MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011989	TTGGG	2	10	1642379	1642388	0 %	40 %	60 %	0 %	222148471
1002	NC_011989	TGGGC	2	10	1643373	1643382	0 %	20 %	60 %	20 %	222148472
1003	NC_011989	ATGAA	2	10	1645930	1645939	60 %	20 %	20 %	0 %	222148475
1004	NC_011989	TCGGC	2	10	1647640	1647649	0 %	20 %	40 %	40 %	222148478
1005	NC_011989	CAATG	2	10	1648869	1648878	40 %	20 %	20 %	20 %	222148479
1006	NC_011989	AGGTG	2	10	1658526	1658535	20 %	20 %	60 %	0 %	222148486
1007	NC_011989	GCGTG	2	10	1659240	1659249	0 %	20 %	60 %	20 %	222148487
1008	NC_011989	AGGCC	2	10	1663191	1663200	20 %	0 %	40 %	40 %	222148492
1009	NC_011989	ACCGT	2	10	1664396	1664405	20 %	20 %	20 %	40 %	222148494
1010	NC_011989	GCATT	2	10	1664631	1664640	20 %	40 %	20 %	20 %	222148494
1011	NC_011989	ATCGT	2	10	1666481	1666490	20 %	40 %	20 %	20 %	222148496
1012	NC_011989	CGGAT	2	10	1666497	1666506	20 %	20 %	40 %	20 %	222148496
1013	NC_011989	CGGCA	2	10	1666695	1666704	20 %	0 %	40 %	40 %	222148496
1014	NC_011989	GCTGT	2	10	1670840	1670849	0 %	40 %	40 %	20 %	222148500
1015	NC_011989	GCTCG	2	10	1671842	1671851	0 %	20 %	40 %	40 %	222148501
1016	NC_011989	CCCAG	2	10	1673147	1673156	20 %	0 %	20 %	60 %	222148503
1017	NC_011989	CGGGC	2	10	1674840	1674849	0 %	0 %	60 %	40 %	222148504
1018	NC_011989	CGCGC	2	10	1691640	1691649	0 %	0 %	40 %	60 %	222148522
1019	NC_011989	CAAGC	2	10	1695003	1695012	40 %	0 %	20 %	40 %	222148525
1020	NC_011989	CGCTA	2	10	1695708	1695717	20 %	20 %	20 %	40 %	222148525
1021	NC_011989	CGGGC	2	10	1699230	1699239	0 %	0 %	60 %	40 %	222148529
1022	NC_011989	GGGCC	2	10	1700520	1700529	0 %	0 %	60 %	40 %	222148530
1023	NC_011989	GACCG	2	10	1700934	1700943	20 %	0 %	40 %	40 %	222148531
1024	NC_011989	GGGCA	2	10	1702863	1702872	20 %	0 %	60 %	20 %	222148532
1025	NC_011989	TGCCG	2	10	1702968	1702977	0 %	20 %	40 %	40 %	222148532
1026	NC_011989	GCTTC	2	10	1709281	1709290	0 %	40 %	20 %	40 %	222148537
1027	NC_011989	GTGAC	2	10	1710949	1710958	20 %	20 %	40 %	20 %	222148538
1028	NC_011989	TGATC	2	10	1711049	1711058	20 %	40 %	20 %	20 %	222148538
1029	NC_011989	TCGAC	2	10	1712366	1712375	20 %	20 %	20 %	40 %	222148539
1030	NC_011989	CCGAT	2	10	1715494	1715503	20 %	20 %	20 %	40 %	222148541
1031	NC_011989	CGTTG	2	10	1718271	1718280	0 %	40 %	40 %	20 %	222148545
1032	NC_011989	GGACA	2	10	1719135	1719144	40 %	0 %	40 %	20 %	222148546
1033	NC_011989	GATCA	2	10	1722978	1722987	40 %	20 %	20 %	20 %	222148547
1034	NC_011989	CGTCG	2	10	1723018	1723027	0 %	20 %	40 %	40 %	222148547
1035	NC_011989	GTCAA	2	10	1723080	1723089	40 %	20 %	20 %	20 %	222148547
1036	NC_011989	GATAG	2	10	1724873	1724882	40 %	20 %	40 %	0 %	222148548
1037	NC_011989	TGCCG	2	10	1725495	1725504	0 %	20 %	40 %	40 %	222148548
1038	NC_011989	GCGCC	2	10	1727126	1727135	0 %	0 %	40 %	60 %	222148550
1039	NC_011989	GGCGG	2	10	1727177	1727186	0 %	0 %	80 %	20 %	222148550
1040	NC_011989	CAAGG	2	10	1727799	1727808	40 %	0 %	40 %	20 %	222148550
1041	NC_011989	CCGGC	2	10	1728153	1728162	0 %	0 %	40 %	60 %	222148550
1042	NC_011989	CCGGC	2	10	1728795	1728804	0 %	0 %	40 %	60 %	222148551
1043	NC_011989	GACAG	2	10	1729624	1729633	40 %	0 %	40 %	20 %	222148552
