MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 3398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011992	CCCAC	2	10	434	443	20 %	0 %	0 %	80 %	222109226
2	NC_011992	ACCAC	2	10	1385	1394	40 %	0 %	0 %	60 %	222109226
3	NC_011992	CCACG	2	10	3708	3717	20 %	0 %	20 %	60 %	222109228
4	NC_011992	TGCGC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	40 %	40 %	222109228
5	NC_011992	CCGCC	2	10	6041	6050	0 %	0 %	20 %	80 %	222109230
6	NC_011992	GATCT	2	10	6066	6075	20 %	40 %	20 %	20 %	222109230
7	NC_011992	CTGGA	2	10	6390	6399	20 %	20 %	40 %	20 %	222109230
8	NC_011992	GGCGC	2	10	6793	6802	0 %	0 %	60 %	40 %	222109231
9	NC_011992	CGCTG	2	10	8877	8886	0 %	20 %	40 %	40 %	222109235
10	NC_011992	CGGCG	2	10	9080	9089	0 %	0 %	60 %	40 %	222109236
11	NC_011992	GCCCT	2	10	9366	9375	0 %	20 %	20 %	60 %	222109236
12	NC_011992	CGCGC	2	10	10352	10361	0 %	0 %	40 %	60 %	222109236
13	NC_011992	CGGCG	2	10	10747	10756	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011992	CCCTG	2	10	11011	11020	0 %	20 %	20 %	60 %	222109237
15	NC_011992	GATGG	2	10	12707	12716	20 %	20 %	60 %	0 %	222109238
16	NC_011992	TGCCC	2	10	13126	13135	0 %	20 %	20 %	60 %	222109239
17	NC_011992	GGCGC	2	10	14197	14206	0 %	0 %	60 %	40 %	222109239
18	NC_011992	GCGCG	2	10	14422	14431	0 %	0 %	60 %	40 %	222109239
19	NC_011992	CGCCC	2	10	14905	14914	0 %	0 %	20 %	80 %	222109239
20	NC_011992	TGGAC	2	10	15312	15321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011992	GGCCT	2	10	16209	16218	0 %	20 %	40 %	40 %	222109241
22	NC_011992	GCCGC	2	10	18352	18361	0 %	0 %	40 %	60 %	222109243
23	NC_011992	GGGCG	2	10	18442	18451	0 %	0 %	80 %	20 %	222109243
24	NC_011992	AGGGC	2	10	18578	18587	20 %	0 %	60 %	20 %	222109243
25	NC_011992	GGGCG	2	10	23298	23307	0 %	0 %	80 %	20 %	222109246
26	NC_011992	CGCGG	2	10	23864	23873	0 %	0 %	60 %	40 %	222109246
27	NC_011992	GCTTG	2	10	26585	26594	0 %	40 %	40 %	20 %	222109248
28	NC_011992	CAGGG	2	10	27336	27345	20 %	0 %	60 %	20 %	222109249
29	NC_011992	GCGCC	2	10	27374	27383	0 %	0 %	40 %	60 %	222109249
30	NC_011992	AGCGC	2	10	27934	27943	20 %	0 %	40 %	40 %	222109250
31	NC_011992	CCGCC	2	10	28558	28567	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_011992	AGGGC	2	10	30157	30166	20 %	0 %	60 %	20 %	222109252
33	NC_011992	CGGGG	2	10	30983	30992	0 %	0 %	80 %	20 %	222109252
34	NC_011992	CCCCG	2	10	33414	33423	0 %	0 %	20 %	80 %	222109253
35	NC_011992	GGCCG	2	10	34839	34848	0 %	0 %	60 %	40 %	222109255
36	NC_011992	TGGCG	2	10	35448	35457	0 %	20 %	60 %	20 %	222109255
37	NC_011992	CCGCG	2	10	35508	35517	0 %	0 %	40 %	60 %	222109255
38	NC_011992	CGGCC	2	10	36024	36033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011992	TGCGC	2	10	36072	36081	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011992	ACCGT	2	10	38159	38168	20 %	20 %	20 %	40 %	222109258
41	NC_011992	GCGCG	2	10	38355	38364	0 %	0 %	60 %	40 %	222109258
42	NC_011992	GCTGC	2	10	39127	39136	0 %	20 %	40 %	40 %	222109260
43	NC_011992	CGCGG	2	10	39500	39509	0 %	0 %	60 %	40 %	222109260
44	NC_011992	TGCGC	2	10	39999	40008	0 %	20 %	40 %	40 %	222109262
45	NC_011992	CGCGG	2	10	41776	41785	0 %	0 %	60 %	40 %	222109262
46	NC_011992	GACCA	2	10	42995	43004	40 %	0 %	20 %	40 %	222109263
47	NC_011992	GCGCA	2	10	43646	43655	20 %	0 %	40 %	40 %	222109263
48	NC_011992	TTTTG	2	10	45052	45061	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011992	GCGCC	2	10	45388	45397	0 %	0 %	40 %	60 %	222109265
