MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 3052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011988	GACT	2	8	67	74	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011988	TCAG	2	8	195	202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011988	GCGG	2	8	1250	1257	0 %	0 %	75 %	25 %	222106128
4	NC_011988	GCGT	2	8	1782	1789	0 %	25 %	50 %	25 %	222106129
5	NC_011988	CGAG	2	8	2330	2337	25 %	0 %	50 %	25 %	222106129
6	NC_011988	GAAG	2	8	2796	2803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011988	GTTG	2	8	3269	3276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011988	TTGA	2	8	3515	3522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011988	TGCT	2	8	3780	3787	0 %	50 %	25 %	25 %	222106130
10	NC_011988	GCCT	2	8	3918	3925	0 %	25 %	25 %	50 %	222106130
11	NC_011988	CTTT	2	8	4843	4850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011988	GCTC	2	8	4884	4891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011988	TGAT	2	8	5188	5195	25 %	50 %	25 %	0 %	222106131
14	NC_011988	TGAG	2	8	5962	5969	25 %	25 %	50 %	0 %	222106131
15	NC_011988	CGAT	2	8	6885	6892	25 %	25 %	25 %	25 %	222106132
16	NC_011988	CCAA	2	8	7026	7033	50 %	0 %	0 %	50 %	222106132
17	NC_011988	GCCA	2	8	7273	7280	25 %	0 %	25 %	50 %	222106132
18	NC_011988	CAGA	2	8	7806	7813	50 %	0 %	25 %	25 %	222106133
19	NC_011988	CCAG	2	8	7823	7830	25 %	0 %	25 %	50 %	222106133
20	NC_011988	CGGG	2	8	8141	8148	0 %	0 %	75 %	25 %	222106133
21	NC_011988	GAGC	2	8	8150	8157	25 %	0 %	50 %	25 %	222106133
22	NC_011988	GTCG	2	8	8331	8338	0 %	25 %	50 %	25 %	222106133
23	NC_011988	TGGG	2	8	8557	8564	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011988	TGCG	2	8	10036	10043	0 %	25 %	50 %	25 %	222106135
25	NC_011988	CTGG	2	8	10349	10356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011988	TCGG	2	8	10705	10712	0 %	25 %	50 %	25 %	222106136
27	NC_011988	TGCC	2	8	10752	10759	0 %	25 %	25 %	50 %	222106136
28	NC_011988	CCTG	2	8	10804	10811	0 %	25 %	25 %	50 %	222106136
29	NC_011988	GCTG	2	8	10948	10955	0 %	25 %	50 %	25 %	222106136
30	NC_011988	CAGA	2	8	11612	11619	50 %	0 %	25 %	25 %	222106137
31	NC_011988	GTGC	2	8	11964	11971	0 %	25 %	50 %	25 %	222106138
32	NC_011988	GGTC	2	8	12302	12309	0 %	25 %	50 %	25 %	222106138
33	NC_011988	CGGG	2	8	12346	12353	0 %	0 %	75 %	25 %	222106138
34	NC_011988	TGGT	2	8	12445	12452	0 %	50 %	50 %	0 %	222106138
35	NC_011988	GATG	2	8	12859	12866	25 %	25 %	50 %	0 %	222106139
36	NC_011988	GTGG	2	8	13340	13347	0 %	25 %	75 %	0 %	222106139
37	NC_011988	GTAA	2	8	13467	13474	50 %	25 %	25 %	0 %	222106139
38	NC_011988	TCGT	2	8	15041	15048	0 %	50 %	25 %	25 %	222106142
39	NC_011988	CTGA	2	8	15709	15716	25 %	25 %	25 %	25 %	222106142
40	NC_011988	CCGT	2	8	18781	18788	0 %	25 %	25 %	50 %	222106145
41	NC_011988	CTTA	2	8	19200	19207	25 %	50 %	0 %	25 %	222106146
42	NC_011988	GGGC	2	8	19533	19540	0 %	0 %	75 %	25 %	222106146
43	NC_011988	TTTC	2	8	20235	20242	0 %	75 %	0 %	25 %	222106146
44	NC_011988	CGTC	2	8	21041	21048	0 %	25 %	25 %	50 %	222106147
45	NC_011988	GATC	2	8	21778	21785	25 %	25 %	25 %	25 %	222106148
46	NC_011988	ATTG	2	8	23191	23198	25 %	50 %	25 %	0 %	222106150
47	NC_011988	GTTT	2	8	23248	23255	0 %	75 %	25 %	0 %	222106150
48	NC_011988	GGCC	2	8	23799	23806	0 %	0 %	50 %	50 %	222106151
49	NC_011988	GCAG	2	8	24078	24085	25 %	0 %	50 %	25 %	222106151
50	NC_011988	TTTG	2	8	24462	24469	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011988	GCCG	2	8	24708	24715	0 %	0 %	50 %	50 %	222106152
52	NC_011988	GAAG	2	8	25584	25591	50 %	0 %	50 %	0 %	222106152
53	NC_011988	TTTC	2	8	26120	26127	0 %	75 %	0 %	25 %	222106153
54	NC_011988	TGGC	2	8	26299	26306	0 %	25 %	50 %	25 %	222106153
