MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011986	CCG	2	6	42204	42209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102372
502	NC_011986	GAG	2	6	42235	42240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102372
503	NC_011986	CGG	2	6	42345	42350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102372
504	NC_011986	GAT	2	6	42371	42376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102372
505	NC_011986	AGG	2	6	42597	42602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102373
506	NC_011986	ACC	2	6	42643	42648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102373
507	NC_011986	AGG	2	6	42680	42685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102373
508	NC_011986	GCG	2	6	42691	42696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102373
509	NC_011986	ACG	2	6	42834	42839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102374
510	NC_011986	GCA	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102374
511	NC_011986	GCT	2	6	43038	43043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102374
512	NC_011986	GAT	2	6	43118	43123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102374
513	NC_011986	GCA	2	6	43420	43425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102375
514	NC_011986	TGC	2	6	43578	43583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
515	NC_011986	CCA	2	6	43585	43590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102375
516	NC_011986	TGC	2	6	43596	43601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
517	NC_011986	TGG	2	6	43628	43633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102375
518	NC_011986	TGT	2	6	43652	43657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102375
519	NC_011986	TCG	2	6	43660	43665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102375
520	NC_011986	AAC	2	6	43672	43677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102375
521	NC_011986	TTC	2	6	43693	43698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102375
522	NC_011986	ATG	2	6	43941	43946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
523	NC_011986	ATG	2	6	43998	44003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
524	NC_011986	ATG	2	6	44010	44015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
525	NC_011986	AAG	2	6	44016	44021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102376
526	NC_011986	GAT	2	6	44048	44053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102376
527	NC_011986	AGA	2	6	44134	44139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102376
528	NC_011986	GCG	2	6	44320	44325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102377
529	NC_011986	ATG	2	6	44355	44360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102377
530	NC_011986	GAT	2	6	44466	44471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102377
531	NC_011986	GGC	2	6	44543	44548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102377
532	NC_011986	CTC	2	6	44664	44669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102378
533	NC_011986	CGA	2	6	44699	44704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
534	NC_011986	GAT	2	6	44726	44731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
535	NC_011986	CGG	2	6	44770	44775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102378
536	NC_011986	CAG	2	6	44891	44896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
537	NC_011986	CGT	2	6	44977	44982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
538	NC_011986	CGA	2	6	45004	45009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
539	NC_011986	CTT	2	6	45016	45021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102378
540	NC_011986	GCG	2	6	45105	45110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102378
541	NC_011986	CGT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
542	NC_011986	TTG	2	6	45120	45125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102378
543	NC_011986	GTC	3	9	45186	45194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
544	NC_011986	GCC	2	6	45221	45226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
545	NC_011986	TCC	2	6	45321	45326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102378
546	NC_011986	ATG	2	6	45327	45332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
547	NC_011986	ATG	2	6	45345	45350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
548	NC_011986	CGC	2	6	45440	45445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
549	NC_011986	GCC	2	6	45495	45500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
550	NC_011986	GCA	2	6	45505	45510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
551	NC_011986	CGA	2	6	45589	45594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
552	NC_011986	GAT	2	6	45725	45730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
553	NC_011986	ATC	2	6	45786	45791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
554	NC_011986	TGC	2	6	45794	45799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
555	NC_011986	CGA	2	6	45805	45810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
556	NC_011986	CAC	2	6	45824	45829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102378
557	NC_011986	TCG	2	6	45852	45857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
558	NC_011986	ATC	2	6	46038	46043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
559	NC_011986	TCA	2	6	46047	46052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102378
560	NC_011986	CGA	2	6	46126	46131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
561	NC_011986	TCG	2	6	46155	46160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
562	NC_011986	AAG	2	6	46202	46207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102378
563	NC_011986	TGA	2	6	46279	46284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
564	NC_011986	CAA	2	6	46366	46371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102378
565	NC_011986	GAA	2	6	46460	46465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102378
566	NC_011986	GAC	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102378
567	NC_011986	TGA	3	9	46821	46829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102378
568	NC_011986	CTG	2	6	47060	47065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102379
569	NC_011986	TGG	2	6	47181	47186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102379
570	NC_011986	ATC	2	6	47189	47194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102379
571	NC_011986	CTT	2	6	47203	47208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102379
572	NC_011986	AGC	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102379
573	NC_011986	CGA	2	6	47287	47292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102379
574	NC_011986	CGC	2	6	47627	47632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102380
575	NC_011986	CGC	2	6	47681	47686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102380
576	NC_011986	GCC	2	6	47748	47753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102380
577	NC_011986	GCA	2	6	48018	48023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102380
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579	NC_011986	CGT	2	6	48070	48075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102380
580	NC_011986	GAT	2	6	48194	48199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102381
581	NC_011986	ATC	2	6	48215	48220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102381
582	NC_011986	CGC	2	6	48272	48277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102381
583	NC_011986	AGC	2	6	48363	48368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102381
584	NC_011986	ATC	2	6	48513	48518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102381
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586	NC_011986	CAG	2	6	48668	48673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
587	NC_011986	ACG	2	6	48828	48833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
588	NC_011986	CGC	2	6	48946	48951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102382
589	NC_011986	CGA	2	6	49000	49005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
590	NC_011986	TCG	2	6	49008	49013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102382
591	NC_011986	TGT	2	6	49051	49056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102382
592	NC_011986	ATC	2	6	49065	49070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102382
593	NC_011986	GCG	2	6	49111	49116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
594	NC_011986	GGC	2	6	49208	49213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
595	NC_011986	CGC	2	6	49370	49375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102382
596	NC_011986	CGA	2	6	49378	49383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
597	NC_011986	CGA	2	6	49525	49530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
598	NC_011986	ATG	2	6	49611	49616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102382
599	NC_011986	GAT	2	6	49655	49660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102382
600	NC_011986	CAG	2	6	49715	49720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
601	NC_011986	GGC	2	6	49739	49744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
602	NC_011986	GCC	2	6	49821	49826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102382
603	NC_011986	TGA	2	6	49837	49842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102382
604	NC_011986	TCG	2	6	49873	49878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102382
605	NC_011986	TTG	2	6	49902	49907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102382
606	NC_011986	GCC	2	6	49913	49918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102382
607	NC_011986	ACC	2	6	49991	49996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102382
608	NC_011986	CGA	2	6	49999	50004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
609	NC_011986	GGC	2	6	50005	50010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
610	NC_011986	CGA	2	6	50083	50088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
611	NC_011986	GCC	2	6	50220	50225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102382
612	NC_011986	GTA	2	6	50228	50233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102382
613	NC_011986	CGA	2	6	50278	50283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
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615	NC_011986	CGG	2	6	50401	50406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
616	NC_011986	GTT	2	6	50432	50437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102382
617	NC_011986	CGA	2	6	50574	50579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
618	NC_011986	TCG	2	6	50583	50588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102382
619	NC_011986	GAC	2	6	50678	50683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
620	NC_011986	GGA	2	6	50851	50856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102382
621	NC_011986	ACC	2	6	50871	50876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102382
622	NC_011986	GCG	2	6	50943	50948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102382
623	NC_011986	ACG	2	6	50967	50972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102382
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