MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 3052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	CGGG	2	8	232021	232028	0 %	0 %	75 %	25 %	222106317
502	NC_011988	GGCG	2	8	232136	232143	0 %	0 %	75 %	25 %	222106317
503	NC_011988	TGGC	2	8	232786	232793	0 %	25 %	50 %	25 %	222106317
504	NC_011988	CGAT	2	8	233941	233948	25 %	25 %	25 %	25 %	222106318
505	NC_011988	CGGG	2	8	234201	234208	0 %	0 %	75 %	25 %	222106319
506	NC_011988	GCCA	2	8	234221	234228	25 %	0 %	25 %	50 %	222106319
507	NC_011988	TGGC	2	8	234396	234403	0 %	25 %	50 %	25 %	222106319
508	NC_011988	CCTT	2	8	234767	234774	0 %	50 %	0 %	50 %	222106319
509	NC_011988	ACGC	2	8	234984	234991	25 %	0 %	25 %	50 %	222106319
510	NC_011988	ATCA	2	8	235277	235284	50 %	25 %	0 %	25 %	222106320
511	NC_011988	GATC	2	8	235511	235518	25 %	25 %	25 %	25 %	222106320
512	NC_011988	ATCT	2	8	235539	235546	25 %	50 %	0 %	25 %	222106320
513	NC_011988	TCGC	2	8	235704	235711	0 %	25 %	25 %	50 %	222106320
514	NC_011988	GGGT	2	8	236253	236260	0 %	25 %	75 %	0 %	222106321
515	NC_011988	ATTG	2	8	236314	236321	25 %	50 %	25 %	0 %	222106321
516	NC_011988	GAAA	2	8	236648	236655	75 %	0 %	25 %	0 %	222106321
517	NC_011988	AGAA	2	8	236783	236790	75 %	0 %	25 %	0 %	222106321
518	NC_011988	GCCA	2	8	237310	237317	25 %	0 %	25 %	50 %	222106322
519	NC_011988	GCGT	2	8	237347	237354	0 %	25 %	50 %	25 %	222106322
520	NC_011988	TCAA	2	8	237515	237522	50 %	25 %	0 %	25 %	222106322
521	NC_011988	ACGG	2	8	237602	237609	25 %	0 %	50 %	25 %	222106322
522	NC_011988	TTCA	2	8	238963	238970	25 %	50 %	0 %	25 %	222106323
523	NC_011988	CGAT	2	8	239010	239017	25 %	25 %	25 %	25 %	222106323
524	NC_011988	GCCA	2	8	239125	239132	25 %	0 %	25 %	50 %	222106323
525	NC_011988	CACC	2	8	239388	239395	25 %	0 %	0 %	75 %	222106323
526	NC_011988	GCCA	2	8	239476	239483	25 %	0 %	25 %	50 %	222106323
527	NC_011988	ATCC	2	8	239860	239867	25 %	25 %	0 %	50 %	222106324
528	NC_011988	CGAC	2	8	239887	239894	25 %	0 %	25 %	50 %	222106324
529	NC_011988	GGCT	2	8	239896	239903	0 %	25 %	50 %	25 %	222106324
530	NC_011988	ATCG	2	8	239909	239916	25 %	25 %	25 %	25 %	222106324
531	NC_011988	CGCC	2	8	240130	240137	0 %	0 %	25 %	75 %	222106324
532	NC_011988	TGGG	2	8	240344	240351	0 %	25 %	75 %	0 %	222106325
533	NC_011988	CCAG	2	8	240426	240433	25 %	0 %	25 %	50 %	222106325
534	NC_011988	CGGA	2	8	240501	240508	25 %	0 %	50 %	25 %	222106325
535	NC_011988	GCTG	2	8	240821	240828	0 %	25 %	50 %	25 %	222106326
536	NC_011988	GCTG	2	8	240916	240923	0 %	25 %	50 %	25 %	222106326
537	NC_011988	GCCA	2	8	241084	241091	25 %	0 %	25 %	50 %	222106326
538	NC_011988	TCCG	2	8	241593	241600	0 %	25 %	25 %	50 %	222106327
539	NC_011988	GCCA	2	8	241868	241875	25 %	0 %	25 %	50 %	222106327
540	NC_011988	TCAC	2	8	242590	242597	25 %	25 %	0 %	50 %	222106328
541	NC_011988	CCGG	2	8	243770	243777	0 %	0 %	50 %	50 %	222106328
542	NC_011988	GCTC	2	8	244016	244023	0 %	25 %	25 %	50 %	222106328
