MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	ATG	2	6	3	8	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011982	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011982	AGG	2	6	3757	3762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011982	GTC	2	6	3847	3852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011982	TAT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011982	CAA	2	6	6233	6238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011982	TAA	2	6	8540	8545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011982	ACG	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011982	AAG	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011982	TCG	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011982	CGC	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011982	CGA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011982	CCG	2	6	8754	8759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011982	CTG	2	6	8870	8875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011982	CGA	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011982	CCG	2	6	8938	8943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011982	CAC	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011982	AAC	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011982	TCG	2	6	9033	9038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011982	AGC	2	6	9061	9066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011982	TTA	2	6	9087	9092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011982	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011982	GCT	3	9	9190	9198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011982	CGG	2	6	9232	9237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011982	CGC	2	6	9322	9327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011982	CTG	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011982	GCG	3	9	9362	9370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011982	CTT	2	6	9413	9418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011982	GCA	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011982	GGC	2	6	9469	9474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011982	CTC	2	6	9524	9529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011982	GCT	2	6	10306	10311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011982	TAG	2	6	10921	10926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011982	TGA	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011982	CCT	2	6	10945	10950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_011982	GGA	2	6	10999	11004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011982	GCC	2	6	12693	12698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011982	CCT	2	6	13603	13608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011982	GAG	2	6	13655	13660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011982	GCC	2	6	13772	13777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011982	GCG	3	9	15547	15555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011982	CTT	2	6	15570	15575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011982	TGT	2	6	18306	18311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011982	GCG	2	6	18316	18321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011982	CTG	2	6	19551	19556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011982	CAG	2	6	19583	19588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011982	GCG	2	6	19600	19605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011982	GCA	2	6	19806	19811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011982	CAG	2	6	19827	19832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011982	TGG	2	6	19896	19901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011982	TCG	2	6	20967	20972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011982	GCG	2	6	22724	22729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011982	GTG	2	6	22822	22827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011982	AAG	2	6	22856	22861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011982	ATC	2	6	22876	22881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011982	GCC	2	6	22885	22890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011982	CAT	2	6	22893	22898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011982	CGA	2	6	23073	23078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011982	ACA	2	6	23096	23101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011982	TCG	2	6	24071	24076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011982	CGA	2	6	24287	24292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011982	TCA	2	6	24298	24303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011982	GCC	2	6	24379	24384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_011982	GGC	2	6	24395	24400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011982	GCG	2	6	24483	24488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011982	TCA	2	6	24557	24562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011982	CAT	2	6	24690	24695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011982	GCC	2	6	24750	24755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011982	TGT	2	6	24891	24896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011982	GTT	2	6	26740	26745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011982	CCT	2	6	27043	27048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011982	AGG	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011982	CCG	3	9	27070	27078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011982	GCG	2	6	27423	27428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011982	GAA	2	6	27649	27654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011982	AAG	2	6	27680	27685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011982	CTG	2	6	27965	27970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011982	ATG	2	6	27981	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011982	ACA	2	6	28042	28047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011982	CCA	2	6	28111	28116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011982	GGC	2	6	28515	28520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011982	GAT	2	6	28574	28579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011982	TGA	2	6	28708	28713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011982	CGC	2	6	28782	28787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011982	GCC	2	6	28870	28875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011982	CGG	2	6	28885	28890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011982	TGA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011982	GAT	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011982	ATC	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011982	CCG	2	6	30311	30316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011982	CGC	2	6	30317	30322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011982	GCG	2	6	30325	30330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011982	CCA	2	6	30349	30354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011982	GAC	2	6	30411	30416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011982	CAT	2	6	30443	30448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011982	TTC	2	6	30450	30455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011982	GAT	2	6	30640	30645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011982	GCA	2	6	30651	30656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011982	GGC	2	6	30659	30664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011982	CGA	2	6	31425	31430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011982	GTG	2	6	31554	31559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011982	GCG	2	6	31626	31631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011982	GAA	2	6	31741	31746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011982	GGC	2	6	31757	31762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011982	ATC	2	6	31831	31836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011982	GCA	2	6	31861	31866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011982	CAA	2	6	31914	31919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011982	GCC	2	6	32051	32056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011982	AAC	2	6	32175	32180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011982	TCC	2	6	32192	32197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011982	CGC	2	6	32209	32214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011982	TTC	2	6	32294	32299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011982	GGC	5	15	32300	32314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011982	CGG	2	6	32338	32343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011982	CGG	2	6	32356	32361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011982	TAA	3	9	32406	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011982	GCA	2	6	32450	32455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011982	CGC	2	6	32458	32463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011982	CAG	2	6	33303	33308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011982	GAT	2	6	33309	33314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011982	GTT	2	6	34126	34131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011982	GGC	2	6	34136	34141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011982	GCC	2	6	34199	34204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011982	GAG	2	6	34349	34354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011982	GTC	2	6	34398	34403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011982	AGG	2	6	34415	34420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011982	CGT	2	6	34491	34496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011982	GGC	2	6	34665	34670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011982	CGC	2	6	34683	34688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011982	GCA	2	6	34722	34727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011982	TCA	2	6	34760	34765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011982	GCG	2	6	35923	35928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011982	GGA	2	6	36007	36012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011982	CCG	2	6	36018	36023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011982	CGA	2	6	36067	36072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011982	GGC	2	6	36079	36084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011982	CGT	2	6	36096	36101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011982	CGA	2	6	36116	36121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011982	TGT	2	6	36210	36215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011982	GAG	2	6	36302	36307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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