MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 1608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011983	TCGTT	2	10	2481407	2481416	0 %	60 %	20 %	20 %	222083033
1502	NC_011983	GGGTG	2	10	2481638	2481647	0 %	20 %	80 %	0 %	222083033
1503	NC_011983	CCATC	2	10	2482267	2482276	20 %	20 %	0 %	60 %	222083033
1504	NC_011983	GATCA	2	10	2482500	2482509	40 %	20 %	20 %	20 %	222083033
1505	NC_011983	TGATC	2	10	2485413	2485422	20 %	40 %	20 %	20 %	222083037
1506	NC_011983	GATCC	2	10	2487617	2487626	20 %	20 %	20 %	40 %	222083039
1507	NC_011983	AGACG	2	10	2490566	2490575	40 %	0 %	40 %	20 %	222083043
1508	NC_011983	GCGAT	2	10	2491931	2491940	20 %	20 %	40 %	20 %	222083044
1509	NC_011983	TGAGG	2	10	2491983	2491992	20 %	20 %	60 %	0 %	222083044
1510	NC_011983	TTGCC	2	10	2492199	2492208	0 %	40 %	20 %	40 %	222083044
1511	NC_011983	CCAGA	2	10	2493905	2493914	40 %	0 %	20 %	40 %	222083046
1512	NC_011983	ACACG	2	10	2493937	2493946	40 %	0 %	20 %	40 %	222083046
1513	NC_011983	ATGTC	2	10	2497823	2497832	20 %	40 %	20 %	20 %	222083049
1514	NC_011983	GACTG	2	10	2498467	2498476	20 %	20 %	40 %	20 %	222083050
1515	NC_011983	TGCCA	2	10	2499844	2499853	20 %	20 %	20 %	40 %	222083051
1516	NC_011983	CCAGC	2	10	2500506	2500515	20 %	0 %	20 %	60 %	222083052
1517	NC_011983	CCCCG	2	10	2500740	2500749	0 %	0 %	20 %	80 %	222083052
1518	NC_011983	CTTGC	2	10	2503963	2503972	0 %	40 %	20 %	40 %	222083056
1519	NC_011983	GATCT	2	10	2504805	2504814	20 %	40 %	20 %	20 %	222083057
1520	NC_011983	GCATT	2	10	2506759	2506768	20 %	40 %	20 %	20 %	222083058
1521	NC_011983	TCTTT	2	10	2506780	2506789	0 %	80 %	0 %	20 %	222083058
1522	NC_011983	CAATA	2	10	2507979	2507988	60 %	20 %	0 %	20 %	222083058
1523	NC_011983	TGCGA	2	10	2508380	2508389	20 %	20 %	40 %	20 %	222083058
1524	NC_011983	TAGCG	2	10	2512558	2512567	20 %	20 %	40 %	20 %	222083059
1525	NC_011983	GGACA	2	10	2513904	2513913	40 %	0 %	40 %	20 %	222083060
1526	NC_011983	CGGAC	2	10	2514021	2514030	20 %	0 %	40 %	40 %	222083060
1527	NC_011983	CGATG	2	10	2515451	2515460	20 %	20 %	40 %	20 %	222083061
1528	NC_011983	TGCGT	2	10	2516718	2516727	0 %	40 %	40 %	20 %	222083062
1529	NC_011983	GAAAG	2	10	2517127	2517136	60 %	0 %	40 %	0 %	222083062
1530	NC_011983	CGACA	2	10	2519639	2519648	40 %	0 %	20 %	40 %	222083065
1531	NC_011983	CGGCG	2	10	2523343	2523352	0 %	0 %	60 %	40 %	222083068
1532	NC_011983	GGCTC	2	10	2524608	2524617	0 %	20 %	40 %	40 %	222083069
1533	NC_011983	ACGGC	2	10	2524956	2524965	20 %	0 %	40 %	40 %	222083069
1534	NC_011983	GCGCC	2	10	2526679	2526688	0 %	0 %	40 %	60 %	222083071
1535	NC_011983	CCGGG	2	10	2527238	2527247	0 %	0 %	60 %	40 %	222083072