543	NC_011988	CGGT	2	8	244505	244512	0 %	25 %	50 %	25 %	222106328
544	NC_011988	GCAA	2	8	244553	244560	50 %	0 %	25 %	25 %	222106328
545	NC_011988	TTGC	2	8	245044	245051	0 %	50 %	25 %	25 %	222106329
546	NC_011988	TTAA	2	8	245954	245961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011988	CAAG	2	8	246754	246761	50 %	0 %	25 %	25 %	222106330
548	NC_011988	TTTC	2	8	247753	247760	0 %	75 %	0 %	25 %	222106331
549	NC_011988	AGAC	2	8	251530	251537	50 %	0 %	25 %	25 %	222106335
550	NC_011988	GCGG	2	8	252097	252104	0 %	0 %	75 %	25 %	222106335
551	NC_011988	CATG	2	8	252196	252203	25 %	25 %	25 %	25 %	222106335
552	NC_011988	CGGG	2	8	252208	252215	0 %	0 %	75 %	25 %	222106335
553	NC_011988	TGAT	2	8	252808	252815	25 %	50 %	25 %	0 %	222106335
554	NC_011988	GACC	2	8	252865	252872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
555	NC_011988	GCTT	2	8	253108	253115	0 %	50 %	25 %	25 %	222106336
556	NC_011988	CTGG	2	8	253640	253647	0 %	25 %	50 %	25 %	222106337
557	NC_011988	AGCC	2	8	254371	254378	25 %	0 %	25 %	50 %	222106338
558	NC_011988	CCTG	2	8	254585	254592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_011988	GAAA	2	8	254643	254650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011988	TCGG	2	8	254767	254774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_011988	CGAT	2	8	254785	254792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_011988	CAGC	2	8	255241	255248	25 %	0 %	25 %	50 %	222106339
563	NC_011988	GGCT	2	8	256892	256899	0 %	25 %	50 %	25 %	222106339
564	NC_011988	GGTG	2	8	257843	257850	0 %	25 %	75 %	0 %	222106339
565	NC_011988	GGCT	2	8	258245	258252	0 %	25 %	50 %	25 %	222106339
566	NC_011988	GGCG	2	8	258935	258942	0 %	0 %	75 %	25 %	222106339
567	NC_011988	TGGC	4	16	259922	259937	0 %	25 %	50 %	25 %	222106339
568	NC_011988	CGAT	2	8	260185	260192	25 %	25 %	25 %	25 %	222106339
569	NC_011988	TCGG	2	8	260430	260437	0 %	25 %	50 %	25 %	222106339
570	NC_011988	TGGC	2	8	260612	260619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_011988	AGAC	2	8	260691	260698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_011988	ATCC	2	8	260957	260964	25 %	25 %	0 %	50 %	222106340
573	NC_011988	CAAT	2	8	261249	261256	50 %	25 %	0 %	25 %	222106340
574	NC_011988	CAGA	2	8	261437	261444	50 %	0 %	25 %	25 %	222106340
575	NC_011988	GGGC	2	8	261469	261476	0 %	0 %	75 %	25 %	222106340
576	NC_011988	CCAA	2	8	261494	261501	50 %	0 %	0 %	50 %	222106340
577	NC_011988	GAGG	2	8	261901	261908	25 %	0 %	75 %	0 %	222106340
578	NC_011988	TGCG	2	8	262617	262624	0 %	25 %	50 %	25 %	222106340
579	NC_011988	GCTT	2	8	262797	262804	0 %	50 %	25 %	25 %	222106340
580	NC_011988	GCCA	2	8	264363	264370	25 %	0 %	25 %	50 %	222106342
581	NC_011988	AAAT	2	8	264516	264523	75 %	25 %	0 %	0 %	222106343
582	NC_011988	GCGA	2	8	264672	264679	25 %	0 %	50 %	25 %	222106343
583	NC_011988	GAGC	2	8	265331	265338	25 %	0 %	50 %	25 %	222106345
584	NC_011988	TCGA	2	8	265402	265409	25 %	25 %	25 %	25 %	222106345
