MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 3398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011992	GCGCC	2	10	3344706	3344715	0 %	0 %	40 %	60 %	222112298
3002	NC_011992	CCACC	2	10	3345357	3345366	20 %	0 %	0 %	80 %	222112300
3003	NC_011992	GCAGG	2	10	3346715	3346724	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3004	NC_011992	CCGCC	3	15	3348285	3348299	0 %	0 %	20 %	80 %	222112302
3005	NC_011992	CTGGA	2	10	3349674	3349683	20 %	20 %	40 %	20 %	222112303
3006	NC_011992	GGCGC	2	10	3351016	3351025	0 %	0 %	60 %	40 %	222112304
3007	NC_011992	CGCTG	2	10	3351927	3351936	0 %	20 %	40 %	40 %	222112304
3008	NC_011992	GCATG	2	10	3352840	3352849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_011992	CTTTT	2	10	3352895	3352904	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3010	NC_011992	CCCTC	2	10	3354072	3354081	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3011	NC_011992	ACGCC	2	10	3354667	3354676	20 %	0 %	20 %	60 %	222112306
3012	NC_011992	GGCGC	2	10	3356124	3356133	0 %	0 %	60 %	40 %	222112307
3013	NC_011992	CGCGG	2	10	3356607	3356616	0 %	0 %	60 %	40 %	222112307
3014	NC_011992	AAGCA	2	10	3356666	3356675	60 %	0 %	20 %	20 %	222112307
3015	NC_011992	CCAGC	2	10	3357319	3357328	20 %	0 %	20 %	60 %	222112307
3016	NC_011992	GCCTG	2	10	3358098	3358107	0 %	20 %	40 %	40 %	222112309
3017	NC_011992	GGGCC	2	10	3358858	3358867	0 %	0 %	60 %	40 %	222112309
3018	NC_011992	CGGCC	2	10	3360609	3360618	0 %	0 %	40 %	60 %	222112312
3019	NC_011992	TCGCC	2	10	3360751	3360760	0 %	20 %	20 %	60 %	222112312
3020	NC_011992	GCGCC	2	10	3361633	3361642	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3021	NC_011992	CGCCA	2	10	3362101	3362110	20 %	0 %	20 %	60 %	222112313
3022	NC_011992	GCCCA	2	10	3364213	3364222	20 %	0 %	20 %	60 %	222112315
3023	NC_011992	CGCCC	2	10	3364757	3364766	0 %	0 %	20 %	80 %	222112316
3024	NC_011992	GCGCC	2	10	3364840	3364849	0 %	0 %	40 %	60 %	222112316
3025	NC_011992	GCCAG	2	10	3365307	3365316	20 %	0 %	40 %	40 %	222112317
3026	NC_011992	GAAAT	2	10	3366066	3366075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011992	TGTGG	2	10	3368618	3368627	0 %	40 %	60 %	0 %	222112320
3028	NC_011992	CTGCC	2	10	3368927	3368936	0 %	20 %	20 %	60 %	222112320
3029	NC_011992	GGCGC	2	10	3369531	3369540	0 %	0 %	60 %	40 %	222112321
3030	NC_011992	CCGCA	2	10	3370065	3370074	20 %	0 %	20 %	60 %	222112321
3031	NC_011992	CGTGG	2	10	3371093	3371102	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_011992	TGGTC	2	10	3371568	3371577	0 %	40 %	40 %	20 %	222112324
3033	NC_011992	GCCAC	2	10	3371962	3371971	20 %	0 %	20 %	60 %	222112325
3034	NC_011992	GCCAC	2	10	3373494	3373503	20 %	0 %	20 %	60 %	222112326
3035	NC_011992	CCTGG	2	10	3374204	3374213	0 %	20 %	40 %	40 %	222112326
3036	NC_011992	CACGG	2	10	3374252	3374261	20 %	0 %	40 %	40 %	222112326
3037	NC_011992	CTGGA	2	10	3375013	3375022	20 %	20 %	40 %	20 %	222112327
3038	NC_011992	GCTGG	2	10	3377101	3377110	0 %	20 %	60 %	20 %	222112328
3039	NC_011992	GCCCC	2	10	3377212	3377221	0 %	0 %	20 %	80 %	222112328
3040	NC_011992	TGCAT	2	10	3377258	3377267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_011992	GCGTC	2	10	3377715	3377724	0 %	20 %	40 %	40 %	222112329
3042	NC_011992	AAATC	2	10	3379560	3379569	60 %	20 %	0 %	20 %	222112330
3043	NC_011992	GCAGT	2	10	3380650	3380659	20 %	20 %	40 %	20 %	222112332
3044	NC_011992	TTCCT	2	10	3383073	3383082	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_011992	CATCT	2	10	3386228	3386237	20 %	40 %	0 %	40 %	222112336
3046	NC_011992	GCGCT	2	10	3387912	3387921	0 %	20 %	40 %	40 %	222112338
3047	NC_011992	GCAAG	2	10	3388291	3388300	40 %	0 %	40 %	20 %	222112338
3048	NC_011992	ATGGC	2	10	3390656	3390665	20 %	20 %	40 %	20 %	222112340
3049	NC_011992	GAGCG	2	10	3391592	3391601	20 %	0 %	60 %	20 %	222112341
3050	NC_011992	GCGTG	2	10	3392724	3392733	0 %	20 %	60 %	20 %	222112343
3051	NC_011992	GCGAC	2	10	3393030	3393039	20 %	0 %	40 %	40 %	222112343
3052	NC_011992	CGCAG	2	10	3398091	3398100	20 %	0 %	40 %	40 %	222112348
3053	NC_011992	TCGGC	2	10	3398488	3398497	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3054	NC_011992	TGTCG	2	10	3403555	3403564	0 %	40 %	40 %	20 %	222112351