55	NC_011988	ATTG	2	8	26387	26394	25 %	50 %	25 %	0 %	222106153
56	NC_011988	CTTT	2	8	27660	27667	0 %	75 %	0 %	25 %	222106154
57	NC_011988	CGAC	2	8	28280	28287	25 %	0 %	25 %	50 %	222106155
58	NC_011988	GCAG	2	8	28669	28676	25 %	0 %	50 %	25 %	222106156
59	NC_011988	CATC	2	8	28831	28838	25 %	25 %	0 %	50 %	222106156
60	NC_011988	TGGC	2	8	28839	28846	0 %	25 %	50 %	25 %	222106156
61	NC_011988	CAAC	2	8	29109	29116	50 %	0 %	0 %	50 %	222106157
62	NC_011988	TGGC	2	8	29444	29451	0 %	25 %	50 %	25 %	222106157
63	NC_011988	GGTG	2	8	29526	29533	0 %	25 %	75 %	0 %	222106157
64	NC_011988	GGGT	2	8	30284	30291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011988	CGGT	2	8	30625	30632	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
66	NC_011988	GTCG	2	8	30951	30958	0 %	25 %	50 %	25 %	222106159
67	NC_011988	CCAG	2	8	32344	32351	25 %	0 %	25 %	50 %	222106160
68	NC_011988	GTCC	2	8	32396	32403	0 %	25 %	25 %	50 %	222106160
69	NC_011988	TTGC	2	8	32504	32511	0 %	50 %	25 %	25 %	222106160
70	NC_011988	CGCC	2	8	32890	32897	0 %	0 %	25 %	75 %	222106161
71	NC_011988	AGGC	2	8	33299	33306	25 %	0 %	50 %	25 %	222106161
72	NC_011988	GATA	2	8	33833	33840	50 %	25 %	25 %	0 %	222106162
73	NC_011988	GCCA	2	8	33907	33914	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
74	NC_011988	GTTG	2	8	33935	33942	0 %	50 %	50 %	0 %	222106162
75	NC_011988	CGAC	2	8	34115	34122	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
76	NC_011988	CAAT	2	8	34142	34149	50 %	25 %	0 %	25 %	222106162
77	NC_011988	CGAC	2	8	34249	34256	25 %	0 %	25 %	50 %	222106162
78	NC_011988	CCAA	2	8	34474	34481	50 %	0 %	0 %	50 %	222106162
79	NC_011988	GTTT	2	8	34783	34790	0 %	75 %	25 %	0 %	222106162
80	NC_011988	CGAG	2	8	35060	35067	25 %	0 %	50 %	25 %	222106162
81	NC_011988	TTTA	2	8	35262	35269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011988	GCAT	2	8	35911	35918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011988	TCTG	2	8	36273	36280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011988	GTGC	2	8	36414	36421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011988	CCTT	2	8	37677	37684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011988	TGGA	2	8	37879	37886	25 %	25 %	50 %	0 %	222106164
87	NC_011988	CCCA	2	8	37944	37951	25 %	0 %	0 %	75 %	222106164
88	NC_011988	GCCT	2	8	38355	38362	0 %	25 %	25 %	50 %	222106164
89	NC_011988	ATCG	2	8	38477	38484	25 %	25 %	25 %	25 %	222106164
90	NC_011988	TGAT	2	8	38671	38678	25 %	50 %	25 %	0 %	222106164
91	NC_011988	GGTT	2	8	39035	39042	0 %	50 %	50 %	0 %	222106165
92	NC_011988	AGTC	2	8	39385	39392	25 %	25 %	25 %	25 %	222106165
93	NC_011988	TCTG	2	8	41203	41210	0 %	50 %	25 %	25 %	222106166
94	NC_011988	CAAC	2	8	41215	41222	50 %	0 %	0 %	50 %	222106166
95	NC_011988	TGGC	2	8	41243	41250	0 %	25 %	50 %	25 %	222106166
96	NC_011988	GGAC	2	8	43521	43528	25 %	0 %	50 %	25 %	222106168
97	NC_011988	GATG	2	8	43696	43703	25 %	25 %	50 %	0 %	222106169
98	NC_011988	CACG	2	8	44261	44268	25 %	0 %	25 %	50 %	222106169
99	NC_011988	GCAT	2	8	44306	44313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011988	ATGC	2	8	44322	44329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011988	ACCG	2	8	44437	44444	25 %	0 %	25 %	50 %	222106170
102	NC_011988	GGGC	2	8	45058	45065	0 %	0 %	75 %	25 %	222106170
103	NC_011988	CTGG	2	8	45449	45456	0 %	25 %	50 %	25 %	222106170
104	NC_011988	CGCC	2	8	45602	45609	0 %	0 %	25 %	75 %	222106170
105	NC_011988	GATC	2	8	45727	45734	25 %	25 %	25 %	25 %	222106170
106	NC_011988	CACC	2	8	45918	45925	25 %	0 %	0 %	75 %	222106171
107	NC_011988	CATC	2	8	46247	46254	25 %	25 %	0 %	50 %	222106171
108	NC_011988	CGCC	2	8	46270	46277	0 %	0 %	25 %	75 %	222106171
109	NC_011988	CCGG	2	8	46332	46339	0 %	0 %	50 %	50 %	222106171
