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Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	CAG	2	6	368	373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109118
2	NC_011991	CAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109118
3	NC_011991	GCT	2	6	495	500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109118
4	NC_011991	CGG	2	6	540	545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109118
5	NC_011991	ATC	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109118
6	NC_011991	GAC	3	9	680	688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109118
7	NC_011991	TCG	2	6	848	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109118
8	NC_011991	GGT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109118
9	NC_011991	TTC	2	6	987	992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109118
10	NC_011991	CGT	3	9	1037	1045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109118
11	NC_011991	CCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109118
12	NC_011991	TGC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109118
13	NC_011991	TCT	2	6	1178	1183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109118
14	NC_011991	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109118
15	NC_011991	AAG	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109118
16	NC_011991	TTG	2	6	1279	1284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109118
17	NC_011991	TCC	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109118
18	NC_011991	GAT	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109118
19	NC_011991	CTG	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109119
20	NC_011991	TGA	2	6	1630	1635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109119
21	NC_011991	GCC	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109119
22	NC_011991	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109119
23	NC_011991	TGC	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109119
24	NC_011991	CAG	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109119
25	NC_011991	GGC	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109119
26	NC_011991	CCG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109119
27	NC_011991	CGA	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109119
28	NC_011991	GCA	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109119
29	NC_011991	ATC	2	6	2120	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109119
30	NC_011991	AGC	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109119
31	NC_011991	GAA	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109119
32	NC_011991	CGG	2	6	2320	2325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109119
33	NC_011991	AGA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109119
34	NC_011991	TTG	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109119
35	NC_011991	ACG	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109120
36	NC_011991	GCG	2	6	2721	2726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109120
37	NC_011991	GAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109120
38	NC_011991	CCT	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109120
39	NC_011991	ACT	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109120
40	NC_011991	TCG	2	6	2988	2993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109120
41	NC_011991	CGC	2	6	3113	3118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109120
42	NC_011991	GAG	2	6	3133	3138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109120
43	NC_011991	CGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109120
44	NC_011991	CGG	2	6	3214	3219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109120
45	NC_011991	GAG	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109120
46	NC_011991	CCG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109120
47	NC_011991	CGA	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109120
48	NC_011991	CTT	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109120
49	NC_011991	CGA	2	6	3375	3380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109120
50	NC_011991	TCA	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109120
51	NC_011991	AGC	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109120
52	NC_011991	TGC	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109120
53	NC_011991	GGC	2	6	3619	3624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109120
54	NC_011991	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109121
55	NC_011991	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109121
56	NC_011991	ATC	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109121
57	NC_011991	TCA	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109121
58	NC_011991	GCC	2	6	4445	4450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109121
59	NC_011991	GGA	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109121
60	NC_011991	ATA	2	6	4596	4601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109121
61	NC_011991	GAG	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109121
62	NC_011991	TGT	2	6	4727	4732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109121
63	NC_011991	TCA	3	9	4747	4755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109121
64	NC_011991	CGT	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109122
65	NC_011991	GGT	2	6	5043	5048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109122
66	NC_011991	CGA	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109122
67	NC_011991	AAG	2	6	5167	5172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109122
68	NC_011991	CTG	2	6	5307	5312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109122
69	NC_011991	TGA	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109122
70	NC_011991	CGC	2	6	5382	5387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109122
71	NC_011991	GAG	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109122
72	NC_011991	GGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109122
73	NC_011991	TCG	2	6	5901	5906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109123
74	NC_011991	CTC	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109123
75	NC_011991	GCC	2	6	6083	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109123
76	NC_011991	CGG	2	6	6162	6167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109123
77	NC_011991	GCG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109124
78	NC_011991	GAG	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109124
79	NC_011991	CCG	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109124
80	NC_011991	GCA	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109124
81	NC_011991	CGG	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109124
82	NC_011991	TCG	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109124
83	NC_011991	GAC	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109124
84	NC_011991	TCC	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109124
85	NC_011991	GAA	2	6	6841	6846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109125
86	NC_011991	GGC	2	6	6906	6911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109125
87	NC_011991	TGG	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109125
88	NC_011991	GAG	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109125
89	NC_011991	TAT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109125
90	NC_011991	CAG	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109125
91	NC_011991	GCC	2	6	7206	7211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109126
92	NC_011991	GTT	2	6	7232	7237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109126
93	NC_011991	GTA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109126
94	NC_011991	CTG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109126
95	NC_011991	GCG	2	6	7417	7422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109126
96	NC_011991	GCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109126
97	NC_011991	TCA	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109126
98	NC_011991	TCG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109126
99	NC_011991	CGG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109126
100	NC_011991	CCG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109126
101	NC_011991	CAG	3	9	7721	7729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109126
102	NC_011991	AGC	2	6	7776	7781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109126
103	NC_011991	CTT	2	6	7808	7813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109126
104	NC_011991	CGG	2	6	7941	7946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109126
105	NC_011991	TCC	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109126
106	NC_011991	TGG	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109126
107	NC_011991	CGA	2	6	8074	8079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109126
108	NC_011991	CAA	2	6	8087	8092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109126
109	NC_011991	CGT	3	9	8230	8238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109126
110	NC_011991	ACG	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109127
111	NC_011991	GCG	2	6	8395	8400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109127
