	NC_013156	TATATT	2	12	70543	70554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810046
34	NC_013156	GCTTTA	2	12	74022	74033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256810051
35	NC_013156	TCATTT	2	12	78207	78218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810055
36	NC_013156	ATTTGA	2	12	83295	83306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810059
37	NC_013156	TTAATT	2	12	88334	88345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810065
38	NC_013156	TGCGAA	2	12	91140	91151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256810068
39	NC_013156	GCCATC	2	12	97052	97063	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256810073
40	NC_013156	CCAATC	2	12	97096	97107	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	256810073
41	NC_013156	AAAGAA	2	12	102885	102896	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810080
42	NC_013156	AAGAAA	2	12	102955	102966	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810080
43	NC_013156	AAATAA	2	12	104432	104443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256810083
44	NC_013156	TCTGTT	2	12	106482	106493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256810085
45	NC_013156	TATCTC	2	12	107299	107310	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256810086
46	NC_013156	TTTTTG	2	12	114110	114121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256810094
47	NC_013156	TTCATT	2	12	115992	116003	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810097
48	NC_013156	TCTCAA	2	12	117566	117577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810097
49	NC_013156	TTCAAA	2	12	118295	118306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256810098
50	NC_013156	CAATCT	2	12	118955	118966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810098
51	NC_013156	GAAAAA	2	12	119277	119288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810099
52	NC_013156	CAGACG	2	12	128875	128886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810109
53	NC_013156	GCAGAG	2	12	132195	132206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256810111
54	NC_013156	TGATGT	2	12	133184	133195	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256810112
55	NC_013156	TTTAAT	2	12	133738	133749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810113
56	NC_013156	GCTACT	2	12	134160	134171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256810113
57	NC_013156	TGTAGA	2	12	135887	135898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810114
58	NC_013156	AAAAAT	2	12	136850	136861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256810115
59	NC_013156	GGATTT	2	12	138033	138044	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256810116
60	NC_013156	AACATA	2	12	139566	139577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256810117
61	NC_013156	AAAAGA	2	12	139670	139681	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810117
62	NC_013156	TAACAG	2	12	140767	140778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810117
63	NC_013156	TGAAAA	2	12	148364	148375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256810124
64	NC_013156	TGAAAT	2	12	148835	148846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256810124
65	NC_013156	GATTTA	2	12	149234	149245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810125
66	NC_013156	AGGCAT	2	12	150413	150424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256810125
67	NC_013156	CCCCAT	2	12	152935	152946	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	256810128
68	NC_013156	TTAACT	2	12	153771	153782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256810129
69	NC_013156	TTGAAG	2	12	160836	160847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810137
70	NC_013156	GATTAT	2	12	161216	161227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810138
71	NC_013156	TGCCTT	2	12	169062	169073	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256810147
72	NC_013156	GCATCA	2	12	170760	170771	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256810149
73	NC_013156	ATAACT	2	12	176226	176237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256810156
74	NC_013156	TGAAGA	2	12	176537	176548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810156
75	NC_013156	GGATGA	2	12	178021	178032	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	256810157
76	NC_013156	AAATTA	2	12	182229	182240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810161
77	NC_013156	CAACAT	2	12	182746	182757	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256810161
78	NC_013156	AGATGA	2	12	187503	187514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810166
79	NC_013156	GTTATG	2	12	189905	189916	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256810168
80	NC_013156	ATCTTT	2	12	199494	199505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810173
81	NC_013156	CTACAA	2	12	200216	200227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256810173
82	NC_013156	CCCTAT	2	12	205191	205202	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	256810178
83	NC_013156	TAATGA	2	12	206080	206091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256810179
84	NC_013156	CAGTTT	2	12	206298	206309	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256810179
85	NC_013156	CCAGAT	2	12	210098	210109	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256810185
86	NC_013156	AAATGT	2	12	210124	210135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256810185
87	NC_013156	TCCTGA	2	12	210574	210585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256810185
88	NC_013156	AACGAT	2	12	211030	211041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810185
89	NC_013156	AGAGAT	2	12	211544	211555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810186
90	NC_013156	TTTAAA	2	12	219870	219881	50 %	50 %	0 %	0 %	256810195
91	NC_013156	TAAATG	2	12	220016	220027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256810195
92	NC_013156	AGATGA	2	12	220059	220070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810195
93	NC_013156	AAGAAA	2	12	220275	220286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810195
94	NC_013156	TTTATT	2	12	225120	225131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256810202
95	NC_013156	AAAAAT	2	12	228392	228403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256810205
96	NC_013156	TATGGA	2	12	231311	231322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
97	NC_013156	ATTAGA	2	12	231346	231357	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256810207
98	NC_013156	ATGTTC	2	12	233098	233109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256810209
99	NC_013156	ACTTCT	2	12	234270	234281	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256810210
100	NC_013156	ATAGAC	2	12	235663	235674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810211
101	NC_013156	AATGAC	2	12	237563	237574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810212
102	NC_013156	GTTGAG	2	12	237957	237968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256810212
103	NC_013156	GAACAA	2	12	241475	241486	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256810214
104	NC_013156	AGGTAA	2	12	243063	243074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810215
105	NC_013156	AGCTAT	2	12	243141	243152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256810215
106	NC_013156	AACTTC	2	12	245581	245592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810219
107	NC_013156	ATTTTT	2	12	245822	245833	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256810219
108	NC_013156	CAACTT	2	12	247752	247763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810220
109	NC_013156	TTTGTT	2	12	249047	249058	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256810222
110	NC_013156	TTTGTT	2	12	249653	249664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256810222
111	NC_013156	TGGGAT	2	12	249693	249704	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256810222
112	NC_013156	ATCTTT	2	12	252345	252356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810224
113	NC_013156	CTATTT	2	12	253241	253252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810225
114	NC_013156	AGAAAG	2	12	256335	256346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810229
115	NC_013156	TGAAGA	2	12	256888	256899	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256810230
116	NC_013156	ACCTAA	2	12	261129	261140	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256810235
117	NC_013156	AGAGCA	2	12	262471	262482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	256810236
118	NC_013156	ACCTCA	2	12	264444	264455	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	256810237
119	NC_013156	ATTTCA	2	12	265273	265284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256810239
120	NC_013156	TTTTTA	2	12	265439	265450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256810239
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230	NC_013156	AATTTA	2	12	476898	476909	50 %	50 %	0 %	0 %	256810458
231	NC_013156	ATTAAA	2	12	477014	477025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810458
232	NC_013156	TTTGAT	2	12	478727	478738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256810459
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234	NC_013156	ATTTAA	2	12	484079	484090	50 %	50 %	0 %	0 %	256810463
235	NC_013156	TTGGAG	2	12	486326	486337	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	256810466
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237	NC_013156	ATTTTT	2	12	491160	491171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256810470
238	NC_013156	ATAAAA	2	12	492297	492308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256810472
239	NC_013156	ATTTAG	2	12	492814	492825	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810472
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346	NC_013156	AAAAGA	2	12	703458	703469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256810701
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348	NC_013156	CAGCTG	2	12	704877	704888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256810702
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