MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 1608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011983	GATCC	2	10	678	687	20 %	20 %	20 %	40 %	222080823
2	NC_011983	CGAAC	2	10	1073	1082	40 %	0 %	20 %	40 %	222080823
3	NC_011983	TCAGC	2	10	3606	3615	20 %	20 %	20 %	40 %	222080825
4	NC_011983	CGAGG	2	10	3709	3718	20 %	0 %	60 %	20 %	222080825
5	NC_011983	ATCGA	2	10	5031	5040	40 %	20 %	20 %	20 %	222080827
6	NC_011983	ACCGA	2	10	7516	7525	40 %	0 %	20 %	40 %	222080830
7	NC_011983	TCCGC	2	10	7943	7952	0 %	20 %	20 %	60 %	222080830
8	NC_011983	CGATG	2	10	8450	8459	20 %	20 %	40 %	20 %	222080831
9	NC_011983	TCGGT	2	10	8525	8534	0 %	40 %	40 %	20 %	222080831
10	NC_011983	GCTCA	2	10	13294	13303	20 %	20 %	20 %	40 %	222080834
11	NC_011983	GCGCA	2	10	13947	13956	20 %	0 %	40 %	40 %	222080834
12	NC_011983	TCGCT	2	10	18255	18264	0 %	40 %	20 %	40 %	222080834
13	NC_011983	TGCGT	2	10	19243	19252	0 %	40 %	40 %	20 %	222080835
14	NC_011983	TGCGC	2	10	19531	19540	0 %	20 %	40 %	40 %	222080835
15	NC_011983	GCGCT	2	10	21482	21491	0 %	20 %	40 %	40 %	222080836
16	NC_011983	TATTC	2	10	21756	21765	20 %	60 %	0 %	20 %	222080836
17	NC_011983	CGGGC	2	10	22752	22761	0 %	0 %	60 %	40 %	222080837
18	NC_011983	CGCTG	2	10	26222	26231	0 %	20 %	40 %	40 %	222080840
19	NC_011983	ATCCG	2	10	28037	28046	20 %	20 %	20 %	40 %	222080842
20	NC_011983	TTCGC	2	10	29402	29411	0 %	40 %	20 %	40 %	222080843
21	NC_011983	GAGAC	2	10	30185	30194	40 %	0 %	40 %	20 %	222080843
22	NC_011983	GAGCT	2	10	30618	30627	20 %	20 %	40 %	20 %	222080844
23	NC_011983	CGAGG	2	10	35784	35793	20 %	0 %	60 %	20 %	222080849
24	NC_011983	TGGGC	2	10	35936	35945	0 %	20 %	60 %	20 %	222080849
25	NC_011983	GCCTC	2	10	37094	37103	0 %	20 %	20 %	60 %	222080851
26	NC_011983	CAGCC	2	10	37606	37615	20 %	0 %	20 %	60 %	222080852
27	NC_011983	CCTTT	2	10	45693	45702	0 %	60 %	0 %	40 %	222080859
28	NC_011983	TGGCT	2	10	46535	46544	0 %	40 %	40 %	20 %	222080859
29	NC_011983	CATTC	2	10	48246	48255	20 %	40 %	0 %	40 %	222080860
30	NC_011983	GGCAG	2	10	48379	48388	20 %	0 %	60 %	20 %	222080861
31	NC_011983	GATCG	2	10	48938	48947	20 %	20 %	40 %	20 %	222080861
32	NC_011983	TGCGA	2	10	49055	49064	20 %	20 %	40 %	20 %	222080861
33	NC_011983	CGGTC	2	10	49504	49513	0 %	20 %	40 %	40 %	222080861
34	NC_011983	GTGCC	2	10	51791	51800	0 %	20 %	40 %	40 %	222080863
35	NC_011983	TGAGA	2	10	52829	52838	40 %	20 %	40 %	0 %	222080863
36	NC_011983	GCATC	2	10	54709	54718	20 %	20 %	20 %	40 %	222080865
37	NC_011983	CGGAT	2	10	55632	55641	20 %	20 %	40 %	20 %	222080865
38	NC_011983	GCCGC	2	10	56107	56116	0 %	0 %	40 %	60 %	222080865
39	NC_011983	ACGAC	2	10	57738	57747	40 %	0 %	20 %	40 %	222080867
40	NC_011983	GCGCA	2	10	59869	59878	20 %	0 %	40 %	40 %	222080869
41	NC_011983	GCGGT	2	10	60652	60661	0 %	20 %	60 %	20 %	222080870
