MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011989	GGCGC	2	10	3549	3558	0 %	0 %	60 %	40 %	222147020
2	NC_011989	GCGTC	2	10	3799	3808	0 %	20 %	40 %	40 %	222147020
3	NC_011989	GACCC	2	10	3983	3992	20 %	0 %	20 %	60 %	222147021
4	NC_011989	GCGTA	2	10	5248	5257	20 %	20 %	40 %	20 %	222147023
5	NC_011989	CCGGC	2	10	6015	6024	0 %	0 %	40 %	60 %	222147024
6	NC_011989	GTCGA	2	10	7003	7012	20 %	20 %	40 %	20 %	222147024
7	NC_011989	ATGAA	2	10	11748	11757	60 %	20 %	20 %	0 %	222147029
8	NC_011989	ACGCA	2	10	13305	13314	40 %	0 %	20 %	40 %	222147030
9	NC_011989	CAGGG	2	10	13997	14006	20 %	0 %	60 %	20 %	222147031
10	NC_011989	CTATG	2	10	18027	18036	20 %	40 %	20 %	20 %	222147035
11	NC_011989	CCGTG	2	10	19236	19245	0 %	20 %	40 %	40 %	222147036
12	NC_011989	CGGCG	2	10	20662	20671	0 %	0 %	60 %	40 %	222147037
13	NC_011989	GCCGA	2	10	20755	20764	20 %	0 %	40 %	40 %	222147037
14	NC_011989	GCGCA	2	10	25241	25250	20 %	0 %	40 %	40 %	222147041
15	NC_011989	GACGA	2	10	26432	26441	40 %	0 %	40 %	20 %	222147043
16	NC_011989	CCGCA	2	10	28379	28388	20 %	0 %	20 %	60 %	222147046
17	NC_011989	GCCAG	2	10	28585	28594	20 %	0 %	40 %	40 %	222147046
18	NC_011989	AACGC	2	10	29738	29747	40 %	0 %	20 %	40 %	222147048
19	NC_011989	CGGCG	2	10	31077	31086	0 %	0 %	60 %	40 %	222147050
20	NC_011989	GCGCG	2	10	32754	32763	0 %	0 %	60 %	40 %	222147051
21	NC_011989	CGGCG	2	10	35450	35459	0 %	0 %	60 %	40 %	222147053
22	NC_011989	GCTGC	2	10	38754	38763	0 %	20 %	40 %	40 %	222147057
23	NC_011989	TGCCG	2	10	39923	39932	0 %	20 %	40 %	40 %	222147058
24	NC_011989	ATGGC	2	10	42804	42813	20 %	20 %	40 %	20 %	222147059
25	NC_011989	CGCTG	2	10	45873	45882	0 %	20 %	40 %	40 %	222147061
26	NC_011989	TGCGC	2	10	46131	46140	0 %	20 %	40 %	40 %	222147061
27	NC_011989	CGCTG	2	10	46164	46173	0 %	20 %	40 %	40 %	222147061
28	NC_011989	GTCCG	2	10	49191	49200	0 %	20 %	40 %	40 %	222147062
29	NC_011989	CGGCG	2	10	49916	49925	0 %	0 %	60 %	40 %	222147062
30	NC_011989	TGGTC	2	10	50577	50586	0 %	40 %	40 %	20 %	222147062
31	NC_011989	AAGTG	2	10	51229	51238	40 %	20 %	40 %	0 %	222147062
32	NC_011989	ACGGA	2	10	52181	52190	40 %	0 %	40 %	20 %	222147063
33	NC_011989	AAATC	2	10	55201	55210	60 %	20 %	0 %	20 %	222147065
34	NC_011989	CAGGG	2	10	57097	57106	20 %	0 %	60 %	20 %	222147067
35	NC_011989	CCGCG	2	10	58451	58460	0 %	0 %	40 %	60 %	222147068
36	NC_011989	GCCGG	2	10	59457	59466	0 %	0 %	60 %	40 %	222147068
37	NC_011989	AGCAC	2	10	59962	59971	40 %	0 %	20 %	40 %	222147068
38	NC_011989	TCTGC	2	10	60288	60297	0 %	40 %	20 %	40 %	222147069
39	NC_011989	ACGAT	2	10	69050	69059	40 %	20 %	20 %	20 %	222147070
40	NC_011989	GGCAT	2	10	69560	69569	20 %	20 %	40 %	20 %	222147070
41	NC_011989	ATCGC	2	10	72082	72091	20 %	20 %	20 %	40 %	222147072
42	NC_011989	ATCCC	2	10	76058	76067	20 %	20 %	0 %	60 %	222147076
43	NC_011989	CGTGA	2	10	79040	79049	20 %	20 %	40 %	20 %	222147077
44	NC_011989	TCGGC	2	10	82609	82618	0 %	20 %	40 %	40 %	222147083
45	NC_011989	GTCAT	2	10	83877	83886	20 %	40 %	20 %	20 %	222147085
46	NC_011989	TCGGT	2	10	84292	84301	0 %	40 %	40 %	20 %	222147085