1044	NC_011989	CTGCC	2	10	1729993	1730002	0 %	20 %	20 %	60 %	222148553
1045	NC_011989	TCCTG	2	10	1730279	1730288	0 %	40 %	20 %	40 %	222148553
1046	NC_011989	CAATC	2	10	1731391	1731400	40 %	20 %	0 %	40 %	222148554
1047	NC_011989	AATCG	2	10	1735105	1735114	40 %	20 %	20 %	20 %	222148557
1048	NC_011989	TTACC	2	10	1740623	1740632	20 %	40 %	0 %	40 %	222148563
1049	NC_011989	GCCCC	2	10	1743149	1743158	0 %	0 %	20 %	80 %	222148566
1050	NC_011989	CCTTG	2	10	1743531	1743540	0 %	40 %	20 %	40 %	222148566
1051	NC_011989	CGCGC	2	10	1747527	1747536	0 %	0 %	40 %	60 %	222148571
1052	NC_011989	GGCCG	2	10	1747598	1747607	0 %	0 %	60 %	40 %	222148571
1053	NC_011989	GCCCG	2	10	1749387	1749396	0 %	0 %	40 %	60 %	222148573
1054	NC_011989	GCCGA	2	10	1749531	1749540	20 %	0 %	40 %	40 %	222148573
1055	NC_011989	TTGCC	2	10	1750911	1750920	0 %	40 %	20 %	40 %	222148574
1056	NC_011989	GGCGC	2	10	1751098	1751107	0 %	0 %	60 %	40 %	222148574
1057	NC_011989	CTGGT	2	10	1755309	1755318	0 %	40 %	40 %	20 %	222148577
1058	NC_011989	CTCGC	2	10	1756698	1756707	0 %	20 %	20 %	60 %	222148578
1059	NC_011989	GTCCA	2	10	1757000	1757009	20 %	20 %	20 %	40 %	222148578
1060	NC_011989	TGACC	2	10	1760528	1760537	20 %	20 %	20 %	40 %	222148581
1061	NC_011989	TGACG	2	10	1763177	1763186	20 %	20 %	40 %	20 %	222148584
1062	NC_011989	GGCTG	2	10	1764494	1764503	0 %	20 %	60 %	20 %	222148585
1063	NC_011989	CGTCC	2	10	1765045	1765054	0 %	20 %	20 %	60 %	222148586
1064	NC_011989	GCGCC	2	10	1766476	1766485	0 %	0 %	40 %	60 %	222148587
1065	NC_011989	CCGGG	2	10	1768837	1768846	0 %	0 %	60 %	40 %	222148589
1066	NC_011989	GGCAA	2	10	1769202	1769211	40 %	0 %	40 %	20 %	222148590
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1071	NC_011989	GCCGC	2	10	1777853	1777862	0 %	0 %	40 %	60 %	222148597
1072	NC_011989	GATCT	2	10	1782547	1782556	20 %	40 %	20 %	20 %	222148601
1073	NC_011989	GGGCT	2	10	1782611	1782620	0 %	20 %	60 %	20 %	222148601
1074	NC_011989	ACGGC	2	10	1784077	1784086	20 %	0 %	40 %	40 %	222148602
1075	NC_011989	GGCCG	2	10	1786987	1786996	0 %	0 %	60 %	40 %	222148604
1076	NC_011989	GGGCA	2	10	1789661	1789670	20 %	0 %	60 %	20 %	222148606
1077	NC_011989	CGAAC	2	10	1792045	1792054	40 %	0 %	20 %	40 %	222148608
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1079	NC_011989	CGACC	2	10	1796188	1796197	20 %	0 %	20 %	60 %	222148612
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1081	NC_011989	TATTT	2	10	1796573	1796582	20 %	80 %	0 %	0 %	222148612
1082	NC_011989	GCCCG	2	10	1797718	1797727	0 %	0 %	40 %	60 %	222148613
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1089	NC_011989	TCGGG	2	10	1814810	1814819	0 %	20 %	60 %	20 %	222148632
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1091	NC_011989	GCCAC	2	10	1817088	1817097	20 %	0 %	20 %	60 %	222148633
1092	NC_011989	TCGTC	2	10	1821304	1821313	0 %	40 %	20 %	40 %	222148637
1093	NC_011989	CATGG	2	10	1824282	1824291	20 %	20 %	40 %	20 %	222148641
1094	NC_011989	CCAAG	2	10	1825103	1825112	40 %	0 %	20 %	40 %	222148642
1095	NC_011989	CAGTG	2	10	1825422	1825431	20 %	20 %	40 %	20 %	222148642
