MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011991	CTG	2	6	90292	90297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109202
1002	NC_011991	CAA	2	6	90401	90406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109202
1003	NC_011991	GTT	2	6	90453	90458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109202
1004	NC_011991	TAG	2	6	90634	90639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109202
1005	NC_011991	GCC	2	6	90643	90648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109202
1006	NC_011991	GCT	2	6	90711	90716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109202
1007	NC_011991	AGT	2	6	90875	90880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109202
1008	NC_011991	GTC	2	6	90917	90922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109202
1009	NC_011991	AGG	2	6	90945	90950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109202
1010	NC_011991	AAC	2	6	90957	90962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109202
1011	NC_011991	CAT	2	6	90973	90978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109202
1012	NC_011991	TTG	2	6	91022	91027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109202
1013	NC_011991	CGG	2	6	91206	91211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109203
1014	NC_011991	CGA	3	9	91299	91307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109203
1015	NC_011991	CAC	2	6	91327	91332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109203
1016	NC_011991	CGC	2	6	91568	91573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109203
1017	NC_011991	ACC	2	6	91597	91602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109203
1018	NC_011991	TGT	2	6	91680	91685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109203
1019	NC_011991	CTG	2	6	91737	91742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109203
1020	NC_011991	CGT	2	6	91780	91785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109203
1021	NC_011991	GAA	2	6	91845	91850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109203
1022	NC_011991	TGG	2	6	91955	91960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109203
1023	NC_011991	GAC	2	6	92274	92279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109204
1024	NC_011991	GTT	2	6	92300	92305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109204
1025	NC_011991	GAT	2	6	92438	92443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109204
1026	NC_011991	TTC	2	6	92478	92483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109204
1027	NC_011991	AAG	2	6	92536	92541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109204
1028	NC_011991	CAA	2	6	92570	92575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109204
1029	NC_011991	TCC	2	6	92583	92588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109204
1030	NC_011991	CGG	2	6	92644	92649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109204
1031	NC_011991	TTC	2	6	92705	92710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109204
1032	NC_011991	CGC	2	6	92735	92740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109204
1033	NC_011991	CGC	2	6	93087	93092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109205
1034	NC_011991	TCT	2	6	93203	93208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109205
1035	NC_011991	TCA	2	6	93236	93241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109205
1036	NC_011991	CTT	2	6	93309	93314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109205
1037	NC_011991	TGC	2	6	93367	93372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109205
1038	NC_011991	TTC	2	6	93547	93552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109205
1039	NC_011991	CAA	2	6	93558	93563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109205
1040	NC_011991	TCT	2	6	93633	93638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109205
1041	NC_011991	TCA	2	6	93676	93681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109205
1042	NC_011991	CAG	2	6	93749	93754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109205
1043	NC_011991	CGA	3	9	93758	93766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109205
1044	NC_011991	TCG	2	6	93910	93915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1045	NC_011991	AAC	2	6	93920	93925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109206
1046	NC_011991	GAA	2	6	94105	94110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109206
1047	NC_011991	CTG	2	6	94193	94198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1048	NC_011991	CGA	2	6	94238	94243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1049	NC_011991	CTA	2	6	94294	94299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109206
1050	NC_011991	GTC	2	6	94389	94394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1051	NC_011991	CGA	2	6	94878	94883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1052	NC_011991	CGG	2	6	94914	94919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109206
1053	NC_011991	CGT	2	6	94928	94933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1054	NC_011991	ATC	2	6	94941	94946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109206
1055	NC_011991	CAG	2	6	95120	95125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109206
1056	NC_011991	TGA	2	6	95827	95832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109207
1057	NC_011991	CAT	3	9	95836	95844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109207
1058	NC_011991	ACT	2	6	95870	95875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109207
1059	NC_011991	CCT	2	6	95985	95990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109207
1060	NC_011991	GAG	2	6	96083	96088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109207
1061	NC_011991	CGA	2	6	96232	96237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109207
1062	NC_011991	CCG	3	9	96241	96249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109207
1063	NC_011991	GAG	2	6	96335	96340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109207
1064	NC_011991	CCT	2	6	96505	96510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109207
1065	NC_011991	GAG	2	6	96524	96529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109207
1066	NC_011991	GAC	2	6	96641	96646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109207
1067	NC_011991	CTT	2	6	96653	96658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109207
1068	NC_011991	GTC	2	6	96743	96748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109207
1069	NC_011991	CAT	2	6	96849	96854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1070	NC_011991	GCA	2	6	96888	96893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1071	NC_011991	TCA	2	6	96909	96914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1072	NC_011991	GAA	2	6	96966	96971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109208
1073	NC_011991	GAG	2	6	96994	96999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109208
1074	NC_011991	CTG	2	6	97009	97014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1075	NC_011991	CGA	2	6	97017	97022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1076	NC_011991	GTG	2	6	97097	97102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109208
1077	NC_011991	ATG	2	6	97115	97120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1078	NC_011991	TTG	2	6	97259	97264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109208