47	NC_011989	GCGAT	2	10	89201	89210	20 %	20 %	40 %	20 %	222147090
48	NC_011989	ATGAC	2	10	89888	89897	40 %	20 %	20 %	20 %	222147091
49	NC_011989	GCCGC	2	10	92038	92047	0 %	0 %	40 %	60 %	222147093
50	NC_011989	TCGCC	2	10	92937	92946	0 %	20 %	20 %	60 %	222147094
51	NC_011989	CCGAT	2	10	97356	97365	20 %	20 %	20 %	40 %	222147099
52	NC_011989	GCAAG	2	10	103737	103746	40 %	0 %	40 %	20 %	222147104
53	NC_011989	CTGCA	2	10	106563	106572	20 %	20 %	20 %	40 %	222147106
54	NC_011989	ATCAC	2	10	107507	107516	40 %	20 %	0 %	40 %	222147108
55	NC_011989	AGACC	2	10	108098	108107	40 %	0 %	20 %	40 %	222147109
56	NC_011989	GTACC	2	10	108471	108480	20 %	20 %	20 %	40 %	222147110
57	NC_011989	CGGCG	2	10	108997	109006	0 %	0 %	60 %	40 %	222147111
58	NC_011989	GGCGA	2	10	110172	110181	20 %	0 %	60 %	20 %	222147112
59	NC_011989	GCGCG	2	10	110252	110261	0 %	0 %	60 %	40 %	222147112
60	NC_011989	ACCGG	2	10	110996	111005	20 %	0 %	40 %	40 %	222147113
61	NC_011989	CCCAG	2	10	112494	112503	20 %	0 %	20 %	60 %	222147114
62	NC_011989	CGGGT	2	10	112865	112874	0 %	20 %	60 %	20 %	222147114
63	NC_011989	CTTGC	2	10	116811	116820	0 %	40 %	20 %	40 %	222147117
64	NC_011989	CGTTT	2	10	119811	119820	0 %	60 %	20 %	20 %	222147120
65	NC_011989	CAAAG	2	10	122550	122559	60 %	0 %	20 %	20 %	222147121
66	NC_011989	GGACG	2	10	123648	123657	20 %	0 %	60 %	20 %	222147123
67	NC_011989	CTGGC	2	10	123806	123815	0 %	20 %	40 %	40 %	222147124
68	NC_011989	CACCG	2	10	124547	124556	20 %	0 %	20 %	60 %	222147125
69	NC_011989	CAATT	2	10	124826	124835	40 %	40 %	0 %	20 %	222147125
70	NC_011989	TGGCC	2	10	125120	125129	0 %	20 %	40 %	40 %	222147125
71	NC_011989	GCCGG	2	10	127854	127863	0 %	0 %	60 %	40 %	222147129
72	NC_011989	GCTGG	2	10	129049	129058	0 %	20 %	60 %	20 %	222147129
73	NC_011989	GCCGG	2	10	129899	129908	0 %	0 %	60 %	40 %	222147130
74	NC_011989	TGCCA	2	10	130635	130644	20 %	20 %	20 %	40 %	222147130
75	NC_011989	GGGAA	2	10	131347	131356	40 %	0 %	60 %	0 %	222147130
76	NC_011989	CGGGC	2	10	131962	131971	0 %	0 %	60 %	40 %	222147131
77	NC_011989	CCATC	2	10	136562	136571	20 %	20 %	0 %	60 %	222147136
78	NC_011989	GCGAG	2	10	137212	137221	20 %	0 %	60 %	20 %	222147137
79	NC_011989	CAGGT	2	10	137508	137517	20 %	20 %	40 %	20 %	222147137
80	NC_011989	CGGCA	2	10	137612	137621	20 %	0 %	40 %	40 %	222147137
81	NC_011989	CCGCG	2	10	137893	137902	0 %	0 %	40 %	60 %	222147138
82	NC_011989	CCTGT	2	10	138416	138425	0 %	40 %	20 %	40 %	222147138
83	NC_011989	ATCGT	2	10	141004	141013	20 %	40 %	20 %	20 %	222147141
84	NC_011989	TCTTG	2	10	145516	145525	0 %	60 %	20 %	20 %	222147142
85	NC_011989	ATCGT	2	10	145806	145815	20 %	40 %	20 %	20 %	222147142
86	NC_011989	ACCCG	2	10	146456	146465	20 %	0 %	20 %	60 %	222147142
87	NC_011989	CCGCC	2	10	151667	151676	0 %	0 %	20 %	80 %	222147144
88	NC_011989	ATCGC	2	10	152122	152131	20 %	20 %	20 %	40 %	222147144
89	NC_011989	CAGGG	2	10	153239	153248	20 %	0 %	60 %	20 %	222147145
90	NC_011989	TGCGC	2	10	155031	155040	0 %	20 %	40 %	40 %	222147146
91	NC_011989	GCTGC	2	10	156561	156570	0 %	20 %	40 %	40 %	222147147
92	NC_011989	CCGAG	2	10	166808	166817	20 %	0 %	40 %	40 %	222147155