1096	NC_011989	CACGC	2	10	1829361	1829370	20 %	0 %	20 %	60 %	222148646
1097	NC_011989	GGACC	2	10	1830624	1830633	20 %	0 %	40 %	40 %	222148647
1098	NC_011989	CGGGG	2	10	1830674	1830683	0 %	0 %	80 %	20 %	222148647
1099	NC_011989	GCACC	2	10	1831087	1831096	20 %	0 %	20 %	60 %	222148647
1100	NC_011989	GCTCA	2	10	1831746	1831755	20 %	20 %	20 %	40 %	222148648
1101	NC_011989	CGTCG	2	10	1832247	1832256	0 %	20 %	40 %	40 %	222148648
1102	NC_011989	GATCA	2	10	1832859	1832868	40 %	20 %	20 %	20 %	222148649
1103	NC_011989	CGCGG	2	10	1833784	1833793	0 %	0 %	60 %	40 %	222148650
1104	NC_011989	CGGCG	2	10	1834479	1834488	0 %	0 %	60 %	40 %	222148651
1105	NC_011989	GGTCT	2	10	1835622	1835631	0 %	40 %	40 %	20 %	222148651
1106	NC_011989	GCGCA	2	10	1836560	1836569	20 %	0 %	40 %	40 %	222148652
1107	NC_011989	TGCCT	2	10	1837152	1837161	0 %	40 %	20 %	40 %	222148653
1108	NC_011989	ATTCC	2	10	1837385	1837394	20 %	40 %	0 %	40 %	222148653
1109	NC_011989	GGTCA	2	10	1838891	1838900	20 %	20 %	40 %	20 %	222148654
1110	NC_011989	GCGCC	2	10	1839445	1839454	0 %	0 %	40 %	60 %	222148654
1111	NC_011989	GGCTT	2	10	1839924	1839933	0 %	40 %	40 %	20 %	222148654
1112	NC_011989	CGAAC	2	10	1840320	1840329	40 %	0 %	20 %	40 %	222148654
1113	NC_011989	TCGCT	2	10	1841590	1841599	0 %	40 %	20 %	40 %	222148654
1114	NC_011989	ATCGA	2	10	1841619	1841628	40 %	20 %	20 %	20 %	222148654
1115	NC_011989	AAGGG	2	10	1844486	1844495	40 %	0 %	60 %	0 %	222148654
1116	NC_011989	CTTTT	2	10	1846907	1846916	0 %	80 %	0 %	20 %	222148657
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1119	NC_011989	CCATT	2	10	1864523	1864532	20 %	40 %	0 %	40 %	222148675
1120	NC_011989	CTGGT	2	10	1865769	1865778	0 %	40 %	40 %	20 %	222148677
1121	NC_011989	GCTGC	2	10	1868995	1869004	0 %	20 %	40 %	40 %	222148679
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1353	NC_011989	GCGAA	2	10	2232246	2232255	40 %	0 %	40 %	20 %	222148987
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1362	NC_011989	GCGCG	2	10	2245950	2245959	0 %	0 %	60 %	40 %	222149000
1363	NC_011989	GGGTG	2	10	2246121	2246130	0 %	20 %	80 %	0 %	222149000
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1366	NC_011989	AAGAT	2	10	2247161	2247170	60 %	20 %	20 %	0 %	222149002
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1368	NC_011989	GCGCC	2	10	2252417	2252426	0 %	0 %	40 %	60 %	222149005
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1492	NC_011989	GACGC	2	10	2449281	2449290	20 %	0 %	40 %	40 %	222149164
1493	NC_011989	TCCAC	2	10	2452145	2452154	20 %	20 %	0 %	60 %	222149167
1494	NC_011989	GCCGA	2	10	2457006	2457015	20 %	0 %	40 %	40 %	222149173
1495	NC_011989	ATGGA	2	10	2463304	2463313	40 %	20 %	40 %	0 %	222149177
1496	NC_011989	ATCCG	2	10	2465158	2465167	20 %	20 %	20 %	40 %	222149178
1497	NC_011989	ATGGC	2	10	2466864	2466873	20 %	20 %	40 %	20 %	222149180
1498	NC_011989	GGTCG	2	10	2472107	2472116	0 %	20 %	60 %	20 %	222149184
1499	NC_011989	GACAT	2	10	2472609	2472618	40 %	20 %	20 %	20 %	222149185
1500	NC_011989	ATCCT	2	10	2472999	2473008	20 %	40 %	0 %	40 %	222149185

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