110	NC_011988	GCCT	2	8	46389	46396	0 %	25 %	25 %	50 %	222106171
111	NC_011988	GGCG	2	8	46604	46611	0 %	0 %	75 %	25 %	222106171
112	NC_011988	GGCG	2	8	46794	46801	0 %	0 %	75 %	25 %	222106171
113	NC_011988	AGCA	2	8	46866	46873	50 %	0 %	25 %	25 %	222106171
114	NC_011988	CCAG	2	8	47163	47170	25 %	0 %	25 %	50 %	222106171
115	NC_011988	ATCC	2	8	47355	47362	25 %	25 %	0 %	50 %	222106171
116	NC_011988	AGAA	2	8	47554	47561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011988	CGAC	2	8	48247	48254	25 %	0 %	25 %	50 %	222106172
118	NC_011988	GCTT	2	8	48546	48553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011988	TGAA	2	8	49281	49288	50 %	25 %	25 %	0 %	222106173
120	NC_011988	GCGA	2	8	50003	50010	25 %	0 %	50 %	25 %	222106174
121	NC_011988	CTTG	2	8	51133	51140	0 %	50 %	25 %	25 %	222106174
122	NC_011988	CGGT	2	8	51822	51829	0 %	25 %	50 %	25 %	222106175
123	NC_011988	TCTT	2	8	53295	53302	0 %	75 %	0 %	25 %	222106177
124	NC_011988	ATGG	2	8	54302	54309	25 %	25 %	50 %	0 %	222106178
125	NC_011988	ATCG	2	8	54595	54602	25 %	25 %	25 %	25 %	222106178
126	NC_011988	CTGA	2	8	54623	54630	25 %	25 %	25 %	25 %	222106178
127	NC_011988	TTGG	2	8	55062	55069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011988	TGGG	2	8	55820	55827	0 %	25 %	75 %	0 %	222106179
129	NC_011988	CCTT	2	8	56308	56315	0 %	50 %	0 %	50 %	222106179
130	NC_011988	CGAT	2	8	56514	56521	25 %	25 %	25 %	25 %	222106179
131	NC_011988	TTCA	2	8	57027	57034	25 %	50 %	0 %	25 %	222106180
132	NC_011988	GCAA	2	8	57255	57262	50 %	0 %	25 %	25 %	222106180
133	NC_011988	ATGG	2	8	58714	58721	25 %	25 %	50 %	0 %	222106182
134	NC_011988	GCTC	2	8	58910	58917	0 %	25 %	25 %	50 %	222106182
135	NC_011988	CAGT	2	8	58941	58948	25 %	25 %	25 %	25 %	222106182
136	NC_011988	GTGG	2	8	60062	60069	0 %	25 %	75 %	0 %	222106183
137	NC_011988	GCCG	2	8	61450	61457	0 %	0 %	50 %	50 %	222106184
138	NC_011988	TGTC	2	8	62781	62788	0 %	50 %	25 %	25 %	222106185
139	NC_011988	GGGC	2	8	62913	62920	0 %	0 %	75 %	25 %	222106185
140	NC_011988	CGAC	2	8	62992	62999	25 %	0 %	25 %	50 %	222106185
141	NC_011988	TGAT	2	8	63438	63445	25 %	50 %	25 %	0 %	222106185
142	NC_011988	GCAA	2	8	64280	64287	50 %	0 %	25 %	25 %	222106186
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144	NC_011988	GTTC	2	8	64983	64990	0 %	50 %	25 %	25 %	222106186
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158	NC_011988	TCAA	2	8	72941	72948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_011988	GGTG	2	8	79889	79896	0 %	25 %	75 %	0 %	222106198
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210	NC_011988	TCAA	2	8	94911	94918	50 %	25 %	0 %	25 %	222106212
211	NC_011988	TTGG	2	8	95187	95194	0 %	50 %	50 %	0 %	222106212
212	NC_011988	GCAG	2	8	95220	95227	25 %	0 %	50 %	25 %	222106212
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248	NC_011988	GCTG	2	8	111699	111706	0 %	25 %	50 %	25 %	222106224
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250	NC_011988	CCGA	2	8	112856	112863	25 %	0 %	25 %	50 %	222106225
251	NC_011988	AGTT	2	8	114263	114270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
252	NC_011988	ACTG	2	8	114720	114727	25 %	25 %	25 %	25 %	222106228
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260	NC_011988	GTCT	2	8	117074	117081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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263	NC_011988	GGCA	2	8	117835	117842	25 %	0 %	50 %	25 %	222106231
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496	NC_011988	AAGC	2	8	229748	229755	50 %	0 %	25 %	25 %	222106315
497	NC_011988	TGAC	2	8	230159	230166	25 %	25 %	25 %	25 %	222106315
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