50	NC_011992	AGGCC	2	10	45497	45506	20 %	0 %	40 %	40 %	222109265
51	NC_011992	TGCCA	2	10	47233	47242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011992	GGCTT	2	10	47694	47703	0 %	40 %	40 %	20 %	222109269
53	NC_011992	GGCGC	2	10	47762	47771	0 %	0 %	60 %	40 %	222109269
54	NC_011992	GCCGG	2	10	48320	48329	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011992	CGCGC	2	10	51421	51430	0 %	0 %	40 %	60 %	222109272
56	NC_011992	TGGAG	2	10	54661	54670	20 %	20 %	60 %	0 %	222109276
57	NC_011992	GCTGC	2	10	54695	54704	0 %	20 %	40 %	40 %	222109276
58	NC_011992	GCAAG	2	10	55832	55841	40 %	0 %	40 %	20 %	222109277
59	NC_011992	TGCGC	2	10	56087	56096	0 %	20 %	40 %	40 %	222109277
60	NC_011992	TGCCT	2	10	58162	58171	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011992	CTGGG	2	10	58625	58634	0 %	20 %	60 %	20 %	222109280
62	NC_011992	GTGGC	2	10	59391	59400	0 %	20 %	60 %	20 %	222109280
63	NC_011992	GCGCC	2	10	60007	60016	0 %	0 %	40 %	60 %	222109281
64	NC_011992	TGCGG	2	10	64364	64373	0 %	20 %	60 %	20 %	222109285
65	NC_011992	CCATG	2	10	64808	64817	20 %	20 %	20 %	40 %	222109285
66	NC_011992	TGCGG	2	10	65196	65205	0 %	20 %	60 %	20 %	222109285
67	NC_011992	AGGGC	2	10	65279	65288	20 %	0 %	60 %	20 %	222109285
68	NC_011992	TGCGC	2	10	65693	65702	0 %	20 %	40 %	40 %	222109285
69	NC_011992	GGGCA	2	10	65913	65922	20 %	0 %	60 %	20 %	222109285
70	NC_011992	GGCCC	2	10	69256	69265	0 %	0 %	40 %	60 %	222109287
71	NC_011992	CGCGC	3	15	69994	70008	0 %	0 %	40 %	60 %	222109288
72	NC_011992	CGCAG	2	10	70267	70276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011992	TGGCG	2	10	72712	72721	0 %	20 %	60 %	20 %	222109291
74	NC_011992	GCCGT	2	10	73492	73501	0 %	20 %	40 %	40 %	222109291
75	NC_011992	GCTGC	2	10	74484	74493	0 %	20 %	40 %	40 %	222109292
76	NC_011992	GCGCG	2	10	74564	74573	0 %	0 %	60 %	40 %	222109292
77	NC_011992	GCCGC	2	10	75524	75533	0 %	0 %	40 %	60 %	222109293
78	NC_011992	TGGTC	2	10	76945	76954	0 %	40 %	40 %	20 %	222109294
79	NC_011992	GTGCC	2	10	79184	79193	0 %	20 %	40 %	40 %	222109295
80	NC_011992	GCCCA	2	10	79506	79515	20 %	0 %	20 %	60 %	222109295
81	NC_011992	CGGCG	2	10	80008	80017	0 %	0 %	60 %	40 %	222109296
82	NC_011992	GCCGG	2	10	80208	80217	0 %	0 %	60 %	40 %	222109296
83	NC_011992	CGCGC	3	15	80283	80297	0 %	0 %	40 %	60 %	222109296
84	NC_011992	GCGCC	2	10	81607	81616	0 %	0 %	40 %	60 %	222109297
85	NC_011992	CGCTG	2	10	82330	82339	0 %	20 %	40 %	40 %	222109297
86	NC_011992	GGCAG	2	10	82409	82418	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011992	CTTGC	2	10	82430	82439	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011992	CGCTG	2	10	85208	85217	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011992	GATTG	2	10	85502	85511	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011992	CGGCC	2	10	85954	85963	0 %	0 %	40 %	60 %	222109300
91	NC_011992	GCGCC	2	10	86270	86279	0 %	0 %	40 %	60 %	222109300
92	NC_011992	GCCGA	2	10	87300	87309	20 %	0 %	40 %	40 %	222109301
93	NC_011992	ACGCT	2	10	87480	87489	20 %	20 %	20 %	40 %	222109301
94	NC_011992	CACGC	2	10	88837	88846	20 %	0 %	20 %	60 %	222109303
95	NC_011992	CCCGG	2	10	89797	89806	0 %	0 %	40 %	60 %	222109303
96	NC_011992	TGGCG	2	10	92685	92694	0 %	20 %	60 %	20 %	222109306
97	NC_011992	CGCAA	2	10	94066	94075	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011992	GCGCC	2	10	96298	96307	0 %	0 %	40 %	60 %	222109311