93	NC_011989	CAGGG	2	10	171248	171257	20 %	0 %	60 %	20 %	222147161
94	NC_011989	TGCCG	2	10	171272	171281	0 %	20 %	40 %	40 %	222147161
95	NC_011989	CATGG	2	10	175246	175255	20 %	20 %	40 %	20 %	222147164
96	NC_011989	GTTCG	2	10	176191	176200	0 %	40 %	40 %	20 %	222147164
97	NC_011989	GGCCT	2	10	177175	177184	0 %	20 %	40 %	40 %	222147165
98	NC_011989	CAACA	2	10	178361	178370	60 %	0 %	0 %	40 %	222147167
99	NC_011989	GCAAT	2	10	178714	178723	40 %	20 %	20 %	20 %	222147167
100	NC_011989	AGGAT	2	10	181471	181480	40 %	20 %	40 %	0 %	222147169
101	NC_011989	CGCTC	2	10	191100	191109	0 %	20 %	20 %	60 %	222147177
102	NC_011989	AGCGC	2	10	197486	197495	20 %	0 %	40 %	40 %	222147183
103	NC_011989	CGAGC	2	10	199436	199445	20 %	0 %	40 %	40 %	222147186
104	NC_011989	ACGCA	2	10	200265	200274	40 %	0 %	20 %	40 %	222147187
105	NC_011989	GTCCT	2	10	200277	200286	0 %	40 %	20 %	40 %	222147187
106	NC_011989	CGGGC	2	10	202102	202111	0 %	0 %	60 %	40 %	222147190
107	NC_011989	ATTGC	2	10	203201	203210	20 %	40 %	20 %	20 %	222147191
108	NC_011989	CGATG	2	10	204062	204071	20 %	20 %	40 %	20 %	222147191
109	NC_011989	CTTCG	2	10	204720	204729	0 %	40 %	20 %	40 %	222147192
110	NC_011989	CCGCG	2	10	207183	207192	0 %	0 %	40 %	60 %	222147196
111	NC_011989	AGCAC	2	10	207830	207839	40 %	0 %	20 %	40 %	222147196
112	NC_011989	TAGCG	2	10	209214	209223	20 %	20 %	40 %	20 %	222147197
113	NC_011989	CCAGA	2	10	209570	209579	40 %	0 %	20 %	40 %	222147197
114	NC_011989	CCGGC	2	10	212382	212391	0 %	0 %	40 %	60 %	222147200
115	NC_011989	ATCGC	2	10	213466	213475	20 %	20 %	20 %	40 %	222147201
116	NC_011989	GCATG	2	10	217633	217642	20 %	20 %	40 %	20 %	222147204
117	NC_011989	CTGGC	2	10	220498	220507	0 %	20 %	40 %	40 %	222147207
118	NC_011989	CGGCG	2	10	226694	226703	0 %	0 %	60 %	40 %	222147212
119	NC_011989	CTGGG	2	10	227558	227567	0 %	20 %	60 %	20 %	222147213
120	NC_011989	GCCCT	2	10	228246	228255	0 %	20 %	20 %	60 %	222147213
121	NC_011989	GCCGA	2	10	228502	228511	20 %	0 %	40 %	40 %	222147214
122	NC_011989	TCGCC	2	10	229922	229931	0 %	20 %	20 %	60 %	222147216
123	NC_011989	TGGGC	2	10	231256	231265	0 %	20 %	60 %	20 %	222147217
124	NC_011989	CGCGC	2	10	231536	231545	0 %	0 %	40 %	60 %	222147217
125	NC_011989	CTGGT	2	10	232603	232612	0 %	40 %	40 %	20 %	222147219
126	NC_011989	GGCCC	2	10	233005	233014	0 %	0 %	40 %	60 %	222147220
127	NC_011989	GTGCC	2	10	233142	233151	0 %	20 %	40 %	40 %	222147220
128	NC_011989	GCTTG	2	10	233383	233392	0 %	40 %	40 %	20 %	222147220
129	NC_011989	TTGTC	2	10	234465	234474	0 %	60 %	20 %	20 %	222147221
130	NC_011989	TGCCG	2	10	235436	235445	0 %	20 %	40 %	40 %	222147222
131	NC_011989	TGCGC	2	10	238569	238578	0 %	20 %	40 %	40 %	222147226
132	NC_011989	TTGGC	2	10	242639	242648	0 %	40 %	40 %	20 %	222147230
133	NC_011989	GCGAT	2	10	243121	243130	20 %	20 %	40 %	20 %	222147230
134	NC_011989	CGAGC	2	10	243206	243215	20 %	0 %	40 %	40 %	222147230
135	NC_011989	TCGTT	2	10	243868	243877	0 %	60 %	20 %	20 %	222147231
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138	NC_011989	GGCCC	2	10	246576	246585	0 %	0 %	40 %	60 %	222147234
