MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	TCA	2	6	270	275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102330
2	NC_011986	AGC	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102330
3	NC_011986	TCC	2	6	331	336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102330
4	NC_011986	GGA	2	6	493	498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102330
5	NC_011986	CGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102330
6	NC_011986	GGC	2	6	602	607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102330
7	NC_011986	GCA	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102330
8	NC_011986	ATG	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102330
9	NC_011986	TGA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102330
10	NC_011986	GAC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102330
11	NC_011986	GCG	2	6	1034	1039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102330
12	NC_011986	CGG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102330
13	NC_011986	TGG	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102330
14	NC_011986	CAA	2	6	1411	1416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102330
15	NC_011986	CTT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102331
16	NC_011986	GAT	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102331
17	NC_011986	CTT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102331
18	NC_011986	ACA	2	6	1580	1585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102331
19	NC_011986	TTG	2	6	1692	1697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102331
20	NC_011986	GCC	2	6	1880	1885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102331
21	NC_011986	GTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102331
22	NC_011986	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102331
23	NC_011986	GAA	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102331
24	NC_011986	GGC	2	6	2431	2436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102331
25	NC_011986	GAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102331
26	NC_011986	ACG	2	6	2691	2696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102332
27	NC_011986	GCG	2	6	2705	2710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102332
28	NC_011986	GAT	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102332
29	NC_011986	CCT	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102332
30	NC_011986	CTG	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102332
31	NC_011986	TGG	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102332
32	NC_011986	CGG	2	6	2973	2978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102332
33	NC_011986	GAT	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102332
34	NC_011986	GAG	2	6	3117	3122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102332
35	NC_011986	CGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102332
36	NC_011986	CGG	2	6	3198	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102332
37	NC_011986	GAG	2	6	3234	3239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102332
38	NC_011986	CTT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102332
39	NC_011986	GTC	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102332
40	NC_011986	GAT	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102332
41	NC_011986	CAT	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102332
42	NC_011986	TGT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102332
43	NC_011986	CTT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102333
44	NC_011986	CTT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102333
45	NC_011986	AAG	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102333
46	NC_011986	ATC	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102333
47	NC_011986	TTC	2	6	4312	4317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102333
48	NC_011986	GGC	2	6	4410	4415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102333
49	NC_011986	TCG	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102333
50	NC_011986	TGA	3	9	5158	5166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102334
51	NC_011986	CTT	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102334
52	NC_011986	CCG	2	6	5336	5341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102334
53	NC_011986	TCG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102334
54	NC_011986	TTG	2	6	5375	5380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102334
55	NC_011986	TCG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102334
56	NC_011986	GTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102335
57	NC_011986	CAA	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102335
58	NC_011986	GCC	2	6	5766	5771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102335
59	NC_011986	GCC	2	6	5870	5875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102335
60	NC_011986	CAG	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102335
61	NC_011986	TAC	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102335
62	NC_011986	AGC	2	6	6181	6186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102335
63	NC_011986	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102335
64	NC_011986	CAG	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102335
65	NC_011986	TGA	2	6	6994	6999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102336
66	NC_011986	GGC	2	6	7094	7099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102336
67	NC_011986	GAC	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102336
68	NC_011986	TTA	2	6	7192	7197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102336
69	NC_011986	GGC	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102336
70	NC_011986	GCG	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102336
71	NC_011986	GAG	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102336
72	NC_011986	TTC	3	9	7405	7413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102337
73	NC_011986	GGA	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102337
74	NC_011986	GGC	2	6	7482	7487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
75	NC_011986	AGG	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102337
76	NC_011986	GCG	2	6	7621	7626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
77	NC_011986	GCC	2	6	7634	7639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102337
78	NC_011986	TGT	2	6	7686	7691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102337
79	NC_011986	CCT	2	6	7700	7705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102337
80	NC_011986	GGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
81	NC_011986	ACC	2	6	7835	7840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102337
82	NC_011986	GCC	2	6	8071	8076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102337
83	NC_011986	GCA	2	6	8085	8090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102337
84	NC_011986	GAT	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102337
85	NC_011986	GGC	2	6	8250	8255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
86	NC_011986	TCA	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102337
87	NC_011986	GCA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102337
88	NC_011986	AGA	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102337
89	NC_011986	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
90	NC_011986	CGG	2	6	8940	8945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
91	NC_011986	AGA	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102337
