MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 36431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013124	CGG	2	6	136	141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370825
2	NC_013124	CAG	2	6	201	206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370825
3	NC_013124	CAT	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370825
4	NC_013124	CGA	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370825
5	NC_013124	CTC	2	6	377	382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370825
6	NC_013124	TCC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370825
7	NC_013124	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370825
8	NC_013124	TCC	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370825
9	NC_013124	CTG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370825
10	NC_013124	TCG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370825
11	NC_013124	TCC	2	6	736	741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370825
12	NC_013124	TCG	2	6	742	747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370825
13	NC_013124	AAG	2	6	772	777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370825
14	NC_013124	AAG	2	6	784	789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370825
15	NC_013124	TTC	2	6	792	797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370825
16	NC_013124	TCC	2	6	958	963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370825
17	NC_013124	CGC	2	6	1019	1024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370825
18	NC_013124	ACA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256370825
19	NC_013124	CGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370825
20	NC_013124	GCA	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370825
21	NC_013124	CGG	2	6	1198	1203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370825
22	NC_013124	CGT	2	6	1286	1291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370825
23	NC_013124	CGG	2	6	1337	1342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370825
24	NC_013124	ACG	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370825
25	NC_013124	CGA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370826
26	NC_013124	GGC	2	6	1731	1736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
27	NC_013124	CTC	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370826
28	NC_013124	GGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
29	NC_013124	GGT	3	9	1935	1943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370826
30	NC_013124	GCT	2	6	1995	2000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370826
31	NC_013124	ACG	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370826
32	NC_013124	CGG	2	6	2099	2104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
33	NC_013124	CGA	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370826
34	NC_013124	CGT	2	6	2250	2255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370826
35	NC_013124	CGA	2	6	2310	2315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370826
36	NC_013124	TCG	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370826
37	NC_013124	CGG	2	6	2410	2415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
38	NC_013124	GAA	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370826
39	NC_013124	CTC	2	6	2443	2448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370826
40	NC_013124	GCG	2	6	2478	2483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
41	NC_013124	AGG	2	6	2501	2506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370826
42	NC_013124	TCG	2	6	2518	2523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370826
43	NC_013124	GCG	2	6	2719	2724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
44	NC_013124	CGG	2	6	2735	2740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370826
45	NC_013124	CGA	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
46	NC_013124	CAT	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370827
47	NC_013124	GGT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370827
48	NC_013124	GTC	3	9	2994	3002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
49	NC_013124	CGT	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
50	NC_013124	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370827
51	NC_013124	GAC	2	6	3138	3143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
52	NC_013124	GCG	2	6	3157	3162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370827
53	NC_013124	AGC	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
54	NC_013124	CGA	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
55	NC_013124	CGT	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
56	NC_013124	TGC	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
57	NC_013124	CGA	2	6	3404	3409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
58	NC_013124	CGG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370827
59	NC_013124	GTG	3	9	3432	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370827
60	NC_013124	CGA	2	6	3458	3463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
61	NC_013124	CTC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370827
62	NC_013124	AAC	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256370827
63	NC_013124	CGT	2	6	3510	3515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
64	NC_013124	CGA	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
65	NC_013124	TCC	2	6	3556	3561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370827
66	NC_013124	GTC	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
67	NC_013124	GCC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370827
68	NC_013124	CGA	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370827
69	NC_013124	GCG	2	6	3722	3727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370827
70	NC_013124	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370827
71	NC_013124	TCA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370827
72	NC_013124	TCG	2	6	3823	3828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370827
73	NC_013124	CGT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370828
74	NC_013124	CGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370828
75	NC_013124	CGT	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370828
76	NC_013124	GGT	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370828
77	NC_013124	TCG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370828
78	NC_013124	GTG	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370828
79	NC_013124	GCA	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370828
80	NC_013124	GGT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370829
81	NC_013124	CAC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370829
82	NC_013124	GTC	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370829
83	NC_013124	CGA	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
84	NC_013124	CGG	2	6	4474	4479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370829
85	NC_013124	GGT	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370829
86	NC_013124	GGC	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370829
87	NC_013124	GGT	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370829
88	NC_013124	CTC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370829
89	NC_013124	GGT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370829
90	NC_013124	CGA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
91	NC_013124	CAA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256370829
92	NC_013124	CGA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
93	NC_013124	CTA	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370829
94	NC_013124	CGC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370829
95	NC_013124	GAG	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370829
96	NC_013124	ACC	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370829
97	NC_013124	GAA	2	6	5114	5119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370829
98	NC_013124	GGC	2	6	5120	5125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370829
99	NC_013124	ACC	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370829
100	NC_013124	TGG	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370829
101	NC_013124	AAG	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370829
102	NC_013124	ATC	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370829
103	NC_013124	GCT	3	9	5809	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370829
104	NC_013124	TTC	3	9	5822	5830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370829
105	NC_013124	TCG	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370829
106	NC_013124	CGC	2	6	5869	5874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370829
107	NC_013124	GCC	2	6	5878	5883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370829