42	NC_011983	AATGT	2	10	61833	61842	40 %	40 %	20 %	0 %	222080871
43	NC_011983	CGGGT	2	10	64162	64171	0 %	20 %	60 %	20 %	222080873
44	NC_011983	ACGGC	2	10	66648	66657	20 %	0 %	40 %	40 %	222080876
45	NC_011983	GCGCG	2	10	66905	66914	0 %	0 %	60 %	40 %	222080877
46	NC_011983	CGCTG	2	10	68440	68449	0 %	20 %	40 %	40 %	222080878
47	NC_011983	GCGCT	2	10	68805	68814	0 %	20 %	40 %	40 %	222080879
48	NC_011983	AGCCG	2	10	69032	69041	20 %	0 %	40 %	40 %	222080879
49	NC_011983	TCCGG	2	10	71243	71252	0 %	20 %	40 %	40 %	222080880
50	NC_011983	AGGGG	2	10	72897	72906	20 %	0 %	80 %	0 %	222080881
51	NC_011983	CCGTG	2	10	76935	76944	0 %	20 %	40 %	40 %	222080886
52	NC_011983	CGGCT	2	10	83088	83097	0 %	20 %	40 %	40 %	222080890
53	NC_011983	CGGCA	2	10	83399	83408	20 %	0 %	40 %	40 %	222080890
54	NC_011983	TGCCC	2	10	88645	88654	0 %	20 %	20 %	60 %	222080894
55	NC_011983	GGCCT	2	10	92322	92331	0 %	20 %	40 %	40 %	222080899
56	NC_011983	ATCGG	2	10	94859	94868	20 %	20 %	40 %	20 %	222080901
57	NC_011983	TGCCG	2	10	95174	95183	0 %	20 %	40 %	40 %	222080902
58	NC_011983	GCACG	2	10	97040	97049	20 %	0 %	40 %	40 %	222080904
59	NC_011983	TCGTC	2	10	98745	98754	0 %	40 %	20 %	40 %	222080905
60	NC_011983	CGCTG	2	10	102975	102984	0 %	20 %	40 %	40 %	222080910
61	NC_011983	GAAGG	2	10	104130	104139	40 %	0 %	60 %	0 %	222080911
62	NC_011983	GCCGA	2	10	104643	104652	20 %	0 %	40 %	40 %	222080911
63	NC_011983	GACCG	2	10	107005	107014	20 %	0 %	40 %	40 %	222080913
64	NC_011983	CTTGC	2	10	107536	107545	0 %	40 %	20 %	40 %	222080913
65	NC_011983	CTGAT	2	10	109685	109694	20 %	40 %	20 %	20 %	222080916
66	NC_011983	CTTGC	2	10	110948	110957	0 %	40 %	20 %	40 %	222080916
67	NC_011983	TTGCC	2	10	111332	111341	0 %	40 %	20 %	40 %	222080916
68	NC_011983	CCGGC	2	10	112124	112133	0 %	0 %	40 %	60 %	222080916
69	NC_011983	TCGCG	2	10	114868	114877	0 %	20 %	40 %	40 %	222080918
70	NC_011983	TCGAC	2	10	115157	115166	20 %	20 %	20 %	40 %	222080918
71	NC_011983	AGGCG	2	10	118493	118502	20 %	0 %	60 %	20 %	222080920
72	NC_011983	TCAAG	2	10	118933	118942	40 %	20 %	20 %	20 %	222080921
73	NC_011983	TCTCG	2	10	119407	119416	0 %	40 %	20 %	40 %	222080921
74	NC_011983	ACGAT	2	10	120875	120884	40 %	20 %	20 %	20 %	222080922
75	NC_011983	ATGAT	2	10	120995	121004	40 %	40 %	20 %	0 %	222080922
76	NC_011983	TGGAT	2	10	122233	122242	20 %	40 %	40 %	0 %	222080923
77	NC_011983	TGGCA	2	10	126245	126254	20 %	20 %	40 %	20 %	222080927
78	NC_011983	GGATC	2	10	126382	126391	20 %	20 %	40 %	20 %	222080927
79	NC_011983	CGGCG	2	10	127953	127962	0 %	0 %	60 %	40 %	222080928
80	NC_011983	TGGCG	2	10	127965	127974	0 %	20 %	60 %	20 %	222080928
81	NC_011983	ACGCA	2	10	128428	128437	40 %	0 %	20 %	40 %	222080928
82	NC_011983	CGTCG	2	10	134286	134295	0 %	20 %	40 %	40 %	222080935
83	NC_011983	TCGCG	2	10	135141	135150	0 %	20 %	40 %	40 %	222080936