1536	NC_011983	GCCGA	2	10	2527421	2527430	20 %	0 %	40 %	40 %	222083072
1537	NC_011983	CCCGG	2	10	2529669	2529678	0 %	0 %	40 %	60 %	222083074
1538	NC_011983	GCCGC	2	10	2540811	2540820	0 %	0 %	40 %	60 %	222083085
1539	NC_011983	TGGCG	2	10	2541571	2541580	0 %	20 %	60 %	20 %	222083086
1540	NC_011983	TCTGG	2	10	2542556	2542565	0 %	40 %	40 %	20 %	222083087
1541	NC_011983	GCTTG	2	10	2544325	2544334	0 %	40 %	40 %	20 %	222083090
1542	NC_011983	CGTTT	2	10	2546097	2546106	0 %	60 %	20 %	20 %	222083093
1543	NC_011983	GAAGA	2	10	2547257	2547266	60 %	0 %	40 %	0 %	222083095
1544	NC_011983	CGACC	2	10	2548870	2548879	20 %	0 %	20 %	60 %	222083096
1545	NC_011983	CTTGC	2	10	2550863	2550872	0 %	40 %	20 %	40 %	222083097
1546	NC_011983	GCGTC	2	10	2551616	2551625	0 %	20 %	40 %	40 %	222083098
1547	NC_011983	CAAGA	2	10	2556980	2556989	60 %	0 %	20 %	20 %	222083104
1548	NC_011983	ATCGC	2	10	2559124	2559133	20 %	20 %	20 %	40 %	222083106
1549	NC_011983	CGATG	2	10	2562117	2562126	20 %	20 %	40 %	20 %	222083108
1550	NC_011983	CCACT	2	10	2564034	2564043	20 %	20 %	0 %	60 %	222083111
1551	NC_011983	CCGAA	2	10	2565924	2565933	40 %	0 %	20 %	40 %	222083113
1552	NC_011983	TCGTC	2	10	2569863	2569872	0 %	40 %	20 %	40 %	222083115
1553	NC_011983	CGTGA	2	10	2570858	2570867	20 %	20 %	40 %	20 %	222083116
1554	NC_011983	TCTGC	2	10	2572368	2572377	0 %	40 %	20 %	40 %	222083118
1555	NC_011983	CTTTG	2	10	2574120	2574129	0 %	60 %	20 %	20 %	222083119
1556	NC_011983	GTCCT	2	10	2574339	2574348	0 %	40 %	20 %	40 %	222083119
1557	NC_011983	CGCTG	2	10	2575346	2575355	0 %	20 %	40 %	40 %	222083119
1558	NC_011983	TGATA	2	10	2578166	2578175	40 %	40 %	20 %	0 %	222083122
1559	NC_011983	CTGGG	2	10	2579259	2579268	0 %	20 %	60 %	20 %	222083123
1560	NC_011983	CGCCC	2	10	2580384	2580393	0 %	0 %	20 %	80 %	222083124
1561	NC_011983	CGTCC	2	10	2580434	2580443	0 %	20 %	20 %	60 %	222083124
1562	NC_011983	ACCGA	2	10	2583792	2583801	40 %	0 %	20 %	40 %	222083125
1563	NC_011983	GCCAA	2	10	2585251	2585260	40 %	0 %	20 %	40 %	222083126
1564	NC_011983	TGCGC	2	10	2585951	2585960	0 %	20 %	40 %	40 %	222083127
1565	NC_011983	CCAAA	2	10	2587215	2587224	60 %	0 %	0 %	40 %	222083127
1566	NC_011983	GCCGC	2	10	2588653	2588662	0 %	0 %	40 %	60 %	222083128
1567	NC_011983	CGGGT	2	10	2590684	2590693	0 %	20 %	60 %	20 %	222083129
1568	NC_011983	TGGCA	2	10	2590831	2590840	20 %	20 %	40 %	20 %	222083129
1569	NC_011983	GATCA	2	10	2593304	2593313	40 %	20 %	20 %	20 %	222083131
1570	NC_011983	GTCGT	2	10	2593698	2593707	0 %	40 %	40 %	20 %	222083131
1571	NC_011983	TGAAT	2	10	2594628	2594637	40 %	40 %	20 %	0 %	222083132
1572	NC_011983	CCGGC	2	10	2597196	2597205	0 %	0 %	40 %	60 %	222083134