1079	NC_011991	ACG	2	6	97265	97270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1080	NC_011991	TAA	2	6	97331	97336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109208
1081	NC_011991	GCC	2	6	97337	97342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109208
1082	NC_011991	CTT	2	6	97392	97397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109208
1083	NC_011991	AGC	2	6	97454	97459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1084	NC_011991	CTC	2	6	97525	97530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109208
1085	NC_011991	ACC	2	6	97590	97595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109208
1086	NC_011991	TGA	2	6	97686	97691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1087	NC_011991	CTT	2	6	97871	97876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109208
1088	NC_011991	GAT	2	6	98047	98052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1089	NC_011991	CGT	2	6	98088	98093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1090	NC_011991	GTC	2	6	98151	98156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1091	NC_011991	CGG	2	6	98248	98253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1092	NC_011991	CAG	2	6	98264	98269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1093	NC_011991	ATC	2	6	98303	98308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1094	NC_011991	CAG	2	6	98490	98495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1095	NC_011991	ACA	2	6	98708	98713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109208
1096	NC_011991	CGT	2	6	98766	98771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1097	NC_011991	GCG	2	6	99197	99202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1098	NC_011991	TGG	2	6	99259	99264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109208
1099	NC_011991	CAG	2	6	99268	99273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1100	NC_011991	AAC	2	6	99421	99426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109208
1101	NC_011991	GTG	2	6	99448	99453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109208
1102	NC_011991	GCC	2	6	99500	99505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109208
1103	NC_011991	GTC	2	6	99565	99570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1104	NC_011991	ACG	2	6	99746	99751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1105	NC_011991	CCG	2	6	99911	99916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109208
1106	NC_011991	GCC	2	6	100068	100073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109208
1107	NC_011991	ACT	2	6	100104	100109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1108	NC_011991	GCT	2	6	100188	100193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1109	NC_011991	AAG	2	6	100223	100228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109208
1110	NC_011991	AGG	2	6	100419	100424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109208
1111	NC_011991	CAT	2	6	100483	100488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1112	NC_011991	CGG	2	6	100494	100499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1113	NC_011991	TTG	2	6	100516	100521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109208
1114	NC_011991	TGT	2	6	100584	100589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109208
1115	NC_011991	CTT	2	6	100788	100793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109208
1116	NC_011991	CCA	2	6	100796	100801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109208
1117	NC_011991	CCA	2	6	100842	100847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109208
1118	NC_011991	GGC	2	6	100906	100911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1119	NC_011991	GAT	2	6	100981	100986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1120	NC_011991	CTT	2	6	101001	101006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109208
1121	NC_011991	ATG	2	6	101069	101074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1122	NC_011991	GTC	2	6	101095	101100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1123	NC_011991	AGA	2	6	101131	101136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109208
1124	NC_011991	TCC	2	6	101240	101245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109208
1125	NC_011991	CGG	2	6	101262	101267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1126	NC_011991	GCA	2	6	101385	101390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1127	NC_011991	GTA	2	6	101423	101428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109208
1128	NC_011991	CAG	2	6	101454	101459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
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1130	NC_011991	GCA	2	6	101490	101495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1131	NC_011991	CGA	2	6	101571	101576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1132	NC_011991	CGG	2	6	101770	101775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1133	NC_011991	GCT	2	6	101790	101795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1134	NC_011991	TGG	2	6	102065	102070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109208
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1136	NC_011991	CGC	2	6	102221	102226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109208
1137	NC_011991	CTG	2	6	102366	102371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1138	NC_011991	GCT	3	9	102411	102419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
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1140	NC_011991	CTA	2	6	102484	102489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1141	NC_011991	GCG	2	6	102608	102613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1142	NC_011991	ATC	2	6	102687	102692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
1143	NC_011991	GCG	2	6	102700	102705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1144	NC_011991	CGA	2	6	103005	103010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1145	NC_011991	CGT	2	6	103092	103097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1146	NC_011991	GCG	2	6	103228	103233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109208
1147	NC_011991	AGG	2	6	103343	103348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109208
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1149	NC_011991	CGA	2	6	103401	103406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109208
1150	NC_011991	CTT	2	6	103410	103415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109208
1151	NC_011991	ACT	2	6	103434	103439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109208
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1239	NC_011991	CTA	2	6	111344	111349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109209
1240	NC_011991	ACT	2	6	111368	111373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109209
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1358	NC_011991	GCC	2	6	121420	121425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1359	NC_011991	GCC	2	6	121470	121475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1360	NC_011991	GGC	2	6	121500	121505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
1361	NC_011991	TGC	2	6	121509	121514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1362	NC_011991	CGG	2	6	121580	121585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
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