585	NC_011988	GCAG	2	8	265605	265612	25 %	0 %	50 %	25 %	222106345
586	NC_011988	CATC	2	8	265700	265707	25 %	25 %	0 %	50 %	222106345
587	NC_011988	GCCT	2	8	266169	266176	0 %	25 %	25 %	50 %	222106345
588	NC_011988	CAAC	2	8	266759	266766	50 %	0 %	0 %	50 %	222106345
589	NC_011988	CATT	2	8	266807	266814	25 %	50 %	0 %	25 %	222106345
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591	NC_011988	CGAT	2	8	267124	267131	25 %	25 %	25 %	25 %	222106346
592	NC_011988	ATCA	2	8	267169	267176	50 %	25 %	0 %	25 %	222106347
593	NC_011988	CCAG	2	8	268314	268321	25 %	0 %	25 %	50 %	222106347
594	NC_011988	CAGG	2	8	268651	268658	25 %	0 %	50 %	25 %	222106347
595	NC_011988	GCCA	2	8	268906	268913	25 %	0 %	25 %	50 %	222106347
596	NC_011988	AGGA	2	8	269711	269718	50 %	0 %	50 %	0 %	222106347
597	NC_011988	CCAT	2	8	269822	269829	25 %	25 %	0 %	50 %	222106347
598	NC_011988	ATCA	2	8	270166	270173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_011988	CGAG	2	8	270282	270289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
600	NC_011988	CTTC	2	8	270396	270403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_011988	AAGG	2	8	270841	270848	50 %	0 %	50 %	0 %	222106348
602	NC_011988	GCTG	2	8	271095	271102	0 %	25 %	50 %	25 %	222106348
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605	NC_011988	CTGC	2	8	272199	272206	0 %	25 %	25 %	50 %	222106349
606	NC_011988	GGGC	2	8	272483	272490	0 %	0 %	75 %	25 %	222106349
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610	NC_011988	ACCG	2	8	273561	273568	25 %	0 %	25 %	50 %	222106350
611	NC_011988	GGCA	2	8	274050	274057	25 %	0 %	50 %	25 %	222106350
612	NC_011988	AGGC	2	8	274175	274182	25 %	0 %	50 %	25 %	222106350
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614	NC_011988	TGAT	2	8	275058	275065	25 %	50 %	25 %	0 %	222106351
615	NC_011988	TTGC	2	8	275313	275320	0 %	50 %	25 %	25 %	222106351
616	NC_011988	CGGG	2	8	275722	275729	0 %	0 %	75 %	25 %	222106352
617	NC_011988	GGGC	2	8	277585	277592	0 %	0 %	75 %	25 %	222106353
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619	NC_011988	GGCG	2	8	278734	278741	0 %	0 %	75 %	25 %	222106354
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623	NC_011988	TGGC	2	8	280308	280315	0 %	25 %	50 %	25 %	222106355
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625	NC_011988	CGTC	2	8	282345	282352	0 %	25 %	25 %	50 %	222106357
626	NC_011988	GCCG	2	8	282583	282590	0 %	0 %	50 %	50 %	222106357
627	NC_011988	CGGG	2	8	283909	283916	0 %	0 %	75 %	25 %	222106359
628	NC_011988	GGCA	2	8	283994	284001	25 %	0 %	50 %	25 %	222106359
629	NC_011988	ATGG	2	8	284739	284746	25 %	25 %	50 %	0 %	222106360
630	NC_011988	GAGC	2	8	285336	285343	25 %	0 %	50 %	25 %	222106360
631	NC_011988	GGCA	2	8	285849	285856	25 %	0 %	50 %	25 %	222106361
632	NC_011988	CATC	2	8	286286	286293	25 %	25 %	0 %	50 %	222106361
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