112	NC_011991	CAT	2	6	8468	8473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109127
113	NC_011991	GCC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109127
114	NC_011991	TCA	2	6	8564	8569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109127
115	NC_011991	CGG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109127
116	NC_011991	CGT	2	6	8702	8707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109127
117	NC_011991	GTT	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109127
118	NC_011991	GGC	3	9	8730	8738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109127
119	NC_011991	CCG	2	6	9507	9512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109128
120	NC_011991	GAC	3	9	9589	9597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
121	NC_011991	GAC	2	6	9637	9642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
122	NC_011991	GAT	2	6	9658	9663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109128
123	NC_011991	GCC	2	6	9715	9720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109128
124	NC_011991	CGA	2	6	9734	9739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
125	NC_011991	CTG	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109128
126	NC_011991	ACG	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
127	NC_011991	GCA	2	6	10075	10080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
128	NC_011991	GCA	2	6	10125	10130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109128
129	NC_011991	GGC	2	6	10269	10274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109128
130	NC_011991	GCA	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109129
131	NC_011991	GAT	2	6	10484	10489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109129
132	NC_011991	ATT	2	6	10511	10516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109129
133	NC_011991	TCT	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109129
134	NC_011991	GCA	2	6	10629	10634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109129
135	NC_011991	ATT	2	6	10635	10640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109129
136	NC_011991	GAG	2	6	10763	10768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109129
137	NC_011991	GAA	2	6	10870	10875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109129
138	NC_011991	GTA	2	6	10901	10906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109129
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142	NC_011991	GGC	2	6	11238	11243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109130
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145	NC_011991	CTT	2	6	11375	11380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109130
146	NC_011991	TTG	2	6	11398	11403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109130
147	NC_011991	GAT	2	6	11409	11414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109130
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150	NC_011991	CTT	2	6	11505	11510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109130
151	NC_011991	TCG	2	6	11542	11547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109130
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153	NC_011991	GCC	2	6	11601	11606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109130
154	NC_011991	GAT	2	6	11658	11663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109130
155	NC_011991	CCG	2	6	11704	11709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109130
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162	NC_011991	TCG	2	6	12346	12351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109131
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240	NC_011991	TCG	2	6	19288	19293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109135
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243	NC_011991	GCA	2	6	19334	19339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109135
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246	NC_011991	GAA	2	6	20080	20085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109136
247	NC_011991	TCC	2	6	20180	20185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109136
248	NC_011991	CGG	2	6	20371	20376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109136
249	NC_011991	GTC	2	6	20450	20455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109136
250	NC_011991	CGG	2	6	20530	20535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109136
251	NC_011991	AAC	2	6	20573	20578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109136
252	NC_011991	TTC	2	6	20732	20737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109137
253	NC_011991	CCT	2	6	20766	20771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109137
254	NC_011991	GCT	2	6	20905	20910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109137
255	NC_011991	ACT	2	6	20919	20924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109137
256	NC_011991	ACT	2	6	20969	20974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109137
257	NC_011991	GCT	2	6	20989	20994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109137
258	NC_011991	CTG	2	6	21046	21051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109137
259	NC_011991	GAC	2	6	21059	21064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109137
260	NC_011991	TGC	2	6	21165	21170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109137
261	NC_011991	GAA	2	6	21171	21176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109137
262	NC_011991	TTG	2	6	21316	21321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109137
263	NC_011991	CGC	2	6	21533	21538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109137
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265	NC_011991	TGT	2	6	21587	21592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109137
266	NC_011991	CTC	2	6	21601	21606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109137
267	NC_011991	CGA	2	6	21628	21633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109137
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269	NC_011991	CAA	2	6	21801	21806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109137
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272	NC_011991	GCA	2	6	22257	22262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109137
273	NC_011991	GTT	2	6	22401	22406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109137
274	NC_011991	CGC	2	6	22487	22492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109137
275	NC_011991	TTG	2	6	22738	22743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109138
276	NC_011991	TCT	2	6	22791	22796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109138
277	NC_011991	TTG	2	6	22808	22813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109138
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281	NC_011991	CAG	2	6	23155	23160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109138
282	NC_011991	GCG	2	6	23218	23223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109138
283	NC_011991	TAG	2	6	23294	23299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109138
284	NC_011991	GCT	2	6	23338	23343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109138
285	NC_011991	AGC	2	6	23360	23365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109138
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370	NC_011991	GAG	2	6	31017	31022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109143
371	NC_011991	GTC	2	6	31023	31028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
372	NC_011991	GCC	2	6	31092	31097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
373	NC_011991	TCG	2	6	31230	31235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
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375	NC_011991	GGC	2	6	31416	31421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
376	NC_011991	GGC	2	6	31466	31471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
377	NC_011991	CAT	2	6	31531	31536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109143
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379	NC_011991	AGT	2	6	31666	31671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109143
380	NC_011991	CTT	2	6	31709	31714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109143
381	NC_011991	CGA	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109143
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383	NC_011991	CGG	3	9	31846	31854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109143
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388	NC_011991	CGC	2	6	32193	32198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109143
389	NC_011991	TGC	2	6	32215	32220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109143
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408	NC_011991	GCC	2	6	34270	34275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109144
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497	NC_011991	TCA	2	6	42797	42802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
498	NC_011991	ACA	2	6	42866	42871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
499	NC_011991	GAT	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
500	NC_011991	CGG	2	6	43079	43084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151

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