MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 36431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_013124	CCA	2	6	2128904	2128909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372760
36003	NC_013124	CGG	2	6	2128953	2128958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372760
36004	NC_013124	GCC	2	6	2128981	2128986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372760
36005	NC_013124	CGA	2	6	2129037	2129042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36006	NC_013124	CGT	2	6	2129058	2129063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36007	NC_013124	CGA	2	6	2129103	2129108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36008	NC_013124	ACG	2	6	2129126	2129131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36009	NC_013124	ACC	2	6	2129140	2129145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372760
36010	NC_013124	TCG	2	6	2129174	2129179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36011	NC_013124	CCT	2	6	2129232	2129237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372760
36012	NC_013124	GCA	2	6	2129374	2129379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36013	NC_013124	CTG	2	6	2129412	2129417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372760
36014	NC_013124	CTG	2	6	2129689	2129694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372761
36015	NC_013124	TGC	2	6	2129753	2129758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372761
36016	NC_013124	CGA	2	6	2129766	2129771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372761
36017	NC_013124	CGC	2	6	2129885	2129890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372761
36018	NC_013124	ACG	2	6	2130089	2130094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372761
36019	NC_013124	ACG	2	6	2130176	2130181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372762
36020	NC_013124	GCC	2	6	2130221	2130226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372762
36021	NC_013124	GCG	2	6	2130279	2130284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372762
36022	NC_013124	CGG	2	6	2130347	2130352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372762
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36025	NC_013124	CGT	2	6	2130875	2130880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372763
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36030	NC_013124	ATG	2	6	2131087	2131092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372763
36031	NC_013124	GAC	2	6	2131167	2131172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372763
36032	NC_013124	GAG	2	6	2131177	2131182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372763
36033	NC_013124	GGA	2	6	2131233	2131238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372763
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36037	NC_013124	CGA	2	6	2131500	2131505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372763
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36040	NC_013124	TGG	2	6	2131729	2131734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372763
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36052	NC_013124	CGA	2	6	2133192	2133197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372764
36053	NC_013124	TGT	2	6	2133243	2133248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372764
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36055	NC_013124	GAG	2	6	2133286	2133291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372764
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36080	NC_013124	TCG	2	6	2134695	2134700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372767
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36083	NC_013124	CGG	2	6	2134875	2134880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372767
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36085	NC_013124	GAA	2	6	2135433	2135438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372768
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36087	NC_013124	CGA	2	6	2135480	2135485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372768
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36096	NC_013124	CGA	2	6	2136168	2136173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372769
36097	NC_013124	CCA	2	6	2136180	2136185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372769
36098	NC_013124	GTG	2	6	2136215	2136220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372769
36099	NC_013124	TAC	2	6	2137293	2137298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372770
36100	NC_013124	CTC	2	6	2137370	2137375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372770
36101	NC_013124	GTG	2	6	2137421	2137426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372770
36102	NC_013124	CTC	2	6	2137478	2137483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372770
36103	NC_013124	GGT	2	6	2137502	2137507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372770
36104	NC_013124	CAC	2	6	2137557	2137562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372770
36105	NC_013124	CGA	2	6	2137749	2137754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
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36108	NC_013124	CGA	2	6	2137992	2137997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
36109	NC_013124	CGA	2	6	2138022	2138027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
36110	NC_013124	CGG	2	6	2138047	2138052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372771
36111	NC_013124	TGA	2	6	2138109	2138114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
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36113	NC_013124	TCC	2	6	2138210	2138215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372771
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36227	NC_013124	GCA	2	6	2145114	2145119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372777
36228	NC_013124	CAC	2	6	2145172	2145177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372777
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36230	NC_013124	CGT	2	6	2145208	2145213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372777
36231	NC_013124	GCA	3	9	2145217	2145225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372777
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36233	NC_013124	GCG	2	6	2145402	2145407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372777
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36331	NC_013124	CTG	2	6	2151243	2151248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372781
36332	NC_013124	GTA	2	6	2151294	2151299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372781
36333	NC_013124	CAG	2	6	2151354	2151359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372781
36334	NC_013124	CGG	2	6	2151369	2151374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372781
36335	NC_013124	CGA	2	6	2151500	2151505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372781
36336	NC_013124	CGT	2	6	2151612	2151617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372781
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36338	NC_013124	AGC	2	6	2152504	2152509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372782
36339	NC_013124	AGC	2	6	2152534	2152539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372782
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36368	NC_013124	CGC	2	6	2155232	2155237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372783
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.