84	NC_011983	ATCCG	2	10	137239	137248	20 %	20 %	20 %	40 %	222080938
85	NC_011983	GTTCG	2	10	138717	138726	0 %	40 %	40 %	20 %	222080939
86	NC_011983	TCAGC	2	10	138797	138806	20 %	20 %	20 %	40 %	222080939
87	NC_011983	CCGGT	2	10	140120	140129	0 %	20 %	40 %	40 %	222080940
88	NC_011983	AAGGC	2	10	140376	140385	40 %	0 %	40 %	20 %	222080940
89	NC_011983	GTGCT	2	10	145742	145751	0 %	40 %	40 %	20 %	222080944
90	NC_011983	CTCGT	2	10	146098	146107	0 %	40 %	20 %	40 %	222080944
91	NC_011983	TGCCG	2	10	146361	146370	0 %	20 %	40 %	40 %	222080944
92	NC_011983	TGGTT	2	10	147285	147294	0 %	60 %	40 %	0 %	222080945
93	NC_011983	GCATC	2	10	150969	150978	20 %	20 %	20 %	40 %	222080947
94	NC_011983	CCGAG	2	10	152144	152153	20 %	0 %	40 %	40 %	222080948
95	NC_011983	TATGG	2	10	156556	156565	20 %	40 %	40 %	0 %	222080954
96	NC_011983	GAAAG	2	10	160450	160459	60 %	0 %	40 %	0 %	222080958
97	NC_011983	ACAGG	2	10	161362	161371	40 %	0 %	40 %	20 %	222080959
98	NC_011983	GGGGC	2	10	165333	165342	0 %	0 %	80 %	20 %	222080963
99	NC_011983	AATGA	2	10	165461	165470	60 %	20 %	20 %	0 %	222080963
100	NC_011983	TGCGC	2	10	165517	165526	0 %	20 %	40 %	40 %	222080963
101	NC_011983	GCCTG	2	10	165791	165800	0 %	20 %	40 %	40 %	222080964
102	NC_011983	CCCGG	2	10	171803	171812	0 %	0 %	40 %	60 %	222080970
103	NC_011983	CATTC	2	10	174030	174039	20 %	40 %	0 %	40 %	222080971
104	NC_011983	CGGCC	2	10	177930	177939	0 %	0 %	40 %	60 %	222080974
105	NC_011983	TCGCC	2	10	184850	184859	0 %	20 %	20 %	60 %	222080979
106	NC_011983	TCTCA	2	10	185256	185265	20 %	40 %	0 %	40 %	222080979
107	NC_011983	ATCGG	2	10	187204	187213	20 %	20 %	40 %	20 %	222080980
108	NC_011983	ACCGC	2	10	188122	188131	20 %	0 %	20 %	60 %	222080981
109	NC_011983	GGTCG	2	10	188713	188722	0 %	20 %	60 %	20 %	222080982
110	NC_011983	GGCTC	2	10	190992	191001	0 %	20 %	40 %	40 %	222080983
111	NC_011983	TGGTG	2	10	192127	192136	0 %	40 %	60 %	0 %	222080984
112	NC_011983	CTGCG	2	10	193070	193079	0 %	20 %	40 %	40 %	222080986
113	NC_011983	CGCAG	2	10	196124	196133	20 %	0 %	40 %	40 %	222080989
114	NC_011983	AAAAT	2	10	198696	198705	80 %	20 %	0 %	0 %	222080992
115	NC_011983	ATTGC	2	10	199591	199600	20 %	40 %	20 %	20 %	222080993
116	NC_011983	CGACG	2	10	202847	202856	20 %	0 %	40 %	40 %	222080996
117	NC_011983	CGCTG	2	10	203880	203889	0 %	20 %	40 %	40 %	222080997
118	NC_011983	ATATC	2	10	204513	204522	40 %	40 %	0 %	20 %	222080998
119	NC_011983	TGCCT	2	10	206746	206755	0 %	40 %	20 %	40 %	222080999
120	NC_011983	GGCTG	2	10	207738	207747	0 %	20 %	60 %	20 %	222081000
121	NC_011983	AGCCG	2	10	209405	209414	20 %	0 %	40 %	40 %	222081002
122	NC_011983	AGGCG	2	10	210445	210454	20 %	0 %	60 %	20 %	222081003
123	NC_011983	CGGCC	2	10	210893	210902	0 %	0 %	40 %	60 %	222081004
124	NC_011983	GACGG	2	10	211821	211830	20 %	0 %	60 %	20 %	222081005
125	NC_011983	CGGGT	2	10	212141	212150	0 %	20 %	60 %	20 %	222081005
