MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011982	CCA	2	6	136589	136594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_011982	ATC	2	6	136622	136627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011982	AGT	2	6	136656	136661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011982	TAA	2	6	136742	136747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011982	TAT	2	6	136920	136925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011982	CCT	2	6	136990	136995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_011982	ATT	2	6	137018	137023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011982	TTG	2	6	137038	137043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011982	TTA	2	6	137058	137063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011982	TTA	2	6	137090	137095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011982	TTA	2	6	137145	137150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011982	GTG	2	6	137970	137975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011982	TAT	2	6	138004	138009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011982	GCA	2	6	138052	138057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011982	TTA	2	6	138155	138160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011982	CAT	2	6	138178	138183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011982	TTC	2	6	139416	139421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011982	ACA	2	6	139463	139468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011982	TCC	2	6	139469	139474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011982	TAA	2	6	139520	139525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011982	AAT	2	6	139535	139540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011982	CGT	2	6	139641	139646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011982	TAT	2	6	139724	139729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011982	TGC	2	6	139943	139948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_011982	CAT	2	6	140178	140183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011982	TGT	2	6	140197	140202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011982	CGA	2	6	140257	140262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011982	CGA	2	6	140455	140460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011982	GTC	2	6	140510	140515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011982	ACC	2	6	140531	140536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_011982	CAC	2	6	140596	140601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_011982	AGC	2	6	140784	140789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_011982	AGC	2	6	140820	140825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011982	CGC	2	6	140869	140874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011982	CTT	2	6	140944	140949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011982	CGC	2	6	141050	141055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_011982	CCT	2	6	141090	141095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_011982	GGT	2	6	141114	141119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011982	CCG	2	6	141167	141172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_011982	CCG	2	6	141245	141250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_011982	ATG	2	6	141348	141353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011982	CCG	2	6	141387	141392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_011982	TGA	3	9	141485	141493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011982	AAG	2	6	141500	141505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011982	TTC	2	6	141615	141620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011982	CGT	2	6	141718	141723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011982	GCA	2	6	144208	144213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011982	ACA	2	6	146601	146606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011982	CGG	2	6	146810	146815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011982	CAA	2	6	146872	146877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_011982	TTC	2	6	146972	146977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011982	GTG	2	6	147035	147040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011982	GCA	2	6	147056	147061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011982	GGC	2	6	147106	147111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011982	CGC	2	6	147243	147248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011982	AAG	2	6	147294	147299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011982	TCC	2	6	147466	147471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_011982	TCG	2	6	147473	147478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011982	CGC	2	6	147483	147488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_011982	GCG	2	6	147589	147594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_011982	CGA	2	6	147848	147853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011982	GCT	2	6	147872	147877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011982	GGC	2	6	147996	148001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_011982	GCC	2	6	148014	148019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011982	TCA	2	6	150683	150688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011982	GTT	2	6	150705	150710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011982	CAA	2	6	150744	150749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011982	AAT	3	9	157297	157305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011982	AAC	2	6	157417	157422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011982	TGG	2	6	158780	158785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011982	TGA	2	6	158786	158791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011982	GGC	2	6	158812	158817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011982	CAA	2	6	158824	158829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_011982	CGT	2	6	158875	158880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011982	AGG	2	6	159775	159780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011982	TTC	2	6	164714	164719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_011982	TGA	2	6	169264	169269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_011982	CGG	2	6	169583	169588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011982	CGG	2	6	169661	169666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_011982	ACC	2	6	169714	169719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_011982	AGG	2	6	169738	169743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011982	AAG	2	6	169884	169889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011982	GCG	2	6	169959	169964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_011982	GCT	2	6	170008	170013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011982	GCT	2	6	170044	170049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011982	GTT	2	6	170195	170200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011982	GCG	2	6	170288	170293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_011982	ACG	2	6	170297	170302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_011982	GAG	2	6	170514	170519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011982	GGC	2	6	170883	170888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_011982	TCG	2	6	172614	172619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011982	CGC	2	6	172691	172696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_011982	GAT	2	6	172711	172716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011982	GCG	2	6	172732	172737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011982	CAA	2	6	172768	172773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_011982	GCT	2	6	172774	172779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011982	ATC	2	6	172781	172786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011982	TGG	2	6	172886	172891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011982	GTG	2	6	173304	173309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011982	TCG	2	6	173414	173419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011982	CCA	2	6	173499	173504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_011982	ACC	2	6	173588	173593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_011982	TTC	2	6	173662	173667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011982	TCC	2	6	173783	173788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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608	NC_011982	TGA	2	6	173904	173909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011982	CGC	2	6	173935	173940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_011982	CGA	2	6	173949	173954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_011982	TGC	2	6	174820	174825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011982	CTG	2	6	174930	174935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_011982	GAA	2	6	174938	174943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011982	CGT	2	6	174944	174949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011982	CTT	2	6	175011	175016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011982	ACC	2	6	175025	175030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_011982	ATC	2	6	175099	175104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011982	GCC	2	6	175177	175182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_011982	CAG	2	6	175188	175193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011982	CGA	2	6	175206	175211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011982	CTC	2	6	179345	179350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_011982	ATC	2	6	179626	179631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_011982	TGA	2	6	179677	179682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011982	GCG	2	6	179790	179795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011982	CGA	2	6	179800	179805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011982	GGA	2	6	179807	179812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011982	TCT	2	6	179827	179832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011982	GCT	2	6	179874	179879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_011982	CTT	2	6	179979	179984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011982	GGC	2	6	180029	180034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011982	GCC	2	6	180167	180172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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633	NC_011982	GAA	2	6	180301	180306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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