108	NC_013124	AAG	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370829
109	NC_013124	CGA	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
110	NC_013124	GGC	2	6	6082	6087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370829
111	NC_013124	CGA	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
112	NC_013124	CGA	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
113	NC_013124	AGC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370829
114	NC_013124	CGT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370829
115	NC_013124	AGG	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
116	NC_013124	TCG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
117	NC_013124	ACG	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
118	NC_013124	GTC	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
119	NC_013124	ACG	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
120	NC_013124	GCT	2	6	6524	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
121	NC_013124	GCC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370830
122	NC_013124	GCT	2	6	6635	6640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
123	NC_013124	CGA	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
124	NC_013124	ACC	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370830
125	NC_013124	CGA	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
126	NC_013124	CAT	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370830
127	NC_013124	GAG	2	6	6981	6986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
128	NC_013124	TCG	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
129	NC_013124	TCG	2	6	7069	7074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
130	NC_013124	GCT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
131	NC_013124	GAA	2	6	7106	7111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370830
132	NC_013124	CGT	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
133	NC_013124	CAA	2	6	7181	7186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256370830
134	NC_013124	CGC	2	6	7201	7206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370830
135	NC_013124	TCG	2	6	7366	7371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
136	NC_013124	GAG	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
137	NC_013124	GAG	3	9	7554	7562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
138	NC_013124	GCG	2	6	7563	7568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370830
139	NC_013124	GCG	2	6	7679	7684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370830
140	NC_013124	CGC	2	6	7715	7720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370830
141	NC_013124	GGA	2	6	7721	7726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
142	NC_013124	GTG	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370830
143	NC_013124	TCA	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370830
144	NC_013124	GGC	2	6	7818	7823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370830
145	NC_013124	GTG	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370830
146	NC_013124	TCG	3	9	7878	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
147	NC_013124	GCT	2	6	7898	7903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
148	NC_013124	TCT	2	6	7906	7911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370830
149	NC_013124	CGA	3	9	8009	8017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
150	NC_013124	TTC	2	6	8073	8078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370830
151	NC_013124	CGT	2	6	8130	8135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
152	NC_013124	ATC	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370830
153	NC_013124	CGA	3	9	8165	8173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370830
154	NC_013124	CGT	3	9	8183	8191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
155	NC_013124	CGT	2	6	8213	8218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
156	NC_013124	CGT	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
157	NC_013124	CGG	2	6	8284	8289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370830
158	NC_013124	TCG	2	6	8326	8331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
159	NC_013124	GGC	2	6	8430	8435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370830
160	NC_013124	CGC	2	6	8483	8488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370830
161	NC_013124	GGA	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
162	NC_013124	GAT	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370830
163	NC_013124	GAG	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370830
164	NC_013124	CGT	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370830
165	NC_013124	GTG	2	6	8790	8795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370831
166	NC_013124	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370831
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181	NC_013124	GCT	2	6	10050	10055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370832
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250	NC_013124	CGT	2	6	13433	13438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370837
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252	NC_013124	GAG	2	6	13575	13580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370837
253	NC_013124	TCG	2	6	13599	13604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370837
254	NC_013124	CGG	2	6	13626	13631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370837
255	NC_013124	CGA	2	6	13646	13651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370837
256	NC_013124	CGA	2	6	13663	13668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370837
257	NC_013124	TGG	2	6	13684	13689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370837
258	NC_013124	CGT	2	6	13748	13753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370837
259	NC_013124	GTC	2	6	13755	13760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370837
260	NC_013124	CGC	2	6	13943	13948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370837
261	NC_013124	CGC	2	6	13958	13963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370837
262	NC_013124	CGG	2	6	13991	13996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370837
263	NC_013124	GAC	2	6	14085	14090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370837
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267	NC_013124	GCC	2	6	14199	14204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370837
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280	NC_013124	GTC	2	6	14795	14800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370838
281	NC_013124	GCG	2	6	14801	14806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370838
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283	NC_013124	CGT	2	6	14848	14853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370838
284	NC_013124	TGA	2	6	14865	14870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370838
285	NC_013124	TCG	2	6	14931	14936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370838
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287	NC_013124	CCA	2	6	14961	14966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370838
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335	NC_013124	TCG	2	6	17409	17414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370842
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340	NC_013124	TCA	2	6	17669	17674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370842
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374	NC_013124	GAG	2	6	19667	19672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370844
375	NC_013124	CGC	2	6	19685	19690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370844
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377	NC_013124	CGA	2	6	19840	19845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370844
378	NC_013124	GAT	2	6	19865	19870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370844
379	NC_013124	CTG	2	6	19871	19876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370844
380	NC_013124	CGG	2	6	19882	19887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370844
381	NC_013124	CGT	2	6	19901	19906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370844
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390	NC_013124	CGC	2	6	20222	20227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370844
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392	NC_013124	GCG	2	6	20305	20310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370844
393	NC_013124	TCG	2	6	20409	20414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370844
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395	NC_013124	TCG	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370845
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