139	NC_011989	AGTGG	2	10	250884	250893	20 %	20 %	60 %	0 %	222147237
140	NC_011989	CGCGC	2	10	251195	251204	0 %	0 %	40 %	60 %	222147237
141	NC_011989	TGCCG	2	10	251850	251859	0 %	20 %	40 %	40 %	222147239
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144	NC_011989	TGCCG	2	10	254234	254243	0 %	20 %	40 %	40 %	222147240
145	NC_011989	GCAGG	2	10	255372	255381	20 %	0 %	60 %	20 %	222147240
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147	NC_011989	TGAAG	2	10	263045	263054	40 %	20 %	40 %	0 %	222147246
148	NC_011989	GACCG	2	10	268029	268038	20 %	0 %	40 %	40 %	222147251
149	NC_011989	ATGCC	2	10	270182	270191	20 %	20 %	20 %	40 %	222147254
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151	NC_011989	CGCGC	2	10	282664	282673	0 %	0 %	40 %	60 %	222147262
152	NC_011989	TCATG	2	10	285114	285123	20 %	40 %	20 %	20 %	222147266
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154	NC_011989	TCCGG	2	10	287841	287850	0 %	20 %	40 %	40 %	222147268
155	NC_011989	TGGTC	2	10	288438	288447	0 %	40 %	40 %	20 %	222147269
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159	NC_011989	TGCCA	2	10	293032	293041	20 %	20 %	20 %	40 %	222147273
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166	NC_011989	AGCGC	2	10	303505	303514	20 %	0 %	40 %	40 %	222147283
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177	NC_011989	CGGCG	2	10	318757	318766	0 %	0 %	60 %	40 %	222147298
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197	NC_011989	GGCAA	2	10	350025	350034	40 %	0 %	40 %	20 %	222147330
198	NC_011989	TGGCG	2	10	351421	351430	0 %	20 %	60 %	20 %	222147332
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242	NC_011989	GCCTT	2	10	420080	420089	0 %	40 %	20 %	40 %	222147395
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244	NC_011989	ATCGT	2	10	427345	427354	20 %	40 %	20 %	20 %	222147402
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246	NC_011989	GCCAC	2	10	429578	429587	20 %	0 %	20 %	60 %	222147404
247	NC_011989	TTGCC	2	10	429853	429862	0 %	40 %	20 %	40 %	222147404
248	NC_011989	CGGGG	2	10	432139	432148	0 %	0 %	80 %	20 %	222147406
249	NC_011989	ACCGC	2	10	433118	433127	20 %	0 %	20 %	60 %	222147407
250	NC_011989	TCGGC	2	10	433876	433885	0 %	20 %	40 %	40 %	222147408
251	NC_011989	CTGGA	2	10	435518	435527	20 %	20 %	40 %	20 %	222147409
252	NC_011989	GCAAT	2	10	436307	436316	40 %	20 %	20 %	20 %	222147410
253	NC_011989	TGTCG	2	10	437014	437023	0 %	40 %	40 %	20 %	222147411
254	NC_011989	GCCCG	2	10	437325	437334	0 %	0 %	40 %	60 %	222147411
255	NC_011989	GGCCG	2	10	440578	440587	0 %	0 %	60 %	40 %	222147413
256	NC_011989	TGGCA	2	10	441248	441257	20 %	20 %	40 %	20 %	222147414
257	NC_011989	GCAGG	2	10	446193	446202	20 %	0 %	60 %	20 %	222147418
258	NC_011989	CTGCC	2	10	446603	446612	0 %	20 %	20 %	60 %	222147418
259	NC_011989	GCCTT	2	10	447422	447431	0 %	40 %	20 %	40 %	222147419
260	NC_011989	CATGG	2	10	452364	452373	20 %	20 %	40 %	20 %	222147424
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262	NC_011989	CAGCC	2	10	460900	460909	20 %	0 %	20 %	60 %	222147431
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