MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013156	ATTTAT	2	12	946747	946758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810956
502	NC_013156	TTCCAG	2	12	946810	946821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256810956
503	NC_013156	GATTTT	2	12	950962	950973	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256810960
504	NC_013156	AGTTAT	2	12	953007	953018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810962
505	NC_013156	TTTAGA	2	12	962416	962427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256810973
506	NC_013156	TAAAAA	2	12	963021	963032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256810973
507	NC_013156	ATTTAA	2	12	963737	963748	50 %	50 %	0 %	0 %	256810973
508	NC_013156	ACGTCA	2	12	966091	966102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256810976
509	NC_013156	TTAAAT	2	12	966252	966263	50 %	50 %	0 %	0 %	256810977
510	NC_013156	CCTCTG	2	12	968540	968551	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	256810979
511	NC_013156	ATTTTA	2	12	969996	970007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810980
512	NC_013156	TTGTTA	2	12	980085	980096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256810991
513	NC_013156	TTTTCA	2	12	981174	981185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256810993
514	NC_013156	AACTTC	2	12	990787	990798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810999
515	NC_013156	TCTGAC	2	12	994395	994406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256811004
516	NC_013156	TGTTTT	2	12	994609	994620	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256811005
517	NC_013156	AATTAC	2	12	994699	994710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256811005
518	NC_013156	AATGAT	2	12	995489	995500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256811006
519	NC_013156	AACATT	2	12	996834	996845	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256811008
520	NC_013156	TTTGGT	2	12	1000284	1000295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811013
521	NC_013156	AAAAAG	2	12	1003680	1003691	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256811015
522	NC_013156	AAATTT	2	12	1018561	1018572	50 %	50 %	0 %	0 %	256811023
523	NC_013156	TGTTTT	2	12	1020503	1020514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	256811026
524	NC_013156	ATCCAC	2	12	1021771	1021782	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	256811027
525	NC_013156	ATGTGT	2	12	1023598	1023609	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256811030
526	NC_013156	TTTCTT	2	12	1024904	1024915	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	256811030
527	NC_013156	TCTTTT	2	12	1026343	1026354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	256811032
528	NC_013156	TTTAAT	2	12	1029906	1029917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811035
529	NC_013156	AGAGGA	2	12	1034827	1034838	50 %	0 %	50 %	0 %	256811040
530	NC_013156	ATGTAT	2	12	1034859	1034870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256811040
531	NC_013156	CAACTT	2	12	1036615	1036626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811040
532	NC_013156	TTTTCC	2	12	1038693	1038704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811043
533	NC_013156	CGTAAG	2	12	1039260	1039271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256811045
534	NC_013156	TCTTGC	2	12	1040339	1040350	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256811046
535	NC_013156	TTCTAA	2	12	1045293	1045304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256811053
536	NC_013156	TTTACT	2	12	1051289	1051300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811058
537	NC_013156	AAAATT	2	12	1053412	1053423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811062
538	NC_013156	TGTTTC	2	12	1055821	1055832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256811063
539	NC_013156	AATTCT	2	12	1057102	1057113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256811065
540	NC_013156	CTTGTA	2	12	1059995	1060006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256811068
541	NC_013156	CTAAAA	2	12	1060354	1060365	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256811070
542	NC_013156	TGCAAC	2	12	1062241	1062252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256811072
543	NC_013156	TTATTT	2	12	1064010	1064021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256811073
544	NC_013156	TTATTG	2	12	1064310	1064321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256811073
545	NC_013156	ATTTTG	2	12	1064766	1064777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256811073
546	NC_013156	TAATTT	2	12	1073731	1073742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811083
547	NC_013156	CCCAAA	2	12	1073999	1074010	50 %	0 %	0 %	50 %	256811083
548	NC_013156	GGCTGA	2	12	1077486	1077497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256811086
549	NC_013156	TGGTTG	2	12	1077729	1077740	0 %	50 %	50 %	0 %	256811087
550	NC_013156	TATTGG	2	12	1079053	1079064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	256811089
551	NC_013156	TTTTGC	2	12	1083734	1083745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256811093
552	NC_013156	TATCCT	2	12	1084015	1084026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256811093
553	NC_013156	GGCTTT	2	12	1085926	1085937	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	256811094
554	NC_013156	GCTAAC	2	12	1086974	1086985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256811095
555	NC_013156	TTTCTA	2	12	1090356	1090367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811098
556	NC_013156	TAATCA	2	12	1094078	1094089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256811103
557	NC_013156	TTCATT	2	12	1094545	1094556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811104