99	NC_011992	GCACG	2	10	96406	96415	20 %	0 %	40 %	40 %	222109311
100	NC_011992	CGTGC	2	10	97206	97215	0 %	20 %	40 %	40 %	222109312
101	NC_011992	GCTGG	2	10	97566	97575	0 %	20 %	60 %	20 %	222109312
102	NC_011992	CGGCC	2	10	97830	97839	0 %	0 %	40 %	60 %	222109312
103	NC_011992	CAGGC	2	10	98048	98057	20 %	0 %	40 %	40 %	222109313
104	NC_011992	CCAGC	2	10	98173	98182	20 %	0 %	20 %	60 %	222109313
105	NC_011992	GCGCG	2	10	101365	101374	0 %	0 %	60 %	40 %	222109316
106	NC_011992	GCCGC	2	10	103279	103288	0 %	0 %	40 %	60 %	222109318
107	NC_011992	GCCGA	2	10	104182	104191	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011992	GCGCG	2	10	106700	106709	0 %	0 %	60 %	40 %	222109322
109	NC_011992	GTCCA	2	10	109633	109642	20 %	20 %	20 %	40 %	222109323
110	NC_011992	CGGCC	2	10	110027	110036	0 %	0 %	40 %	60 %	222109324
111	NC_011992	TGGCG	2	10	110351	110360	0 %	20 %	60 %	20 %	222109324
112	NC_011992	GCGCG	2	10	110739	110748	0 %	0 %	60 %	40 %	222109325
113	NC_011992	GCGCC	2	10	110778	110787	0 %	0 %	40 %	60 %	222109325
114	NC_011992	CCGCG	2	10	113297	113306	0 %	0 %	40 %	60 %	222109326
115	NC_011992	CGCAG	2	10	113789	113798	20 %	0 %	40 %	40 %	222109327
116	NC_011992	GCCGC	2	10	114707	114716	0 %	0 %	40 %	60 %	222109329
117	NC_011992	GTGGC	2	10	116255	116264	0 %	20 %	60 %	20 %	222109329
118	NC_011992	TGGCC	2	10	116442	116451	0 %	20 %	40 %	40 %	222109329
119	NC_011992	CGTTG	2	10	116505	116514	0 %	40 %	40 %	20 %	222109329
120	NC_011992	GGGGT	2	10	122466	122475	0 %	20 %	80 %	0 %	222109331
121	NC_011992	GACCA	2	10	122559	122568	40 %	0 %	20 %	40 %	222109331
122	NC_011992	CGAGC	2	10	123056	123065	20 %	0 %	40 %	40 %	222109331
123	NC_011992	CGGGC	2	10	123356	123365	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011992	CCGGC	2	10	124089	124098	0 %	0 %	40 %	60 %	222109332
125	NC_011992	TGAGC	2	10	124192	124201	20 %	20 %	40 %	20 %	222109332
126	NC_011992	GCGCG	2	10	124375	124384	0 %	0 %	60 %	40 %	222109332
127	NC_011992	GCCGC	2	10	124830	124839	0 %	0 %	40 %	60 %	222109332
128	NC_011992	GCTGC	2	10	125363	125372	0 %	20 %	40 %	40 %	222109333
129	NC_011992	GCGCC	2	10	125421	125430	0 %	0 %	40 %	60 %	222109333
130	NC_011992	GCGGG	2	10	128340	128349	0 %	0 %	80 %	20 %	222109335
131	NC_011992	CGTGC	2	10	128833	128842	0 %	20 %	40 %	40 %	222109335
132	NC_011992	CGGCG	2	10	129802	129811	0 %	0 %	60 %	40 %	222109336
133	NC_011992	GCGCT	3	15	130650	130664	0 %	20 %	40 %	40 %	222109337
134	NC_011992	GGCCG	2	10	131184	131193	0 %	0 %	60 %	40 %	222109337
135	NC_011992	GCTGT	2	10	131567	131576	0 %	40 %	40 %	20 %	222109337
136	NC_011992	GCGCC	2	10	131896	131905	0 %	0 %	40 %	60 %	222109338
137	NC_011992	ACGCG	2	10	133808	133817	20 %	0 %	40 %	40 %	222109340
138	NC_011992	GGGGT	2	10	137259	137268	0 %	20 %	80 %	0 %	222109343
139	NC_011992	GCCTG	2	10	138995	139004	0 %	20 %	40 %	40 %	222109344
140	NC_011992	ACCGC	2	10	139280	139289	20 %	0 %	20 %	60 %	222109344
141	NC_011992	CTGGC	2	10	139756	139765	0 %	20 %	40 %	40 %	222109344
142	NC_011992	GGCCA	2	10	140155	140164	20 %	0 %	40 %	40 %	222109345
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144	NC_011992	GCCCG	2	10	143403	143412	0 %	0 %	40 %	60 %	222109348
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146	NC_011992	CAAAC	2	10	147516	147525	60 %	0 %	0 %	40 %	222109351
147	NC_011992	AGCTC	2	10	149222	149231	20 %	20 %	20 %	40 %	222109354