1573	NC_011983	ATCAG	2	10	2598968	2598977	40 %	20 %	20 %	20 %	222083136
1574	NC_011983	ATCGC	2	10	2603482	2603491	20 %	20 %	20 %	40 %	222083138
1575	NC_011983	AGCAA	2	10	2604403	2604412	60 %	0 %	20 %	20 %	222083138
1576	NC_011983	GCTCG	2	10	2610418	2610427	0 %	20 %	40 %	40 %	222080782
1577	NC_011983	CGTCG	2	10	2611172	2611181	0 %	20 %	40 %	40 %	222080783
1578	NC_011983	AAGGA	2	10	2611361	2611370	60 %	0 %	40 %	0 %	222080783
1579	NC_011983	CATCG	2	10	2612007	2612016	20 %	20 %	20 %	40 %	222080784
1580	NC_011983	GATCG	2	10	2612594	2612603	20 %	20 %	40 %	20 %	222080785
1581	NC_011983	AGGCA	2	10	2615067	2615076	40 %	0 %	40 %	20 %	222080787
1582	NC_011983	GGTCG	2	10	2616519	2616528	0 %	20 %	60 %	20 %	222080789
1583	NC_011983	GATCA	2	10	2618281	2618290	40 %	20 %	20 %	20 %	222080791
1584	NC_011983	CGGCG	2	10	2619156	2619165	0 %	0 %	60 %	40 %	222080792
1585	NC_011983	GCTCG	2	10	2621938	2621947	0 %	20 %	40 %	40 %	222080794
1586	NC_011983	GCCTC	2	10	2622631	2622640	0 %	20 %	20 %	60 %	222080795
1587	NC_011983	GGAAT	2	10	2624652	2624661	40 %	20 %	40 %	0 %	222080796
1588	NC_011983	CCGGT	2	10	2625668	2625677	0 %	20 %	40 %	40 %	222080797
1589	NC_011983	GTACC	2	10	2628515	2628524	20 %	20 %	20 %	40 %	222080801
1590	NC_011983	CCGAT	2	10	2630335	2630344	20 %	20 %	20 %	40 %	222080803
1591	NC_011983	GGCTA	2	10	2632563	2632572	20 %	20 %	40 %	20 %	222080805
1592	NC_011983	CTGCG	2	10	2633060	2633069	0 %	20 %	40 %	40 %	222080805
1593	NC_011983	CGGCG	2	10	2634461	2634470	0 %	0 %	60 %	40 %	222080806
1594	NC_011983	AGCCG	2	10	2634673	2634682	20 %	0 %	40 %	40 %	222080807
1595	NC_011983	CGGCC	2	10	2635259	2635268	0 %	0 %	40 %	60 %	222080807
1596	NC_011983	CGGCG	3	15	2635798	2635812	0 %	0 %	60 %	40 %	222080808
1597	NC_011983	GCATG	2	10	2637539	2637548	20 %	20 %	40 %	20 %	222080810
1598	NC_011983	CCAGC	2	10	2639620	2639629	20 %	0 %	20 %	60 %	222080811
1599	NC_011983	GCCGG	2	10	2640028	2640037	0 %	0 %	60 %	40 %	222080811
1600	NC_011983	TCGCT	2	10	2641336	2641345	0 %	40 %	20 %	40 %	222080812
1601	NC_011983	CCGAT	2	10	2642464	2642473	20 %	20 %	20 %	40 %	222080812
1602	NC_011983	ACGGC	2	10	2643010	2643019	20 %	0 %	40 %	40 %	222080812
1603	NC_011983	GGCCG	2	10	2643512	2643521	0 %	0 %	60 %	40 %	222080813
1604	NC_011983	ACGCG	2	10	2644846	2644855	20 %	0 %	40 %	40 %	222080814
1605	NC_011983	TCGTC	2	10	2646070	2646079	0 %	40 %	20 %	40 %	222080816
1606	NC_011983	GGCGA	2	10	2646375	2646384	20 %	0 %	60 %	20 %	222080816
1607	NC_011983	CTTGG	2	10	2648079	2648088	0 %	40 %	40 %	20 %	222080818
1608	NC_011983	CCGGG	2	10	2648299	2648308	0 %	0 %	60 %	40 %	222080818

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.