558	NC_013156	AGATAT	2	12	1096643	1096654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256811107
559	NC_013156	AAAAGT	2	12	1096999	1097010	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256811107
560	NC_013156	AAAACT	2	12	1101220	1101231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256811112
561	NC_013156	ATTTAG	2	12	1102884	1102895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256811114
562	NC_013156	ATCTTT	2	12	1106657	1106668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811118
563	NC_013156	TTTTTC	2	12	1107304	1107315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	256811119
564	NC_013156	CAGATA	2	12	1112229	1112240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256811125
565	NC_013156	ATTTCT	2	12	1112682	1112693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811126
566	NC_013156	GATGGG	2	12	1114379	1114390	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	256811128
567	NC_013156	ATCTTC	2	12	1115525	1115536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256811129
568	NC_013156	TCCTTT	2	12	1115648	1115659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811129
569	NC_013156	AGAACA	2	12	1118621	1118632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	256811133
570	NC_013156	ACGAGA	2	12	1118635	1118646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	256811133
571	NC_013156	ATTGGA	2	12	1123794	1123805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811138
572	NC_013156	ATTTAA	2	12	1128243	1128254	50 %	50 %	0 %	0 %	256811140
573	NC_013156	ATTTTA	2	12	1129259	1129270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811141
574	NC_013156	ATTTTC	2	12	1130191	1130202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811143
575	NC_013156	GCTAAA	2	12	1133756	1133767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256811145
576	NC_013156	TAATTT	2	12	1136335	1136346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811146
577	NC_013156	AATTTC	2	12	1138939	1138950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256811151
578	NC_013156	AATTGC	2	12	1140562	1140573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256811153
579	NC_013156	TTAAAT	2	12	1142939	1142950	50 %	50 %	0 %	0 %	256811157
580	NC_013156	AGATGA	2	12	1143001	1143012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256811157
581	NC_013156	AATCAA	2	12	1143055	1143066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256811157
582	NC_013156	GCTAAC	2	12	1143343	1143354	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	256811158
583	NC_013156	CAGTTA	2	12	1145084	1145095	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256811160
584	NC_013156	TATTTA	2	12	1145177	1145188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811160
585	NC_013156	ATAAAA	2	12	1146994	1147005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	256811162
586	NC_013156	TTAAAA	2	12	1147192	1147203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811163
587	NC_013156	TTCAAA	2	12	1147517	1147528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256811163
588	NC_013156	ATTGGA	2	12	1147880	1147891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811165
589	NC_013156	TCTCCA	2	12	1148564	1148575	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	256811165
590	NC_013156	TCAGTT	2	12	1150604	1150615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256811165
591	NC_013156	TCAGTT	2	12	1152366	1152377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256811167
592	NC_013156	TGCCAT	2	12	1153106	1153117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	256811167
593	NC_013156	AAATGA	2	12	1159785	1159796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	256811175
594	NC_013156	AGTTGA	2	12	1160942	1160953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811176
595	NC_013156	CAGTTA	2	12	1162296	1162307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	256811177
596	NC_013156	TTTTAA	2	12	1163433	1163444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811177
597	NC_013156	TTAAGG	2	12	1163757	1163768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811177
598	NC_013156	AGCTCC	2	12	1167705	1167716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256811181
599	NC_013156	TAAAGC	2	12	1170793	1170804	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256811183
600	NC_013156	TTGATA	2	12	1174276	1174287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256811188
601	NC_013156	AAAAGG	2	12	1174297	1174308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811188
602	NC_013156	TATATC	2	12	1175599	1175610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	256811189
603	NC_013156	AGCTTT	2	12	1175635	1175646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256811189
604	NC_013156	AAAGAA	2	12	1179363	1179374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	256811192
605	NC_013156	TAATAT	2	12	1180382	1180393	50 %	50 %	0 %	0 %	256811193
606	NC_013156	ATTATA	2	12	1181061	1181072	50 %	50 %	0 %	0 %	256811193
607	NC_013156	TCTTGT	2	12	1181561	1181572	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	256811194
608	NC_013156	TTGTAT	2	12	1181835	1181846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256811194
609	NC_013156	GTTTTA	2	12	1183197	1183208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	256811195
610	NC_013156	AACATC	2	12	1184070	1184081	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256811197
611	NC_013156	AATTAA	2	12	1185260	1185271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811198
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613	NC_013156	TTAAAG	2	12	1191611	1191622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	256811203
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