126	NC_011983	TGCGG	2	10	212824	212833	0 %	20 %	60 %	20 %	222081005
127	NC_011983	GACCG	2	10	212985	212994	20 %	0 %	40 %	40 %	222081005
128	NC_011983	GGCTT	2	10	215017	215026	0 %	40 %	40 %	20 %	222081007
129	NC_011983	GACGC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	40 %	40 %	222081009
130	NC_011983	CCGGC	2	10	217721	217730	0 %	0 %	40 %	60 %	222081009
131	NC_011983	CTTCC	2	10	218588	218597	0 %	40 %	0 %	60 %	222081012
132	NC_011983	CCGAT	2	10	219259	219268	20 %	20 %	20 %	40 %	222081011
133	NC_011983	AGGAA	2	10	219903	219912	60 %	0 %	40 %	0 %	222081011
134	NC_011983	GCATG	2	10	220805	220814	20 %	20 %	40 %	20 %	222081013
135	NC_011983	CGATG	2	10	222325	222334	20 %	20 %	40 %	20 %	222081014
136	NC_011983	GCCTC	2	10	225268	225277	0 %	20 %	20 %	60 %	222081016
137	NC_011983	TCGCC	2	10	225672	225681	0 %	20 %	20 %	60 %	222081017
138	NC_011983	CTGCC	2	10	226488	226497	0 %	20 %	20 %	60 %	222081017
139	NC_011983	GTGCT	2	10	228599	228608	0 %	40 %	40 %	20 %	222081019
140	NC_011983	TCGCC	2	10	229811	229820	0 %	20 %	20 %	60 %	222081020
141	NC_011983	AGGCC	2	10	230584	230593	20 %	0 %	40 %	40 %	222081021
142	NC_011983	GGAGC	2	10	234453	234462	20 %	0 %	60 %	20 %	222081026
143	NC_011983	CGGTG	2	10	234831	234840	0 %	20 %	60 %	20 %	222081027
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149	NC_011983	AGGAG	2	10	240500	240509	40 %	0 %	60 %	0 %	222081033
150	NC_011983	GCCTT	2	10	241984	241993	0 %	40 %	20 %	40 %	222081035
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153	NC_011983	CTTCC	2	10	248069	248078	0 %	40 %	0 %	60 %	222081042
154	NC_011983	TGGTC	2	10	248742	248751	0 %	40 %	40 %	20 %	222081042
155	NC_011983	CCAGT	2	10	249877	249886	20 %	20 %	20 %	40 %	222081043
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174	NC_011983	CGCAG	2	10	278160	278169	20 %	0 %	40 %	40 %	222081074
175	NC_011983	TGGGA	2	10	278931	278940	20 %	20 %	60 %	0 %	222081075
176	NC_011983	CCGTT	2	10	279033	279042	0 %	40 %	20 %	40 %	222081075
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178	NC_011983	GACGT	2	10	287143	287152	20 %	20 %	40 %	20 %	222081082
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193	NC_011983	GGCCG	2	10	309589	309598	0 %	0 %	60 %	40 %	222081102
194	NC_011983	CGTGG	2	10	313479	313488	0 %	20 %	60 %	20 %	222081105
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239	NC_011983	AGCTC	2	10	382962	382971	20 %	20 %	20 %	40 %	222081171
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245	NC_011983	GCGCG	2	10	396379	396388	0 %	0 %	60 %	40 %	222081182
246	NC_011983	ATGAG	2	10	396771	396780	40 %	20 %	40 %	0 %	222081183
247	NC_011983	GCGCG	2	10	397964	397973	0 %	0 %	60 %	40 %	222081184
248	NC_011983	TGCGA	2	10	398794	398803	20 %	20 %	40 %	20 %	222081185
249	NC_011983	GAGAT	2	10	402414	402423	40 %	20 %	40 %	0 %	222081188