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150	NC_011992	GGCCG	2	10	151363	151372	0 %	0 %	60 %	40 %	222109355
151	NC_011992	CCAGC	2	10	151665	151674	20 %	0 %	20 %	60 %	222109356
152	NC_011992	GCCAA	2	10	155794	155803	40 %	0 %	20 %	40 %	222109359
153	NC_011992	CCAGC	2	10	156890	156899	20 %	0 %	20 %	60 %	222109360
154	NC_011992	GGCCT	2	10	157617	157626	0 %	20 %	40 %	40 %	222109361
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156	NC_011992	GGCCA	2	10	158415	158424	20 %	0 %	40 %	40 %	222109362
157	NC_011992	TGCGC	2	10	162583	162592	0 %	20 %	40 %	40 %	222109365
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170	NC_011992	CGTGG	2	10	182324	182333	0 %	20 %	60 %	20 %	222109384
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173	NC_011992	CGGCG	2	10	183714	183723	0 %	0 %	60 %	40 %	222109385
174	NC_011992	CGCGT	2	10	183864	183873	0 %	20 %	40 %	40 %	222109385
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179	NC_011992	GGCCT	2	10	190510	190519	0 %	20 %	40 %	40 %	222109390
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182	NC_011992	GTTGC	2	10	193086	193095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_011992	CCAGC	2	10	194270	194279	20 %	0 %	20 %	60 %	222109393
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195	NC_011992	GGCCT	2	10	206614	206623	0 %	20 %	40 %	40 %	222109404
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197	NC_011992	GCACC	2	10	208317	208326	20 %	0 %	20 %	60 %	222109406
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199	NC_011992	TGCCG	2	10	208665	208674	0 %	20 %	40 %	40 %	222109406
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247	NC_011992	CGCGG	2	10	264916	264925	0 %	0 %	60 %	40 %	222109464
248	NC_011992	CCCGC	2	10	265608	265617	0 %	0 %	20 %	80 %	222109465
249	NC_011992	CACGC	2	10	266051	266060	20 %	0 %	20 %	60 %	222109465
250	NC_011992	CGCAG	2	10	267402	267411	20 %	0 %	40 %	40 %	222109466
251	NC_011992	GGCGC	2	10	267998	268007	0 %	0 %	60 %	40 %	222109467
252	NC_011992	GACAT	2	10	269290	269299	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_011992	GTCGC	2	10	270013	270022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_011992	GGCAC	2	10	273164	273173	20 %	0 %	40 %	40 %	222109475
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256	NC_011992	GCGCC	2	10	275341	275350	0 %	0 %	40 %	60 %	222109477
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258	NC_011992	GCGCA	2	10	276519	276528	20 %	0 %	40 %	40 %	222109478
259	NC_011992	CGGAA	2	10	278203	278212	40 %	0 %	40 %	20 %	222109479
260	NC_011992	AAAAC	2	10	278265	278274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
261	NC_011992	GCCGT	2	10	282427	282436	0 %	20 %	40 %	40 %	222109484
262	NC_011992	CGCGG	2	10	283064	283073	0 %	0 %	60 %	40 %	222109484
263	NC_011992	GGCTG	2	10	283211	283220	0 %	20 %	60 %	20 %	222109484
264	NC_011992	CGTGC	2	10	284125	284134	0 %	20 %	40 %	40 %	222109486
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266	NC_011992	GAAGT	2	10	286533	286542	40 %	20 %	40 %	0 %	222109489
267	NC_011992	GTTCG	2	10	291183	291192	0 %	40 %	40 %	20 %	222109493
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396	NC_011992	CAGGC	2	10	423906	423915	20 %	0 %	40 %	40 %	222109638
397	NC_011992	GCGCG	2	10	426433	426442	0 %	0 %	60 %	40 %	222109640
398	NC_011992	GCGCG	2	10	426991	427000	0 %	0 %	60 %	40 %	222109640
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