92	NC_011986	GCG	2	6	9121	9126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102337
93	NC_011986	TGG	2	6	9468	9473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102337
94	NC_011986	AGG	2	6	9518	9523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102337
95	NC_011986	AAG	2	6	9557	9562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102337
96	NC_011986	AGG	2	6	9566	9571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102337
97	NC_011986	CGC	2	6	9603	9608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102337
98	NC_011986	ATT	2	6	9668	9673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102337
99	NC_011986	TGT	2	6	9912	9917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102337
100	NC_011986	TGA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102337
101	NC_011986	AGC	2	6	10019	10024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102337
102	NC_011986	GAG	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102337
103	NC_011986	ATG	2	6	10463	10468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102338
104	NC_011986	TCG	2	6	10479	10484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102338
105	NC_011986	CGC	2	6	10651	10656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102338
106	NC_011986	GTC	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102338
107	NC_011986	CAG	2	6	10920	10925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102338
108	NC_011986	GAA	2	6	10945	10950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102338
109	NC_011986	CAG	2	6	10990	10995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102338
110	NC_011986	CCT	2	6	11025	11030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102338
111	NC_011986	CAT	2	6	11035	11040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102338
112	NC_011986	ATT	2	6	11090	11095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102338
113	NC_011986	ATG	2	6	11270	11275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102338
114	NC_011986	TGT	2	6	11289	11294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102338
115	NC_011986	GAG	2	6	11359	11364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102338
116	NC_011986	CTG	2	6	11419	11424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102338
117	NC_011986	GCC	2	6	11496	11501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102338
118	NC_011986	TGC	2	6	11539	11544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102338
119	NC_011986	AAG	2	6	11590	11595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102338
120	NC_011986	TCA	2	6	11691	11696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102338
121	NC_011986	GAA	2	6	11722	11727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102338
122	NC_011986	GCG	2	6	11749	11754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102338
123	NC_011986	GTT	2	6	11888	11893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102338
124	NC_011986	TTC	3	9	11984	11992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102338
125	NC_011986	ATC	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102338
126	NC_011986	GAT	2	6	12112	12117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102338
127	NC_011986	GGA	2	6	12144	12149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102338
128	NC_011986	ACC	2	6	12163	12168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102338
129	NC_011986	CTT	2	6	12181	12186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102338
130	NC_011986	GCG	2	6	12284	12289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102338
131	NC_011986	CGC	2	6	12551	12556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102339
132	NC_011986	CCT	2	6	12562	12567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102339
133	NC_011986	CGG	2	6	12571	12576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102339
134	NC_011986	CCG	2	6	12638	12643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102339
135	NC_011986	TGC	2	6	12655	12660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102339
136	NC_011986	ATC	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102339
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139	NC_011986	TCC	2	6	13206	13211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102339
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143	NC_011986	ATC	2	6	13449	13454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102339
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155	NC_011986	GGC	2	6	14429	14434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102340
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234	NC_011986	TTC	2	6	20062	20067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102347
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239	NC_011986	TGA	2	6	20515	20520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102347
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242	NC_011986	CAG	2	6	20965	20970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102347
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250	NC_011986	CCG	2	6	21485	21490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102347
251	NC_011986	ATC	2	6	21560	21565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102347
252	NC_011986	GAC	2	6	21574	21579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102347
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254	NC_011986	CTT	2	6	21756	21761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102347
255	NC_011986	TGA	2	6	21762	21767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102347
256	NC_011986	GAA	2	6	22097	22102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102348
257	NC_011986	ATC	2	6	22103	22108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102348
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259	NC_011986	CAA	2	6	22231	22236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102348
260	NC_011986	TGA	2	6	22254	22259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102348
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283	NC_011986	GAC	2	6	23797	23802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102350
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375	NC_011986	GGC	2	6	31397	31402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102360
376	NC_011986	CTG	2	6	31575	31580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102360
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378	NC_011986	GCG	2	6	32139	32144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102361
379	NC_011986	ATC	2	6	32147	32152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102361
380	NC_011986	GAA	2	6	32201	32206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102361
381	NC_011986	GAT	2	6	32368	32373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102361
382	NC_011986	GCT	2	6	32425	32430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102362
383	NC_011986	TAT	2	6	32450	32455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102362
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403	NC_011986	CGA	2	6	34531	34536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102363
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461	NC_011986	CGT	2	6	39186	39191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102370
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500	NC_011986	TTG	3	9	42179	42187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102372

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