250	NC_011983	AAAGA	2	10	406516	406525	80 %	0 %	20 %	0 %	222081190
251	NC_011983	GTCCT	2	10	407360	407369	0 %	40 %	20 %	40 %	222081191
252	NC_011983	GGCGC	2	10	407444	407453	0 %	0 %	60 %	40 %	222081191
253	NC_011983	ATCGA	2	10	409098	409107	40 %	20 %	20 %	20 %	222081193
254	NC_011983	TCACC	2	10	410097	410106	20 %	20 %	0 %	60 %	222081194
255	NC_011983	GCGAG	2	10	410933	410942	20 %	0 %	60 %	20 %	222081194
256	NC_011983	CGATG	2	10	411198	411207	20 %	20 %	40 %	20 %	222081194
257	NC_011983	GCGCC	2	10	411457	411466	0 %	0 %	40 %	60 %	222081195
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259	NC_011983	GCCTC	2	10	420018	420027	0 %	20 %	20 %	60 %	222081203
260	NC_011983	GATCT	2	10	420112	420121	20 %	40 %	20 %	20 %	222081203
261	NC_011983	GGTGA	2	10	421110	421119	20 %	20 %	60 %	0 %	222081204
262	NC_011983	CGTTC	2	10	421979	421988	0 %	40 %	20 %	40 %	222081205
263	NC_011983	CGATC	2	10	425619	425628	20 %	20 %	20 %	40 %	222081209
264	NC_011983	ATTCC	2	10	427279	427288	20 %	40 %	0 %	40 %	222081211
265	NC_011983	GCGAT	2	10	429067	429076	20 %	20 %	40 %	20 %	222081214
266	NC_011983	CGAGG	2	10	429173	429182	20 %	0 %	60 %	20 %	222081214
267	NC_011983	GCGCG	2	10	430723	430732	0 %	0 %	60 %	40 %	222081215
268	NC_011983	AGGGC	2	10	431416	431425	20 %	0 %	60 %	20 %	222081216
269	NC_011983	ACCGA	2	10	431760	431769	40 %	0 %	20 %	40 %	222081216
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277	NC_011983	CCGGC	2	10	451502	451511	0 %	0 %	40 %	60 %	222081232
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284	NC_011983	TCCTC	2	10	460976	460985	0 %	40 %	0 %	60 %	222081240
285	NC_011983	CTCTT	2	10	461314	461323	0 %	60 %	0 %	40 %	222081241
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289	NC_011983	CTGAC	2	10	465697	465706	20 %	20 %	20 %	40 %	222081244
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374	NC_011983	TTCGC	2	10	610309	610318	0 %	40 %	20 %	40 %	222081373
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377	NC_011983	TCGTA	2	10	617298	617307	20 %	40 %	20 %	20 %	222081378
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381	NC_011983	ACCGA	2	10	624050	624059	40 %	0 %	20 %	40 %	222081384
382	NC_011983	CCGGC	2	10	624933	624942	0 %	0 %	40 %	60 %	222081385
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384	NC_011983	TGATC	2	10	626789	626798	20 %	40 %	20 %	20 %	222081388
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386	NC_011983	CGCGA	2	10	628157	628166	20 %	0 %	40 %	40 %	222081389
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388	NC_011983	GGCCT	2	10	633715	633724	0 %	20 %	40 %	40 %	222081394
389	NC_011983	GCATC	2	10	638191	638200	20 %	20 %	20 %	40 %	222081397
390	NC_011983	GACCG	2	10	639869	639878	20 %	0 %	40 %	40 %	222081398
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