3055	NC_011992	CTTGG	2	10	3403603	3403612	0 %	40 %	40 %	20 %	222112351
3056	NC_011992	CAGGC	2	10	3403768	3403777	20 %	0 %	40 %	40 %	222112351
3057	NC_011992	ACTCG	2	10	3404098	3404107	20 %	20 %	20 %	40 %	222112351
3058	NC_011992	GCCAA	2	10	3405823	3405832	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3059	NC_011992	CGCCC	2	10	3407119	3407128	0 %	0 %	20 %	80 %	222112354
3060	NC_011992	AGCGC	2	10	3407198	3407207	20 %	0 %	40 %	40 %	222112354
3061	NC_011992	TGACC	2	10	3408788	3408797	20 %	20 %	20 %	40 %	222112358
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3063	NC_011992	CTGCG	2	10	3410079	3410088	0 %	20 %	40 %	40 %	222112358
3064	NC_011992	AGATC	2	10	3410381	3410390	40 %	20 %	20 %	20 %	222112358
3065	NC_011992	AGTGC	2	10	3411798	3411807	20 %	20 %	40 %	20 %	222112360
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3071	NC_011992	CAGCG	2	10	3419691	3419700	20 %	0 %	40 %	40 %	222112364
3072	NC_011992	TGCGC	2	10	3420797	3420806	0 %	20 %	40 %	40 %	222112364
3073	NC_011992	CGGTG	2	10	3422673	3422682	0 %	20 %	60 %	20 %	222112367
3074	NC_011992	GCCGC	2	10	3422839	3422848	0 %	0 %	40 %	60 %	222112367
3075	NC_011992	CGGCG	2	10	3424003	3424012	0 %	0 %	60 %	40 %	222112370
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3096	NC_011992	GCCCG	2	10	3451658	3451667	0 %	0 %	40 %	60 %	222112402
3097	NC_011992	GCCCG	2	10	3454610	3454619	0 %	0 %	40 %	60 %	222112406
3098	NC_011992	CACCG	2	10	3456760	3456769	20 %	0 %	20 %	60 %	222112407
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3104	NC_011992	GCACG	2	10	3461066	3461075	20 %	0 %	40 %	40 %	222112410
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3109	NC_011992	TGGTC	2	10	3466296	3466305	0 %	40 %	40 %	20 %	222112411
3110	NC_011992	CCCAG	2	10	3468137	3468146	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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3116	NC_011992	CTCCC	2	10	3477559	3477568	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3117	NC_011992	CACGA	2	10	3479116	3479125	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3377	NC_011992	CGTGA	2	10	3782424	3782433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3378	NC_011992	CGGGG	2	10	3782522	3782531	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3379	NC_011992	GGCCG	2	10	3782536	3782545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3380	NC_011992	AAGCG	2	10	3782628	3782637	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3381	NC_011992	CCATG	2	10	3783960	3783969	20 %	20 %	20 %	40 %	222112693
3382	NC_011992	AGGCA	2	10	3785081	3785090	40 %	0 %	40 %	20 %	222112693
3383	NC_011992	GGTCG	2	10	3785335	3785344	0 %	20 %	60 %	20 %	222112693
3384	NC_011992	AAGCG	2	10	3786667	3786676	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3385	NC_011992	GCCGG	2	10	3786696	3786705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3386	NC_011992	GAGCG	2	10	3786717	3786726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3387	NC_011992	GCGCA	2	10	3787467	3787476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3388	NC_011992	AAGCG	2	10	3787606	3787615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3389	NC_011992	CGCTG	2	10	3787898	3787907	0 %	20 %	40 %	40 %	222112696
3390	NC_011992	GCGCA	2	10	3788156	3788165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3391	NC_011992	AAGCG	2	10	3788305	3788314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3392	NC_011992	GTGAA	2	10	3788740	3788749	40 %	20 %	40 %	0 %	222112697
3393	NC_011992	GCGCA	2	10	3788942	3788951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3394	NC_011992	AGCGC	2	10	3789095	3789104	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3395	NC_011992	ACGGT	2	10	3789313	3789322	20 %	20 %	40 %	20 %	222112698
3396	NC_011992	GCAAC	2	10	3789525	3789534	40 %	0 %	20 %	40 %	222112698
3397	NC_011992	CAGGT	2	10	3791642	3791651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3398	NC_011992	CGGCC	2	10	3796166	3796175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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